Details for gene set V$CEBP

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls#SCID_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$CEBP_01
Enrichment Score (ES)	-0.4465447
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.4767832
Nominal p-value	0.0019455253
FDR q-value	0.2108593
FWER p-Value	0.932

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PSMA1	1415695_at 1436769_at 1436770_x_at 1458292_at	8	6.245	0.0567	No
2	BCL11B	1440137_at 1441762_at 1450339_a_at	186	2.915	0.0752	No
3	CSK	1423518_at 1439744_at	289	2.344	0.0919	No
4	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	376	2.102	0.1072	No
5	SUPT16H	1419741_at 1449578_at 1456449_at	449	1.937	0.1216	No
6	UTX	1427235_at 1427672_a_at 1440524_at 1441201_at 1445198_at 1446234_at 1446278_at	947	1.192	0.1096	No
7	PPP1CB	1426205_at 1431328_at 1433540_x_at 1456462_x_at	1050	1.104	0.1150	No
8	EVI2A	1443894_at 1450241_a_at 1458788_at 1460055_at	1110	1.055	0.1220	No
9	STOML2	1448774_at	1157	1.019	0.1292	No
10	ZNF462	1439106_at 1456789_at	1172	1.009	0.1377	No
11	SYNE2	1427982_s_at 1438585_at 1442285_at 1447159_at 1459322_at	1249	0.965	0.1431	No
12	CS	1422577_at 1422578_at 1450667_a_at	1256	0.961	0.1516	No
13	PCDH8	1417051_at 1432491_at 1447825_x_at	1269	0.954	0.1597	No
14	EYA1	1421727_at 1443117_at 1457424_at	1310	0.929	0.1664	No
15	TNRC15	1439837_at 1446275_at 1451856_at 1457472_at	1428	0.873	0.1690	No
16	FABP1	1417556_at 1448764_a_at	1591	0.796	0.1688	No
17	KPNA3	1421828_at 1445527_at 1446538_at 1450385_at 1450386_at	1831	0.695	0.1642	No
18	NPR3	1435184_at 1448024_at 1450286_at	1929	0.659	0.1657	No
19	RBMS1	1418703_at 1434005_at 1441437_at 1458578_at 1459968_at	2213	0.577	0.1580	No
20	TMEM10	1435854_at 1447487_at	2548	0.499	0.1472	No
21	NUP155	1418727_at 1449200_at	2793	0.453	0.1401	No
22	PVRL1	1438111_at 1438421_at 1440131_at 1446488_at 1450819_at	2967	0.425	0.1360	No
23	SEPHS2	1418325_at 1449040_a_at	2985	0.423	0.1391	No
24	DNM3	1425403_at 1436624_at 1436875_at 1438801_at 1445540_at 1446265_at 1446431_at 1446694_at 1457405_at	3145	0.396	0.1354	No
25	IGSF4	1417376_a_at 1417377_at 1417378_at 1431611_a_at	3240	0.383	0.1346	No
26	RALY	1418573_a_at	3532	0.348	0.1244	No
27	FOXD3	1422210_at	3541	0.347	0.1272	No
28	SPA17	1417635_at	3569	0.344	0.1291	No
29	PLXNC1	1423213_at 1423214_at 1443433_at 1443434_s_at 1450905_at 1450906_at	3804	0.324	0.1213	No
30	PRDM10	1441764_at 1444812_at	3974	0.310	0.1163	No
31	GPX1	1460671_at	4159	0.297	0.1106	No
32	COL2A1	1450567_a_at	4182	0.296	0.1123	No
33	PFKFB1	1427213_at	4583	0.272	0.0964	No
34	KCNJ1	1418613_at 1418614_at	4611	0.271	0.0976	No
35	SLITRK3	1439250_at	4623	0.270	0.0996	No
36	ITGB1BP2	1423238_at	4624	0.270	0.1020	No
37	CALN1	1425846_a_at	4738	0.265	0.0993	No
38	WWP2	1438482_at 1442162_at 1448145_at 1448146_at 1456714_at 1457499_at	4832	0.260	0.0974	No
39	MAP4K4	1422615_at 1440609_at 1448050_s_at 1459912_at	4839	0.259	0.0995	No
40	PRDM1	1420425_at 1444997_at	4910	0.257	0.0986	No
41	CLDN2	1417231_at 1417232_at	5049	0.251	0.0945	No
42	POU3F4	1422164_at 1422165_at	5317	0.239	0.0844	No
43	CD86	1420404_at 1449858_at	5473	0.232	0.0794	No
44	POU3F3	1422331_at 1435197_at	5623	0.226	0.0746	No
45	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	5785	0.221	0.0692	No
46	CSAD	1427981_a_at	6082	0.209	0.0575	No
47	OSR2	1426155_a_at 1430950_at	6279	0.202	0.0504	No
48	HOXA11	1420414_at	6511	0.195	0.0415	No
49	SV2B	1434800_at 1435687_at	6743	0.187	0.0326	No
50	TITF1	1422346_at	6856	0.183	0.0291	No
51	UBXD3	1426007_a_at 1451906_at 1456385_x_at 1457581_at	7058	0.177	0.0215	No
52	SFRS6	1416720_at 1416721_s_at 1447898_s_at 1448454_at	7077	0.176	0.0223	No
53	CDH13	1423551_at 1431824_at 1454015_a_at 1459535_at	7175	0.173	0.0194	No
54	RNF19	1417508_at 1417509_at	7184	0.173	0.0206	No
55	SSTR5	1445459_at	7323	0.169	0.0158	No
56	HOXB3	1427605_at 1456229_at	7398	0.167	0.0139	No
57	PLEK	1417523_at 1448748_at 1448749_at	7428	0.166	0.0141	No
58	FIGN	1450268_at	7499	0.164	0.0124	No
59	CDH16	1448906_at	7520	0.163	0.0130	No
60	CLDN16	1420434_at	7831	0.153	0.0001	No
61	LSAMP	1443754_x_at 1455636_at 1460092_at	8099	0.147	-0.0108	No
62	OLFM2	1435790_at	8407	0.139	-0.0237	No
63	SHOX2	1420559_a_at 1438042_at	8521	0.136	-0.0276	No
64	KCTD4	1420537_at 1441801_at	8652	0.133	-0.0324	No
65	NEUROG1	1438551_at 1450836_at	8727	0.131	-0.0346	No
66	PURG	1424970_at 1452029_a_at	8751	0.130	-0.0345	No
67	NEUROD1	1426412_at 1426413_at	8767	0.130	-0.0340	No
68	KCNQ4	1435721_at 1442909_at	8914	0.126	-0.0395	No
69	ATOH1	1449822_at	9016	0.124	-0.0431	No
70	GNGT2	1428733_at	9037	0.123	-0.0428	No
71	MYOCD	1425808_a_at 1425978_at	9321	0.116	-0.0548	No
72	HAGH	1424171_a_at 1424172_at 1437519_x_at	9373	0.115	-0.0561	No
73	TNF	1419607_at	9455	0.113	-0.0588	No
74	NUDT10	1435061_at	9554	0.111	-0.0623	No
75	YTHDF1	1415767_at 1437102_at 1437456_x_at	9690	0.107	-0.0675	No
76	HOXA10	1431475_a_at 1446408_at	9730	0.106	-0.0683	No
77	ADM	1416077_at 1447839_x_at	10131	0.097	-0.0859	No
78	CACNB1	1425777_at 1426108_s_at 1440940_at 1451834_at	10138	0.097	-0.0853	No
79	IL13	1420802_at	10244	0.094	-0.0892	No
80	MAMDC1	1442206_at 1442561_at 1445372_at 1458147_at	10294	0.093	-0.0906	No
81	ACLY	1425326_at 1438389_x_at 1439445_x_at 1439459_x_at 1446315_at 1451666_at	10308	0.093	-0.0904	No
82	NR3C1	1421866_at 1421867_at 1453860_s_at 1457635_s_at 1460303_at	10372	0.091	-0.0924	No
83	KCNK2	1445929_at 1449158_at	10596	0.086	-0.1019	No
84	NUDT3	1451575_a_at	10719	0.084	-0.1068	No
85	RORA	1420583_a_at 1424034_at 1424035_at 1436325_at 1436326_at 1441085_at 1443511_at 1443647_at 1446360_at 1455165_at 1457177_at 1458129_at	10762	0.082	-0.1079	No
86	ELAVL2	1421881_a_at 1421882_a_at 1421883_at 1433052_at	10772	0.082	-0.1076	No
87	SEMA3A	1420416_at 1420417_at 1449865_at	10890	0.079	-0.1123	No
88	SLC31A1	1433750_at 1455285_at	10920	0.078	-0.1129	No
89	VAX1	1421774_at	10974	0.077	-0.1146	No
90	NFATC4	1423380_s_at 1432821_at 1454369_a_at	10981	0.077	-0.1142	No
91	A2BP1	1418314_a_at 1438217_at 1447735_x_at 1455358_at 1456921_at	11030	0.075	-0.1157	No
92	LMO3	1455754_at	11248	0.071	-0.1250	No
93	ZCCHC5	1437355_at	11281	0.071	-0.1259	No
94	SOX5	1423500_a_at 1432189_a_at 1432190_at 1440827_x_at 1446461_at 1452511_at 1459261_at	11524	0.065	-0.1364	No
95	ERG	1425370_a_at 1440244_at	11676	0.061	-0.1428	No
96	HOXB6	1451660_a_at	11693	0.060	-0.1430	No
97	OBFC1	1434737_at 1441896_x_at 1445544_x_at 1456679_at 1458998_at	11918	0.054	-0.1528	No
98	VSNL1	1420955_at 1450055_at	11945	0.054	-0.1535	No
99	SLC35A2	1422827_x_at 1432533_a_at 1436664_a_at 1439433_a_at 1453858_at 1457024_x_at	11983	0.053	-0.1547	No
100	JARID2	1422698_s_at 1446082_at 1450710_at 1456661_at	12069	0.051	-0.1582	No
101	PPM1E	1434990_at 1445741_at	12076	0.050	-0.1580	No
102	SOX2	1416967_at	12260	0.046	-0.1660	No
103	HAND2	1422221_at 1436041_at 1443854_at 1446812_at	12388	0.044	-0.1714	No
104	LRFN5	1441502_at 1454687_at	12486	0.041	-0.1755	No
105	OTX1	1437601_at	12770	0.035	-0.1882	No
106	EVI1	1423011_at 1438325_at	12919	0.031	-0.1947	No
107	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	12965	0.030	-0.1965	No
108	PCDH9	1439322_at 1442659_at 1444215_at 1444724_at 1445052_at 1445061_at 1457973_at	12998	0.029	-0.1977	No
109	ARHGAP5	1423194_at 1450896_at 1450897_at 1457410_at	13009	0.029	-0.1979	No
110	NPAS2	1421036_at 1421037_at	13184	0.024	-0.2057	No
111	PER2	1417602_at 1417603_at 1445892_at 1457350_at	13291	0.021	-0.2104	No
112	BNC2	1438861_at 1440593_at 1459132_at	13352	0.019	-0.2130	No
113	NKX2-2	1421112_at	13361	0.019	-0.2132	No
114	SAMSN1	1421457_a_at 1431539_at	13388	0.018	-0.2142	No
115	FOSB	1422134_at	13390	0.018	-0.2141	No
116	PRELP	1416321_s_at 1416322_at	13432	0.017	-0.2158	No
117	WRN	1425074_at 1425982_a_at 1450163_a_at	13473	0.016	-0.2175	No
118	DLL1	1419204_at	13645	0.011	-0.2253	No
119	HEY1	1415999_at	13675	0.010	-0.2265	No
120	WNT1	1425377_at	13758	0.008	-0.2302	No
121	ST5	1428372_at	14095	-0.001	-0.2456	No
122	EDNRA	1433525_at 1440093_at 1451691_at 1460513_a_at	14216	-0.005	-0.2511	No
123	CACNG2	1420596_at 1440210_at 1453363_at	14231	-0.005	-0.2517	No
124	CACNA2D3	1419225_at	14240	-0.005	-0.2520	No
125	SUMO2	1415782_at	14318	-0.007	-0.2555	No
126	GCNT2	1421415_s_at 1425503_at 1430826_s_at 1437607_at 1438660_at 1450238_at 1451733_at 1453674_at	14367	-0.009	-0.2576	No
127	TNFSF10	1420412_at 1439680_at 1459913_at	14582	-0.016	-0.2673	No
128	GNAZ	1426517_at 1435268_at	14658	-0.019	-0.2706	No
129	GRIN2B	1422223_at 1431700_at	14738	-0.021	-0.2741	No
130	SLC24A4	1435206_at	14839	-0.024	-0.2784	No
131	ENAM	1421699_at	14970	-0.029	-0.2842	No
132	IGFBP5	1422313_a_at 1452114_s_at	14975	-0.029	-0.2841	No
133	LTBP1	1419786_at 1440678_at 1446232_at 1447547_at 1448870_at 1457852_at 1458739_at	15313	-0.041	-0.2992	No
134	DDX52	1434607_at 1434608_at	15314	-0.041	-0.2988	No
135	TNMD	1417979_at	15427	-0.046	-0.3036	No
136	RIMS1	1435667_at 1438305_at 1444393_at	15693	-0.056	-0.3152	No
137	PEX16	1425021_a_at 1436253_at 1447801_x_at	15912	-0.066	-0.3247	No
138	SEPX1	1418888_a_at	16272	-0.084	-0.3404	No
139	HPCAL1	1448812_at	16305	-0.085	-0.3411	No
140	SPINK5	1430567_at	16315	-0.086	-0.3407	No
141	NCDN	1416852_a_at 1416853_at	16457	-0.095	-0.3463	No
142	CCDC6	1428311_at 1459159_a_at	16614	-0.106	-0.3525	No
143	ZFHX1B	1422748_at 1434298_at 1442393_at 1445518_at 1454200_at 1456389_at	16812	-0.119	-0.3605	No
144	GSTA4	1416368_at	16843	-0.121	-0.3608	No
145	TACSTD2	1423323_at	16871	-0.124	-0.3609	No
146	CASK	1422518_at 1422519_at 1427692_a_at 1445152_at	16955	-0.130	-0.3635	No
147	DAPK1	1426915_at 1427358_a_at 1445032_at	17131	-0.145	-0.3703	No
148	LBX1	1422323_a_at 1427400_at	17313	-0.162	-0.3771	No
149	PAK1IP1	1423766_at 1430875_a_at	17568	-0.186	-0.3871	No
150	POLR3F	1429686_at 1430328_at 1431999_at 1439075_at 1451773_s_at	17695	-0.200	-0.3910	No
151	CHCHD7	1440158_x_at 1444318_at 1446844_at 1454640_at	17703	-0.201	-0.3895	No
152	LRRTM1	1437746_at 1452624_at 1455883_a_at	17809	-0.213	-0.3924	No
153	SMAD5	1421047_at 1433641_at 1451873_a_at	17862	-0.219	-0.3928	No
154	ANGPT2	1422415_at 1446903_at 1448831_at	18431	-0.298	-0.4162	No
155	RGS3	1425701_a_at 1427648_at 1449516_a_at 1454026_a_at	18473	-0.303	-0.4153	No
156	TPM1	1423049_a_at 1423721_at 1447713_at 1456623_at	18508	-0.307	-0.4141	No
157	MNT	1418192_at	18590	-0.320	-0.4149	No
158	TGIF	1422286_a_at	18672	-0.332	-0.4156	No
159	BCAR3	1415936_at 1431564_at	18956	-0.386	-0.4251	No
160	LEMD2	1424326_at	18970	-0.388	-0.4221	No
161	TOP1	1423474_at 1438495_at 1457573_at 1459672_at	19100	-0.415	-0.4242	No
162	NRAS	1422688_a_at 1454060_a_at	19135	-0.424	-0.4219	No
163	CHD6	1427384_at 1431047_at	19393	-0.483	-0.4293	No
164	CPEB4	1420617_at 1420618_at 1449931_at	19768	-0.585	-0.4412	Yes
165	ZBTB9	1429125_at	19789	-0.590	-0.4367	Yes
166	HS3ST3B1	1421331_at 1421332_at 1433977_at 1442816_at 1444055_at	19819	-0.601	-0.4326	Yes
167	HDAC4	1436758_at 1447566_at 1454693_at	20113	-0.702	-0.4396	Yes
168	PDE3B	1433694_at	20125	-0.705	-0.4337	Yes
169	DOCK9	1445232_at 1446803_at 1446833_at 1446927_at	20128	-0.707	-0.4273	Yes
170	PHOX2B	1422232_at 1455907_x_at	20380	-0.812	-0.4314	Yes
171	EPC2	1455317_at	20395	-0.823	-0.4246	Yes
172	ARRDC4	1424759_at	20520	-0.880	-0.4222	Yes
173	ABI3	1446191_at 1452928_at	20625	-0.934	-0.4185	Yes
174	CENTD1	1436895_at 1446649_at 1452291_at 1456337_at 1458173_at	20747	-1.027	-0.4146	Yes
175	RAMP1	1417481_at 1447474_at	20780	-1.051	-0.4065	Yes
176	ANGPTL2	1421002_at 1431848_at	20782	-1.051	-0.3969	Yes
177	FLI1	1422024_at 1433512_at 1441584_at	20787	-1.055	-0.3875	Yes
178	PURA	1420628_at 1438219_at 1449934_at 1453783_at 1456898_at	20835	-1.087	-0.3797	Yes
179	DUSP2	1450698_at	20842	-1.091	-0.3700	Yes
180	FOXP1	1421140_a_at 1421141_a_at 1421142_s_at 1435222_at 1438802_at 1443258_at 1446280_at 1447209_at 1455242_at 1456851_at	21031	-1.284	-0.3669	Yes
181	USP32	1430403_at 1436159_at 1439857_at 1440399_at 1443689_at 1459857_at	21033	-1.285	-0.3552	Yes
182	SNTB2	1420371_at 1420372_at 1436986_at 1449840_at	21056	-1.304	-0.3443	Yes
183	MTSS1	1424826_s_at 1434036_at 1440847_at 1443729_at 1446284_at 1451496_at	21124	-1.383	-0.3348	Yes
184	MYLIP	1424988_at	21493	-2.022	-0.3332	Yes
185	IHPK2	1428373_at 1435319_at	21544	-2.129	-0.3160	Yes
186	FUT8	1441015_at 1442483_at 1443656_at 1456367_at 1460319_at	21554	-2.160	-0.2967	Yes
187	PPP2CA	1417367_at 1444875_at 1456390_at	21563	-2.190	-0.2771	Yes
188	REST	1425564_at 1425565_at 1428227_at	21648	-2.452	-0.2585	Yes
189	TBL1X	1434643_at 1434644_at 1441435_at 1446736_at 1455042_at	21686	-2.601	-0.2364	Yes
190	FGF13	1418497_at 1418498_at	21695	-2.635	-0.2127	Yes
191	ATRX	1420945_at 1420946_at 1420947_at 1438750_at 1441014_at 1441771_at 1450051_at 1453734_at 1456832_at	21709	-2.755	-0.1882	Yes
192	NEO1	1423513_at 1434931_at 1440789_at 1444295_at 1447693_s_at 1447694_x_at 1459485_at	21731	-2.823	-0.1633	Yes
193	SSBP3	1425940_a_at 1427917_s_at 1439136_at 1443554_at 1457560_at 1458749_at	21778	-3.006	-0.1379	Yes
194	HBP1	1432143_a_at 1438430_at 1446269_at 1460367_at	21819	-3.274	-0.1099	Yes
195	S100A9	1448756_at	21895	-4.073	-0.0761	Yes
196	TEC	1441524_at 1460204_at	21901	-4.227	-0.0377	Yes
197	EGR2	1427682_a_at 1427683_at	21904	-4.293	0.0015	Yes