Details for gene set GOLDRATH

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	GOLDRATH_HP
Enrichment Score (ES)	0.52107996
Normalized Enrichment Score (NES)	1.8508003
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.033923727
FWER p-Value	0.233

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	D13WSU177E	1424620_at 1451414_at	23	4.061	0.0333	Yes
2	SRPR	1423670_a_at 1427570_at	61	3.277	0.0594	Yes
3	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	68	3.199	0.0862	Yes
4	KLF9	1422264_s_at 1428288_at 1428289_at 1436763_a_at 1436952_at 1452723_at 1456341_a_at	71	3.194	0.1132	Yes
5	PSMC6	1417771_a_at	90	3.001	0.1378	Yes
6	YIPF5	1418576_at 1444289_at 1449142_a_at	123	2.749	0.1596	Yes
7	SET	1426853_at 1426854_a_at	171	2.519	0.1788	Yes
8	GNPNAT1	1423156_at 1423157_at 1423158_at 1457807_at 1458196_at	200	2.370	0.1976	Yes
9	MRPS25	1418716_at 1418717_at 1449194_at	345	1.894	0.2070	Yes
10	2310056P07RIK	1443339_at 1451385_at	377	1.823	0.2210	Yes
11	NOLA2	1416605_at 1416606_s_at	424	1.726	0.2335	Yes
12	TAF9	1422778_at 1451509_at	430	1.716	0.2478	Yes
13	BAG2	1423948_at	488	1.614	0.2589	Yes
14	SLC7A5	1418326_at	515	1.580	0.2711	Yes
15	PPA1	1416939_at	526	1.570	0.2839	Yes
16	CPSF2	1420936_s_at 1420937_at 1431089_at 1443083_at	570	1.515	0.2948	Yes
17	MKI67IP	1424001_at	610	1.458	0.3053	Yes
18	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	637	1.424	0.3162	Yes
19	1110008F13RIK	1416699_at 1459810_at	647	1.416	0.3278	Yes
20	PCGF2	1420645_at 1456330_at	694	1.369	0.3373	Yes
21	CACYBP	1452047_at	723	1.336	0.3473	Yes
22	MUT	1416838_at 1416839_at 1448486_at	761	1.301	0.3566	Yes
23	PDAP1	1434019_at 1434020_at	764	1.298	0.3675	Yes
24	RNF11	1426404_a_at 1426405_at 1439685_at 1442048_at 1452058_a_at	834	1.235	0.3748	Yes
25	2610005L07RIK	1429040_at 1429041_at 1429882_at 1440184_at 1440387_at 1452997_at 1453589_a_at 1457673_at 1458527_at	859	1.217	0.3840	Yes
26	NUDT19	1432332_a_at 1434216_a_at	881	1.196	0.3932	Yes
27	ZHX1	1448875_at 1458382_a_at	906	1.184	0.4021	Yes
28	SMN1	1426596_a_at	926	1.164	0.4111	Yes
29	SFXN1	1417559_at 1417560_at	937	1.157	0.4204	Yes
30	HDGF	1415888_at 1419964_s_at 1449681_at	1025	1.103	0.4258	Yes
31	PTGES3	1417998_at 1460221_at	1194	1.006	0.4266	Yes
32	UBQLN2	1420844_at 1450021_at 1456627_at	1201	1.003	0.4348	Yes
33	BRP44	1423833_a_at 1430071_at	1284	0.952	0.4391	Yes
34	PDCD2	1423534_at	1300	0.943	0.4464	Yes
35	CANX	1415692_s_at 1422845_at 1428935_at	1491	0.854	0.4449	Yes
36	ATP5J	1416143_at	1524	0.840	0.4506	Yes
37	NUDCD2	1418566_s_at 1449140_at	1603	0.807	0.4538	Yes
38	4933428G09RIK	1426253_at 1443403_at	1621	0.802	0.4598	Yes
39	PCCB	1450969_at	1651	0.791	0.4652	Yes
40	CETN3	1417239_at	1652	0.790	0.4719	Yes
41	RAB18	1420899_at 1420900_a_at	1714	0.766	0.4756	Yes
42	UNG	1425753_a_at	1740	0.755	0.4808	Yes
43	VDAC2	1415990_at	1929	0.690	0.4780	Yes
44	CCT2	1416037_a_at 1433534_a_at 1433535_x_at	1946	0.684	0.4831	Yes
45	VTI1B	1449003_a_at	2032	0.658	0.4848	Yes
46	D1ERTD622E	1417471_s_at 1448721_at	2070	0.648	0.4885	Yes
47	CHEK2	1422747_at	2083	0.644	0.4935	Yes
48	SEL1H	1425187_at 1425188_s_at 1430692_a_at 1436774_at 1453559_a_at	2089	0.643	0.4987	Yes
49	PDCD6	1416027_at	2107	0.639	0.5033	Yes
50	QDPR	1423664_at 1437993_x_at	2150	0.628	0.5067	Yes
51	ITFG1	1419041_at 1441736_at	2152	0.628	0.5120	Yes
52	GALK1	1417177_at	2171	0.621	0.5164	Yes
53	PB1	1426877_a_at 1426878_at 1427266_at 1442603_at	2184	0.618	0.5211	Yes
54	HSPE1	1450668_s_at	2429	0.562	0.5146	No
55	ITGB1BP1	1422157_a_at 1445697_at	2439	0.561	0.5190	No
56	MRPS33	1427173_a_at	2732	0.497	0.5098	No
57	PRPS2	1420637_at 1420638_at 1443418_at 1454843_at	2850	0.472	0.5084	No
58	MAGOH	1416212_at	2904	0.464	0.5099	No
59	JOSD3	1430147_a_at 1430271_x_at 1436558_at 1442289_at 1452635_x_at 1452987_at 1457292_at	2985	0.451	0.5100	No
60	AKAP8	1433669_at 1450983_at	3001	0.449	0.5131	No
61	PLEKHA1	1417965_at 1443111_at	3092	0.435	0.5127	No
62	PSMC5	1415740_at	3506	0.387	0.4970	No
63	GOLPH4	1428875_at 1445190_at 1459045_at	3575	0.380	0.4971	No
64	CD55	1418762_at 1443906_at 1460242_at	3656	0.370	0.4965	No
65	PTDSS1	1416372_at 1441866_s_at 1449739_at	3782	0.356	0.4938	No
66	AU021838	1433903_at 1454814_s_at	3836	0.351	0.4943	No
67	2310010J17RIK	1439962_at	4502	0.301	0.4663	No
68	RNF141	1418466_at 1427120_at 1433655_at 1449086_at 1449087_at	4633	0.292	0.4628	No
69	CSPG3	1423604_at 1434679_at 1444020_at	4682	0.289	0.4631	No
70	2310016A09RIK	1451322_at	5011	0.269	0.4503	No
71	BTBD14A	1417152_at 1417153_at 1429582_at 1447608_x_at	5031	0.268	0.4517	No
72	SCD5	1415822_at 1415823_at 1415824_at	5229	0.257	0.4448	No
73	ZRSR2	1421128_at 1442154_at 1444611_at 1455727_at	5489	0.244	0.4349	No
74	ADAM3A	1448329_at	5705	0.233	0.4270	No
75	BYSL	1422767_at 1450742_at	5777	0.231	0.4257	No
76	NDUFC1	1416285_at 1448284_a_at	6157	0.214	0.4101	No
77	2700007P21RIK	1430586_at 1436859_at 1459902_at	6340	0.207	0.4035	No
78	PARK7	1416526_a_at 1456194_a_at	6553	0.199	0.3954	No
79	TM9SF3	1416509_at 1428412_at 1442821_at 1448375_at 1458681_at 1460186_at	6915	0.185	0.3804	No
80	EOMES	1426001_at 1435172_at	7296	0.172	0.3644	No
81	NME1	1424110_a_at 1435277_x_at	7883	0.153	0.3388	No
82	LIN7C	1418898_at 1423322_at 1449262_s_at 1450937_at	7889	0.152	0.3398	No
83	IRAK1	1448668_a_at 1460649_at	8075	0.146	0.3326	No
84	C330012H03RIK	1437103_at 1439764_s_at	8171	0.143	0.3294	No
85	VAMP4	1422895_at 1422896_at 1434796_at	8216	0.142	0.3286	No
86	MYO6	1421120_at 1433942_at 1435559_at	8260	0.141	0.3278	No
87	PNPLA1	1457448_at	8332	0.138	0.3257	No
88	DHX9	1425617_at 1425618_at 1451770_s_at	8415	0.136	0.3231	No
89	TPD52	1419493_a_at 1419494_a_at 1436008_at 1458668_at	8631	0.129	0.3143	No
90	STRN	1422036_at 1455022_at 1455156_at	8724	0.126	0.3111	No
91	H2AFY	1424572_a_at	8759	0.125	0.3106	No
92	EBF3	1428349_s_at 1452751_at 1456513_at 1460666_a_at	8875	0.121	0.3064	No
93	IPP	1421771_a_at	9375	0.106	0.2843	No
94	1110059E24RIK	1416841_at	9441	0.104	0.2822	No
95	YME1L1	1423360_at 1423361_at 1437822_at 1450954_at	9761	0.095	0.2684	No
96	IGBP1	1419999_at 1420000_s_at 1442161_at 1449700_at 1460737_at	10094	0.085	0.2539	No
97	2310028O11RIK	1433616_a_at 1436001_at 1455126_x_at	10317	0.079	0.2443	No
98	NDUFB2	1416834_x_at 1442658_at 1448483_a_at 1453806_at	10405	0.076	0.2410	No
99	4833442J19RIK	1427202_at 1457915_at	10608	0.071	0.2323	No
100	GTPBP1	1450022_at 1450023_at	10800	0.064	0.2240	No
101	CDCA7L	1451306_at	11011	0.059	0.2149	No
102	MRPL9	1427297_at 1430976_a_at 1437749_s_at	11107	0.057	0.2110	No
103	GMFB	1417069_a_at 1431686_a_at 1431687_at 1448570_at 1448571_a_at	11141	0.056	0.2100	No
104	STT3A	1423033_at 1441417_at 1450841_at 1455824_x_at	11144	0.056	0.2103	No
105	SNX9	1423076_at 1423077_at	11203	0.054	0.2081	No
106	CTNND2	1422592_at 1438891_at 1443638_at 1445114_at 1447552_s_at 1456116_at	11644	0.041	0.1883	No
107	PRKCA	1427562_a_at 1443069_at 1445028_at 1445395_at 1446598_at 1450945_at	11704	0.039	0.1859	No
108	NDUFB3	1416547_at	11977	0.031	0.1736	No
109	IPO7	1442511_at 1454955_at 1458165_at	12189	0.024	0.1641	No
110	ATP5D	1423716_s_at 1456580_s_at	12206	0.024	0.1636	No
111	KCNS2	1421342_at 1441211_at 1457325_at	12245	0.023	0.1621	No
112	NTAN1	1423538_at 1447917_x_at	12401	0.018	0.1551	No
113	APP	1420621_a_at 1427442_a_at 1438373_at 1438374_x_at 1444705_at 1447347_at 1458525_at	12789	0.007	0.1374	No
114	SDHC	1435986_x_at 1448630_a_at	12898	0.003	0.1324	No
115	FUBP1	1433482_a_at 1433640_at 1437543_at 1437544_at	13444	-0.016	0.1075	No
116	NDUFAB1	1428159_s_at 1428160_at 1435934_at 1447919_x_at 1453565_at 1458678_at	13457	-0.016	0.1071	No
117	AQP9	1421605_a_at 1424011_at	13478	-0.017	0.1063	No
118	CRI1	1416614_at 1448405_a_at 1448406_at	13495	-0.017	0.1057	No
119	KCTD12	1434881_s_at	13820	-0.029	0.0911	No
120	X83328	1417241_at	13986	-0.035	0.0838	No
121	ATP6V0B	1416769_s_at 1425448_x_at 1437013_x_at	14303	-0.047	0.0697	No
122	ENPEP	1448649_at	14483	-0.054	0.0619	No
123	RAD23B	1424222_s_at 1450903_at 1455420_at 1456822_at	14537	-0.056	0.0599	No
124	IFT88	1448652_at	14686	-0.062	0.0537	No
125	GPX1	1460671_at	14878	-0.070	0.0455	No
126	HSD3B5	1420531_at	15095	-0.081	0.0362	No
127	SNRPE	1451294_s_at	15312	-0.091	0.0271	No
128	BCL2	1422938_at 1427818_at 1437122_at 1440770_at 1443837_x_at 1457687_at	15400	-0.096	0.0239	No
129	SEMA4F	1419328_at 1439768_x_at	15769	-0.114	0.0080	No
130	ALDH3A2	1415776_at	15805	-0.116	0.0073	No
131	5730408K05RIK	1429207_at 1429208_at	15837	-0.118	0.0069	No
132	WASPIP	1436953_at 1436954_at 1447274_at 1447348_at	15934	-0.124	0.0036	No
133	RECK	1450784_at	15953	-0.125	0.0038	No
134	ROCK1	1423444_at 1423445_at 1441162_at 1446518_at 1450994_at 1460729_at	16107	-0.135	-0.0021	No
135	USP15	1436891_at 1446186_at 1454036_a_at 1455842_x_at	16300	-0.149	-0.0097	No
136	E330034G19RIK	1433798_a_at	16310	-0.149	-0.0088	No
137	AU016916	1420083_at	16417	-0.157	-0.0124	No
138	2700094K13RIK	1436349_at	16422	-0.157	-0.0112	No
139	TLOC1	1432635_a_at 1433704_s_at 1439233_at 1444811_at 1454697_at 1455698_at	16634	-0.174	-0.0194	No
140	AI788669	1434312_at	16737	-0.182	-0.0226	No
141	RPIA	1418337_at	16743	-0.182	-0.0213	No
142	ZFP62	1425495_at 1451730_at	16866	-0.193	-0.0252	No
143	SOCS3	1416576_at 1455899_x_at 1456212_x_at	16975	-0.204	-0.0285	No
144	TAX1BP1	1420174_s_at 1420175_at 1442901_at 1448399_at	17091	-0.217	-0.0319	No
145	F2RL1	1448931_at	17238	-0.231	-0.0367	No
146	SOS2	1452281_at	17296	-0.238	-0.0373	No
147	TIMM22	1448517_at 1448518_at	17476	-0.257	-0.0433	No
148	SFPQ	1423795_at 1423796_at 1436898_at 1438458_a_at 1438459_x_at 1439058_at	17679	-0.282	-0.0502	No
149	PELO	1434071_a_at	17970	-0.321	-0.0608	No
150	PCBD2	1452621_at	17999	-0.324	-0.0594	No
151	IL10RB	1419455_at	18247	-0.360	-0.0677	No
152	TGOLN1	1418520_at 1423308_at 1423309_at	18289	-0.366	-0.0665	No
153	CREB1	1421582_a_at 1421583_at 1423402_at 1428755_at 1452529_a_at 1452901_at	18300	-0.366	-0.0638	No
154	IMPA2	1418665_at 1459983_at	18353	-0.372	-0.0631	No
155	1110049G11RIK	1449213_at	18369	-0.374	-0.0606	No
156	RAB5C	1424684_at	18632	-0.420	-0.0691	No
157	4930453N24RIK	1423976_at 1427664_at 1438553_x_at 1449718_s_at 1449719_at	18702	-0.434	-0.0686	No
158	DYNLL2	1418258_s_at 1418371_at	18914	-0.478	-0.0742	No
159	E2F1	1417878_at 1431875_a_at 1447840_x_at	18940	-0.485	-0.0712	No
160	CYB5R1	1424048_a_at	19411	-0.599	-0.0878	No
161	C1QB	1417063_at 1434366_x_at 1437726_x_at 1457322_at	19540	-0.630	-0.0883	No
162	UBL5	1416848_at	19541	-0.630	-0.0830	No
163	CMAS	1426662_at	19610	-0.646	-0.0806	No
164	AW146242	1423812_s_at 1451127_at 1458828_at	19618	-0.649	-0.0755	No
165	ZFP131	1428616_at	19659	-0.663	-0.0717	No
166	GLUL	1426235_a_at 1426236_a_at	19701	-0.675	-0.0678	No
167	ATP11A	1421167_at 1456388_at	20085	-0.812	-0.0786	No
168	MSL2L1	1429108_at 1429109_at 1453030_at	20194	-0.847	-0.0764	No
169	HRB	1426922_s_at 1426923_at 1434840_at 1452237_at 1452238_at	20413	-0.938	-0.0784	No
170	NFKBIZ	1417483_at 1448728_a_at 1457404_at	20983	-1.334	-0.0933	No
171	GYK	1422703_at 1422704_at 1445242_at	21287	-1.704	-0.0928	No
172	5830411E10RIK	1426806_at 1430623_s_at 1444399_at 1452203_at 1455679_at 1460521_a_at	21330	-1.770	-0.0797	No
173	TRNT1	1425561_at 1425562_s_at	21505	-2.101	-0.0699	No
174	DUSP19	1418038_s_at 1440572_at 1448922_at	21526	-2.153	-0.0526	No
175	SORL1	1426258_at 1445889_at 1453003_at 1460390_at	21605	-2.353	-0.0362	No
176	PAFAH1B1	1417086_at 1427703_at 1439656_at 1441404_at 1444125_at 1448578_at 1456947_at 1460199_a_at	21667	-2.566	-0.0173	No
177	BZW2	1423456_at 1443227_at	21839	-3.484	0.0044	No