Details for gene set V$AP1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls #ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls #ATM_minus_versus_BT_ATM_minus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_BT_ATM_minus.cls#ATM_minus_versus_BT_ATM_minus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$AP1_Q4
Enrichment Score (ES)	0.35232174
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2677574
Nominal p-value	0.054502368
FDR q-value	0.38813326
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	RTN4	1421116_a_at 1435284_at 1437224_at 1439650_at 1442760_x_at 1452649_at	107	2.957	0.0239	Yes
2	VIM	1438118_x_at 1450641_at 1456292_a_at	204	2.394	0.0428	Yes
3	SCRN1	1428717_at 1428718_at	208	2.374	0.0657	Yes
4	UBQLN1	1419385_a_at 1424368_s_at 1450345_at	358	1.894	0.0773	Yes
5	TCF12	1421908_a_at 1427670_a_at 1438762_at 1439209_at 1439619_at 1443012_at 1444620_at 1445093_at 1445133_at 1457524_at 1458337_at	361	1.881	0.0955	Yes
6	ELA1	1423693_at	385	1.843	0.1124	Yes
7	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	400	1.816	0.1295	Yes
8	PAPPA	1427633_a_at 1432591_at 1432592_at 1459375_at	412	1.793	0.1464	Yes
9	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	430	1.763	0.1628	Yes
10	TRIB1	1424880_at 1424881_at	462	1.717	0.1781	Yes
11	GARNL4	1434754_at	647	1.490	0.1841	Yes
12	PDGFRB	1417148_at 1436970_a_at	661	1.481	0.1980	Yes
13	BAG2	1423948_at	668	1.475	0.2121	Yes
14	RBBP7	1415775_at 1456227_x_at	690	1.450	0.2252	Yes
15	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	694	1.445	0.2391	Yes
16	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	796	1.349	0.2476	Yes
17	PDAP1	1434019_at 1434020_at	811	1.334	0.2600	Yes
18	DSTN	1417124_at	837	1.304	0.2715	Yes
19	PSMA3	1448442_a_at	862	1.286	0.2829	Yes
20	XLKD1	1429379_at 1453128_at	946	1.217	0.2910	Yes
21	ETV5	1420998_at 1428142_at 1450082_s_at	973	1.197	0.3014	Yes
22	PSMD11	1429370_a_at 1432726_at 1456059_at 1456104_at	1058	1.143	0.3087	Yes
23	ABCB6	1422524_at	1197	1.055	0.3126	Yes
24	NEFH	1424847_at	1409	0.937	0.3120	Yes
25	GPR150	1442261_at 1447485_at	1438	0.925	0.3198	Yes
26	PADI3	1419767_at	1448	0.920	0.3283	Yes
27	AKT1S1	1428158_at 1437736_at 1452684_at	1487	0.901	0.3353	Yes
28	BNIP3	1422470_at	1534	0.882	0.3418	Yes
29	LRRFIP2	1436378_at 1436510_a_at	1631	0.845	0.3456	Yes
30	TAGLN2	1426529_a_at	1671	0.832	0.3519	Yes
31	BLMH	1438961_s_at 1439325_at 1452101_at	1827	0.766	0.3523	Yes
32	COL27A1	1429549_at 1453191_at	1979	0.721	0.3523	Yes
33	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	2179	0.663	0.3496	No
34	STOML2	1448774_at	2342	0.619	0.3482	No
35	TCF7	1433471_at 1450461_at	2761	0.525	0.3341	No
36	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	2802	0.519	0.3373	No
37	IRAK1	1448668_a_at 1460649_at	3271	0.445	0.3201	No
38	SHC3	1450326_at	3286	0.443	0.3238	No
39	PDE4D	1443289_at 1458212_at 1459289_at 1459311_at	3417	0.427	0.3219	No
40	IGFBP6	1417933_at	3533	0.412	0.3207	No
41	EEF1A1	1424635_at	3567	0.407	0.3231	No
42	SLC16A6	1417884_at	3618	0.401	0.3247	No
43	SFN	1448612_at	3644	0.399	0.3274	No
44	USP3	1425022_at 1425023_at 1435531_at 1441056_at 1446886_at	3718	0.390	0.3279	No
45	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	3799	0.382	0.3279	No
46	APBA2BP	1431946_a_at 1447907_x_at	3956	0.368	0.3243	No
47	ZIC4	1421539_at 1456417_at	4089	0.358	0.3218	No
48	ABHD2	1418661_at 1440447_at	4095	0.357	0.3250	No
49	CREM	1418322_at 1430598_at 1430847_a_at 1449037_at	4236	0.344	0.3219	No
50	USP2	1417168_a_at 1417169_at	4277	0.340	0.3234	No
51	RGS8	1453060_at	4281	0.340	0.3266	No
52	CIZ1	1448779_at	4487	0.326	0.3203	No
53	EEF1A2	1418062_at	4622	0.315	0.3172	No
54	HOXD3	1421537_at 1437664_at	4723	0.308	0.3156	No
55	TGFBR2	1422019_at 1425444_a_at 1426397_at 1443115_at 1458607_at	4959	0.294	0.3077	No
56	LAMC2	1421279_at 1452505_at	5213	0.278	0.2987	No
57	RAPGEF6	1427412_s_at 1434509_at 1438828_at 1443877_a_at 1443878_at	5221	0.277	0.3011	No
58	ABHD4	1416315_at 1439259_x_at	5238	0.276	0.3030	No
59	GJB3	1416715_at	5394	0.266	0.2985	No
60	VDR	1418175_at 1418176_at	5440	0.263	0.2990	No
61	SMARCA2	1430526_a_at 1439930_at 1452333_at	5737	0.245	0.2878	No
62	LPP	1425673_at 1436714_at 1437235_x_at 1438271_at 1440167_s_at 1454899_at 1455314_at	5876	0.236	0.2837	No
63	PKN3	1434525_at	5967	0.231	0.2818	No
64	ADORA2A	1427519_at 1460710_at	5975	0.231	0.2837	No
65	PRDM1	1420425_at 1444997_at	6009	0.229	0.2845	No
66	FGF12	1440270_at 1451693_a_at 1460137_at	6093	0.225	0.2828	No
67	NEK6	1451043_at	6236	0.218	0.2784	No
68	MCART1	1433816_at 1454712_at	6494	0.205	0.2686	No
69	IL9	1450565_at	6539	0.203	0.2685	No
70	RAD23B	1424222_s_at 1450903_at 1455420_at 1456822_at	6564	0.202	0.2694	No
71	MAP2K1	1416351_at	6588	0.201	0.2703	No
72	UCN2	1450607_s_at	6601	0.200	0.2717	No
73	AKAP1	1418279_a_at 1449019_at	6725	0.193	0.2679	No
74	GGN	1445278_at	6730	0.193	0.2696	No
75	APOBEC1	1451755_a_at	6807	0.190	0.2680	No
76	IL10	1450330_at	6978	0.183	0.2619	No
77	ICK	1448310_at 1454243_at 1455687_at	7057	0.180	0.2601	No
78	RIN1	1424507_at 1437460_x_at	7303	0.168	0.2504	No
79	LAMB3	1417812_a_at	7330	0.167	0.2509	No
80	EDN1	1451924_a_at	7359	0.165	0.2512	No
81	GNGT2	1428733_at	7856	0.146	0.2298	No
82	CLSTN3	1426989_at	7916	0.144	0.2285	No
83	ROM1	1448996_at	7922	0.143	0.2296	No
84	LRP1B	1450211_at 1457235_at	8067	0.138	0.2244	No
85	IL1RN	1423017_a_at 1425663_at 1451798_at	8151	0.135	0.2219	No
86	AP2B1	1427077_a_at 1445142_at 1446566_at 1452292_at 1458971_at	8277	0.130	0.2174	No
87	WDFY3	1427456_at 1428517_at 1445718_at 1446109_at 1447433_at 1458952_at 1459287_at 1459414_at	8542	0.120	0.2064	No
88	EFNA1	1416895_at 1448510_at	8650	0.117	0.2026	No
89	FAP	1417552_at	8726	0.114	0.2003	No
90	KBTBD5	1431043_at	8858	0.109	0.1953	No
91	SYTL1	1450240_a_at	8862	0.109	0.1962	No
92	HS3ST3B1	1421331_at 1421332_at 1433977_at 1442816_at 1444055_at	8968	0.105	0.1924	No
93	DCTN2	1424461_at	9003	0.104	0.1919	No
94	CAPNS1	1426400_a_at	9202	0.097	0.1837	No
95	IL6	1450297_at	9669	0.082	0.1631	No
96	DUSP13	1450198_at	9731	0.080	0.1611	No
97	ZPBP2	1429512_at 1460503_at	9852	0.076	0.1563	No
98	LRRC15	1436055_at 1453214_at	10356	0.059	0.1337	No
99	EYA1	1421727_at 1443117_at 1457424_at	10434	0.056	0.1307	No
100	GPR3	1460275_at	10445	0.056	0.1308	No
101	FBXW11	1425461_at 1425462_at 1437468_x_at 1438336_at 1443010_at 1447294_at 1457485_at	10641	0.049	0.1223	No
102	GUP1	1424553_at	10788	0.044	0.1160	No
103	ZIC1	1423477_at 1439627_at	10933	0.039	0.1098	No
104	USP13	1452442_at 1455473_at	10938	0.039	0.1100	No
105	MYBPH	1419487_at	11175	0.031	0.0994	No
106	ST18	1436793_at 1455123_at	11284	0.027	0.0947	No
107	CMYA1	1419220_at	11475	0.021	0.0862	No
108	DTX2	1421720_a_at 1439429_x_at	11480	0.021	0.0862	No
109	BMP2	1423635_at	11643	0.016	0.0789	No
110	APOB48R	1420382_at	11684	0.014	0.0772	No
111	LIMK1	1417627_a_at 1425836_a_at 1456234_at 1458989_at	11721	0.013	0.0757	No
112	MAPRE3	1427079_at	11724	0.013	0.0757	No
113	SH3RF2	1456640_at	11868	0.008	0.0692	No
114	HOXA11	1420414_at	11888	0.007	0.0684	No
115	NFRKB	1434753_at 1445551_at	11938	0.005	0.0662	No
116	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	11941	0.005	0.0661	No
117	BTK	1422755_at	12029	0.002	0.0622	No
118	ELK3	1417662_at 1442986_at 1445886_at 1448797_at	12041	0.002	0.0617	No
119	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	12114	-0.001	0.0584	No
120	LMNA	1421654_a_at 1425472_a_at 1426868_x_at 1452212_at 1457670_s_at	12390	-0.011	0.0458	No
121	NRIP3	1418104_at 1431597_a_at 1448954_at	12753	-0.024	0.0294	No
122	S100A5	1449927_at	12768	-0.025	0.0290	No
123	GNAI1	1427510_at 1434440_at 1454959_s_at	12771	-0.025	0.0291	No
124	PAX9	1421246_at 1421247_at	12785	-0.025	0.0288	No
125	AK5	1426339_at 1457032_at	12838	-0.028	0.0267	No
126	NRAS	1422688_a_at 1454060_a_at	12913	-0.030	0.0236	No
127	LAPTM5	1426025_s_at 1436905_x_at 1447742_at 1459841_x_at	13077	-0.036	0.0164	No
128	DNM1	1427754_a_at 1456346_at 1460365_a_at	13078	-0.036	0.0168	No
129	GAB2	1419829_a_at 1420785_at 1439786_at 1446860_at	13126	-0.038	0.0150	No
130	CRYBA2	1419011_at	13617	-0.057	-0.0070	No
131	PTPRR	1426047_a_at	13628	-0.057	-0.0069	No
132	MMP7	1449478_at	13809	-0.065	-0.0146	No
133	MDFI	1420713_a_at 1425924_at	13869	-0.067	-0.0166	No
134	LIFR	1425107_a_at 1450207_at	13897	-0.068	-0.0172	No
135	CORO1C	1417752_at 1419911_at 1437721_at 1442972_at 1449660_s_at 1459169_at	14088	-0.077	-0.0252	No
136	STX17	1427924_at 1427925_at 1428917_at 1431929_a_at	14317	-0.086	-0.0348	No
137	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	14322	-0.086	-0.0342	No
138	FHL3	1420779_at	14401	-0.090	-0.0369	No
139	IBRDC2	1425282_at 1439153_at 1443252_at 1456834_at	14680	-0.103	-0.0487	No
140	IL23A	1419529_at	14766	-0.106	-0.0516	No
141	TNFRSF12A	1418571_at 1418572_x_at	15336	-0.133	-0.0764	No
142	CASK	1422518_at 1422519_at 1427692_a_at 1445152_at	15564	-0.145	-0.0855	No
143	SCOC	1416267_at 1430999_a_at	15671	-0.151	-0.0889	No
144	MAP1A	1460566_at	15679	-0.152	-0.0877	No
145	RPL27A	1437729_at	15696	-0.153	-0.0870	No
146	CYFIP1	1416329_at 1445327_at 1457134_at 1457615_at	15708	-0.154	-0.0860	No
147	AXIN2	1421341_at 1436845_at	15774	-0.157	-0.0874	No
148	FGF11	1421793_at 1439959_at	15905	-0.164	-0.0918	No
149	SYNPO	1427045_at 1434089_at	15940	-0.166	-0.0918	No
150	RABEP1	1421305_x_at 1426023_a_at 1427448_at 1443856_at 1444930_at 1459494_at	15945	-0.167	-0.0903	No
151	PLAC1	1417553_at	16002	-0.170	-0.0913	No
152	GOLGA4	1417674_s_at 1448803_at 1460213_at	16491	-0.201	-0.1118	No
153	HSPB7	1421289_at 1421290_at 1434927_at	16504	-0.202	-0.1103	No
154	PAK6	1445475_at 1455200_at	16562	-0.206	-0.1110	No
155	KBTBD10	1444494_at	16955	-0.236	-0.1267	No
156	CCL22	1417925_at	17045	-0.243	-0.1284	No
157	ROCK2	1423592_at 1451041_at	17379	-0.272	-0.1411	No
158	MMP9	1416298_at 1448291_at	17606	-0.294	-0.1486	No
159	AKT3	1422078_at 1435260_at 1435879_at 1443222_at 1460307_at	17784	-0.314	-0.1537	No
160	ESRRB	1422986_at 1436926_at 1441921_x_at	17939	-0.332	-0.1576	No
161	RPA3	1448938_at	18042	-0.345	-0.1589	No
162	UBE2C	1452954_at	18103	-0.351	-0.1582	No
163	UCHL3	1452402_at	18192	-0.365	-0.1587	No
164	GSN	1415812_at 1436991_x_at 1437171_x_at 1441225_at 1456312_x_at 1456568_at 1456569_x_at	18558	-0.423	-0.1714	No
165	CMAS	1426662_at	18585	-0.427	-0.1684	No
166	TRIM8	1418577_at 1427593_at 1438679_at 1460237_at	18603	-0.430	-0.1650	No
167	HDAC3	1426437_s_at	18679	-0.444	-0.1642	No
168	FKBP8	1416113_at	18759	-0.458	-0.1633	No
169	MMP19	1421976_at 1421977_at	19111	-0.530	-0.1743	No
170	EPHA2	1421151_a_at	19123	-0.533	-0.1696	No
171	ARRDC4	1424759_at	19144	-0.537	-0.1653	No
172	RB1CC1	1418968_at 1431605_at 1449292_at	19278	-0.565	-0.1660	No
173	TBC1D17	1423659_a_at	19294	-0.569	-0.1611	No
174	CD151	1420921_at 1424093_x_at 1427525_at 1437670_x_at 1440507_at 1451232_at 1456085_x_at	19404	-0.592	-0.1604	No
175	KCNN4	1421038_a_at 1435945_a_at	19417	-0.594	-0.1551	No
176	UBE3A	1416680_at 1416681_at 1416682_at 1425206_a_at 1431224_at 1445727_at	19440	-0.598	-0.1503	No
177	PSMD4	1418874_a_at 1425859_a_at 1451725_a_at	19461	-0.603	-0.1454	No
178	PIM2	1417216_at	19510	-0.613	-0.1416	No
179	LAMC1	1423885_at 1423886_at	19527	-0.618	-0.1363	No
180	AP2A2	1432006_at 1432007_s_at 1435869_s_at 1452490_a_at 1455482_at	19545	-0.625	-0.1310	No
181	ISG20	1419569_a_at	19716	-0.671	-0.1323	No
182	MAPK3	1427060_at	19743	-0.679	-0.1269	No
183	ANXA7	1416137_at 1416138_at 1438764_at	19773	-0.687	-0.1215	No
184	JMJD1A	1426810_at	19946	-0.744	-0.1222	No
185	EVI2B	1426505_at	20268	-0.868	-0.1285	No
186	BAZ2A	1427209_at 1427210_at 1438192_s_at	20275	-0.870	-0.1203	No
187	ANKRD28	1434630_at 1454801_at	20363	-0.909	-0.1155	No
188	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	20469	-0.962	-0.1109	No
189	PITPNC1	1428025_s_at 1428878_a_at 1428879_at 1431074_a_at 1435066_at 1441574_at 1452939_a_at 1452940_x_at 1453750_x_at 1455204_at	20715	-1.133	-0.1112	No
190	STAT5B	1422102_a_at 1422103_a_at	20955	-1.307	-0.1095	No
191	CAMKK1	1418954_at	20965	-1.313	-0.0971	No
192	BACH1	1440831_at 1449311_at	20983	-1.331	-0.0849	No
193	PCDH9	1439322_at 1442659_at 1444215_at 1444724_at 1445052_at 1445061_at 1457973_at	21010	-1.366	-0.0728	No
194	SRPK2	1417134_at 1417135_at 1417136_s_at 1431372_at 1435746_at 1440080_at 1442241_at 1442980_at 1447755_at 1448603_at	21433	-1.928	-0.0734	No
195	KCNH2	1449544_a_at	21520	-2.088	-0.0571	No
196	LTBP3	1418049_at 1437833_at 1438312_s_at 1456189_x_at	21607	-2.293	-0.0387	No
197	RTN3	1418101_a_at 1425539_a_at 1442365_at 1443220_at	21735	-2.732	-0.0179	No
198	ABI3	1446191_at 1452928_at	21745	-2.779	0.0087	No