Details for gene set V$E2F

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	BT_ATM_minus
GeneSet	V$E2F_03
Enrichment Score (ES)	0.5655975
Normalized Enrichment Score (NES)	1.6263415
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.28537405
FWER p-Value	0.58

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	NUTF2	1434367_s_at 1447440_at 1449017_at	1	5.678	0.0886	Yes
2	FBXL20	1442464_at 1445575_at 1452826_s_at 1456378_s_at	26	3.426	0.1410	Yes
3	ANP32E	1420592_a_at 1447680_at	32	3.091	0.1890	Yes
4	WHSC1L1	1442085_at 1447931_at 1455668_at 1457630_at 1457793_a_at 1457794_at 1459907_a_at	49	2.748	0.2312	Yes
5	DLST	1423710_at 1430161_at 1431011_at 1437775_at	110	2.162	0.2622	Yes
6	CBX5	1421932_at 1421933_at 1421934_at 1450416_at 1454636_at 1459845_at	141	1.949	0.2912	Yes
7	DPYSL2	1433770_at 1450502_at 1458188_at 1458632_at	146	1.935	0.3213	Yes
8	SUV39H1	1427382_a_at 1432227_at 1432236_a_at	204	1.726	0.3456	Yes
9	STAG1	1421939_a_at 1421940_at 1431921_a_at 1434189_at 1435731_x_at 1445145_at 1445652_at 1450420_at	210	1.684	0.3716	Yes
10	TOP1	1423474_at 1438495_at 1457573_at 1459672_at	215	1.670	0.3975	Yes
11	SF4	1424381_at 1444699_at	239	1.611	0.4216	Yes
12	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	368	1.284	0.4358	Yes
13	NUP153	1441689_at 1441733_s_at 1452176_at	392	1.232	0.4540	Yes
14	RFC1	1418342_at 1449050_at 1451920_a_at	436	1.145	0.4699	Yes
15	GRIA4	1421351_at 1435722_at 1436772_at 1440891_at 1443285_at 1458230_at 1460097_at	503	1.006	0.4825	Yes
16	TCP1	1442317_at 1448122_at	622	0.836	0.4902	Yes
17	EIF4G2	1415863_at 1452758_s_at	696	0.753	0.4986	Yes
18	PLK4	1419838_s_at 1426580_at 1452115_a_at	700	0.747	0.5101	Yes
19	FBXO5	1429499_at	768	0.683	0.5177	Yes
20	OSBPL7	1428893_at 1459966_at	925	0.577	0.5195	Yes
21	CENPB	1426051_a_at 1435944_s_at	956	0.563	0.5269	Yes
22	H2AFZ	1441370_at	992	0.541	0.5338	Yes
23	HRBL	1425362_at 1437642_at 1441347_at	1031	0.521	0.5402	Yes
24	STAG2	1421849_at 1450396_at	1081	0.498	0.5457	Yes
25	EIF2S1	1440272_at 1452662_a_at	1087	0.495	0.5532	Yes
26	KNTC1	1435575_at	1115	0.486	0.5595	Yes
27	TOPBP1	1452241_at 1458480_at	1345	0.396	0.5552	Yes
28	PRIM1	1418369_at 1444544_at 1449061_a_at	1460	0.362	0.5556	Yes
29	KCND2	1422834_at 1422835_at 1446065_at 1447764_at 1450773_at 1459288_at	1490	0.355	0.5598	Yes
30	HNRPD	1425142_a_at 1446083_at	1547	0.345	0.5626	Yes
31	ARHGEF17	1419938_s_at 1419939_at 1433682_at 1442357_at 1447441_at	1805	0.293	0.5554	Yes
32	PRKDC	1451576_at	1820	0.291	0.5593	Yes
33	ORC1L	1422663_at 1443172_at	1929	0.271	0.5585	Yes
34	JPH1	1421520_at 1438428_at	1950	0.268	0.5618	Yes
35	MCM6	1416251_at 1438852_x_at 1447756_x_at	1959	0.267	0.5656	Yes
36	NASP	1416042_s_at 1416043_at 1440328_at 1442728_at	2058	0.252	0.5650	No
37	MCM7	1416030_a_at 1416031_s_at 1438320_s_at	2508	0.201	0.5475	No
38	DLL4	1421826_at 1421827_at	3144	0.153	0.5207	No
39	BRMS1L	1452850_s_at 1460443_at	3522	0.135	0.5055	No
40	DCK	1428838_a_at 1439012_a_at 1449176_a_at	4097	0.112	0.4809	No
41	MCM4	1416214_at 1436708_x_at	4469	0.100	0.4654	No
42	MXD3	1422970_at 1438847_at 1448878_at	4550	0.098	0.4633	No
43	MCM3	1420029_at 1426653_at	4751	0.093	0.4555	No
44	PIM1	1423006_at 1435458_at	4778	0.092	0.4558	No
45	RPA2	1416433_at 1454011_a_at	4839	0.091	0.4545	No
46	APRIN	1435242_at 1436161_at 1441553_at	4865	0.090	0.4547	No
47	SLC16A2	1418446_at	4884	0.090	0.4553	No
48	AXUD1	1434350_at	4890	0.090	0.4565	No
49	DMC1	1420335_at 1449819_at	4926	0.089	0.4562	No
50	A2BP1	1418314_a_at 1438217_at 1447735_x_at 1455358_at 1456921_at	5187	0.083	0.4456	No
51	CCNT2	1427088_at 1427089_at 1435445_at 1452297_at 1453399_at 1457439_at	5344	0.079	0.4397	No
52	POLD1	1448187_at 1456055_x_at	5519	0.076	0.4328	No
53	E2F1	1417878_at 1431875_a_at 1447840_x_at	5785	0.070	0.4218	No
54	ZIC3	1423424_at 1438737_at	5867	0.068	0.4191	No
55	CTCF	1418330_at 1449042_at	5882	0.068	0.4195	No
56	NRIP3	1418104_at 1431597_a_at 1448954_at	5937	0.067	0.4181	No
57	PODN	1435180_at	5939	0.067	0.4191	No
58	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	5961	0.067	0.4192	No
59	MCM2	1434079_s_at 1448777_at	5983	0.066	0.4192	No
60	PDGFRA	1421916_at 1421917_at 1438946_at	6042	0.065	0.4176	No
61	LGALS1	1419573_a_at 1455439_a_at	6151	0.063	0.4136	No
62	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	6517	0.057	0.3977	No
63	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	6657	0.054	0.3922	No
64	BMP7	1418910_at 1432410_a_at	6752	0.052	0.3887	No
65	AP4M1	1418846_at	6784	0.052	0.3881	No
66	SLBP	1430058_at 1460168_at	7117	0.046	0.3736	No
67	PCSK1	1421396_at	7127	0.046	0.3739	No
68	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	7277	0.043	0.3677	No
69	UNG	1425753_a_at	7458	0.041	0.3601	No
70	RCOR2	1417302_at	7486	0.040	0.3594	No
71	RHD	1417049_at	7879	0.034	0.3420	No
72	ADAMTS2	1435990_at 1455720_at 1457058_at	8419	0.027	0.3176	No
73	SFRS2	1415807_s_at 1427504_s_at 1427816_at 1452439_s_at	8726	0.022	0.3039	No
74	KCTD15	1435339_at	8838	0.021	0.2991	No
75	CTDSP1	1452055_at	9338	0.014	0.2764	No
76	RPL28	1416074_a_at	9341	0.014	0.2766	No
77	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	9520	0.012	0.2686	No
78	SEZ6	1420885_a_at 1427674_a_at 1459972_x_at	9671	0.010	0.2618	No
79	TREX2	1449367_at	9846	0.008	0.2540	No
80	LUC7L2	1423251_at 1427087_at 1436165_at 1436766_at 1436767_at 1437761_at 1458423_at	9988	0.006	0.2476	No
81	REPS2	1435389_at 1446652_at	10044	0.005	0.2451	No
82	NR4A2	1447863_s_at 1450749_a_at 1450750_a_at 1455034_at	10054	0.005	0.2448	No
83	PKMYT1	1418481_at 1438601_at	10064	0.004	0.2444	No
84	PTMA	1423455_at	10147	0.003	0.2407	No
85	STMN1	1415849_s_at	10236	0.002	0.2367	No
86	PPM1D	1434142_at 1449092_at 1459069_at	10593	-0.002	0.2204	No
87	SLITRK3	1439250_at	11020	-0.008	0.2009	No
88	IPO7	1442511_at 1454955_at 1458165_at	11201	-0.010	0.1928	No
89	MELK	1416558_at	11206	-0.011	0.1928	No
90	ASXL2	1439063_at 1444754_at 1453295_at 1458366_at 1460597_at	11344	-0.012	0.1867	No
91	SLC25A11	1426586_at	11457	-0.014	0.1818	No
92	SEMA5A	1422167_at 1434776_at 1437422_at 1446772_at 1446865_at 1446910_at 1459109_at	11478	-0.014	0.1811	No
93	PCSK4	1425824_a_at	11524	-0.015	0.1792	No
94	CASP8AP2	1449217_at	11526	-0.015	0.1794	No
95	MAZ	1427099_at	11563	-0.015	0.1780	No
96	SFRS1	1428099_a_at 1428100_at 1430982_at 1434972_x_at 1452430_s_at 1453722_s_at 1457136_at	11574	-0.015	0.1778	No
97	SALL1	1450489_at	12002	-0.020	0.1585	No
98	UXT	1418986_a_at	12125	-0.022	0.1532	No
99	CACNA1G	1423365_at	12159	-0.023	0.1520	No
100	ATE1	1420036_at 1420651_at 1420652_at 1435173_at 1446611_at 1449709_s_at	12291	-0.025	0.1464	No
101	FANCG	1420960_at	12323	-0.025	0.1454	No
102	TBX3	1437479_x_at 1439567_at 1444594_at 1445757_at 1448029_at	12492	-0.027	0.1381	No
103	HMGN2	1433507_a_at	12840	-0.032	0.1226	No
104	DNAJC9	1426473_at	12937	-0.033	0.1187	No
105	GLRA3	1450239_at	12948	-0.033	0.1188	No
106	EPHB1	1455188_at	13030	-0.034	0.1156	No
107	ANP32A	1421918_at 1434555_at 1450407_a_at	13315	-0.038	0.1032	No
108	RAD51	1418281_at	13394	-0.040	0.1002	No
109	EGLN2	1416533_at	13399	-0.040	0.1006	No
110	NR6A1	1421515_at 1421516_at 1428825_at 1428826_at 1445872_at	13465	-0.041	0.0983	No
111	ATAD2	1436174_at 1443146_at 1443229_at	13783	-0.046	0.0844	No
112	NHLRC2	1429145_at 1433929_at 1444863_at 1453048_at 1457312_at	13837	-0.046	0.0827	No
113	DNAJC11	1433880_at 1433881_at 1439763_at 1446686_at 1447055_at	14155	-0.051	0.0689	No
114	RPS20	1456373_x_at 1456436_x_at	14425	-0.056	0.0575	No
115	DAXX	1419026_at	14604	-0.059	0.0502	No
116	PEG3	1417355_at 1417356_at 1433924_at 1447731_at 1447732_x_at	14677	-0.060	0.0478	No
117	RPS6KA5	1431050_at 1437625_at 1439004_at 1440343_at	14877	-0.063	0.0397	No
118	ARID4A	1436191_at 1438464_at 1456420_at	14958	-0.064	0.0370	No
119	RAB11B	1423448_at	14993	-0.065	0.0364	No
120	PRKCSH	1416339_a_at	15124	-0.067	0.0315	No
121	EVI1	1423011_at 1438325_at	15439	-0.073	0.0182	No
122	PAQR4	1423101_at	15521	-0.074	0.0156	No
123	LIG1	1416641_at	15681	-0.077	0.0095	No
124	PLAGL1	1426208_x_at 1438588_at 1450533_a_at	15943	-0.082	-0.0012	No
125	AUTS2	1427293_a_at 1438680_at 1441869_x_at 1442360_at 1443062_at 1443070_at 1443770_x_at 1444069_at 1445307_at 1445469_at 1445538_at 1446849_at 1452379_at 1457139_at 1458592_at 1459338_at	15982	-0.082	-0.0016	No
126	DCLRE1A	1417904_at 1432097_a_at 1442329_at	16731	-0.098	-0.0345	No
127	MRPL18	1448373_at	16836	-0.101	-0.0377	No
128	CDC6	1417019_a_at	16864	-0.101	-0.0373	No
129	ANKHD1	1419867_a_at 1436597_at 1440754_at 1441597_at 1442641_at 1448008_at 1453023_at 1455759_a_at	17027	-0.106	-0.0431	No
130	KCNA6	1421568_at 1441049_at 1456954_at	17043	-0.106	-0.0422	No
131	KLF5	1430255_at 1451021_a_at 1451739_at	17128	-0.108	-0.0443	No
132	KLHDC3	1415991_a_at 1448164_at 1454747_a_at 1455910_at	17228	-0.111	-0.0472	No
133	RANBP1	1422547_at	17317	-0.113	-0.0494	No
134	ZIM2	1432297_at	17376	-0.115	-0.0503	No
135	ING3	1422805_a_at 1422806_x_at 1450760_a_at 1460082_at	17618	-0.121	-0.0595	No
136	HNRPA0	1428407_at	17657	-0.123	-0.0593	No
137	DNMT1	1422946_a_at 1435122_x_at 1445637_at 1447877_x_at	17935	-0.131	-0.0700	No
138	CDC45L	1416575_at 1457838_at	18091	-0.136	-0.0750	No
139	RET	1421359_at	18244	-0.140	-0.0798	No
140	UFD1L	1418087_at 1432367_a_at	18298	-0.142	-0.0800	No
141	E2F7	1437187_at	18552	-0.151	-0.0893	No
142	HNRPA1	1423531_a_at 1430020_x_at 1436549_a_at 1442758_at 1446038_at 1455305_x_at 1455740_at	18647	-0.154	-0.0912	No
143	FMO4	1425799_at 1444852_at	18827	-0.162	-0.0969	No
144	GMNN	1417506_at	18961	-0.168	-0.1004	No
145	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	19002	-0.170	-0.0996	No
146	PVRL1	1438111_at 1438421_at 1440131_at 1446488_at 1450819_at	19290	-0.184	-0.1099	No
147	DDB2	1425706_a_at 1436680_s_at	19294	-0.185	-0.1071	No
148	ARF3	1421789_s_at 1423973_a_at 1434787_at 1437331_a_at 1456007_at	19307	-0.185	-0.1048	No
149	TLE3	1419654_at 1419655_at 1449554_at 1458512_at	19661	-0.208	-0.1178	No
150	AK2	1448450_at 1448451_at	19729	-0.213	-0.1175	No
151	RNF121	1426503_a_at 1426504_a_at	19740	-0.214	-0.1146	No
152	PRPS1	1416052_at	19805	-0.218	-0.1142	No
153	PPRC1	1426381_at	19981	-0.234	-0.1186	No
154	USP52	1426700_a_at	20034	-0.240	-0.1172	No
155	RBL1	1424156_at 1425166_at 1432604_at 1454293_at	20053	-0.241	-0.1143	No
156	ATP6V1D	1416951_a_at 1416952_at 1438993_a_at	20058	-0.242	-0.1107	No
157	RBBP4	1434892_x_at 1442443_at 1454791_a_at 1454875_a_at 1456260_at	20283	-0.268	-0.1168	No
158	MYC	1424942_a_at	20287	-0.268	-0.1128	No
159	HTF9C	1434244_x_at 1441920_x_at 1448114_a_at 1448115_at 1453995_a_at 1457620_at	20311	-0.271	-0.1096	No
160	FUS	1451285_at 1451286_s_at 1455831_at 1458801_at	20535	-0.301	-0.1151	No
161	CDCA7	1428069_at 1445681_at	20603	-0.313	-0.1133	No
162	ID3	1416630_at	20719	-0.332	-0.1134	No
163	E2F3	1427462_at 1434564_at	20809	-0.350	-0.1121	No
164	EZH2	1416544_at 1444263_at	20951	-0.389	-0.1125	No
165	FKBP5	1416125_at 1447736_at 1448231_at 1458089_at	21223	-0.495	-0.1172	No
166	ZCCHC8	1423755_at 1441639_at	21242	-0.509	-0.1101	No
167	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	21554	-0.797	-0.1119	No
168	POLA2	1425794_at 1448369_at 1456713_at	21701	-1.119	-0.1011	No
169	TIAM1	1418057_at 1444373_at 1453887_a_at	21816	-1.590	-0.0816	No
170	PHF15	1430081_at 1455345_at	21828	-1.631	-0.0566	No
171	VAMP3	1421102_a_at 1433693_x_at 1433916_at 1437708_x_at 1456245_x_at 1457391_at	21833	-1.639	-0.0312	No
172	CDC25A	1417131_at 1417132_at 1445995_at	21900	-2.292	0.0016	No