Details for gene set V$AP2REP

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	BT_ATM_minus
GeneSet	V$AP2REP_01
Enrichment Score (ES)	0.56877124
Normalized Enrichment Score (NES)	1.5885133
Nominal p-value	0.007102273
FDR q-value	0.21883552
FWER p-Value	0.796

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PHC2	1416048_at 1437239_x_at 1439639_at	31	3.111	0.0878	Yes
2	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	38	2.981	0.1730	Yes
3	LTBP3	1418049_at 1437833_at 1438312_s_at 1456189_x_at	82	2.475	0.2419	Yes
4	PDE10A	1419389_at 1419390_at 1432490_a_at 1439618_at 1458499_at	86	2.456	0.3122	Yes
5	PHYHIPL	1427023_at 1437062_s_at	114	2.135	0.3722	Yes
6	CBLL1	1421122_at 1437203_at 1458261_at	169	1.848	0.4227	Yes
7	ARL6IP2	1416793_at 1416794_at 1431197_at 1435594_at	339	1.360	0.4539	Yes
8	YWHAG	1420816_at 1420817_at 1450012_x_at 1459693_x_at	534	0.952	0.4723	Yes
9	BRD4	1424922_a_at 1440078_at 1450711_at 1451870_a_at 1458708_at	543	0.942	0.4989	Yes
10	BCL2L11	1426334_a_at 1435448_at 1435449_at 1456005_a_at 1456006_at 1459794_at	978	0.550	0.4948	Yes
11	CALM3	1426710_at 1438825_at 1438826_x_at 1450864_at	998	0.538	0.5094	Yes
12	CYR61	1416039_x_at 1417848_at 1417849_at 1438133_a_at 1442340_x_at 1457823_at 1459462_at	1090	0.494	0.5194	Yes
13	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	1092	0.494	0.5335	Yes
14	PANK1	1418715_at 1429813_at 1429814_at 1431028_a_at 1457110_at	1300	0.411	0.5358	Yes
15	TNPO1	1433585_at 1447034_at 1455043_at	1419	0.372	0.5410	Yes
16	RAP2C	1428119_a_at 1437016_x_at 1460430_at	1511	0.351	0.5469	Yes
17	MYO1C	1419648_at 1419649_s_at 1449550_at 1449551_at	1599	0.331	0.5524	Yes
18	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	1607	0.330	0.5615	Yes
19	DDIT4L	1439332_at 1444139_at 1451751_at	1836	0.287	0.5593	Yes
20	JPH1	1421520_at 1438428_at	1950	0.268	0.5618	Yes
21	COBL	1434917_at 1442076_at	1987	0.262	0.5677	Yes
22	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	2125	0.245	0.5684	Yes
23	PPOX	1416618_at 1441862_at 1448065_at	2261	0.228	0.5688	Yes
24	UBE2E2	1424358_at 1447025_at	2479	0.204	0.5647	No
25	SERPINF1	1416168_at 1453724_a_at	2646	0.187	0.5624	No
26	SERPINB2	1419082_at	2677	0.185	0.5663	No
27	SMARCA5	1440048_at	2940	0.165	0.5591	No
28	NUDT11	1426887_at	3054	0.158	0.5584	No
29	IRX4	1419539_at	3091	0.156	0.5612	No
30	CALD1	1424768_at 1424769_s_at 1424770_at 1433146_at 1433147_at 1458057_at	3109	0.155	0.5649	No
31	RORA	1420583_a_at 1424034_at 1424035_at 1436325_at 1436326_at 1441085_at 1443511_at 1443647_at 1446360_at 1455165_at 1457177_at 1458129_at	3298	0.145	0.5604	No
32	RHOJ	1418892_at 1444982_at	3405	0.140	0.5595	No
33	PUM1	1423117_at 1456054_a_at 1460325_at	3602	0.131	0.5543	No
34	NFKBIE	1431843_a_at 1458299_s_at	3857	0.121	0.5461	No
35	CYB561D1	1431021_at 1434226_at 1459837_at	4318	0.105	0.5280	No
36	GRIN2A	1421616_at	4539	0.099	0.5208	No
37	BHLHB5	1418271_at	4720	0.094	0.5152	No
38	CYP8B1	1449309_at	5119	0.084	0.4994	No
39	YBX2	1420762_a_at	5124	0.084	0.5016	No
40	IL3	1450566_at	5351	0.079	0.4935	No
41	SCAMP5	1450247_a_at 1451224_at	5641	0.073	0.4824	No
42	ITSN2	1423184_at 1431772_a_at 1435023_at 1445375_at 1446595_at 1446735_at 1446911_at	5826	0.069	0.4759	No
43	DYRK1B	1422254_a_at	5834	0.069	0.4776	No
44	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	5961	0.067	0.4737	No
45	PAK6	1445475_at 1455200_at	6007	0.066	0.4735	No
46	PIK3R3	1445097_at 1447068_at 1456482_at	6062	0.065	0.4729	No
47	FXYD6	1417343_at	6295	0.060	0.4640	No
48	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	6517	0.057	0.4555	No
49	GNB2	1450623_at	6760	0.052	0.4459	No
50	BMP1	1426238_at 1427457_a_at 1427458_at 1446007_at	7016	0.048	0.4356	No
51	MYOZ1	1448636_at 1460202_at	7109	0.046	0.4327	No
52	DAAM1	1431035_at 1455244_at 1458662_at	7310	0.043	0.4248	No
53	EBF2	1418494_at 1446128_at 1449101_at 1449102_at	7485	0.040	0.4179	No
54	PDYN	1416266_at	7505	0.040	0.4182	No
55	CHRM1	1439611_at 1450833_at	7689	0.037	0.4109	No
56	PARD6A	1449100_at	7941	0.034	0.4004	No
57	WDTC1	1434560_at	8000	0.033	0.3986	No
58	SLC6A5	1425992_at	8118	0.031	0.3942	No
59	ADNP	1423069_at	8145	0.031	0.3939	No
60	HOXC6	1427361_at 1427362_x_at 1427454_at	8436	0.026	0.3813	No
61	EFNA5	1421796_a_at 1436866_at 1440052_at 1446383_at 1451930_at	8500	0.026	0.3792	No
62	NOSTRIN	1441075_at	8555	0.025	0.3774	No
63	NKX3-1	1449998_at	8615	0.024	0.3754	No
64	IRAK1	1448668_a_at 1460649_at	8664	0.023	0.3739	No
65	EPHA1	1422917_at 1432399_a_at 1432400_at	8879	0.020	0.3646	No
66	MRVI1	1422245_a_at 1459665_s_at	9005	0.019	0.3594	No
67	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	9520	0.012	0.3362	No
68	ZDHHC15	1442274_at	9621	0.011	0.3319	No
69	NUDT10	1435061_at	9669	0.010	0.3301	No
70	EYA4	1432461_at 1442542_at 1445809_at 1456647_a_at 1456665_at	9985	0.006	0.3158	No
71	PTMA	1423455_at	10147	0.003	0.3085	No
72	ARID1A	1447104_at	10550	-0.002	0.2901	No
73	PDZRN4	1456512_at	10551	-0.002	0.2902	No
74	GRIN3A	1436575_at 1438866_at 1458378_at	10563	-0.002	0.2897	No
75	ATP2B2	1420402_at 1420403_at 1433888_at	10615	-0.003	0.2874	No
76	CD3D	1422828_at	11092	-0.009	0.2659	No
77	PCSK6	1426981_at	11200	-0.010	0.2613	No
78	GNG3	1417428_at	12022	-0.021	0.2242	No
79	EED	1448653_at	12440	-0.026	0.2059	No
80	ATP5H	1423676_at 1435112_a_at	12509	-0.027	0.2035	No
81	CD3G	1419178_at	12544	-0.028	0.2028	No
82	WNT4	1450782_at	12549	-0.028	0.2034	No
83	NLGN3	1456384_at	12703	-0.030	0.1972	No
84	COL16A1	1427986_a_at	12772	-0.031	0.1950	No
85	NRG1	1456524_at	13345	-0.039	0.1699	No
86	TRPM3	1439026_at 1441966_at 1443723_at 1445555_at 1456633_at 1456923_at 1457927_at	13595	-0.043	0.1597	No
87	IGFALS	1422826_at	13720	-0.044	0.1553	No
88	MAPT	1417885_at 1424718_at 1424719_a_at 1445634_at 1455028_at	14093	-0.050	0.1397	No
89	TACSTD2	1423323_at	14163	-0.051	0.1380	No
90	FHIT	1425893_a_at	14327	-0.054	0.1320	No
91	CLPTM1	1416883_at	14359	-0.055	0.1322	No
92	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	15047	-0.066	0.1026	No
93	POLR2A	1422311_a_at 1426242_at 1458710_at	15394	-0.072	0.0888	No
94	ECH1	1448491_at	15401	-0.072	0.0906	No
95	NHLH2	1436888_at	15601	-0.075	0.0836	No
96	JMJD1C	1426900_at 1439998_at 1441592_at 1448049_at 1458521_at	15770	-0.078	0.0781	No
97	PHF12	1434922_at 1453579_at	15961	-0.082	0.0718	No
98	ADAMTS4	1452595_at	16226	-0.087	0.0621	No
99	LCAT	1417043_at	16371	-0.090	0.0581	No
100	JPH2	1421453_at 1455404_at	16632	-0.096	0.0490	No
101	GMPPB	1439030_at	16776	-0.099	0.0453	No
102	NEFL	1426255_at	16906	-0.102	0.0423	No
103	BSCL2	1420632_a_at 1437345_a_at	16931	-0.103	0.0441	No
104	PTGDS	1423859_a_at 1423860_at	16951	-0.103	0.0462	No
105	MPO	1415960_at	17124	-0.108	0.0414	No
106	TNPO2	1425592_at 1425593_at 1437283_at	18101	-0.136	0.0006	No
107	SCAMP3	1416294_at	18109	-0.136	0.0042	No
108	CPNE1	1433439_at	18111	-0.136	0.0080	No
109	SMURF2	1429045_at 1429046_at 1454894_at	18189	-0.139	0.0085	No
110	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	18413	-0.146	0.0024	No
111	RHOG	1422572_at	18414	-0.146	0.0066	No
112	PBX1	1430183_at 1440037_at 1440954_at 1442846_at 1449542_at 1458853_at	18587	-0.152	0.0031	No
113	TNKS1BP1	1427051_at	18603	-0.153	0.0068	No
114	UBE2H	1418631_at 1418632_at 1428791_at 1438971_x_at 1447374_at 1459930_at	18707	-0.157	0.0066	No
115	AMFR	1450102_a_at	19966	-0.232	-0.0444	No
116	PCBP4	1433658_x_at 1449054_a_at 1449055_x_at	20040	-0.240	-0.0409	No
117	CACNB3	1448656_at	20112	-0.249	-0.0370	No
118	GATA1	1449232_at	20523	-0.299	-0.0472	No
119	BTBD9	1431230_a_at 1434769_at 1435706_at 1440548_at 1444827_at 1445220_at 1458043_at	20534	-0.301	-0.0391	No
120	ZBTB4	1429722_at 1460488_at	21116	-0.450	-0.0528	No
121	ZHX2	1455210_at	21117	-0.450	-0.0399	No
122	MSN	1421814_at 1450379_at	21392	-0.627	-0.0345	No
123	ACVR1	1416786_at 1416787_at 1448460_at 1457551_at	21409	-0.646	-0.0167	No
124	VIM	1438118_x_at 1450641_at 1456292_a_at	21782	-1.421	0.0070	No