Details for gene set V$AP1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls #ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls #ATM_minus_versus_BT_ATM_minus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls#ATM_minus_versus_BT_ATM_minus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$AP1_Q6
Enrichment Score (ES)	0.35851637
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2852312
Nominal p-value	0.02631579
FDR q-value	0.48778126
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PTP4A1	1419024_at 1455002_at	77	3.262	0.0251	Yes
2	RTN4	1421116_a_at 1435284_at 1437224_at 1439650_at 1442760_x_at 1452649_at	107	2.957	0.0496	Yes
3	SPARC	1416589_at 1448392_at 1458204_at	146	2.707	0.0716	Yes
4	VIM	1438118_x_at 1450641_at 1456292_a_at	204	2.394	0.0900	Yes
5	SCRN1	1428717_at 1428718_at	208	2.374	0.1107	Yes
6	UBQLN1	1419385_a_at 1424368_s_at 1450345_at	358	1.894	0.1204	Yes
7	TCF12	1421908_a_at 1427670_a_at 1438762_at 1439209_at 1439619_at 1443012_at 1444620_at 1445093_at 1445133_at 1457524_at 1458337_at	361	1.881	0.1368	Yes
8	GTF2B	1438066_at 1451135_at	362	1.878	0.1533	Yes
9	ELA1	1423693_at	385	1.843	0.1684	Yes
10	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	400	1.816	0.1837	Yes
11	ECM1	1448613_at	405	1.807	0.1994	Yes
12	PAPPA	1427633_a_at 1432591_at 1432592_at 1459375_at	412	1.793	0.2148	Yes
13	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	430	1.763	0.2295	Yes
14	TRIB1	1424880_at 1424881_at	462	1.717	0.2431	Yes
15	PSMD12	1448492_a_at	475	1.704	0.2575	Yes
16	SPATS2	1460677_at	625	1.510	0.2639	Yes
17	PDGFRB	1417148_at 1436970_a_at	661	1.481	0.2752	Yes
18	RBBP7	1415775_at 1456227_x_at	690	1.450	0.2867	Yes
19	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	796	1.349	0.2937	Yes
20	PDAP1	1434019_at 1434020_at	811	1.334	0.3047	Yes
21	DSTN	1417124_at	837	1.304	0.3150	Yes
22	XLKD1	1429379_at 1453128_at	946	1.217	0.3207	Yes
23	ETV5	1420998_at 1428142_at 1450082_s_at	973	1.197	0.3300	Yes
24	MARK1	1419834_x_at 1425509_at 1425510_at 1425511_at 1449630_s_at	1019	1.169	0.3382	Yes
25	PSMD11	1429370_a_at 1432726_at 1456059_at 1456104_at	1058	1.143	0.3465	Yes
26	NEFH	1424847_at	1409	0.937	0.3386	Yes
27	AKT1S1	1428158_at 1437736_at 1452684_at	1487	0.901	0.3429	Yes
28	WNT6	1419708_at 1435980_x_at	1584	0.860	0.3460	Yes
29	LRRFIP2	1436378_at 1436510_a_at	1631	0.845	0.3513	Yes
30	TAGLN2	1426529_a_at	1671	0.832	0.3568	Yes
31	BLMH	1438961_s_at 1439325_at 1452101_at	1827	0.766	0.3564	Yes
32	COL27A1	1429549_at 1453191_at	1979	0.721	0.3558	Yes
33	SLC35E4	1434167_at 1436693_x_at 1439118_at	2092	0.685	0.3567	Yes
34	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	2179	0.663	0.3585	Yes
35	ALDOA	1416921_x_at 1433604_x_at 1434799_x_at	2655	0.543	0.3414	No
36	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	2802	0.519	0.3393	No
37	ENO1	1419023_x_at	3198	0.457	0.3251	No
38	SHC3	1450326_at	3286	0.443	0.3250	No
39	NDRG2	1448154_at	3349	0.435	0.3259	No
40	SLC16A6	1417884_at	3618	0.401	0.3171	No
41	SFN	1448612_at	3644	0.399	0.3195	No
42	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	3799	0.382	0.3157	No
43	APBA2BP	1431946_a_at 1447907_x_at	3956	0.368	0.3118	No
44	NFATC4	1423380_s_at 1432821_at 1454369_a_at	4000	0.365	0.3130	No
45	ABHD2	1418661_at 1440447_at	4095	0.357	0.3118	No
46	RGS8	1453060_at	4281	0.340	0.3063	No
47	EEF1A2	1418062_at	4622	0.315	0.2934	No
48	HOXD3	1421537_at 1437664_at	4723	0.308	0.2915	No
49	TGFBR2	1422019_at 1425444_a_at 1426397_at 1443115_at 1458607_at	4959	0.294	0.2833	No
50	LAMC2	1421279_at 1452505_at	5213	0.278	0.2741	No
51	ABHD4	1416315_at 1439259_x_at	5238	0.276	0.2754	No
52	OMG	1418212_at	5285	0.273	0.2757	No
53	GJB3	1416715_at	5394	0.266	0.2730	No
54	VDR	1418175_at 1418176_at	5440	0.263	0.2733	No
55	SMARCA2	1430526_a_at 1439930_at 1452333_at	5737	0.245	0.2618	No
56	LPP	1425673_at 1436714_at 1437235_x_at 1438271_at 1440167_s_at 1454899_at 1455314_at	5876	0.236	0.2575	No
57	PKN3	1434525_at	5967	0.231	0.2554	No
58	ADORA2A	1427519_at 1460710_at	5975	0.231	0.2571	No
59	PRDM1	1420425_at 1444997_at	6009	0.229	0.2576	No
60	RAB30	1426452_a_at	6043	0.227	0.2581	No
61	FGF12	1440270_at 1451693_a_at 1460137_at	6093	0.225	0.2578	No
62	NEK6	1451043_at	6236	0.218	0.2532	No
63	MCART1	1433816_at 1454712_at	6494	0.205	0.2432	No
64	IL9	1450565_at	6539	0.203	0.2429	No
65	UCN2	1450607_s_at	6601	0.200	0.2419	No
66	FLNC	1424063_at 1447812_x_at 1449073_at	6650	0.198	0.2414	No
67	GGN	1445278_at	6730	0.193	0.2394	No
68	APOBEC1	1451755_a_at	6807	0.190	0.2376	No
69	ICK	1448310_at 1454243_at 1455687_at	7057	0.180	0.2277	No
70	RIN1	1424507_at 1437460_x_at	7303	0.168	0.2179	No
71	GFAP	1426508_at 1426509_s_at 1440142_s_at	7492	0.160	0.2107	No
72	CLSTN3	1426989_at	7916	0.144	0.1925	No
73	ROM1	1448996_at	7922	0.143	0.1935	No
74	DMPK	1422989_a_at 1434944_at	7973	0.141	0.1924	No
75	IL1RN	1423017_a_at 1425663_at 1451798_at	8151	0.135	0.1855	No
76	DSCR1L1	1421425_a_at 1450243_a_at	8264	0.131	0.1815	No
77	AP2B1	1427077_a_at 1445142_at 1446566_at 1452292_at 1458971_at	8277	0.130	0.1821	No
78	RIMS1	1435667_at 1438305_at 1444393_at	8514	0.121	0.1723	No
79	LAMA3	1444860_at	8516	0.121	0.1733	No
80	WDFY3	1427456_at 1428517_at 1445718_at 1446109_at 1447433_at 1458952_at 1459287_at 1459414_at	8542	0.120	0.1732	No
81	EFNA1	1416895_at 1448510_at	8650	0.117	0.1693	No
82	FAP	1417552_at	8726	0.114	0.1669	No
83	KBTBD5	1431043_at	8858	0.109	0.1618	No
84	SYTL1	1450240_a_at	8862	0.109	0.1626	No
85	DCTN2	1424461_at	9003	0.104	0.1571	No
86	RAB3D	1418890_a_at 1418891_a_at 1449259_at 1449260_at	9080	0.101	0.1545	No
87	RBPSUH	1418114_at 1438848_at 1446436_at 1448957_at 1454896_at	9180	0.098	0.1508	No
88	CAPNS1	1426400_a_at	9202	0.097	0.1507	No
89	TUBA4	1417373_a_at 1417374_at 1417375_at	9252	0.095	0.1493	No
90	P2RXL1	1450327_at	9420	0.090	0.1424	No
91	OLR1	1419534_at	9515	0.087	0.1388	No
92	SYT2	1420418_at 1440323_at 1449866_at	9761	0.079	0.1282	No
93	TLL1	1420753_at	10242	0.063	0.1067	No
94	GPR3	1460275_at	10445	0.056	0.0979	No
95	FBXW11	1425461_at 1425462_at 1437468_x_at 1438336_at 1443010_at 1447294_at 1457485_at	10641	0.049	0.0893	No
96	USP13	1452442_at 1455473_at	10938	0.039	0.0761	No
97	HSPB8	1417013_at 1417014_at 1456434_x_at	10954	0.038	0.0757	No
98	MYBPH	1419487_at	11175	0.031	0.0659	No
99	ST18	1436793_at 1455123_at	11284	0.027	0.0611	No
100	SCEL	1422837_at 1459426_at	11466	0.021	0.0530	No
101	BMP2	1423635_at	11643	0.016	0.0451	No
102	HOXA11	1420414_at	11888	0.007	0.0339	No
103	CPA6	1440617_at	11936	0.005	0.0318	No
104	NFRKB	1434753_at 1445551_at	11938	0.005	0.0318	No
105	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	11941	0.005	0.0317	No
106	BTK	1422755_at	12029	0.002	0.0277	No
107	ELK3	1417662_at 1442986_at 1445886_at 1448797_at	12041	0.002	0.0273	No
108	VGF	1436094_at	12045	0.002	0.0271	No
109	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	12114	-0.001	0.0240	No
110	LMNA	1421654_a_at 1425472_a_at 1426868_x_at 1452212_at 1457670_s_at	12390	-0.011	0.0115	No
111	PSMD2	1415831_at	12480	-0.015	0.0075	No
112	PHLDA2	1417837_at	12649	-0.021	-0.0001	No
113	NRIP3	1418104_at 1431597_a_at 1448954_at	12753	-0.024	-0.0046	No
114	S100A5	1449927_at	12768	-0.025	-0.0050	No
115	GNAI1	1427510_at 1434440_at 1454959_s_at	12771	-0.025	-0.0049	No
116	AK5	1426339_at 1457032_at	12838	-0.028	-0.0077	No
117	SNCB	1418053_at	12878	-0.029	-0.0092	No
118	NR1D1	1421802_at 1426464_at	12975	-0.033	-0.0133	No
119	LAPTM5	1426025_s_at 1436905_x_at 1447742_at 1459841_x_at	13077	-0.036	-0.0177	No
120	GAB2	1419829_a_at 1420785_at 1439786_at 1446860_at	13126	-0.038	-0.0195	No
121	CRYBA2	1419011_at	13617	-0.057	-0.0416	No
122	MMP7	1449478_at	13809	-0.065	-0.0498	No
123	MDFI	1420713_a_at 1425924_at	13869	-0.067	-0.0519	No
124	ABCA2	1449302_at	13911	-0.069	-0.0532	No
125	PLCD1	1416675_s_at 1448432_at	14205	-0.082	-0.0660	No
126	IGSF9	1420518_a_at 1441420_at	14228	-0.082	-0.0663	No
127	STX17	1427924_at 1427925_at 1428917_at 1431929_a_at	14317	-0.086	-0.0696	No
128	FHL3	1420779_at	14401	-0.090	-0.0726	No
129	NR0B2	1449854_at	14658	-0.102	-0.0835	No
130	IBRDC2	1425282_at 1439153_at 1443252_at 1456834_at	14680	-0.103	-0.0835	No
131	IL23A	1419529_at	14766	-0.106	-0.0865	No
132	GPX1	1460671_at	15297	-0.131	-0.1097	No
133	CASK	1422518_at 1422519_at 1427692_a_at 1445152_at	15564	-0.145	-0.1207	No
134	SCOC	1416267_at 1430999_a_at	15671	-0.151	-0.1242	No
135	MAP1A	1460566_at	15679	-0.152	-0.1232	No
136	CYFIP1	1416329_at 1445327_at 1457134_at 1457615_at	15708	-0.154	-0.1232	No
137	AXIN2	1421341_at 1436845_at	15774	-0.157	-0.1248	No
138	ATP1B1	1418453_a_at 1423890_x_at 1439036_a_at 1451152_a_at 1455949_at	15917	-0.165	-0.1299	No
139	PFTK1	1419249_at 1419250_a_at 1441692_at 1445984_at 1453956_a_at	16147	-0.180	-0.1388	No
140	SFTPC	1418639_at 1438290_x_at	16236	-0.185	-0.1413	No
141	HSPB7	1421289_at 1421290_at 1434927_at	16504	-0.202	-0.1518	No
142	PAK6	1445475_at 1455200_at	16562	-0.206	-0.1526	No
143	NCDN	1416852_a_at 1416853_at	16594	-0.208	-0.1522	No
144	PVALB	1417653_at	16679	-0.215	-0.1542	No
145	KBTBD10	1444494_at	16955	-0.236	-0.1648	No
146	PKP3	1418831_at 1418832_at	17159	-0.253	-0.1719	No
147	ROCK2	1423592_at 1451041_at	17379	-0.272	-0.1796	No
148	MMP9	1416298_at 1448291_at	17606	-0.294	-0.1874	No
149	DCN	1441506_at 1449368_at	17747	-0.310	-0.1911	No
150	ITPKC	1440024_at 1454755_at	17749	-0.310	-0.1884	No
151	ADCK4	1448490_at	17879	-0.325	-0.1915	No
152	PLEC1	1419835_s_at 1434610_at 1437554_at	17942	-0.333	-0.1915	No
153	KCNA2	1422197_at	18002	-0.340	-0.1912	No
154	UBE2C	1452954_at	18103	-0.351	-0.1927	No
155	UCHL3	1452402_at	18192	-0.365	-0.1936	No
156	DIRAS1	1425748_at 1451820_at 1455526_at	18285	-0.378	-0.1945	No
157	CMAS	1426662_at	18585	-0.427	-0.2045	No
158	TRIM8	1418577_at 1427593_at 1438679_at 1460237_at	18603	-0.430	-0.2015	No
159	HS3ST2	1438624_x_at 1440814_x_at 1454784_at	18611	-0.431	-0.1980	No
160	HDAC3	1426437_s_at	18679	-0.444	-0.1972	No
161	COBL	1434917_at 1442076_at	18717	-0.450	-0.1950	No
162	VAMP5	1430522_a_at	18808	-0.468	-0.1950	No
163	DTNA	1419223_a_at 1425292_at 1426066_a_at 1427588_a_at 1429768_at 1447280_at 1456069_at 1458908_at	18913	-0.490	-0.1955	No
164	EPHA2	1421151_a_at	19123	-0.533	-0.2004	No
165	GADD45A	1449519_at	19176	-0.544	-0.1981	No
166	PEA15	1416406_at 1416407_at 1459733_at	19189	-0.547	-0.1938	No
167	RB1CC1	1418968_at 1431605_at 1449292_at	19278	-0.565	-0.1929	No
168	TBC1D17	1423659_a_at	19294	-0.569	-0.1886	No
169	ABCD1	1418838_at	19319	-0.573	-0.1847	No
170	PSMD4	1418874_a_at 1425859_a_at 1451725_a_at	19461	-0.603	-0.1859	No
171	LAMC1	1423885_at 1423886_at	19527	-0.618	-0.1835	No
172	AP2A2	1432006_at 1432007_s_at 1435869_s_at 1452490_a_at 1455482_at	19545	-0.625	-0.1788	No
173	SLC26A1	1451239_a_at 1458327_x_at	19703	-0.667	-0.1802	No
174	MAPK3	1427060_at	19743	-0.679	-0.1760	No
175	ANXA7	1416137_at 1416138_at 1438764_at	19773	-0.687	-0.1713	No
176	VASP	1451097_at	19786	-0.691	-0.1658	No
177	JMJD1A	1426810_at	19946	-0.744	-0.1666	No
178	TMEM24	1428095_a_at 1457585_at	20152	-0.818	-0.1689	No
179	BAZ2A	1427209_at 1427210_at 1438192_s_at	20275	-0.870	-0.1668	No
180	RIT1	1420540_a_at 1428710_at	20359	-0.908	-0.1627	No
181	IDS	1421216_a_at 1427812_at 1427813_at 1434751_at 1450166_at 1455481_at	20652	-1.083	-0.1666	No
182	PITPNC1	1428025_s_at 1428878_a_at 1428879_at 1431074_a_at 1435066_at 1441574_at 1452939_a_at 1452940_x_at 1453750_x_at 1455204_at	20715	-1.133	-0.1596	No
183	STAT5B	1422102_a_at 1422103_a_at	20955	-1.307	-0.1591	No
184	CAMKK1	1418954_at	20965	-1.313	-0.1480	No
185	PCDH9	1439322_at 1442659_at 1444215_at 1444724_at 1445052_at 1445061_at 1457973_at	21010	-1.366	-0.1380	No
186	TRAF3	1418587_at 1444758_at 1449149_at	21100	-1.459	-0.1293	No
187	TUBA1	1418884_x_at	21112	-1.474	-0.1169	No
188	YWHAZ	1416102_at 1416103_at 1436971_x_at 1436981_a_at 1439005_x_at 1443893_at 1448218_s_at 1448219_a_at	21200	-1.573	-0.1072	No
189	PPP2CA	1417367_at 1444875_at 1456390_at	21342	-1.750	-0.0983	No
190	C3AR1	1419482_at 1419483_at 1442082_at	21398	-1.859	-0.0845	No
191	PSME4	1426823_s_at 1426824_at 1440511_at 1445147_at 1446464_at 1452211_at	21500	-2.049	-0.0712	No
192	LTBP3	1418049_at 1437833_at 1438312_s_at 1456189_x_at	21607	-2.293	-0.0560	No
193	DHRS3	1448390_a_at	21666	-2.476	-0.0369	No
194	ABI3	1446191_at 1452928_at	21745	-2.779	-0.0162	No
195	PSMD7	1432820_at 1451056_at 1454368_at	21757	-2.831	0.0081	No