Details for gene set STEMCELL_COMMON

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_SCID.phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls #ATM_minus_versus_SCID
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls#ATM_minus_versus_SCID
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	STEMCELL_COMMON_UP
Enrichment Score (ES)	0.5332686
Normalized Enrichment Score (NES)	1.6599531
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.48636052
FWER p-Value	0.988

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PTPN2	1417140_a_at 1425197_at 1425198_at 1438562_a_at	23	4.536	0.0445	Yes
2	XPO1	1418442_at 1418443_at 1448070_at	57	3.357	0.0768	Yes
3	EIF4G2	1415863_at 1452758_s_at	85	3.012	0.1058	Yes
4	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	132	2.633	0.1302	Yes
5	FKBP9	1423677_at 1437687_x_at	138	2.570	0.1558	Yes
6	SMARCAD1	1435651_a_at 1440066_at 1452276_at	155	2.495	0.1801	Yes
7	WDR43	1428389_s_at 1428390_at	158	2.471	0.2049	Yes
8	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	160	2.455	0.2295	Yes
9	RAB18	1420899_at 1420900_a_at	171	2.413	0.2533	Yes
10	SEC23IP	1433627_at 1439882_at	193	2.316	0.2756	Yes
11	GSTA4	1416368_at	279	1.963	0.2915	Yes
12	XRCC5	1451968_at	361	1.719	0.3050	Yes
13	RNF4	1423654_a_at 1445749_at 1451072_a_at	386	1.673	0.3208	Yes
14	RSL1D1	1456383_at	436	1.588	0.3345	Yes
15	PSMD12	1448492_a_at	515	1.418	0.3451	Yes
16	DDX1	1415915_at 1440816_x_at	604	1.263	0.3538	Yes
17	DNAJB6	1429776_a_at 1429777_at 1434035_at 1435701_at 1442217_at 1448234_at	624	1.236	0.3654	Yes
18	GNL2	1426579_at	764	1.082	0.3698	Yes
19	RABGGTB	1419553_a_at	778	1.064	0.3799	Yes
20	RPP14	1419460_at 1419461_at 1443358_at	801	1.042	0.3894	Yes
21	RAD23B	1424222_s_at 1450903_at 1455420_at 1456822_at	864	0.985	0.3965	Yes
22	RCL1	1416730_at 1457992_at	889	0.963	0.4050	Yes
23	KLHL7	1428091_at 1452660_s_at	914	0.943	0.4134	Yes
24	PPIC	1416498_at	970	0.903	0.4200	Yes
25	ZMAT3	1449353_at	1139	0.784	0.4201	Yes
26	GNB1	1417432_a_at 1425908_at 1454696_at 1459442_at	1154	0.773	0.4273	Yes
27	SLC38A2	1426722_at 1429593_at 1429594_at	1202	0.741	0.4326	Yes
28	ACADM	1415984_at	1216	0.735	0.4394	Yes
29	YWHAB	1420878_a_at 1420879_a_at 1420880_a_at 1436783_x_at 1438708_x_at 1455815_a_at	1221	0.733	0.4465	Yes
30	PEX7	1418988_at	1277	0.700	0.4511	Yes
31	LSG1	1437630_at	1326	0.679	0.4557	Yes
32	CIRH1A	1423884_at	1441	0.635	0.4568	Yes
33	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	1506	0.614	0.4601	Yes
34	MSH2	1416988_at 1447888_x_at	1511	0.613	0.4660	Yes
35	MKI67IP	1424001_at	1584	0.589	0.4687	Yes
36	SMAD2	1420634_a_at 1458304_at	1601	0.582	0.4738	Yes
37	DICER1	1427941_at 1460571_at	1606	0.581	0.4794	Yes
38	EIF4EBP1	1417562_at 1417563_at 1434976_x_at	1638	0.571	0.4838	Yes
39	ITGB1	1426918_at 1426919_at 1426920_x_at 1427771_x_at 1438119_at 1452545_a_at	1653	0.567	0.4888	Yes
40	WBP5	1451230_a_at	1765	0.535	0.4891	Yes
41	COPS4	1416163_at	1798	0.524	0.4929	Yes
42	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	1837	0.513	0.4963	Yes
43	TXNDC9	1424512_a_at 1436108_at 1436951_x_at	1886	0.499	0.4991	Yes
44	CAD	1440857_at 1452829_at 1452830_s_at	1903	0.494	0.5033	Yes
45	CRTAP	1448592_at	1981	0.475	0.5046	Yes
46	MRPL17	1450866_a_at 1450867_at 1458027_at	2107	0.442	0.5033	Yes
47	SFRS6	1416720_at 1416721_s_at 1447898_s_at 1448454_at	2139	0.436	0.5063	Yes
48	MRPS2	1420845_at 1420846_at	2140	0.436	0.5106	Yes
49	PDCD2	1423534_at	2151	0.433	0.5145	Yes
50	BLZF1	1418973_at 1418974_at 1442164_at	2179	0.428	0.5176	Yes
51	SEC23A	1423347_at	2238	0.416	0.5191	Yes
52	ARCN1	1423743_at 1436062_at 1444372_at 1451089_a_at	2248	0.414	0.5229	Yes
53	UMPS	1431652_at 1434859_at 1451445_at 1455832_a_at	2254	0.412	0.5268	Yes
54	SMAD1	1416081_at 1448208_at 1459843_s_at	2338	0.396	0.5269	Yes
55	RFFL	1431748_a_at 1434432_at	2358	0.391	0.5300	Yes
56	NDUFAB1	1428159_s_at 1428160_at 1435934_at 1447919_x_at 1453565_at 1458678_at	2438	0.378	0.5302	Yes
57	GARS	1423784_at	2571	0.357	0.5277	Yes
58	MPDU1	1416104_at	2596	0.353	0.5301	Yes
59	IARS2	1426735_at 1441665_at	2705	0.337	0.5286	Yes
60	WTAP	1438471_at 1452401_at 1454805_at	2791	0.325	0.5279	Yes
61	JAGN1	1417064_at	2797	0.324	0.5309	Yes
62	FBXO38	1452255_at	2870	0.315	0.5308	Yes
63	FBXO8	1418510_s_at	2930	0.308	0.5312	Yes
64	MARCH7	1420609_at 1436893_a_at 1440966_at 1443329_at 1458690_at	2976	0.302	0.5322	Yes
65	PPA1	1416939_at	3074	0.290	0.5306	Yes
66	ADAM9	1416094_at	3081	0.289	0.5333	Yes
67	UPP1	1448562_at	3266	0.269	0.5275	No
68	ZCCHC10	1418820_s_at	3385	0.259	0.5247	No
69	RCN1	1417090_at 1447890_at	3581	0.241	0.5182	No
70	LAPTM4A	1423368_at	3851	0.222	0.5081	No
71	FHL1	1417872_at 1459003_at	4099	0.205	0.4988	No
72	PRPSAP1	1428182_at	4274	0.194	0.4927	No
73	ZFX	1419565_a_at 1425972_a_at 1428046_a_at 1449512_a_at	5094	0.154	0.4567	No
74	MRPS10	1428153_at 1458999_at	5322	0.145	0.4477	No
75	NDUFAF1	1423711_at	5349	0.144	0.4479	No
76	TPP2	1421893_a_at 1421894_a_at 1430575_a_at 1430576_at 1438264_a_at	5439	0.141	0.4453	No
77	USP9X	1420922_at 1420923_at 1428193_at 1428194_at 1450037_at 1450038_s_at 1450039_at	5607	0.134	0.4390	No
78	TBRG4	1417658_at 1442793_s_at 1448795_a_at 1448796_s_at	5692	0.131	0.4364	No
79	IMPAD1	1437288_at 1437289_at 1437290_at	5792	0.128	0.4332	No
80	RARSL	1424209_at	6037	0.120	0.4232	No
81	KIF2A	1432072_at 1450052_at 1450053_at 1452499_a_at 1454107_a_at	6095	0.118	0.4217	No
82	ZZZ3	1434332_at 1438487_s_at 1441748_at	6134	0.117	0.4211	No
83	TXNL1	1423299_at 1435235_at 1436947_a_at 1437905_at 1437906_x_at 1455866_x_at	6277	0.113	0.4158	No
84	SOCS2	1418507_s_at 1438470_at 1441476_at 1442586_at 1446085_at 1449109_at	7116	0.089	0.3782	No
85	PHTF2	1437067_at 1437637_at 1444559_at	7133	0.089	0.3783	No
86	TGIF2	1431115_at 1434400_at	7199	0.087	0.3762	No
87	RNF138	1419368_a_at 1419369_at 1454064_a_at	7689	0.075	0.3545	No
88	MDFI	1420713_a_at 1425924_at	7878	0.070	0.3466	No
89	SH3D19	1418460_at 1418461_at 1427574_s_at 1445781_at 1449084_s_at	8301	0.061	0.3278	No
90	YES1	1418470_at 1449090_a_at 1456843_at 1458878_at	8419	0.058	0.3230	No
91	STAM	1416861_at 1416862_at 1457828_at 1459427_at	8879	0.047	0.3024	No
92	YAP1	1416487_a_at 1448363_at	9378	0.036	0.2799	No
93	DTYMK	1438096_a_at 1449116_a_at 1452681_at	9905	0.025	0.2560	No
94	RRN3	1415725_at	10153	0.021	0.2448	No
95	PPP1R2	1417341_a_at 1417342_at 1448684_at 1456830_at	10587	0.012	0.2251	No
96	MRPS31	1417737_at 1443165_at	11015	0.003	0.2055	No
97	PCF11	1427159_at 1427160_at 1428724_at 1456489_at	11028	0.003	0.2050	No
98	RPS6KB1	1428849_at 1446376_at 1454956_at 1457562_at 1459951_at 1460705_at	11308	-0.003	0.1922	No
99	ERCC5	1450935_at 1457713_at	11733	-0.012	0.1728	No
100	GAB1	1417693_a_at 1417694_at 1448814_at	11772	-0.013	0.1712	No
101	CBR3	1427912_at	11774	-0.013	0.1713	No
102	CTTN	1421313_s_at 1421314_at 1421315_s_at 1423917_a_at 1433908_a_at	12060	-0.018	0.1584	No
103	SNX12	1421797_a_at 1454807_a_at 1455465_at 1459041_at	12215	-0.022	0.1515	No
104	PSMD11	1429370_a_at 1432726_at 1456059_at 1456104_at	12219	-0.022	0.1516	No
105	MTERFD1	1454116_a_at 1459262_at	12389	-0.025	0.1441	No
106	LIMA1	1422499_at 1425654_a_at 1435726_at 1435727_s_at 1450629_at	12564	-0.029	0.1364	No
107	BACH1	1440831_at 1449311_at	12794	-0.034	0.1262	No
108	KCNAB3	1421790_a_at 1423950_at	13031	-0.040	0.1158	No
109	TJP1	1417749_a_at	13105	-0.041	0.1129	No
110	CTBP2	1422887_a_at 1439823_at	13178	-0.043	0.1100	No
111	MRPL45	1423492_at	13448	-0.049	0.0981	No
112	TOM1L1	1439337_at 1451117_a_at	13505	-0.050	0.0960	No
113	MDFIC	1427040_at	14013	-0.062	0.0734	No
114	TEAD2	1448519_at	14065	-0.064	0.0717	No
115	RASA1	1426476_at 1426477_at 1426478_at 1438998_at	14171	-0.066	0.0675	No
116	GRWD1	1436887_x_at 1452171_at 1455841_s_at	14340	-0.071	0.0605	No
117	CPXM1	1448901_at	14368	-0.072	0.0600	No
118	LAS1L	1446743_at 1452266_at	14481	-0.075	0.0556	No
119	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	14578	-0.077	0.0520	No
120	SFRS3	1416150_a_at 1416151_at 1416152_a_at 1454993_a_at	14690	-0.081	0.0477	No
121	MAP4K3	1444406_at	14818	-0.084	0.0427	No
122	YWHAH	1416004_at	15732	-0.110	0.0019	No
123	PIGX	1425134_a_at 1455284_x_at	15744	-0.111	0.0025	No
124	ELOVL6	1417403_at 1417404_at 1445062_at 1445578_at 1445641_at	15858	-0.115	-0.0015	No
125	TXNRD1	1421529_a_at 1424486_a_at 1424487_x_at	16010	-0.119	-0.0073	No
126	ROCK2	1423592_at 1451041_at	16819	-0.149	-0.0429	No
127	USP10	1448230_at	16879	-0.151	-0.0441	No
128	WDR55	1426496_at	16977	-0.155	-0.0470	No
129	RYK	1426388_s_at 1447400_at 1451789_a_at 1458960_at 1459188_at	17624	-0.190	-0.0748	No
130	MRPL3	1422463_a_at 1422464_at 1431006_at 1440636_at	17681	-0.193	-0.0754	No
131	PAFAH2	1448489_at	17698	-0.194	-0.0742	No
132	ZMYM4	1429253_at 1438460_at	18149	-0.226	-0.0926	No
133	PLS3	1423725_at	18381	-0.244	-0.1007	No
134	STATIP1	1415774_at 1438179_s_at	18514	-0.257	-0.1042	No
135	UBE2D2	1416475_at 1416476_a_at 1416477_at 1439655_at 1445885_at 1448356_at	18520	-0.257	-0.1018	No
136	ALDH7A1	1415902_at 1448137_at 1460167_at	18857	-0.288	-0.1144	No
137	COPS7A	1423245_at 1429078_a_at	19193	-0.330	-0.1265	No
138	TRIP6	1449041_a_at	19260	-0.341	-0.1261	No
139	SLC4A7	1455876_at 1457528_at	19393	-0.359	-0.1285	No
140	EPRS	1430370_at	19490	-0.373	-0.1292	No
141	TARSL1	1431125_a_at 1436856_x_at	19540	-0.381	-0.1276	No
142	IARS	1426705_s_at 1452154_at	19687	-0.404	-0.1302	No
143	CRSP3	1452064_at	19819	-0.428	-0.1319	No
144	RPUSD4	1452710_at	19844	-0.433	-0.1287	No
145	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	19871	-0.440	-0.1255	No
146	LAPTM4B	1416148_at 1436915_x_at 1438365_x_at 1459215_at	19906	-0.447	-0.1225	No
147	GCAT	1417823_at 1417824_at	20077	-0.489	-0.1254	No
148	GCLM	1418627_at	20168	-0.513	-0.1244	No
149	UTP20	1452252_at 1459028_at	20299	-0.552	-0.1248	No
150	MPHOSPH10	1429080_at 1431388_at	20371	-0.571	-0.1223	No
151	ANKRD17	1415726_at 1421220_at 1436775_a_at 1444608_at 1445826_at 1454763_at 1459952_at	20510	-0.621	-0.1224	No
152	DPH5	1439049_at 1452839_at 1459549_at	20681	-0.689	-0.1233	No
153	TBC1D15	1416060_at 1416061_at 1416062_at	20712	-0.708	-0.1176	No
154	CHD1	1420990_at 1444787_at 1444788_x_at 1450077_at 1457473_at	20911	-0.827	-0.1184	No
155	ARIH1	1427188_at 1427189_at 1436498_at 1441022_at 1459397_at 1460090_at	21043	-0.926	-0.1151	No
156	NUP35	1426447_at	21044	-0.927	-0.1058	No
157	PLA2G6	1422147_a_at 1431278_s_at	21135	-1.016	-0.0997	No
158	STRN3	1423535_at 1423536_at 1441050_at 1441266_at 1457343_at	21159	-1.042	-0.0903	No
159	GAS2	1429147_at 1435834_at 1438564_at 1450112_a_at	21283	-1.171	-0.0841	No
160	PANX3	1432860_at 1454387_at 1456073_s_at	21286	-1.174	-0.0724	No
161	PRPF6	1424036_at 1426026_at 1454789_x_at	21300	-1.202	-0.0609	No
162	ITGA6	1422444_at 1422445_at	21588	-1.745	-0.0566	No
163	PKD2	1417753_at 1441870_s_at	21598	-1.766	-0.0392	No
164	UBE2T	1422462_at 1442398_at	21699	-2.090	-0.0228	No
165	MRPL34	1416349_at 1438014_at	21863	-3.348	0.0034	No