Details for gene set V$CEBPB

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus.phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls #SCID_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_SCID_versus_ATM_plus.cls#SCID_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$CEBPB_02
Enrichment Score (ES)	-0.45587066
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.491654
Nominal p-value	0.0021141649
FDR q-value	0.22699611
FWER p-Value	0.9

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	MBNL1	1416904_at 1439686_at 1440315_at 1445106_at 1457924_at	61	3.921	0.0280	No
2	H3F3B	1420376_a_at 1430357_at 1455725_a_at	228	2.638	0.0410	No
3	NFIL3	1418932_at	366	2.125	0.0514	No
4	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	376	2.102	0.0675	No
5	DLX1	1449470_at	454	1.923	0.0790	No
6	TGFB3	1417455_at	493	1.839	0.0917	No
7	SOCS2	1418507_s_at 1438470_at 1441476_at 1442586_at 1446085_at 1449109_at	513	1.797	0.1049	No
8	SPRED1	1423160_at 1423161_s_at 1423162_s_at 1428777_at 1441517_at 1442859_at 1443652_x_at 1445228_at 1452911_at 1460116_s_at	553	1.708	0.1165	No
9	FCER1G	1418340_at	768	1.376	0.1175	No
10	ATAD2	1436174_at 1443146_at 1443229_at	798	1.334	0.1266	No
11	SLC25A12	1428440_at 1444489_at	866	1.247	0.1333	No
12	SERPINF1	1416168_at 1453724_a_at	915	1.216	0.1407	No
13	THRA	1426997_at 1443952_at 1454675_at	1041	1.111	0.1436	No
14	PPP1CB	1426205_at 1431328_at 1433540_x_at 1456462_x_at	1050	1.104	0.1519	No
15	AGC1	1449827_at	1154	1.020	0.1552	No
16	EIF4A1	1427058_at 1430980_a_at 1434985_a_at	1229	0.977	0.1594	No
17	H2AFJ	1440252_at	1282	0.944	0.1645	No
18	RASAL2	1436910_at 1444671_at	1298	0.934	0.1711	No
19	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	1392	0.891	0.1738	No
20	RUVBL2	1422482_at	1512	0.835	0.1749	No
21	SDPR	1416778_at 1416779_at 1443832_s_at	1642	0.770	0.1750	No
22	PRDX3	1416292_at	1646	0.768	0.1809	No
23	LMO4	1420981_a_at 1439651_at	1803	0.702	0.1792	No
24	ESR1	1421244_at 1435663_at 1457877_at 1460591_at	1825	0.697	0.1837	No
25	KPNA3	1421828_at 1445527_at 1446538_at 1450385_at 1450386_at	1831	0.695	0.1890	No
26	DYRK3	1424229_at	1850	0.689	0.1935	No
27	GOT1	1450970_at	1919	0.662	0.1956	No
28	ITPR3	1417297_at	2034	0.625	0.1953	No
29	STX18	1425011_x_at 1429288_x_at 1431295_a_at 1435102_a_at 1453819_x_at	2208	0.578	0.1918	No
30	RIN3	1434684_at 1442530_at	2236	0.571	0.1951	No
31	PDAP1	1434019_at 1434020_at	2715	0.466	0.1767	No
32	PCF11	1427159_at 1427160_at 1428724_at 1456489_at	2876	0.438	0.1728	No
33	SEPHS2	1418325_at 1449040_a_at	2985	0.423	0.1712	No
34	CCL3	1419561_at	3075	0.406	0.1703	No
35	MYO1C	1419648_at 1419649_s_at 1449550_at 1449551_at	3172	0.392	0.1689	No
36	DDR2	1422738_at 1455688_at	3796	0.325	0.1428	No
37	PIP5K1A	1421833_at 1421834_at 1450389_s_at	3970	0.311	0.1373	No
38	MPP6	1440396_at 1440490_at 1449348_at	3977	0.310	0.1395	No
39	MRC2	1421044_at 1421045_at 1446466_at	4074	0.302	0.1374	No
40	PLA2G2E	1420674_at	4116	0.300	0.1379	No
41	MAP2K6	1426850_a_at 1459292_at	4140	0.298	0.1392	No
42	RHOB	1449110_at	4240	0.292	0.1369	No
43	PHLDB1	1424467_at 1424468_s_at	4274	0.291	0.1377	No
44	RFX4	1432053_at 1436931_at 1443312_at	4552	0.273	0.1271	No
45	CITED1	1449031_at	4581	0.272	0.1279	No
46	PPARG	1420715_a_at	4732	0.265	0.1231	No
47	CSMD3	1438272_at 1438572_at 1454245_at	4737	0.265	0.1250	No
48	MAP4K4	1422615_at 1440609_at 1448050_s_at 1459912_at	4839	0.259	0.1224	No
49	PCTP	1420983_at 1420984_at	4989	0.253	0.1175	No
50	TRIB1	1424880_at 1424881_at	5044	0.251	0.1170	No
51	STAT3	1424272_at 1426587_a_at 1459961_a_at 1460700_at	5150	0.246	0.1141	No
52	ALDH1A2	1422789_at	5256	0.241	0.1112	No
53	H2AFZ	1441370_at	5496	0.231	0.1020	No
54	DBH	1447592_at 1450670_at 1459848_x_at	5522	0.230	0.1026	No
55	ERF	1422114_at 1435561_at	5583	0.228	0.1017	No
56	KCNH7	1427634_at	5872	0.217	0.0901	No
57	PKNOX2	1428017_at 1433907_at	6018	0.211	0.0851	No
58	PRLR	1421382_at 1425853_s_at 1437397_at 1441102_at 1448556_at 1450226_at 1451844_at 1451850_at	6065	0.210	0.0846	No
59	TOB1	1423176_at 1440844_at	6119	0.208	0.0838	No
60	SLC19A3	1436417_at 1450348_at	6658	0.189	0.0606	No
61	PAFAH2	1448489_at	7339	0.168	0.0306	No
62	FGA	1424279_at	7449	0.165	0.0269	No
63	KCNE3	1418499_a_at	7465	0.165	0.0275	No
64	ARRDC3	1454617_at	7471	0.165	0.0286	No
65	FIGN	1450268_at	7499	0.164	0.0286	No
66	MAP3K3	1426686_s_at 1426687_at 1436522_at	7583	0.161	0.0261	No
67	HOXA5	1443803_x_at 1448926_at	7718	0.157	0.0211	No
68	VNN3	1420723_at	7845	0.153	0.0165	No
69	COL4A4	1425772_at 1440250_at 1445328_at	8395	0.139	-0.0076	No
70	C1QL1	1422777_at	9035	0.123	-0.0361	No
71	CITED4	1425400_a_at 1438261_at	9080	0.122	-0.0371	No
72	WNT5A	1436791_at 1448818_at 1456976_at	9180	0.120	-0.0407	No
73	AQP9	1421605_a_at 1424011_at	9363	0.115	-0.0482	No
74	CYP24A1	1418866_at 1418867_at	9397	0.114	-0.0488	No
75	EDN2	1449161_at	9515	0.112	-0.0533	No
76	RGR	1422832_at	9806	0.104	-0.0659	No
77	PDGFRA	1421916_at 1421917_at 1438946_at	9899	0.102	-0.0693	No
78	EFNA5	1421796_a_at 1436866_at 1440052_at 1446383_at 1451930_at	10079	0.098	-0.0768	No
79	UGP2	1426460_a_at 1426461_at 1434485_a_at 1434486_x_at 1451742_a_at	10093	0.098	-0.0766	No
80	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	10125	0.097	-0.0773	No
81	HNRPR	1427129_a_at 1438807_at 1452030_a_at	10304	0.093	-0.0847	No
82	ACLY	1425326_at 1438389_x_at 1439445_x_at 1439459_x_at 1446315_at 1451666_at	10308	0.093	-0.0841	No
83	SLC6A4	1417150_at	10397	0.091	-0.0875	No
84	SPRY4	1422020_at 1422021_at 1440867_at 1445669_at	10504	0.088	-0.0916	No
85	ELAVL2	1421881_a_at 1421882_a_at 1421883_at 1433052_at	10772	0.082	-0.1033	No
86	LEP	1422582_at	10875	0.079	-0.1073	No
87	LUZP1	1416469_at 1448352_at	10980	0.077	-0.1115	No
88	NHLH1	1419533_at	10992	0.076	-0.1114	No
89	TRPM1	1418935_at 1437445_at 1437531_at 1440241_at	11020	0.076	-0.1121	No
90	SLIT3	1427086_at 1452296_at	11084	0.074	-0.1144	No
91	SOX10	1424985_a_at 1425369_a_at 1451689_a_at	11118	0.074	-0.1153	No
92	ASAH2	1425994_a_at 1450726_at 1458849_at	11225	0.072	-0.1197	No
93	ASGR1	1421944_a_at	11377	0.069	-0.1261	No
94	GYS1	1450196_s_at	11406	0.068	-0.1268	No
95	SOX5	1423500_a_at 1432189_a_at 1432190_at 1440827_x_at 1446461_at 1452511_at 1459261_at	11524	0.065	-0.1317	No
96	ARNT	1419996_s_at 1421721_a_at 1425064_at 1437042_at 1449696_at	11705	0.060	-0.1395	No
97	CIAS1	1425412_at	11795	0.057	-0.1431	No
98	ZADH2	1451277_at	12101	0.050	-0.1568	No
99	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	12597	0.039	-0.1792	No
100	TAC1	1416783_at 1419411_at 1431883_at	12744	0.035	-0.1857	No
101	PLA2G4A	1448558_a_at	12887	0.032	-0.1920	No
102	ASCL2	1422396_s_at 1432018_at 1460514_s_at	12915	0.031	-0.1930	No
103	BDKRB1	1450586_at	12928	0.031	-0.1933	No
104	MOSPD2	1424124_at 1438834_at 1453920_a_at	12967	0.030	-0.1948	No
105	IL1RAPL2	1420462_at 1427645_a_at 1441168_at 1446520_at 1446875_at	13015	0.029	-0.1967	No
106	CHRM1	1439611_at 1450833_at	13032	0.028	-0.1972	No
107	PPL	1460732_a_at	13044	0.028	-0.1975	No
108	TBR1	1416711_at	13048	0.028	-0.1974	No
109	CPNE4	1429443_at 1453888_at	13111	0.026	-0.2001	No
110	BNC2	1438861_at 1440593_at 1459132_at	13352	0.019	-0.2110	No
111	CSPG2	1421694_a_at 1427256_at 1427257_at 1433043_at 1433044_at 1447586_at 1447887_x_at 1459767_x_at	13468	0.016	-0.2161	No
112	HOXC13	1425874_at	13494	0.015	-0.2172	No
113	FMO2	1422904_at 1422905_s_at 1435459_at 1453435_a_at 1454005_at	13637	0.011	-0.2236	No
114	FST	1421365_at 1434458_at	13754	0.008	-0.2289	No
115	PPP1R3D	1452922_at	14038	0.001	-0.2419	No
116	CHD2	1444246_at 1445843_at	14051	0.000	-0.2424	No
117	SYNCRIP	1422768_at 1422769_at 1426402_at 1428546_at 1450743_s_at	14132	-0.002	-0.2461	No
118	FGB	1428079_at	14197	-0.004	-0.2490	No
119	RPA3	1448938_at	14354	-0.009	-0.2561	No
120	BDNF	1422168_a_at 1422169_a_at	14468	-0.012	-0.2612	No
121	P2RY4	1422276_at	14560	-0.015	-0.2653	No
122	PDE4D	1443289_at 1458212_at 1459289_at 1459311_at	14809	-0.023	-0.2765	No
123	PDGFB	1450413_at 1450414_at	14848	-0.025	-0.2781	No
124	MEOX2	1424233_at 1424234_s_at	15069	-0.032	-0.2879	No
125	SP8	1440519_at	15214	-0.037	-0.2943	No
126	PDGFRL	1428896_at	15264	-0.039	-0.2962	No
127	CP	1417494_a_at 1417495_x_at 1417496_at 1417497_at 1441326_at 1448734_at 1448735_at	15377	-0.044	-0.3010	No
128	MTF1	1418333_at 1428979_at 1429170_a_at 1440414_at 1452990_at	15499	-0.049	-0.3062	No
129	SLC12A1	1421390_at 1424260_at 1443126_at	15509	-0.049	-0.3062	No
130	G0S2	1448700_at	15603	-0.052	-0.3101	No
131	RBPMS	1425652_s_at 1429359_s_at 1437161_x_at 1444765_at 1455936_a_at 1459078_at	15720	-0.057	-0.3150	No
132	KCNJ2	1450503_at	15909	-0.066	-0.3231	No
133	SULF1	1436319_at 1438200_at 1446416_at 1457402_at	15995	-0.070	-0.3265	No
134	PCDH7	1427592_at 1437442_at 1449249_at 1456214_at	16003	-0.071	-0.3262	No
135	NEK6	1451043_at	16056	-0.073	-0.3281	No
136	HIST1H1C	1416101_a_at 1436994_a_at 1438204_at	16154	-0.078	-0.3319	No
137	SMARCAD1	1435651_a_at 1440066_at 1452276_at	16433	-0.094	-0.3440	No
138	SMARCA1	1460292_a_at	16584	-0.104	-0.3501	No
139	BCL11A	1419406_a_at 1426552_a_at 1446293_at 1447334_at 1447335_x_at 1453814_at 1456632_at	16608	-0.105	-0.3503	No
140	ZFHX1B	1422748_at 1434298_at 1442393_at 1445518_at 1454200_at 1456389_at	16812	-0.119	-0.3587	No
141	CASK	1422518_at 1422519_at 1427692_a_at 1445152_at	16955	-0.130	-0.3642	No
142	UBE2E2	1424358_at 1447025_at	16965	-0.131	-0.3636	No
143	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	17021	-0.136	-0.3650	No
144	RG9MTD2	1427375_at 1435035_at 1447781_s_at	17170	-0.149	-0.3707	No
145	RRBP1	1426123_a_at 1436660_at 1449221_a_at 1452767_at	17456	-0.176	-0.3824	No
146	BAZ1A	1433599_at 1447930_at	17586	-0.188	-0.3869	No
147	SYNJ1	1436333_a_at 1436334_at 1439672_at 1439997_at 1454961_at	17659	-0.197	-0.3886	No
148	SLC7A11	1420413_at 1443536_at	17899	-0.223	-0.3979	No
149	SMARCA2	1430526_a_at 1439930_at 1452333_at	17965	-0.232	-0.3990	No
150	RPS21	1430288_x_at 1433549_x_at 1433721_x_at 1434358_x_at	18303	-0.282	-0.4123	No
151	ADRB2	1437302_at	18314	-0.283	-0.4106	No
152	COL4A3	1438779_at 1450224_at	18315	-0.283	-0.4083	No
153	PRG4	1449824_at	18404	-0.294	-0.4101	No
154	TGIF	1422286_a_at	18672	-0.332	-0.4198	No
155	PER1	1449851_at	18904	-0.376	-0.4274	No
156	LEMD2	1424326_at	18970	-0.388	-0.4274	No
157	TOP1	1423474_at 1438495_at 1457573_at 1459672_at	19100	-0.415	-0.4301	No
158	CUEDC1	1425920_at 1435358_at 1443455_at 1451447_at	19380	-0.481	-0.4391	No
159	TMPRSS4	1426302_at	19569	-0.529	-0.4436	No
160	PDCL	1423599_a_at 1425149_a_at	19667	-0.554	-0.4437	No
161	RAD23B	1424222_s_at 1450903_at 1455420_at 1456822_at	19773	-0.586	-0.4440	No
162	FBXW7	1424986_s_at 1451558_at	20033	-0.670	-0.4506	Yes
163	PTPN12	1422045_a_at 1439705_at 1450478_a_at 1450479_x_at 1455105_at 1459459_at	20048	-0.675	-0.4460	Yes
164	PDE3B	1433694_at	20125	-0.705	-0.4439	Yes
165	PPM1B	1425330_a_at 1426382_at 1441479_at 1451669_at	20193	-0.732	-0.4413	Yes
166	ARID1B	1439321_at 1455979_at 1456952_at	20316	-0.786	-0.4407	Yes
167	MNAB	1420143_at 1420144_x_at 1426924_at 1426925_at 1438268_at 1446444_at 1456105_at	20369	-0.808	-0.4368	Yes
168	PHOX2B	1422232_at 1455907_x_at	20380	-0.812	-0.4308	Yes
169	SERTAD4	1454877_at	20427	-0.835	-0.4264	Yes
170	HAVCR1	1434716_at 1450364_a_at	20489	-0.866	-0.4224	Yes
171	SPIB	1460407_at	20683	-0.979	-0.4236	Yes
172	EIF4A2	1450934_at	20685	-0.981	-0.4160	Yes
173	RAB3IP	1434306_at 1436103_at	20708	-0.999	-0.4091	Yes
174	FOXP1	1421140_a_at 1421141_a_at 1421142_s_at 1435222_at 1438802_at 1443258_at 1446280_at 1447209_at 1455242_at 1456851_at	21031	-1.284	-0.4139	Yes
175	NDRG1	1423413_at 1450976_at 1456174_x_at	21141	-1.408	-0.4078	Yes
176	DUSP1	1448830_at	21193	-1.485	-0.3985	Yes
177	BMF	1422995_at 1454880_s_at 1458325_x_at	21256	-1.564	-0.3891	Yes
178	EHF	1419474_a_at 1419475_a_at 1447760_x_at 1451375_at	21461	-1.936	-0.3833	Yes
179	CACNB2	1441521_at 1444693_at 1446632_at 1452476_at 1456401_at	21490	-2.012	-0.3688	Yes
180	SMAD1	1416081_at 1448208_at 1459843_s_at	21506	-2.046	-0.3534	Yes
181	NFE2L2	1416543_at 1457117_at	21541	-2.121	-0.3384	Yes
182	IHPK2	1428373_at 1435319_at	21544	-2.129	-0.3218	Yes
183	ANGPT1	1421441_at 1438936_s_at 1438937_x_at 1439066_at 1446656_at 1450717_at 1457381_at	21555	-2.161	-0.3053	Yes
184	PFN2	1418209_a_at 1418210_at 1436993_x_at	21559	-2.170	-0.2884	Yes
185	UBQLN1	1419385_a_at 1424368_s_at 1450345_at	21577	-2.210	-0.2718	Yes
186	CDKN1B	1419497_at 1434045_at	21588	-2.239	-0.2547	Yes
187	NFKBIA	1420088_at 1420089_at 1438157_s_at 1448306_at 1449731_s_at	21592	-2.242	-0.2372	Yes
188	BNIP3L	1416922_a_at 1416923_a_at 1448525_a_at	21637	-2.411	-0.2204	Yes
189	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	21747	-2.870	-0.2029	Yes
190	CSNK1E	1417175_at 1417176_at 1435373_at	21762	-2.918	-0.1806	Yes
191	ID3	1416630_at	21780	-3.031	-0.1576	Yes
192	STEAP2	1428636_at 1438773_at 1442359_at 1444290_at 1446071_at	21806	-3.194	-0.1337	Yes
193	CCND2	1416122_at 1416123_at 1416124_at 1430127_a_at 1434745_at 1448229_s_at 1455956_x_at	21828	-3.314	-0.1087	Yes
194	S100A9	1448756_at	21895	-4.073	-0.0797	Yes
195	CBX4	1419583_at 1440479_at	21915	-4.895	-0.0422	Yes
196	TCF12	1421908_a_at 1427670_a_at 1438762_at 1439209_at 1439619_at 1443012_at 1444620_at 1445093_at 1445133_at 1457524_at 1458337_at	21929	-5.496	0.0003	Yes