Details for gene set AMINO_ACID_AND_DERIVATIVE_METABOLIC

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	AMINO_ACID_AND_DERIVATIVE_METABOLIC_PROCESS
Enrichment Score (ES)	0.53668255
Normalized Enrichment Score (NES)	1.7523875
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.15943824
FWER p-Value	0.655

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	ARG1	1419549_at	19	4.174	0.0792	Yes
2	ALDH18A1	1415836_at 1435855_x_at 1437325_x_at 1437333_x_at 1437620_x_at	136	2.652	0.1247	Yes
3	GSTZ1	1427552_a_at 1458134_at	186	2.447	0.1694	Yes
4	NFS1	1416373_at 1431431_a_at 1442017_at	190	2.422	0.2157	Yes
5	DARS	1423800_at	319	1.933	0.2469	Yes
6	PYCR1	1424556_at	357	1.870	0.2811	Yes
7	ATF4	1438992_x_at 1439258_at 1448135_at	378	1.823	0.3151	Yes
8	HPRT1	1448736_a_at	464	1.663	0.3431	Yes
9	MSRA	1442385_at 1448856_a_at 1458923_at	504	1.590	0.3718	Yes
10	SLC7A5	1418326_at	515	1.580	0.4016	Yes
11	SCYE1	1416486_at	700	1.362	0.4193	Yes
12	GOT1	1450970_at	795	1.271	0.4394	Yes
13	RARS	1416312_at	855	1.222	0.4601	Yes
14	GOT2	1417715_a_at 1417716_at	993	1.127	0.4755	Yes
15	OAZ2	1426763_at 1426764_at 1442541_at 1442735_at	1045	1.091	0.4940	Yes
16	BCAT1	1430111_a_at 1450871_a_at	1077	1.071	0.5132	Yes
17	MCCC2	1428021_at 1432472_a_at 1454840_at	1141	1.036	0.5301	Yes
18	SLC25A15	1420966_at 1420967_at	1541	0.834	0.5279	Yes
19	SMS	1428699_at 1434190_at	2072	0.647	0.5160	Yes
20	QDPR	1423664_at 1437993_x_at	2150	0.628	0.5245	Yes
21	YARS	1460638_at	2288	0.591	0.5296	Yes
22	GAD1	1416561_at 1416562_at	2626	0.519	0.5241	Yes
23	AARS	1423685_at 1451083_s_at	2724	0.499	0.5292	Yes
24	P4HB	1437465_a_at 1444326_at	2767	0.489	0.5367	Yes
25	HPD	1424618_at	3192	0.423	0.5254	No
26	TYR	1417717_a_at 1448821_at 1456095_at	3473	0.390	0.5201	No
27	GLUD1	1416209_at 1448253_at	3631	0.373	0.5200	No
28	ALDH5A1	1453065_at	3698	0.364	0.5240	No
29	SLC7A6	1433467_at 1460541_at	3790	0.355	0.5266	No
30	GATM	1423569_at	4180	0.322	0.5150	No
31	TGFB2	1423250_a_at 1438303_at 1446141_at 1450922_a_at 1450923_at	4218	0.320	0.5194	No
32	CDO1	1448842_at	4344	0.311	0.5197	No
33	DIO1	1417991_at	4444	0.304	0.5210	No
34	SLC3A1	1448741_at	4810	0.280	0.5096	No
35	PLOD1	1416289_at 1445893_at	5188	0.259	0.4973	No
36	SULT1B1	1418940_at	5235	0.257	0.5002	No
37	DIO2	1418937_at 1418938_at 1426081_a_at	5268	0.256	0.5036	No
38	FPGS	1460673_at	5994	0.221	0.4746	No
39	GLS2	1435245_at	6074	0.218	0.4752	No
40	DCT	1418028_at	6174	0.213	0.4748	No
41	GAD2	1421978_at	6308	0.208	0.4727	No
42	BPHL	1420235_at 1424242_at 1430531_at	6509	0.200	0.4673	No
43	COLQ	1448081_at	6776	0.190	0.4588	No
44	GAMT	1422558_at	6822	0.189	0.4604	No
45	SLC6A6	1420148_at 1421346_a_at 1437149_at 1449751_at	7192	0.175	0.4468	No
46	PEPD	1416712_at	7266	0.173	0.4468	No
47	FARS2	1431354_a_at 1439406_x_at	7295	0.172	0.4488	No
48	GGTLA1	1418216_at 1439420_x_at 1455747_at	7476	0.166	0.4438	No
49	SLC7A7	1417392_a_at 1447181_s_at	7984	0.149	0.4234	No
50	ASRGL1	1424395_at 1424396_a_at 1460360_at	8081	0.146	0.4218	No
51	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	8218	0.142	0.4183	No
52	MAT1A	1423147_at	8477	0.134	0.4091	No
53	ASPA	1418472_at	8515	0.133	0.4099	No
54	BCKDHA	1416647_at	8542	0.132	0.4113	No
55	BCKDK	1443813_x_at 1460644_at	8831	0.122	0.4004	No
56	GCLM	1418627_at	8970	0.118	0.3964	No
57	SLC7A2	1422648_at 1426008_a_at 1436555_at 1440506_at 1450703_at	9381	0.106	0.3797	No
58	ASL	1448350_at	9435	0.104	0.3792	No
59	SLC6A14	1420503_at 1420504_at	9476	0.103	0.3794	No
60	DHPS	1434003_a_at 1434004_at	9773	0.095	0.3676	No
61	SCLY	1417671_at 1441192_at	10312	0.079	0.3445	No
62	DDAH1	1429298_at 1429299_at 1434519_at 1438879_at 1454995_at 1455400_at	11497	0.045	0.2912	No
63	PAH	1454638_a_at	11537	0.044	0.2903	No
64	INDO	1420437_at	12066	0.028	0.2666	No
65	GLDC	1416049_at 1459959_at	12463	0.016	0.2488	No
66	SDS	1424744_at	12776	0.007	0.2347	No
67	SLC7A9	1448783_at	13106	-0.004	0.2197	No
68	PRG3	1449924_at	13266	-0.010	0.2126	No
69	GSS	1441931_x_at 1448273_at	13704	-0.025	0.1931	No
70	SLC7A4	1426068_at 1426069_s_at 1436776_x_at	13919	-0.033	0.1839	No
71	SLC5A7	1421428_at	14024	-0.037	0.1798	No
72	MTHFR	1422132_at 1434087_at 1450498_at	14143	-0.042	0.1752	No
73	GCLC	1424296_at	14439	-0.052	0.1627	No
74	BBOX1	1419618_at	14564	-0.058	0.1581	No
75	OTUB2	1417575_at 1417576_a_at	14589	-0.058	0.1582	No
76	WARS	1415694_at 1425106_a_at 1434813_x_at 1437832_x_at	14931	-0.072	0.1439	No
77	HDC	1451796_s_at 1454713_s_at	15711	-0.111	0.1104	No
78	SLC7A8	1417929_at	15987	-0.127	0.1002	No
79	HGD	1452986_at	16155	-0.138	0.0952	No
80	FAH	1417220_at	16635	-0.174	0.0767	No
81	SARS2	1448522_at	16708	-0.180	0.0768	No
82	CCBL1	1428151_x_at 1438348_x_at 1446302_at 1452678_a_at	16834	-0.191	0.0747	No
83	BCKDHB	1427153_at	17183	-0.226	0.0631	No
84	OAZ1	1428868_a_at 1436292_a_at	18219	-0.355	0.0225	No
85	MAT2B	1448196_at	18318	-0.369	0.0251	No
86	ADI1	1449076_x_at	18634	-0.420	0.0188	No
87	ALDH4A1	1452375_at	18686	-0.431	0.0247	No
88	GGT1	1448485_at	19029	-0.505	0.0187	No
89	ALDH6A1	1448104_at	19132	-0.529	0.0242	No
90	DDAH2	1416457_at	19146	-0.531	0.0338	No
91	BAAT	1419001_at 1419002_s_at	20376	-0.921	-0.0048	No
92	ETNK1	1419884_at 1430996_at 1433514_at 1433515_s_at 1439972_at 1449650_at 1454633_at	21184	-1.566	-0.0117	No
93	PTS	1450660_at 1458402_at	21618	-2.400	0.0145	No