Details for gene set V$OCT1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$OCT1_04
Enrichment Score (ES)	-0.42415753
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.3948934
Nominal p-value	0.018099548
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	0.993

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	MEF2C	1421027_a_at 1421028_a_at 1424852_at 1439946_at 1445420_at 1446484_at 1451506_at 1451507_at 1458551_at	284	1.486	0.0256	No
2	SLC7A11	1420413_at 1443536_at	638	0.813	0.0305	No
3	PRKCB1	1423478_at 1438981_at 1443144_at 1459674_at 1460419_a_at	662	0.786	0.0499	No
4	FOXP1	1421140_a_at 1421141_a_at 1421142_s_at 1435222_at 1438802_at 1443258_at 1446280_at 1447209_at 1455242_at 1456851_at	815	0.649	0.0598	No
5	OPCML	1435612_at 1442752_at 1457446_at 1458228_at	841	0.635	0.0752	No
6	SP6	1427786_at 1427787_at 1437788_at 1442342_at	1237	0.439	0.0684	No
7	TDRD5	1446208_at 1456391_at	1274	0.423	0.0778	No
8	RUNX1	1422864_at 1422865_at 1427650_a_at 1427847_at 1440878_at 1444527_at 1446930_at 1452530_a_at 1452531_at 1452578_at 1459470_at	1324	0.401	0.0859	No
9	TOPBP1	1452241_at 1458480_at	1345	0.396	0.0953	No
10	MAP2K6	1426850_a_at 1459292_at	1462	0.361	0.0994	No
11	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	1622	0.328	0.1006	No
12	MEIS1	1440431_at 1443260_at 1445773_at 1450992_a_at 1459423_at 1459512_at	1732	0.307	0.1036	No
13	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	1777	0.299	0.1093	No
14	CHD6	1427384_at 1431047_at	1834	0.288	0.1143	No
15	TPD52	1419493_a_at 1419494_a_at 1436008_at 1458668_at	1869	0.281	0.1200	No
16	ATP1B2	1422009_at 1435148_at	1951	0.268	0.1233	No
17	IGSF4D	1435145_at 1435146_s_at 1435147_x_at 1436743_at 1440412_at 1444664_at 1459761_x_at	1964	0.266	0.1296	No
18	GDI1	1447613_at 1451070_at	1991	0.262	0.1352	No
19	POU2F1	1419716_a_at 1427695_a_at 1427835_at	2047	0.253	0.1393	No
20	LDB2	1421101_a_at 1439557_s_at 1445126_at 1456786_at	2059	0.252	0.1453	No
21	KCNS3	1445519_at 1457799_at	2151	0.240	0.1474	No
22	PRDM2	1429251_at 1444123_at 1453068_at	2169	0.239	0.1529	No
23	JAM3	1423503_at 1423504_at 1444895_at	2475	0.205	0.1442	No
24	GALNT1	1423236_at 1423237_at	2568	0.194	0.1450	No
25	CDC42EP3	1422642_at 1450700_at	2740	0.179	0.1418	No
26	POU3F4	1422164_at 1422165_at	2811	0.174	0.1431	No
27	FGF13	1418497_at 1418498_at	2812	0.174	0.1476	No
28	IRX4	1419539_at	3091	0.156	0.1389	No
29	GABRG1	1427227_at 1460408_at	3478	0.136	0.1247	No
30	SCEL	1422837_at 1459426_at	3569	0.132	0.1240	No
31	CNOT2	1436980_x_at 1445017_at 1447212_at 1454602_s_at 1454603_a_at 1456576_x_at	3604	0.131	0.1259	No
32	MOXD1	1422643_at	3813	0.123	0.1195	No
33	NEUROG1	1438551_at 1450836_at	3893	0.120	0.1190	No
34	GRIK3	1427709_at	4006	0.115	0.1168	No
35	BCL11B	1440137_at 1441762_at 1450339_a_at	4031	0.115	0.1187	No
36	LMNA	1421654_a_at 1425472_a_at 1426868_x_at 1452212_at 1457670_s_at	4143	0.110	0.1165	No
37	UNC13B	1417757_at 1443308_at	4254	0.106	0.1142	No
38	NFIA	1421162_a_at 1421163_a_at 1427733_a_at 1438236_at 1440660_at 1441547_at 1446742_at 1446990_at 1456087_at 1459431_at	4271	0.106	0.1162	No
39	CASK	1422518_at 1422519_at 1427692_a_at 1445152_at	4774	0.092	0.0956	No
40	HBXIP	1415759_a_at 1436152_a_at 1445400_at	5037	0.086	0.0858	No
41	SCUBE2	1453486_a_at	5147	0.084	0.0829	No
42	SLC17A6	1418610_at 1428379_at	5201	0.082	0.0826	No
43	SLC35C2	1420054_s_at 1420055_at 1460731_at	5367	0.079	0.0771	No
44	PPP2R3A	1455198_a_at	5439	0.077	0.0758	No
45	GRM8	1421530_a_at	5496	0.076	0.0753	No
46	CPEB4	1420617_at 1420618_at 1449931_at	5694	0.072	0.0681	No
47	EPHB3	1451550_at	5703	0.072	0.0696	No
48	SH3BGRL	1421871_at 1428107_at 1436997_x_at 1459571_at	5829	0.069	0.0656	No
49	HOXC4	1422870_at	5840	0.069	0.0670	No
50	ZIC3	1423424_at 1438737_at	5867	0.068	0.0675	No
51	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	5961	0.067	0.0650	No
52	ANK3	1425202_a_at 1439220_at 1447259_at 1451628_a_at 1457288_at	6173	0.063	0.0569	No
53	OMD	1418745_at	6492	0.057	0.0438	No
54	AHCY	1417125_at	6535	0.056	0.0433	No
55	CHD2	1444246_at 1445843_at	6687	0.054	0.0378	No
56	ISL1	1422720_at 1450723_at	6725	0.053	0.0375	No
57	ZIC4	1421539_at 1456417_at	6800	0.052	0.0354	No
58	BCL2L1	1420887_a_at 1420888_at 1426050_at 1426191_a_at	6963	0.049	0.0292	No
59	NCALD	1417568_at 1417569_at 1439730_at 1444466_at 1458037_at	7015	0.048	0.0282	No
60	TBR1	1416711_at	7241	0.044	0.0190	No
61	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	7256	0.044	0.0195	No
62	CSF3	1419427_at	7376	0.042	0.0151	No
63	HOXD4	1450209_at	7968	0.033	-0.0112	No
64	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	8254	0.029	-0.0236	No
65	CLCA3	1416306_at 1459889_at	8284	0.029	-0.0241	No
66	HOXC6	1427361_at 1427362_x_at 1427454_at	8436	0.026	-0.0304	No
67	NPTX2	1420720_at 1449960_at	8528	0.025	-0.0339	No
68	IRAK1	1448668_a_at 1460649_at	8664	0.023	-0.0395	No
69	OLFML3	1448475_at	8703	0.023	-0.0407	No
70	SMARCA2	1430526_a_at 1439930_at 1452333_at	8713	0.023	-0.0405	No
71	PKP4	1438677_at 1452209_at	8776	0.022	-0.0428	No
72	FES	1427368_x_at 1452410_a_at	8937	0.020	-0.0496	No
73	ATOH1	1449822_at	9611	0.011	-0.0803	No
74	PHKA1	1422743_at 1422744_at 1435567_at	9679	0.010	-0.0831	No
75	CDX4	1421552_at	9814	0.008	-0.0890	No
76	ACBD4	1428271_at 1449626_s_at	9820	0.008	-0.0891	No
77	CD86	1420404_at 1449858_at	9895	0.007	-0.0923	No
78	CACNA1D	1427974_s_at 1428051_a_at	9922	0.006	-0.0933	No
79	PURA	1420628_at 1438219_at 1449934_at 1453783_at 1456898_at	9944	0.006	-0.0941	No
80	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	10193	0.003	-0.1055	No
81	NDUFA4	1424085_at	10281	0.002	-0.1094	No
82	GAB2	1419829_a_at 1420785_at 1439786_at 1446860_at	10440	-0.000	-0.1167	No
83	PDZRN4	1456512_at	10551	-0.002	-0.1217	No
84	GRIN3A	1436575_at 1438866_at 1458378_at	10563	-0.002	-0.1221	No
85	PTPRD	1424886_at 1429052_at 1435537_at 1439175_at 1440624_at 1441498_at 1441932_at 1442837_at 1443053_at 1443056_at 1443075_at 1443860_at 1444492_at 1444622_at 1445767_at 1459173_at	10942	-0.007	-0.1393	No
86	TCF2	1421224_a_at 1441484_at 1451687_a_at	11043	-0.008	-0.1437	No
87	MITF	1422025_at 1455214_at	11169	-0.010	-0.1492	No
88	BNC2	1438861_at 1440593_at 1459132_at	11214	-0.011	-0.1509	No
89	CDH13	1423551_at 1431824_at 1454015_a_at 1459535_at	11228	-0.011	-0.1512	No
90	BAT2	1422799_at 1422800_at 1442802_x_at	11420	-0.013	-0.1597	No
91	STOML2	1448774_at	11493	-0.014	-0.1626	No
92	TWIST1	1418733_at	11661	-0.016	-0.1698	No
93	PDE1A	1431625_at 1449298_a_at	11815	-0.018	-0.1764	No
94	TAL2	1450517_at 1460309_at	12104	-0.022	-0.1891	No
95	RGL1	1418535_at 1440662_at 1449124_at	12222	-0.024	-0.1938	No
96	GABRG2	1418177_at 1437147_at	12432	-0.026	-0.2028	No
97	CCRL1	1426139_a_at 1437668_at 1437669_x_at	12536	-0.028	-0.2068	No
98	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	12546	-0.028	-0.2065	No
99	MID1	1422055_at 1438239_at 1441929_at 1443666_at	12645	-0.029	-0.2102	No
100	OLIG3	1421728_at	12651	-0.029	-0.2097	No
101	YTHDC2	1437357_at	12966	-0.034	-0.2232	No
102	NPHP4	1431329_at 1434024_at 1444639_at	13176	-0.037	-0.2319	No
103	NR6A1	1421515_at 1421516_at 1428825_at 1428826_at 1445872_at	13465	-0.041	-0.2440	No
104	TBXAS1	1416827_at	13468	-0.041	-0.2431	No
105	HS3ST1	1423450_a_at	13629	-0.043	-0.2493	No
106	PMCH	1429361_at	13701	-0.044	-0.2514	No
107	HOXA10	1431475_a_at 1446408_at	13767	-0.045	-0.2532	No
108	CNTN6	1422649_at	13904	-0.048	-0.2582	No
109	EIF4A1	1427058_at 1430980_a_at 1434985_a_at	13943	-0.048	-0.2587	No
110	HDAC9	1421306_a_at 1434572_at	14126	-0.051	-0.2658	No
111	PIK4CB	1439197_at	14286	-0.053	-0.2717	No
112	NFIX	1423493_a_at 1436363_a_at 1436364_x_at 1451443_at 1459909_at	14504	-0.057	-0.2802	No
113	HOXD10	1418606_at	14797	-0.062	-0.2920	No
114	ZIC1	1423477_at 1439627_at	14851	-0.063	-0.2928	No
115	ZFPM2	1419012_at 1444803_at 1447020_at 1449314_at	14953	-0.064	-0.2958	No
116	HOXC10	1439798_at	15057	-0.066	-0.2988	No
117	EYA1	1421727_at 1443117_at 1457424_at	15225	-0.069	-0.3047	No
118	PHOX2B	1422232_at 1455907_x_at	15247	-0.069	-0.3039	No
119	EHF	1419474_a_at 1419475_a_at 1447760_x_at 1451375_at	15268	-0.069	-0.3030	No
120	POU3F2	1450831_at 1453478_at 1457734_at	15793	-0.079	-0.3250	No
121	ANKRD17	1415726_at 1421220_at 1436775_a_at 1444608_at 1445826_at 1454763_at 1459952_at	15905	-0.081	-0.3280	No
122	PLAGL1	1426208_x_at 1438588_at 1450533_a_at	15943	-0.082	-0.3276	No
123	TCEAL1	1424634_at	16062	-0.084	-0.3308	No
124	THRA	1426997_at 1443952_at 1454675_at	16064	-0.084	-0.3287	No
125	HOXB3	1427605_at 1456229_at	16086	-0.084	-0.3275	No
126	GPM6A	1426442_at 1456741_s_at 1459303_at	16400	-0.091	-0.3395	No
127	ZBTB10	1458695_at	16475	-0.092	-0.3405	No
128	LMO3	1455754_at	16590	-0.095	-0.3433	No
129	DLX1	1449470_at	16705	-0.098	-0.3460	No
130	SALL3	1441186_at 1452386_at	16813	-0.100	-0.3483	No
131	SERTAD4	1454877_at	16848	-0.101	-0.3472	No
132	SLC26A7	1425841_at	17173	-0.110	-0.3592	No
133	HOXC5	1439885_at 1450832_at 1456301_at	17184	-0.110	-0.3569	No
134	LECT1	1460258_at	17236	-0.111	-0.3563	No
135	SOX5	1423500_a_at 1432189_a_at 1432190_at 1440827_x_at 1446461_at 1452511_at 1459261_at	17428	-0.116	-0.3621	No
136	NCAM1	1421966_at 1425126_at 1426864_a_at 1426865_a_at 1439556_at 1440067_at 1441995_at 1442680_at 1443018_at 1450437_a_at 1450438_at 1454140_at	17639	-0.122	-0.3685	No
137	IGSF4	1417376_a_at 1417377_at 1417378_at 1431611_a_at	17794	-0.126	-0.3723	No
138	MAB21L2	1418934_at	17805	-0.127	-0.3695	No
139	COMMD10	1428491_at 1456236_s_at	17821	-0.127	-0.3669	No
140	FOXP2	1422014_at 1438231_at 1438232_at 1440108_at 1441365_at 1458191_at	17936	-0.131	-0.3687	No
141	PBX1	1430183_at 1440037_at 1440954_at 1442846_at 1449542_at 1458853_at	18587	-0.152	-0.3946	No
142	PNMA1	1429224_at	18733	-0.158	-0.3971	No
143	NDNL2	1422554_at	18811	-0.161	-0.3965	No
144	MNT	1418192_at	19190	-0.179	-0.4092	No
145	CCND1	1417419_at 1417420_at 1448698_at	19337	-0.187	-0.4111	No
146	LMO4	1420981_a_at 1439651_at	19371	-0.188	-0.4077	No
147	NOTCH2	1451889_at 1455556_at	19560	-0.201	-0.4111	No
148	SHOX2	1420559_a_at 1438042_at	19595	-0.203	-0.4074	No
149	ELAVL4	1428741_at 1450258_a_at 1452894_at 1457399_at	19842	-0.221	-0.4129	No
150	SLC38A4	1428111_at 1448889_at	19909	-0.229	-0.4100	No
151	NCOA5	1424055_at 1456997_at	19986	-0.235	-0.4074	No
152	RHOBTB2	1435674_at 1451517_at	20249	-0.264	-0.4126	No
153	DIXDC1	1425256_a_at 1435207_at 1443957_at 1444395_at	20502	-0.296	-0.4165	Yes
154	PPP3CB	1427468_at 1428473_at 1428474_at 1433835_at 1446149_at 1459378_at	20516	-0.299	-0.4093	Yes
155	NIN	1419078_at 1444155_at	20555	-0.303	-0.4031	Yes
156	GPR85	1424896_at 1424897_at 1437618_x_at 1459795_at	20581	-0.310	-0.3962	Yes
157	CUTL1	1424667_a_at 1424668_a_at 1425611_a_at 1425612_at 1434683_at 1437686_x_at 1440465_at 1447295_at 1451435_at	20670	-0.324	-0.3919	Yes
158	KCNQ5	1427426_at 1441071_at	20679	-0.325	-0.3838	Yes
159	PTEN	1422553_at 1441593_at 1444325_at 1450655_at 1454722_at 1455728_at 1457493_at	20804	-0.349	-0.3804	Yes
160	DTNA	1419223_a_at 1425292_at 1426066_a_at 1427588_a_at 1429768_at 1447280_at 1456069_at 1458908_at	21089	-0.437	-0.3821	Yes
161	ITM2B	1417999_at 1418000_a_at 1418001_at 1456372_at	21120	-0.452	-0.3717	Yes
162	XYLT2	1452515_a_at	21170	-0.469	-0.3618	Yes
163	GNAO1	1421152_a_at 1448031_at 1460383_at	21269	-0.528	-0.3525	Yes
164	ARPC5	1444568_at 1448129_at	21388	-0.623	-0.3417	Yes
165	MBNL1	1416904_at 1439686_at 1440315_at 1445106_at 1457924_at	21482	-0.716	-0.3274	Yes
166	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	21554	-0.797	-0.3099	Yes
167	SCML4	1427417_at 1427545_at 1440157_at	21651	-0.966	-0.2892	Yes
168	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	21694	-1.093	-0.2627	Yes
169	FNBP1	1426983_at 1451806_at 1453746_at 1458639_at 1460047_at	21704	-1.128	-0.2338	Yes
170	SFRS7	1424033_at 1424883_s_at 1436871_at	21715	-1.179	-0.2036	Yes
171	SYNPR	1423640_at 1444331_at	21840	-1.662	-0.1660	Yes
172	STX12	1435982_at 1448936_at	21869	-1.777	-0.1211	Yes
173	NSF	1422455_s_at 1422456_at 1430409_at 1457205_at	21897	-2.139	-0.0667	Yes
174	H3F3B	1420376_a_at 1430357_at 1455725_a_at	21913	-2.628	0.0010	Yes