Details for gene set V$E2F1_Q6

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls#SCID_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	SCID
GeneSet	V$E2F1_Q6_01
Enrichment Score (ES)	0.5163989
Normalized Enrichment Score (NES)	1.6775966
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.07985766
FWER p-Value	0.19

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CDCA7	1428069_at 1445681_at	43	4.243	0.0386	Yes
2	HNRPD	1425142_a_at 1446083_at	59	3.935	0.0755	Yes
3	HNRPA1	1423531_a_at 1430020_x_at 1436549_a_at 1442758_at 1446038_at 1455305_x_at 1455740_at	92	3.541	0.1079	Yes
4	FKBP5	1416125_at 1447736_at 1448231_at 1458089_at	110	3.370	0.1393	Yes
5	POLA2	1425794_at 1448369_at 1456713_at	144	3.131	0.1677	Yes
6	HIRA	1436241_s_at 1450049_a_at 1450050_at 1459103_at	251	2.504	0.1868	Yes
7	NOLC1	1428869_at 1428870_at 1450087_a_at	258	2.467	0.2101	Yes
8	MCM6	1416251_at 1438852_x_at 1447756_x_at	280	2.372	0.2318	Yes
9	HTF9C	1434244_x_at 1441920_x_at 1448114_a_at 1448115_at 1453995_a_at 1457620_at	310	2.282	0.2522	Yes
10	ACO2	1436934_s_at 1442102_at 1451002_at	402	2.038	0.2675	Yes
11	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	473	1.879	0.2823	Yes
12	ATP5G2	1415980_at 1456128_at	502	1.824	0.2984	Yes
13	ESPL1	1433862_at	718	1.428	0.3022	Yes
14	UNG	1425753_a_at	734	1.410	0.3150	Yes
15	WEE1	1416773_at 1416774_at	753	1.388	0.3274	Yes
16	GMNN	1417506_at	766	1.376	0.3400	Yes
17	ATAD2	1436174_at 1443146_at 1443229_at	798	1.334	0.3513	Yes
18	RAD51	1418281_at	812	1.324	0.3634	Yes
19	TOPBP1	1452241_at 1458480_at	1029	1.121	0.3642	Yes
20	MYC	1424942_a_at	1043	1.111	0.3742	Yes
21	CLSPN	1441984_at 1456280_at	1091	1.069	0.3823	Yes
22	POLE2	1427094_at 1431440_at	1190	1.000	0.3873	Yes
23	TMPO	1421237_at 1426020_at 1426349_s_at 1428976_at 1452036_a_at	1357	0.910	0.3884	Yes
24	CDC45L	1416575_at 1457838_at	1397	0.889	0.3951	Yes
25	RANBP1	1422547_at	1425	0.874	0.4022	Yes
26	PPRC1	1426381_at	1520	0.834	0.4058	Yes
27	RQCD1	1450887_at	1563	0.810	0.4117	Yes
28	MXD3	1422970_at 1438847_at 1448878_at	1622	0.783	0.4165	Yes
29	PHF5A	1424170_at	1645	0.768	0.4228	Yes
30	ORC1L	1422663_at 1443172_at	1723	0.732	0.4263	Yes
31	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	1759	0.718	0.4315	Yes
32	AMD1	1448484_at	1771	0.713	0.4378	Yes
33	POLD3	1426838_at 1426839_at 1443733_x_at 1459647_at	1778	0.711	0.4443	Yes
34	RB1CC1	1418968_at 1431605_at 1449292_at	1798	0.704	0.4502	Yes
35	DNAJC9	1426473_at	1805	0.702	0.4566	Yes
36	UXT	1418986_a_at	1888	0.671	0.4593	Yes
37	MCM2	1434079_s_at 1448777_at	1953	0.651	0.4626	Yes
38	JPH1	1421520_at 1438428_at	1986	0.642	0.4672	Yes
39	NASP	1416042_s_at 1416043_at 1440328_at 1442728_at	2004	0.634	0.4725	Yes
40	YBX2	1420762_a_at	2026	0.628	0.4775	Yes
41	FAF1	1418242_at 1434370_s_at	2178	0.584	0.4762	Yes
42	SLC25A1	1428190_at	2183	0.583	0.4815	Yes
43	INSM1	1421399_at 1455865_at	2184	0.583	0.4871	Yes
44	MCM7	1416030_a_at 1416031_s_at 1438320_s_at	2279	0.560	0.4882	Yes
45	LRP1	1442849_at 1448655_at	2316	0.548	0.4917	Yes
46	SUV39H1	1427382_a_at 1432227_at 1432236_a_at	2351	0.541	0.4953	Yes
47	AP1S1	1416087_at	2354	0.540	0.5004	Yes
48	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	2419	0.526	0.5025	Yes
49	NCL	1415771_at 1415772_at 1415773_at 1442404_at 1456528_x_at	2458	0.516	0.5057	Yes
50	NUMA1	1423974_at 1423975_s_at 1441090_at 1444576_at 1444577_x_at	2467	0.514	0.5102	Yes
51	MRPL40	1448849_at	2546	0.499	0.5114	Yes
52	ILF3	1422546_at 1436802_at 1460669_at	2570	0.492	0.5151	Yes
53	RPL18	1437005_a_at 1450372_a_at	2642	0.481	0.5164	Yes
54	ATM	1421205_at 1428830_at	2801	0.453	0.5135	No
55	PCSK1	1421396_at	2937	0.428	0.5114	No
56	SYNGR4	1418875_at	3049	0.410	0.5102	No
57	PRPS1	1416052_at	3171	0.392	0.5084	No
58	AK2	1448450_at 1448451_at	3259	0.380	0.5080	No
59	TYRO3	1425248_a_at 1425249_a_at	3303	0.375	0.5096	No
60	DNAJC11	1433880_at 1433881_at 1439763_at 1446686_at 1447055_at	3439	0.358	0.5068	No
61	MCM8	1429557_at	3676	0.335	0.4992	No
62	ENPP1	1419276_at 1459546_s_at	3899	0.317	0.4920	No
63	DHH	1422127_at 1434959_at	4389	0.282	0.4722	No
64	PAQR4	1423101_at	4481	0.277	0.4707	No
65	PKMYT1	1418481_at 1438601_at	4550	0.273	0.4702	No
66	FANCC	1442265_at 1447632_at 1450861_at	4769	0.264	0.4627	No
67	STMN1	1415849_s_at	4880	0.258	0.4601	No
68	ERBB2IP	1428011_a_at 1439079_a_at 1439080_at 1439638_at 1440573_at	5173	0.245	0.4490	No
69	ERF	1422114_at 1435561_at	5583	0.228	0.4324	No
70	FHOD1	1435557_at	5614	0.227	0.4332	No
71	FZD1	1422985_at 1437284_at	5631	0.226	0.4346	No
72	DNAJC5G	1437814_at	5670	0.225	0.4350	No
73	RBL1	1424156_at 1425166_at 1432604_at 1454293_at	5694	0.224	0.4361	No
74	STK35	1431107_at 1439802_at	5726	0.223	0.4368	No
75	HMGN2	1433507_a_at	5868	0.217	0.4324	No
76	KCNS2	1421342_at 1441211_at 1457325_at	5975	0.213	0.4296	No
77	E2F3	1427462_at 1434564_at	6026	0.211	0.4293	No
78	MCM4	1416214_at 1436708_x_at	6049	0.210	0.4303	No
79	NPAT	1456485_at 1459185_at	6586	0.192	0.4075	No
80	PCNA	1417947_at	7044	0.177	0.3882	No
81	RAVER1	1427110_at 1427111_s_at 1444966_at	7164	0.174	0.3844	No
82	HR	1422110_at 1435950_at	7231	0.172	0.3830	No
83	AP4M1	1418846_at	7271	0.170	0.3828	No
84	E2F1	1417878_at 1431875_a_at 1447840_x_at	7608	0.160	0.3689	No
85	CASP2	1448165_at	8316	0.141	0.3378	No
86	SP1	1418180_at 1448994_at 1454852_at	8439	0.138	0.3335	No
87	MYH10	1441057_at 1452740_at	8799	0.129	0.3183	No
88	GNG4	1417943_at 1417944_at 1447669_s_at	9322	0.116	0.2954	No
89	TNF	1419607_at	9455	0.113	0.2904	No
90	HMGA2	1422851_at 1443394_at 1446196_at 1450780_s_at 1450781_at 1458241_at	9590	0.110	0.2853	No
91	FANCG	1420960_at	9663	0.108	0.2830	No
92	CTNND2	1422592_at 1438891_at 1443638_at 1445114_at 1447552_s_at 1456116_at	9716	0.107	0.2816	No
93	EFNA5	1421796_a_at 1436866_at 1440052_at 1446383_at 1451930_at	10079	0.098	0.2660	No
94	HNRPR	1427129_a_at 1438807_at 1452030_a_at	10304	0.093	0.2565	No
95	IRX3	1418517_at	10452	0.089	0.2506	No
96	BMP2	1423635_at	10564	0.087	0.2464	No
97	CNOT3	1435965_at 1441465_at	11144	0.073	0.2205	No
98	MAZ	1427099_at	11861	0.056	0.1881	No
99	REPS2	1435389_at 1446652_at	11974	0.053	0.1835	No
100	PHF15	1430081_at 1455345_at	12053	0.051	0.1804	No
101	HOXC10	1439798_at	12336	0.045	0.1679	No
102	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	12344	0.045	0.1680	No
103	POU2F1	1419716_a_at 1427695_a_at 1427835_at	12594	0.039	0.1569	No
104	ARHGAP11A	1438434_at	12759	0.035	0.1497	No
105	UFD1L	1418087_at 1432367_a_at	12812	0.034	0.1476	No
106	PTMA	1423455_at	12819	0.034	0.1477	No
107	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	12965	0.030	0.1413	No
108	ACBD6	1452601_a_at 1453199_at	13205	0.024	0.1305	No
109	ANKHD1	1419867_a_at 1436597_at 1440754_at 1441597_at 1442641_at 1448008_at 1453023_at 1455759_a_at	13446	0.017	0.1197	No
110	USP2	1417168_a_at 1417169_at	13527	0.014	0.1161	No
111	IPO7	1442511_at 1454955_at 1458165_at	13685	0.010	0.1090	No
112	PCDH10	1421311_at 1425563_s_at 1430667_at 1438134_at 1442565_at 1444301_at	13780	0.008	0.1048	No
113	IGSF4D	1435145_at 1435146_s_at 1435147_x_at 1436743_at 1440412_at 1444664_at 1459761_x_at	14130	-0.002	0.0888	No
114	SYNCRIP	1422768_at 1422769_at 1426402_at 1428546_at 1450743_s_at	14132	-0.002	0.0887	No
115	PODN	1435180_at	14260	-0.006	0.0829	No
116	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	14403	-0.011	0.0765	No
117	TMEM15	1424366_at	15201	-0.037	0.0403	No
118	KLF5	1430255_at 1451021_a_at 1451739_at	15319	-0.042	0.0353	No
119	MSH2	1416988_at 1447888_x_at	15440	-0.046	0.0302	No
120	ACTN3	1418677_at	15976	-0.069	0.0063	No
121	GADD45B	1420197_at 1449773_s_at 1450971_at	16031	-0.072	0.0045	No
122	PHF13	1455175_at	16417	-0.093	-0.0123	No
123	CASP8AP2	1449217_at	16429	-0.094	-0.0119	No
124	WHSC1L1	1442085_at 1447931_at 1455668_at 1457630_at 1457793_a_at 1457794_at 1459907_a_at	16449	-0.095	-0.0119	No
125	GSPT1	1426736_at 1426737_at 1435000_at 1446550_at 1452168_x_at 1455173_at	16459	-0.096	-0.0114	No
126	SMARCA1	1460292_a_at	16584	-0.104	-0.0161	No
127	SFRS1	1428099_a_at 1428100_at 1430982_at 1434972_x_at 1452430_s_at 1453722_s_at 1457136_at	16751	-0.116	-0.0226	No
128	ATE1	1420036_at 1420651_at 1420652_at 1435173_at 1446611_at 1449709_s_at	17123	-0.144	-0.0383	No
129	GATA1	1449232_at	17210	-0.153	-0.0408	No
130	CBX5	1421932_at 1421933_at 1421934_at 1450416_at 1454636_at 1459845_at	17244	-0.156	-0.0408	No
131	DLEU2	1427410_at 1427411_s_at 1456145_at	17253	-0.157	-0.0397	No
132	PRKDC	1451576_at	17327	-0.164	-0.0414	No
133	GPRC5B	1424613_at 1451411_at	17333	-0.164	-0.0401	No
134	CCNT1	1419313_at 1456477_at	17385	-0.169	-0.0408	No
135	EED	1448653_at	17478	-0.178	-0.0434	No
136	HCN3	1451023_at	17698	-0.200	-0.0515	No
137	FBXO5	1429499_at	17869	-0.220	-0.0572	No
138	EZH2	1416544_at 1444263_at	17898	-0.223	-0.0564	No
139	USP37	1434242_at 1438212_at	18018	-0.241	-0.0595	No
140	MGAT2	1426350_at 1452037_at	18023	-0.242	-0.0574	No
141	CHD4	1436343_at 1438476_a_at 1451295_a_at	18186	-0.264	-0.0623	No
142	SFRS12	1427134_at 1427135_at 1427136_s_at 1458056_at	18233	-0.271	-0.0618	No
143	USP52	1426700_a_at	18283	-0.280	-0.0614	No
144	TCF8	1418926_at 1420243_at 1443005_at 1443203_at 1446127_at 1456686_at	18318	-0.283	-0.0603	No
145	BRMS1L	1452850_s_at 1460443_at	18343	-0.286	-0.0586	No
146	PPM1D	1434142_at 1449092_at 1459069_at	18374	-0.291	-0.0572	No
147	CDC25A	1417131_at 1417132_at 1445995_at	18425	-0.297	-0.0567	No
148	SPHK2	1417431_a_at 1426230_at	18457	-0.301	-0.0552	No
149	TBX6	1449868_at	18581	-0.319	-0.0579	No
150	ASXL2	1439063_at 1444754_at 1453295_at 1458366_at 1460597_at	18697	-0.335	-0.0599	No
151	HNRPUL1	1451984_at	18773	-0.350	-0.0600	No
152	ADAMTS2	1435990_at 1455720_at 1457058_at	18967	-0.388	-0.0652	No
153	SIN3A	1419101_at 1419102_at 1419900_at 1449343_s_at	19301	-0.463	-0.0761	No
154	DDB2	1425706_a_at 1436680_s_at	19308	-0.465	-0.0719	No
155	SFRS2	1415807_s_at 1427504_s_at 1427816_at 1452439_s_at	19530	-0.519	-0.0771	No
156	DNMT1	1422946_a_at 1435122_x_at 1445637_at 1447877_x_at	19582	-0.533	-0.0743	No
157	CTCF	1418330_at 1449042_at	19751	-0.580	-0.0765	No
158	CDC5L	1428092_at 1460429_at	19943	-0.639	-0.0792	No
159	STAG2	1421849_at 1450396_at	20247	-0.758	-0.0859	No
160	RAB11B	1423448_at	20399	-0.825	-0.0849	No
161	SUMO1	1438289_a_at 1444557_at 1451005_at 1456349_x_at	20469	-0.858	-0.0799	No
162	NCOA6	1423374_at	20631	-0.939	-0.0783	No
163	TRIM39	1418851_at	20684	-0.980	-0.0713	No
164	FLI1	1422024_at 1433512_at 1441584_at	20787	-1.055	-0.0659	No
165	PIK3CD	1422991_at 1422992_s_at 1443798_at 1453281_at 1458321_at	20914	-1.159	-0.0606	No
166	PPP1R8	1424554_at 1435821_s_at	21012	-1.255	-0.0531	No
167	STAG1	1421939_a_at 1421940_at 1431921_a_at 1434189_at 1435731_x_at 1445145_at 1445652_at 1450420_at	21105	-1.362	-0.0443	No
168	MTSS1	1424826_s_at 1434036_at 1440847_at 1443729_at 1446284_at 1451496_at	21124	-1.383	-0.0319	No
169	MCM3	1420029_at 1426653_at	21483	-1.983	-0.0294	No
170	KBTBD7	1428192_at 1439865_at 1452700_s_at	21583	-2.218	-0.0128	No
171	ID3	1416630_at	21780	-3.031	0.0072	No