Details for gene set V$MMEF2

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls#SCID_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$MMEF2_Q6
Enrichment Score (ES)	-0.44517797
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.4686886
Nominal p-value	0.004016064
FDR q-value	0.18922472
FWER p-Value	0.95

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	RTN3	1418101_a_at 1425539_a_at 1442365_at 1443220_at	166	3.028	0.0178	No
2	OLIG3	1421728_at	249	2.508	0.0352	No
3	NFIL3	1418932_at	366	2.125	0.0477	No
4	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	376	2.102	0.0650	No
5	MYH6	1417729_at 1448826_at 1458850_at	460	1.906	0.0772	No
6	ZDHHC8	1436468_at 1451476_at	575	1.673	0.0860	No
7	SDC1	1415943_at 1415944_at 1437279_x_at 1448158_at	588	1.648	0.0994	No
8	INPPL1	1460394_a_at	693	1.461	0.1069	No
9	INSIG2	1417980_a_at 1417981_at 1417982_at	883	1.235	0.1086	No
10	TOPBP1	1452241_at 1458480_at	1029	1.121	0.1113	No
11	TLE3	1419654_at 1419655_at 1449554_at 1458512_at	1062	1.091	0.1190	No
12	CRTAP	1448592_at	1095	1.065	0.1265	No
13	EYA1	1421727_at 1443117_at 1457424_at	1310	0.929	0.1245	No
14	PDLIM1	1416554_at	1650	0.766	0.1154	No
15	BHLHB2	1418025_at	1676	0.753	0.1205	No
16	GRIK1	1427676_a_at 1439987_at	1677	0.751	0.1269	No
17	PRKCBP1	1426614_at 1429415_at 1445827_at 1456143_at 1458617_at	1785	0.710	0.1279	No
18	LUC7L	1428255_at 1431181_a_at 1431664_at 1452708_a_at	1799	0.704	0.1332	No
19	ESR1	1421244_at 1435663_at 1457877_at 1460591_at	1825	0.697	0.1380	No
20	KPNA3	1421828_at 1445527_at 1446538_at 1450385_at 1450386_at	1831	0.695	0.1436	No
21	HIBADH	1423780_at 1435967_s_at 1442848_at 1446297_at	1832	0.695	0.1494	No
22	LMCD1	1424596_s_at	1886	0.673	0.1526	No
23	DNAJB5	1421961_a_at 1421962_at 1450436_s_at	2110	0.604	0.1475	No
24	COL11A2	1423578_at	2198	0.579	0.1483	No
25	COX7A2	1416970_a_at 1416971_at	2232	0.572	0.1516	No
26	ARHGAP12	1431052_at 1444463_at 1451525_at 1451526_at	2261	0.564	0.1551	No
27	CKM	1417614_at	2368	0.537	0.1547	No
28	PRX	1423292_a_at	2388	0.533	0.1583	No
29	DKK1	1420360_at 1458232_at	2478	0.512	0.1586	No
30	GCAT	1417823_at 1417824_at	2597	0.488	0.1572	No
31	CHN2	1428573_at 1428574_a_at 1441158_at 1443626_at	2831	0.446	0.1503	No
32	ARHGAP26	1430957_at 1435694_at 1440688_at	3045	0.410	0.1439	No
33	BZW2	1423456_at 1443227_at	3157	0.394	0.1421	No
34	WFDC1	1431335_a_at	3233	0.384	0.1419	No
35	TYRO3	1425248_a_at 1425249_a_at	3303	0.375	0.1419	No
36	SLC12A5	1425337_at 1445933_at 1451674_at	3313	0.374	0.1446	No
37	CLASP1	1427353_at 1452265_at 1459233_at 1460102_at	3497	0.351	0.1392	No
38	NR2F1	1418157_at 1422412_x_at	3518	0.349	0.1412	No
39	RALY	1418573_a_at	3532	0.348	0.1435	No
40	FOXD3	1422210_at	3541	0.347	0.1461	No
41	TACR1	1422282_at	3543	0.346	0.1489	No
42	EHD4	1449852_a_at	3821	0.322	0.1389	No
43	KBTBD5	1431043_at	3875	0.319	0.1391	No
44	HNRPL	1424101_at 1445594_at	4425	0.280	0.1162	No
45	HOXD4	1450209_at	4490	0.276	0.1156	No
46	HOXA4	1420226_x_at 1427354_at	4518	0.275	0.1167	No
47	MYL2	1448394_at	4567	0.273	0.1168	No
48	SOX14	1427609_at	4652	0.269	0.1152	No
49	GYPC	1423878_at	5289	0.240	0.0879	No
50	FLRT3	1429310_at 1453102_at	5358	0.237	0.0868	No
51	MYL1	1452651_a_at	5418	0.234	0.0860	No
52	SIX3	1426637_a_at 1426638_at	5554	0.229	0.0818	No
53	FHOD1	1435557_at	5614	0.227	0.0810	No
54	CYP26B1	1460011_at	5627	0.226	0.0823	No
55	HTR2B	1422125_at	5713	0.223	0.0803	No
56	HMGN2	1433507_a_at	5868	0.217	0.0750	No
57	KIRREL3	1431402_at 1441357_at 1452728_at	6137	0.207	0.0644	No
58	P2RX5	1449433_at	6154	0.207	0.0654	No
59	LMX1A	1421554_at	6193	0.205	0.0654	No
60	GPR15	1431296_at	6321	0.201	0.0613	No
61	NOG	1422300_at	6324	0.201	0.0629	No
62	FILIP1	1436650_at 1444075_at	6437	0.197	0.0594	No
63	TFDP2	1435344_at 1437174_at 1443962_at 1445873_at	6508	0.195	0.0578	No
64	HOXA11	1420414_at	6511	0.195	0.0593	No
65	TBX4	1426321_at 1456033_at	6532	0.194	0.0600	No
66	AICDA	1420577_at	6540	0.193	0.0613	No
67	SOX3	1435192_at 1450485_at	6685	0.188	0.0563	No
68	ADAMTS9	1431399_at 1437785_at	6931	0.180	0.0465	No
69	FLT1	1419300_at 1440926_at 1451756_at 1454037_a_at	7106	0.175	0.0400	No
70	ABCB4	1449818_at	7298	0.170	0.0327	No
71	CLDN23	1424409_at	7309	0.169	0.0336	No
72	CSPG3	1423604_at 1434679_at 1444020_at	7593	0.161	0.0220	No
73	ACTA1	1427735_a_at	7667	0.158	0.0199	No
74	NLK	1419112_at 1435970_at 1443279_at 1445427_at 1456467_s_at	7740	0.156	0.0179	No
75	PRRX1	1425526_a_at 1425527_at 1425528_at 1432129_a_at 1439774_at 1458004_at	7916	0.151	0.0111	No
76	FOXP2	1422014_at 1438231_at 1438232_at 1440108_at 1441365_at 1458191_at	7919	0.151	0.0123	No
77	RUNX2	1424704_at 1425389_a_at 1426034_a_at	7937	0.151	0.0128	No
78	MYO15A	1421615_at	8208	0.144	0.0016	No
79	NRAP	1421253_at	8332	0.141	-0.0029	No
80	ASPH	1420959_at 1425274_at 1425275_at 1426015_s_at 1436455_at 1450058_at	8373	0.140	-0.0035	No
81	AMBN	1449417_at	8870	0.127	-0.0253	No
82	DGKI	1439986_at 1442813_at	8975	0.125	-0.0290	No
83	HOXB8	1452493_s_at	9030	0.123	-0.0305	No
84	GSC	1421412_at	9068	0.122	-0.0311	No
85	MAB21L2	1418934_at	9210	0.119	-0.0366	No
86	BHLHB5	1418271_at	9217	0.119	-0.0359	No
87	HAS2	1418678_at 1449169_at	9237	0.118	-0.0358	No
88	HOXA10	1431475_a_at 1446408_at	9730	0.106	-0.0575	No
89	LHX9	1419324_at 1431598_a_at 1441313_x_at	9846	0.103	-0.0620	No
90	GAN	1439615_at	10006	0.100	-0.0684	No
91	CPS1	1455540_at	10087	0.098	-0.0713	No
92	POU3F2	1450831_at 1453478_at 1457734_at	10230	0.094	-0.0770	No
93	SMPX	1418095_at	10342	0.092	-0.0814	No
94	ELAVL2	1421881_a_at 1421882_a_at 1421883_at 1433052_at	10772	0.082	-0.1004	No
95	SALL3	1441186_at 1452386_at	10806	0.081	-0.1012	No
96	SEMA3A	1420416_at 1420417_at 1449865_at	10890	0.079	-0.1044	No
97	CLDN14	1420345_at	10935	0.078	-0.1058	No
98	HOXD8	1431099_at 1433638_s_at	10975	0.077	-0.1069	No
99	LUZP1	1416469_at 1448352_at	10980	0.077	-0.1065	No
100	NHLH1	1419533_at	10992	0.076	-0.1063	No
101	CALCR	1418688_at	11094	0.074	-0.1103	No
102	DCTN1	1422521_at 1435414_s_at	11163	0.073	-0.1129	No
103	LMO3	1455754_at	11248	0.071	-0.1161	No
104	LRRN3	1434539_at	11289	0.071	-0.1174	No
105	PPP2R2B	1426621_a_at	11361	0.069	-0.1201	No
106	TNNC1	1418370_at	11414	0.068	-0.1219	No
107	SOX5	1423500_a_at 1432189_a_at 1432190_at 1440827_x_at 1446461_at 1452511_at 1459261_at	11524	0.065	-0.1263	No
108	SLC38A3	1418706_at 1446013_at	11528	0.064	-0.1259	No
109	GABRA1	1421280_at 1421281_at 1436889_at 1455766_at	11630	0.062	-0.1301	No
110	HOXB6	1451660_a_at	11693	0.060	-0.1324	No
111	GPR153	1426973_at	11831	0.057	-0.1382	No
112	DMPK	1422989_a_at 1434944_at	11975	0.053	-0.1444	No
113	BAI3	1446358_at 1454782_at	12054	0.051	-0.1475	No
114	ARHGEF15	1440358_at 1455522_at 1457172_at	12294	0.046	-0.1581	No
115	HOXC10	1439798_at	12336	0.045	-0.1597	No
116	POU2F1	1419716_a_at 1427695_a_at 1427835_at	12594	0.039	-0.1712	No
117	DNAJA4	1418591_at 1418592_at 1434196_at	12644	0.037	-0.1731	No
118	EHD1	1416010_a_at 1416011_x_at 1416012_at 1448175_at	12731	0.036	-0.1768	No
119	TBR1	1416711_at	13048	0.028	-0.1911	No
120	MYOZ2	1418769_at	13279	0.021	-0.2015	No
121	BNC2	1438861_at 1440593_at 1459132_at	13352	0.019	-0.2046	No
122	HSPB7	1421289_at 1421290_at 1434927_at	13506	0.015	-0.2115	No
123	USP2	1417168_a_at 1417169_at	13527	0.014	-0.2123	No
124	USP13	1452442_at 1455473_at	13695	0.010	-0.2199	No
125	CASQ1	1422598_at	13871	0.005	-0.2279	No
126	HAPLN1	1421633_a_at 1426294_at 1426295_at 1438020_at 1445735_at 1458109_at	14162	-0.003	-0.2412	No
127	FOXA2	1422833_at	14175	-0.003	-0.2418	No
128	CACNA2D3	1419225_at	14240	-0.005	-0.2447	No
129	TCEA3	1424531_a_at	14382	-0.010	-0.2511	No
130	RHOBTB1	1429206_at 1429656_at	14489	-0.013	-0.2558	No
131	CRHBP	1436127_at	14583	-0.016	-0.2600	No
132	SALL1	1450489_at	14688	-0.020	-0.2646	No
133	VANGL1	1427234_at	14710	-0.020	-0.2654	No
134	ACCN1	1417994_a_at	14718	-0.021	-0.2655	No
135	NANOS1	1436648_at 1455877_a_at	14872	-0.025	-0.2724	No
136	DLGAP4	1426465_at 1455548_at	14880	-0.025	-0.2725	No
137	TWIST2	1448925_at	14982	-0.029	-0.2769	No
138	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	14991	-0.030	-0.2770	No
139	SV2A	1423406_at	15395	-0.044	-0.2952	No
140	PACSIN3	1416995_at 1431534_at 1437834_s_at 1456191_x_at	15417	-0.045	-0.2958	No
141	RTN1	1429761_at	15473	-0.048	-0.2979	No
142	CFL2	1418066_at 1418067_at 1431432_at	15544	-0.050	-0.3007	No
143	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	15577	-0.051	-0.3017	No
144	TUBA4	1417373_a_at 1417374_at 1417375_at	16036	-0.072	-0.3222	No
145	DUSP14	1431422_a_at	16212	-0.080	-0.3296	No
146	RFX3	1425413_at 1441253_at 1441702_at	16291	-0.085	-0.3324	No
147	ACTG2	1422340_a_at	16889	-0.125	-0.3588	No
148	NRP2	1425433_a_at 1426528_at 1435349_at 1452552_at 1456778_at 1459256_at	16937	-0.129	-0.3599	No
149	CYB561D1	1431021_at 1434226_at 1459837_at	17129	-0.145	-0.3675	No
150	UBE3A	1416680_at 1416681_at 1416682_at 1425206_a_at 1431224_at 1445727_at	17278	-0.159	-0.3730	No
151	SSH3	1447929_at	17308	-0.162	-0.3729	No
152	ADD3	1423297_at 1423298_at 1426574_a_at 1447077_at 1456162_x_at	17322	-0.163	-0.3722	No
153	SLC39A13	1423926_at	17380	-0.168	-0.3734	No
154	SSPN	1417644_at 1417645_at	17564	-0.186	-0.3802	No
155	PIP5K2C	1416387_at 1416388_at	17635	-0.196	-0.3818	No
156	CAPN1	1417228_at 1417229_at	17805	-0.213	-0.3878	No
157	LRRTM1	1437746_at 1452624_at 1455883_a_at	17809	-0.213	-0.3861	No
158	HSPB1	1422943_a_at 1425964_x_at 1427853_a_at 1427854_x_at 1453914_at	17828	-0.216	-0.3851	No
159	ELMO3	1434489_at	17843	-0.217	-0.3840	No
160	ADAM11	1450248_at	17984	-0.235	-0.3884	No
161	ANKMY2	1425482_s_at 1425936_a_at 1451724_at	18035	-0.244	-0.3887	No
162	LPHN2	1434111_at 1434112_at 1444906_at	18234	-0.271	-0.3955	No
163	RHOA	1437628_s_at	18366	-0.289	-0.3991	No
164	COLQ	1448081_at	18390	-0.293	-0.3977	No
165	MITF	1422025_at 1455214_at	18675	-0.333	-0.4080	No
166	MBNL2	1433754_at 1436858_at 1446475_at 1455827_at 1457237_at 1457477_at	18809	-0.356	-0.4111	No
167	PFTK1	1419249_at 1419250_a_at 1441692_at 1445984_at 1453956_a_at	18930	-0.379	-0.4134	No
168	CACNB3	1448656_at	18979	-0.391	-0.4123	No
169	SIN3A	1419101_at 1419102_at 1419900_at 1449343_s_at	19301	-0.463	-0.4232	No
170	RIMS2	1422809_at 1432102_at 1436470_at 1443215_at 1450761_s_at	19648	-0.550	-0.4345	No
171	SH3BGRL3	1416528_at	19649	-0.550	-0.4299	No
172	ZBTB9	1429125_at	19789	-0.590	-0.4313	No
173	SLCO2A1	1420913_at 1450032_at	19797	-0.592	-0.4266	No
174	DNAJA2	1417182_at 1417183_at 1429476_s_at 1457233_at	19956	-0.643	-0.4285	No
175	ATP6V0C	1416392_a_at 1435732_x_at 1438925_x_at	20187	-0.731	-0.4329	No
176	STAG2	1421849_at 1450396_at	20247	-0.758	-0.4293	No
177	TCTA	1420123_at 1420124_s_at 1420125_at 1424068_at	20462	-0.853	-0.4319	No
178	MXI1	1425732_a_at 1450376_at	20751	-1.032	-0.4365	Yes
179	JUNB	1415899_at	20884	-1.130	-0.4331	Yes
180	NEDD4	1421955_a_at 1444044_at 1450431_a_at 1451109_a_at	20897	-1.145	-0.4240	Yes
181	ZPBP2	1429512_at 1460503_at	21001	-1.245	-0.4182	Yes
182	TUBA1	1418884_x_at	21146	-1.412	-0.4130	Yes
183	ARMET	1428112_at 1459455_at	21208	-1.507	-0.4031	Yes
184	ELAVL4	1428741_at 1450258_a_at 1452894_at 1457399_at	21221	-1.522	-0.3909	Yes
185	PRKCQ	1426044_a_at	21352	-1.700	-0.3825	Yes
186	CDC42EP3	1422642_at 1450700_at	21422	-1.841	-0.3702	Yes
187	MYB	1421317_x_at 1422734_a_at 1450194_a_at	21514	-2.063	-0.3571	Yes
188	B4GALT1	1418014_a_at 1458616_at 1458773_at	21533	-2.101	-0.3402	Yes
189	MAS1	1422936_at 1447026_at	21680	-2.572	-0.3253	Yes
190	FGF13	1418497_at 1418498_at	21695	-2.635	-0.3037	Yes
191	TOMM70A	1417192_at 1426675_at 1426676_s_at 1447239_at 1457353_at	21699	-2.663	-0.2815	Yes
192	HIVEP3	1421150_at 1429134_at 1439660_at 1450132_at 1458802_at	21730	-2.819	-0.2591	Yes
193	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	21747	-2.870	-0.2357	Yes
194	DHRS3	1448390_a_at	21748	-2.873	-0.2116	Yes
195	CSNK1E	1417175_at 1417176_at 1435373_at	21762	-2.918	-0.1876	Yes
196	PRKAG1	1417690_at 1433533_x_at 1457803_at	21794	-3.115	-0.1628	Yes
197	RCOR1	1434336_s_at 1437545_at 1454932_at	21798	-3.139	-0.1365	Yes
198	GNB4	1419469_at 1419470_at	21801	-3.148	-0.1101	Yes
199	PPP1R16B	1425414_at 1455080_at	21805	-3.184	-0.0835	Yes
200	KLF2	1448890_at	21824	-3.304	-0.0565	Yes
201	RBM8A	1418119_at 1418120_at	21864	-3.577	-0.0282	Yes
202	ARL6IP2	1416793_at 1416794_at 1431197_at 1435594_at	21882	-3.739	0.0025	Yes