Details for gene set V$TST1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls#SCID_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$TST1_01
Enrichment Score (ES)	-0.46760297
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.5243914
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.18998082
FWER p-Value	0.808

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CCNF	1422513_at 1443807_x_at	132	3.226	0.0261	No
2	H3F3B	1420376_a_at 1430357_at 1455725_a_at	228	2.638	0.0480	No
3	OLIG3	1421728_at	249	2.508	0.0721	No
4	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	269	2.417	0.0953	No
5	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	376	2.102	0.1114	No
6	NR2F2	1416158_at 1416159_at 1416160_at 1431237_at 1444229_at	427	1.978	0.1288	No
7	ATP5G2	1415980_at 1456128_at	502	1.824	0.1436	No
8	KCTD15	1435339_at	520	1.779	0.1605	No
9	MRPS18B	1451164_a_at	1187	1.003	0.1399	No
10	PCDH8	1417051_at 1432491_at 1447825_x_at	1269	0.954	0.1457	No
11	ACACA	1444810_at	1338	0.919	0.1517	No
12	GNB1L	1419316_s_at 1441391_at	1437	0.869	0.1558	No
13	PSMB3	1417052_at	1556	0.815	0.1585	No
14	FABP1	1417556_at 1448764_a_at	1591	0.796	0.1649	No
15	IRX2	1426298_at	1639	0.773	0.1704	No
16	RAP2A	1421574_at 1426965_at 1440473_at	1793	0.707	0.1704	No
17	GPM6A	1426442_at 1456741_s_at 1459303_at	2454	0.517	0.1453	No
18	NIPA2	1421968_a_at 1426717_at 1459866_x_at	2577	0.492	0.1445	No
19	MAP2K5	1417854_at 1430180_at 1453712_a_at 1455941_s_at	2716	0.466	0.1428	No
20	EBP	1416667_at	2920	0.431	0.1378	No
21	SLC25A3	1416300_a_at 1440302_at	3105	0.401	0.1333	No
22	ANKRD28	1434630_at 1454801_at	3455	0.357	0.1209	No
23	WNT6	1419708_at 1435980_x_at	3634	0.338	0.1160	No
24	IGFBP6	1417933_at	3906	0.317	0.1067	No
25	PIK3R3	1445097_at 1447068_at 1456482_at	3939	0.314	0.1084	No
26	GPX1	1460671_at	4159	0.297	0.1013	No
27	BTBD3	1425660_at 1433868_at 1442748_at	4272	0.291	0.0990	No
28	CSMD3	1438272_at 1438572_at 1454245_at	4737	0.265	0.0803	No
29	DSCR1	1416600_a_at 1416601_a_at	5067	0.250	0.0677	No
30	SLITRK5	1429718_at	5152	0.246	0.0663	No
31	WNT4	1450782_at	5214	0.243	0.0659	No
32	MGAT4B	1424720_at	5224	0.242	0.0679	No
33	FES	1427368_x_at 1452410_a_at	5287	0.240	0.0674	No
34	ADAM23	1423378_at 1438084_at 1447946_at 1459642_at	5311	0.239	0.0688	No
35	FLRT3	1429310_at 1453102_at	5358	0.237	0.0690	No
36	HOXC4	1422870_at	5486	0.232	0.0655	No
37	NDST4	1421318_at 1431452_at 1450195_at	5536	0.230	0.0655	No
38	SCRN1	1428717_at 1428718_at	5749	0.221	0.0580	No
39	KCNH7	1427634_at	5872	0.217	0.0545	No
40	CABP1	1421255_a_at	5906	0.215	0.0552	No
41	SCRT2	1440930_a_at 1440931_at 1446986_at 1457310_x_at	6109	0.208	0.0480	No
42	TOB1	1423176_at 1440844_at	6119	0.208	0.0496	No
43	GRB10	1425457_a_at 1425458_a_at 1430164_a_at 1440935_at 1441620_at 1446921_at	6124	0.208	0.0515	No
44	HOXD3	1421537_at 1437664_at	6140	0.207	0.0529	No
45	HTR2C	1435513_at 1450477_at	6286	0.202	0.0482	No
46	CACNA2D2	1426185_at	6385	0.199	0.0457	No
47	THBS2	1422571_at 1447862_x_at 1450663_at	6574	0.192	0.0390	No
48	P4HA1	1426519_at 1452094_at	6616	0.191	0.0390	No
49	MPP2	1449173_at	6637	0.190	0.0400	No
50	FGFR2	1420847_a_at 1433489_s_at 1443996_at	6647	0.190	0.0414	No
51	RHOJ	1418892_at 1444982_at	6660	0.189	0.0428	No
52	TWIST1	1418733_at	7069	0.176	0.0258	No
53	SEMA5B	1422146_at 1435963_at	7242	0.171	0.0196	No
54	ING3	1422805_a_at 1422806_x_at 1450760_a_at 1460082_at	7333	0.169	0.0171	No
55	MESDC1	1416397_at 1416398_at	7354	0.168	0.0179	No
56	ARRDC3	1454617_at	7471	0.165	0.0142	No
57	FIGN	1450268_at	7499	0.164	0.0146	No
58	HOXA5	1443803_x_at 1448926_at	7718	0.157	0.0061	No
59	SIPA1L1	1434222_at 1440119_at 1440647_at	8060	0.147	-0.0081	No
60	SLC17A6	1418610_at 1428379_at	8069	0.147	-0.0070	No
61	TBX5	1425694_at 1425695_at	8081	0.147	-0.0060	No
62	TSGA13	1420587_at	8140	0.145	-0.0073	No
63	PCDH17	1436920_at 1446821_at 1453070_at	8252	0.143	-0.0109	No
64	ESRRG	1421747_at 1455267_at 1457896_at	8458	0.138	-0.0190	No
65	SLC5A3	1422170_at	8660	0.133	-0.0269	No
66	FBLN5	1416164_at 1446377_at	8726	0.131	-0.0286	No
67	NEUROG1	1438551_at 1450836_at	8727	0.131	-0.0273	No
68	PDE1A	1431625_at 1449298_a_at	8731	0.131	-0.0261	No
69	PURG	1424970_at 1452029_a_at	8751	0.130	-0.0257	No
70	SLC1A7	1456971_at	8811	0.129	-0.0271	No
71	PORCN	1424220_a_at 1438753_at	8940	0.126	-0.0318	No
72	PLXNA2	1429772_at 1446420_at 1451753_at 1453286_at 1455037_at 1458102_at 1459033_at	9025	0.123	-0.0344	No
73	HOXB8	1452493_s_at	9030	0.123	-0.0333	No
74	NXPH4	1429753_at	9211	0.119	-0.0404	No
75	HAS2	1418678_at 1449169_at	9237	0.118	-0.0404	No
76	PCDH18	1422889_at 1422890_at 1430427_a_at	9375	0.115	-0.0456	No
77	IL21	1450334_at	9461	0.113	-0.0484	No
78	BHLHB3	1421099_at	9569	0.110	-0.0522	No
79	HMGA2	1422851_at 1443394_at 1446196_at 1450780_s_at 1450781_at 1458241_at	9590	0.110	-0.0520	No
80	GEMIN7	1435764_a_at	9669	0.108	-0.0545	No
81	OMD	1418745_at	9697	0.107	-0.0547	No
82	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	10125	0.097	-0.0734	No
83	HOXC6	1427361_at 1427362_x_at 1427454_at	10271	0.093	-0.0791	No
84	PLCG2	1426926_at	10300	0.093	-0.0794	No
85	SMPX	1418095_at	10342	0.092	-0.0804	No
86	IRX3	1418517_at	10452	0.089	-0.0845	No
87	ISL1	1422720_at 1450723_at	10578	0.087	-0.0894	No
88	THAP6	1453843_at 1456536_at	10668	0.085	-0.0927	No
89	B3GALT2	1423084_at 1437433_at 1437644_at	10690	0.084	-0.0928	No
90	ELAVL2	1421881_a_at 1421882_a_at 1421883_at 1433052_at	10772	0.082	-0.0957	No
91	KLF14	1457397_at	10871	0.079	-0.0994	No
92	ZIC1	1423477_at 1439627_at	11004	0.076	-0.1047	No
93	ZIC4	1421539_at 1456417_at	11247	0.071	-0.1151	No
94	LIN28	1437752_at	11363	0.069	-0.1197	No
95	POFUT1	1443881_at 1450137_at 1456323_at	11580	0.063	-0.1290	No
96	CALCA	1427355_at 1452004_at	11729	0.059	-0.1353	No
97	TTYH1	1422694_at 1422696_at 1426617_a_at	11900	0.055	-0.1425	No
98	JARID2	1422698_s_at 1446082_at 1450710_at 1456661_at	12069	0.051	-0.1497	No
99	HEPH	1448696_at	12108	0.050	-0.1510	No
100	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	12344	0.045	-0.1614	No
101	GATA6	1425463_at 1425464_at 1443081_at	12587	0.039	-0.1721	No
102	CITED2	1417129_a_at 1421267_a_at 1439915_at 1440091_at 1443561_at 1443926_at 1445638_at 1446176_at 1447861_x_at 1457632_s_at 1459301_at	12674	0.037	-0.1757	No
103	PDGFA	1418711_at 1449187_at	12746	0.035	-0.1786	No
104	OTX2	1425926_a_at	12978	0.030	-0.1889	No
105	HOXD1	1420573_at	13026	0.028	-0.1908	No
106	DIO2	1418937_at 1418938_at 1426081_a_at	13050	0.028	-0.1916	No
107	NR2E1	1434921_at 1457289_at	13079	0.027	-0.1926	No
108	EPHB3	1451550_at	13337	0.019	-0.2042	No
109	BNC2	1438861_at 1440593_at 1459132_at	13352	0.019	-0.2047	No
110	LAMA4	1424807_at 1424808_at	13412	0.018	-0.2072	No
111	ANXA11	1418468_at	13524	0.014	-0.2122	No
112	HEY1	1415999_at	13675	0.010	-0.2190	No
113	USP13	1452442_at 1455473_at	13695	0.010	-0.2197	No
114	KLHL13	1416242_at 1448269_a_at	13773	0.008	-0.2232	No
115	ADCYAP1	1423427_at 1441778_at	14001	0.002	-0.2336	No
116	TNRC4	1452851_at	14082	-0.000	-0.2373	No
117	OLIG2	1416232_at	14083	-0.000	-0.2373	No
118	RNF14	1422429_at 1425929_a_at 1431030_a_at 1437035_x_at	14084	-0.000	-0.2373	No
119	ARL4A	1425411_at 1431429_a_at 1435092_at	14097	-0.001	-0.2378	No
120	NFKB2	1425902_a_at 1429128_x_at	14187	-0.004	-0.2419	No
121	CACNA2D3	1419225_at	14240	-0.005	-0.2442	No
122	ZF	1425698_a_at 1438302_at 1452856_at 1452857_at	14251	-0.006	-0.2446	No
123	ABCC6	1421212_at	14313	-0.007	-0.2473	No
124	SLC24A1	1451647_at	14700	-0.020	-0.2649	No
125	PTPRK	1423277_at 1423278_at 1431680_a_at 1441276_at 1441277_s_at 1441644_at 1443491_at 1443699_at 1444763_at	14713	-0.021	-0.2652	No
126	PIPOX	1449374_at	14797	-0.023	-0.2688	No
127	SRC	1423240_at 1450918_s_at	14992	-0.030	-0.2774	No
128	CXADR	1427321_s_at 1449949_a_at 1451865_at 1452391_at 1453282_at	15086	-0.032	-0.2814	No
129	DCX	1418139_at 1418140_at 1418141_at 1448974_at	15124	-0.034	-0.2828	No
130	KLF5	1430255_at 1451021_a_at 1451739_at	15319	-0.042	-0.2913	No
131	RTN1	1429761_at	15473	-0.048	-0.2978	No
132	KLHDC1	1443932_at	15476	-0.048	-0.2974	No
133	NEUROD6	1418047_at	15521	-0.049	-0.2990	No
134	CFL2	1418066_at 1418067_at 1431432_at	15544	-0.050	-0.2995	No
135	RIMS1	1435667_at 1438305_at 1444393_at	15693	-0.056	-0.3057	No
136	LIF	1421206_at 1421207_at 1450160_at	15753	-0.059	-0.3079	No
137	NEK6	1451043_at	16056	-0.073	-0.3210	No
138	MGLL	1426785_s_at 1431331_at 1450391_a_at 1453836_a_at	16132	-0.077	-0.3237	No
139	KIF1C	1424747_at 1426325_at	16147	-0.077	-0.3236	No
140	RAD18	1423318_at 1435826_at 1443954_at 1451928_a_at	16168	-0.078	-0.3237	No
141	RFX3	1425413_at 1441253_at 1441702_at	16291	-0.085	-0.3285	No
142	EPHA7	1427528_a_at 1443485_at 1445635_at 1451991_at 1452380_at	16571	-0.103	-0.3403	No
143	LMNA	1421654_a_at 1425472_a_at 1426868_x_at 1452212_at 1457670_s_at	16605	-0.105	-0.3407	No
144	ZFHX1B	1422748_at 1434298_at 1442393_at 1445518_at 1454200_at 1456389_at	16812	-0.119	-0.3490	No
145	LBX1	1422323_a_at 1427400_at	17313	-0.162	-0.3704	No
146	SDF2	1416857_at	17551	-0.185	-0.3794	No
147	PRDX5	1416381_a_at	17849	-0.217	-0.3909	No
148	SMARCA2	1430526_a_at 1439930_at 1452333_at	17965	-0.232	-0.3939	No
149	USP52	1426700_a_at	18283	-0.280	-0.4057	No
150	MLLT3	1429205_at 1431890_a_at 1441535_at 1453622_s_at	18511	-0.307	-0.4131	No
151	PFTK1	1419249_at 1419250_a_at 1441692_at 1445984_at 1453956_a_at	18930	-0.379	-0.4285	No
152	NRXN3	1419825_at 1431153_at 1432931_at 1433788_at 1438193_at 1439629_at 1442423_at 1444700_at 1456137_at 1460101_at	19658	-0.551	-0.4564	No
153	PIM1	1423006_at 1435458_at	19899	-0.622	-0.4613	Yes
154	PPP1R10	1426726_at 1426727_s_at 1430560_at	20038	-0.671	-0.4609	Yes
155	SUPT6H	1417628_at 1430458_at	20101	-0.698	-0.4568	Yes
156	STAG2	1421849_at 1450396_at	20247	-0.758	-0.4559	Yes
157	ADNP	1423069_at	20352	-0.800	-0.4527	Yes
158	PGRMC1	1423451_at	20372	-0.808	-0.4455	Yes
159	PHOX2B	1422232_at 1455907_x_at	20380	-0.812	-0.4378	Yes
160	INPP4B	1441416_at 1446539_at 1456254_at 1457359_at	20431	-0.839	-0.4317	Yes
161	ZHX2	1455210_at	20574	-0.905	-0.4292	Yes
162	TMSB4X	1415906_at	20623	-0.934	-0.4221	Yes
163	BAZ2B	1435240_at 1440984_at 1441556_at 1442704_at 1442971_at 1445048_at 1448007_at 1458077_at	20739	-1.021	-0.4172	Yes
164	SLC27A4	1424441_at	20756	-1.035	-0.4077	Yes
165	PURA	1420628_at 1438219_at 1449934_at 1453783_at 1456898_at	20835	-1.087	-0.4004	Yes
166	CXCL13	1417851_at 1448859_at	20846	-1.097	-0.3899	Yes
167	GDI1	1447613_at 1451070_at	20922	-1.166	-0.3818	Yes
168	STAG1	1421939_a_at 1421940_at 1431921_a_at 1434189_at 1435731_x_at 1445145_at 1445652_at 1450420_at	21105	-1.362	-0.3766	Yes
169	CSTF3	1424723_s_at 1443909_at	21152	-1.422	-0.3645	Yes
170	PLAGL2	1417517_at 1417518_at 1417519_at 1442235_at	21162	-1.435	-0.3506	Yes
171	ELAVL4	1428741_at 1450258_a_at 1452894_at 1457399_at	21221	-1.522	-0.3381	Yes
172	BMF	1422995_at 1454880_s_at 1458325_x_at	21256	-1.564	-0.3241	Yes
173	PRKACB	1420610_at 1420611_at 1457197_at	21289	-1.608	-0.3095	Yes
174	CDC42EP3	1422642_at 1450700_at	21422	-1.841	-0.2973	Yes
175	RAP1GDS1	1425266_a_at 1459768_x_at	21428	-1.858	-0.2790	Yes
176	SMAD4	1422485_at 1422486_a_at 1422487_at 1444205_at	21604	-2.282	-0.2643	Yes
177	SMOC1	1448321_at	21673	-2.545	-0.2420	Yes
178	SESN3	1449303_at 1453313_at	21684	-2.588	-0.2167	Yes
179	NR4A3	1421079_at 1421080_at	21688	-2.605	-0.1909	Yes
180	ATRX	1420945_at 1420946_at 1420947_at 1438750_at 1441014_at 1441771_at 1450051_at 1453734_at 1456832_at	21709	-2.755	-0.1643	Yes
181	SSBP3	1425940_a_at 1427917_s_at 1439136_at 1443554_at 1457560_at 1458749_at	21778	-3.006	-0.1375	Yes
182	NR4A2	1447863_s_at 1450749_a_at 1450750_a_at 1455034_at	21813	-3.239	-0.1068	Yes
183	PDE4B	1422473_at 1422474_at 1442700_at 1444731_at 1445449_at 1446577_at 1447237_at 1447718_at	21826	-3.306	-0.0744	Yes
184	MLL5	1427236_a_at 1432601_at 1434704_at 1439107_a_at 1439108_at	21876	-3.671	-0.0401	Yes
185	EGR2	1427682_a_at 1427683_at	21904	-4.293	0.0015	Yes