Details for gene set V$USF

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$USF_C
Enrichment Score (ES)	0.40362498
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3585435
Nominal p-value	0.011952192
FDR q-value	0.4363986
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	MTHFD1	1415916_a_at 1415917_at 1436704_x_at	105	3.497	0.0208	Yes
2	RUSC1	1431137_at 1434743_x_at 1436014_a_at 1437991_x_at 1438017_at	199	2.940	0.0381	Yes
3	EIF2C2	1426366_at 1438043_at	235	2.765	0.0567	Yes
4	SNX5	1417646_a_at 1417647_at 1417648_s_at 1437074_at 1448791_at	259	2.669	0.0752	Yes
5	SDC1	1415943_at 1415944_at 1437279_x_at 1448158_at	327	2.435	0.0900	Yes
6	SET	1426853_at 1426854_a_at	389	2.252	0.1037	Yes
7	OPRS1	1416750_at 1435579_at 1440792_x_at 1451956_a_at 1457324_at	412	2.179	0.1186	Yes
8	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	463	2.047	0.1313	Yes
9	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	485	2.001	0.1450	Yes
10	PPAT	1428543_at 1441770_at 1452831_s_at	490	1.988	0.1594	Yes
11	LYAR	1417511_at	507	1.958	0.1730	Yes
12	GPD1	1416204_at 1439396_x_at 1448249_at 1456732_at	623	1.745	0.1805	Yes
13	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	664	1.690	0.1910	Yes
14	LAP3	1450860_at	700	1.647	0.2015	Yes
15	SH3KBP1	1431592_a_at 1432269_a_at 1446562_at 1456261_at 1460337_at	716	1.626	0.2127	Yes
16	ABCB6	1422524_at	720	1.617	0.2244	Yes
17	TIMM9	1428010_at 1449886_a_at	728	1.608	0.2359	Yes
18	EXOSC2	1426630_at 1446994_at	787	1.531	0.2445	Yes
19	WEE1	1416773_at 1416774_at	812	1.497	0.2543	Yes
20	HMOX1	1448239_at	821	1.489	0.2649	Yes
21	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	984	1.315	0.2671	Yes
22	XRN2	1422842_at 1450777_at	1007	1.298	0.2756	Yes
23	IPO4	1436420_a_at 1450814_a_at	1010	1.295	0.2850	Yes
24	TIMM10	1417499_at	1047	1.256	0.2925	Yes
25	FBL	1416684_at 1416685_s_at	1059	1.245	0.3011	Yes
26	ENO3	1417951_at 1449631_at	1128	1.196	0.3068	Yes
27	MAX	1423501_at	1202	1.144	0.3118	Yes
28	EXOSC5	1417167_at	1228	1.127	0.3189	Yes
29	NUDC	1419471_a_at	1319	1.074	0.3226	Yes
30	BCAS3	1423528_at 1428454_at 1457817_at 1458557_at	1353	1.052	0.3288	Yes
31	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	1381	1.024	0.3351	Yes
32	IVNS1ABP	1420961_a_at 1425718_a_at 1450084_s_at	1418	1.007	0.3408	Yes
33	ARX	1420926_at 1441175_at 1450042_at	1474	0.974	0.3454	Yes
34	PB1	1426877_a_at 1426878_at 1427266_at 1442603_at	1535	0.952	0.3496	Yes
35	SLC12A5	1425337_at 1445933_at 1451674_at	1567	0.937	0.3551	Yes
36	EIF4B	1426378_at 1426379_at 1426380_at	1593	0.925	0.3607	Yes
37	HSPE1	1450668_s_at	1603	0.919	0.3670	Yes
38	AK3	1423717_at 1423718_at 1432436_a_at 1458812_at	1661	0.896	0.3709	Yes
39	G6PC3	1428245_at	1801	0.830	0.3706	Yes
40	PSMB3	1417052_at	1802	0.829	0.3767	Yes
41	AKAP12	1419706_a_at 1458235_at	1960	0.761	0.3751	Yes
42	USP2	1417168_a_at 1417169_at	1973	0.758	0.3801	Yes
43	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	1981	0.754	0.3853	Yes
44	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	2142	0.701	0.3830	Yes
45	NLN	1424981_at 1451555_at	2148	0.699	0.3879	Yes
46	HHIP	1421426_at 1437933_at 1438083_at 1455277_at	2184	0.687	0.3914	Yes
47	POLR2L	1428296_at	2288	0.656	0.3914	Yes
48	CNNM1	1420354_at 1441312_at 1445979_at	2336	0.640	0.3940	Yes
49	NPTX1	1422130_at 1434877_at	2356	0.635	0.3977	Yes
50	POLR2H	1424473_at	2509	0.593	0.3951	Yes
51	EEF1E1	1444757_at 1449044_at	2527	0.589	0.3986	Yes
52	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	2557	0.581	0.4015	Yes
53	GRK6	1437436_s_at 1450480_a_at 1451672_at	2604	0.572	0.4036	Yes
54	NKX2-3	1425827_at 1427741_x_at 1452528_a_at	2875	0.513	0.3950	No
55	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	2876	0.513	0.3987	No
56	CACNA1D	1427974_s_at 1428051_a_at	2996	0.489	0.3968	No
57	MCM8	1429557_at	3109	0.467	0.3951	No
58	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	3166	0.459	0.3959	No
59	FGF6	1427582_at	3265	0.441	0.3946	No
60	CTSF	1449794_x_at 1451019_at	3739	0.383	0.3756	No
61	LHX9	1419324_at 1431598_a_at 1441313_x_at	3746	0.382	0.3782	No
62	LTBR	1416435_at	3828	0.373	0.3772	No
63	ANXA6	1415818_at 1429246_a_at 1429247_at 1442288_at	4092	0.345	0.3676	No
64	GTF2A1	1421357_at	4157	0.340	0.3671	No
65	FADS3	1418773_at 1435910_at 1449219_at	4162	0.340	0.3695	No
66	ENPP6	1436090_at 1438785_at	4238	0.335	0.3685	No
67	SRP72	1428876_at 1428877_at	4378	0.322	0.3644	No
68	NPM1	1415839_a_at 1420267_at 1420268_x_at 1420269_at 1432416_a_at	4421	0.319	0.3648	No
69	SEZ6L	1424764_at 1440128_s_at	4517	0.311	0.3627	No
70	LRP8	1421459_a_at 1440882_at 1442347_at	4583	0.306	0.3620	No
71	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	4660	0.302	0.3607	No
72	SATB2	1425904_at 1427017_at	4730	0.298	0.3597	No
73	RUNX2	1424704_at 1425389_a_at 1426034_a_at	4776	0.295	0.3598	No
74	FGF11	1421793_at 1439959_at	5376	0.264	0.3342	No
75	RHEBL1	1447818_x_at 1451516_at	5481	0.259	0.3313	No
76	COL2A1	1450567_a_at	5508	0.258	0.3320	No
77	STMN1	1415849_s_at	5579	0.255	0.3306	No
78	PSEN2	1425869_a_at 1431542_at	5675	0.250	0.3281	No
79	ELK1	1421896_at 1421897_at 1446390_at	5676	0.250	0.3299	No
80	SCRT2	1440930_a_at 1440931_at 1446986_at 1457310_x_at	5694	0.249	0.3310	No
81	HYAL2	1448679_at	5937	0.239	0.3216	No
82	PTMA	1423455_at	5941	0.238	0.3232	No
83	HMGN2	1433507_a_at	6108	0.230	0.3172	No
84	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	6143	0.229	0.3174	No
85	MYOHD1	1451183_at 1459265_at	6480	0.217	0.3035	No
86	KIAA0427	1427743_at 1436047_at	7654	0.175	0.2508	No
87	TDRD1	1421513_at	7719	0.173	0.2491	No
88	BCKDHA	1416647_at	7889	0.168	0.2425	No
89	BMP4	1422912_at	7916	0.167	0.2426	No
90	AVP	1450794_at	7983	0.165	0.2407	No
91	LIN28	1437752_at	8125	0.161	0.2354	No
92	NTN2L	1422056_at	8411	0.152	0.2234	No
93	MPP3	1419077_at 1459611_at	8413	0.152	0.2245	No
94	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	8427	0.152	0.2250	No
95	TBX4	1426321_at 1456033_at	8727	0.143	0.2123	No
96	HERPUD1	1435626_a_at 1448185_at	8957	0.136	0.2028	No
97	B4GALT2	1418080_at 1448941_at	8977	0.136	0.2029	No
98	DAZL	1419542_at 1449502_at	9033	0.134	0.2013	No
99	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	9129	0.132	0.1979	No
100	ETV4	1423232_at 1443381_at	9279	0.128	0.1920	No
101	PFDN2	1421950_at	9427	0.123	0.1862	No
102	SYT3	1417708_at	9470	0.122	0.1851	No
103	RPL13A	1417608_a_at 1433928_a_at 1455001_x_at 1455485_x_at	9611	0.119	0.1795	No
104	TEF	1424175_at 1438033_at 1450184_s_at	9729	0.116	0.1750	No
105	GRIN2A	1421616_at	9786	0.114	0.1733	No
106	ACVR2B	1419140_at 1439856_at	9801	0.114	0.1735	No
107	DRD1	1455629_at 1456051_at	9838	0.112	0.1726	No
108	HPCAL4	1433987_at	9907	0.111	0.1703	No
109	ARRDC3	1454617_at	10217	0.103	0.1568	No
110	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	10277	0.101	0.1549	No
111	FHOD1	1435557_at	10486	0.096	0.1460	No
112	IPO13	1433464_at	10521	0.095	0.1451	No
113	CENTB5	1439021_at	10544	0.095	0.1448	No
114	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	10549	0.095	0.1453	No
115	BHLHB2	1418025_at	10600	0.093	0.1437	No
116	FCHSD2	1434260_at 1456949_at	10778	0.089	0.1362	No
117	GPRC5C	1424450_at 1452947_at	10902	0.086	0.1312	No
118	HS3ST3A1	1435622_at	10972	0.084	0.1286	No
119	RAPGEF6	1427412_s_at 1434509_at 1438828_at 1443877_a_at 1443878_at	10981	0.084	0.1289	No
120	DAZAP1	1419275_at	11036	0.082	0.1270	No
121	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	11039	0.082	0.1275	No
122	HPCA	1425833_a_at 1450930_at	11314	0.075	0.1154	No
123	TLL1	1420753_at	11328	0.075	0.1154	No
124	HSPA4	1416146_at 1416147_at 1440575_at	11411	0.073	0.1121	No
125	ELOVL4	1424306_at 1451308_at	11463	0.071	0.1103	No
126	SIRT1	1418640_at 1458538_at	11507	0.070	0.1089	No
127	SC5DL	1424709_at 1434520_at 1451457_at	11855	0.061	0.0933	No
128	CGN	1430329_at 1435155_at	12047	0.057	0.0850	No
129	ALDH3B1	1452301_at	12141	0.055	0.0811	No
130	GPX1	1460671_at	12158	0.054	0.0807	No
131	DIABLO	1417683_at 1425768_at	12275	0.051	0.0758	No
132	SLC6A15	1426712_at	12374	0.049	0.0716	No
133	UBXD3	1426007_a_at 1451906_at 1456385_x_at 1457581_at	12509	0.046	0.0658	No
134	RPL19	1416219_at	12561	0.044	0.0638	No
135	ABCA1	1421839_at 1421840_at 1450392_at	12616	0.043	0.0616	No
136	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	12818	0.037	0.0526	No
137	GTF2H1	1453169_a_at	12878	0.036	0.0502	No
138	FLT3	1419538_at	12892	0.036	0.0499	No
139	VGF	1436094_at	13205	0.027	0.0357	No
140	PPARGC1B	1438775_at 1449945_at 1457578_at	13224	0.027	0.0351	No
141	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	13300	0.024	0.0318	No
142	PLA2G4A	1448558_a_at	13554	0.017	0.0203	No
143	NR1D1	1421802_at 1426464_at	13560	0.017	0.0202	No
144	SGTB	1437977_at 1451529_at	14157	-0.001	-0.0072	No
145	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	14520	-0.015	-0.0238	No
146	GIT1	1454759_at	14675	-0.021	-0.0307	No
147	CDC14A	1436913_at 1443184_at 1446493_at 1459517_at	15153	-0.039	-0.0524	No
148	CHRM1	1439611_at 1450833_at	15171	-0.040	-0.0529	No
149	SLC39A7	1416949_s_at	15217	-0.042	-0.0547	No
150	RXRB	1416990_at	15512	-0.055	-0.0678	No
151	SOCS5	1423349_at 1423350_at 1441640_at 1442890_at	15633	-0.061	-0.0729	No
152	SLC31A2	1416654_at 1453721_a_at 1459399_at	15678	-0.063	-0.0744	No
153	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	15702	-0.064	-0.0750	No
154	HSPBAP1	1428566_at 1428567_at 1441900_x_at 1442842_at	15983	-0.080	-0.0873	No
155	HOXA4	1420226_x_at 1427354_at	16382	-0.105	-0.1049	No
156	CHST11	1428902_at 1450509_at	16406	-0.106	-0.1051	No
157	HOXC13	1425874_at	16502	-0.112	-0.1087	No
158	TMEM15	1424366_at	16583	-0.119	-0.1115	No
159	POGK	1447864_s_at 1459896_at	16721	-0.130	-0.1168	No
160	ZNRF2	1431154_at 1434016_at 1434017_at 1444735_at 1455290_at 1455291_s_at	16923	-0.146	-0.1250	No
161	ADCY3	1421959_s_at 1421960_at 1436928_s_at 1436929_x_at 1440405_at 1444641_at	16997	-0.153	-0.1273	No
162	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	17066	-0.160	-0.1292	No
163	MYCL1	1422087_at 1422088_at 1434777_at	17220	-0.176	-0.1350	No
164	ARHGAP20	1427522_at 1429918_at	17376	-0.194	-0.1407	No
165	PRKCE	1437860_at 1437861_s_at 1442609_at 1444649_at 1449956_at 1452878_at	17444	-0.203	-0.1423	No
166	SLC26A2	1421145_at 1443882_at	17621	-0.229	-0.1487	No
167	PER1	1449851_at	17965	-0.273	-0.1625	No
168	PAICS	1423564_a_at 1423565_at 1436298_x_at	18013	-0.279	-0.1626	No
169	CRMP1	1448289_at	18082	-0.291	-0.1636	No
170	PFN1	1449018_at	18085	-0.291	-0.1616	No
171	CLCN2	1449248_at	18268	-0.321	-0.1676	No
172	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	18391	-0.339	-0.1707	No
173	MNT	1418192_at	18560	-0.368	-0.1757	No
174	BTBD5	1428721_at 1453987_at	18591	-0.373	-0.1744	No
175	ZFP91	1426326_at 1429615_at 1429616_at 1459444_at	18741	-0.402	-0.1783	No
176	BMP2K	1421103_at 1437419_at 1458370_at	18776	-0.413	-0.1768	No
177	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	18852	-0.430	-0.1771	No
178	ADNP	1423069_at	18957	-0.454	-0.1786	No
179	CNOT4	1420999_at 1421000_at 1436645_a_at 1437586_at 1443169_at 1450083_at 1459449_at	19187	-0.508	-0.1854	No
180	TNFRSF21	1422740_at 1450731_s_at	19224	-0.516	-0.1833	No
181	GNA13	1422555_s_at 1422556_at 1430295_at 1433749_at 1446722_at 1450656_at 1453470_a_at 1460317_s_at	19431	-0.569	-0.1886	No
182	CCDC6	1428311_at 1459159_a_at	19500	-0.591	-0.1874	No
183	FARP1	1445200_at 1452280_at 1459799_at	19968	-0.748	-0.2034	No
184	GABARAP	1416937_at	20042	-0.778	-0.2011	No
185	MXD4	1422574_at 1434378_a_at 1434379_at	20047	-0.780	-0.1955	No
186	MICAL2	1438726_at 1455685_at	20093	-0.800	-0.1917	No
187	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	20132	-0.816	-0.1875	No
188	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	20186	-0.844	-0.1837	No
189	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	20204	-0.850	-0.1783	No
190	H3F3A	1423263_at 1442087_at	20275	-0.881	-0.1751	No
191	AMPD2	1426757_at 1438941_x_at	20416	-0.954	-0.1745	No
192	JMJD1A	1426810_at	20644	-1.089	-0.1770	No
193	PDK2	1448825_at	20844	-1.246	-0.1770	No
194	UBE1	1442767_s_at 1448116_at	20855	-1.261	-0.1682	No
195	DNAJB9	1417191_at	20945	-1.340	-0.1625	No
196	WBP2	1448121_at	21031	-1.460	-0.1557	No
197	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	21141	-1.622	-0.1489	No
198	CAMK4	1421941_at 1426167_a_at 1439843_at 1442822_at 1452572_at	21148	-1.632	-0.1372	No
199	SEMA7A	1422040_at 1459903_at	21279	-1.816	-0.1298	No
200	SCFD2	1433608_at 1447367_at	21339	-1.900	-0.1186	No
201	MYST3	1436315_at 1437487_at 1446143_at 1446405_at	21430	-2.062	-0.1077	No
202	SLC20A1	1438824_at 1446441_at 1448568_a_at	21556	-2.311	-0.0965	No
203	PA2G4	1420142_s_at 1423060_at 1435372_a_at 1450854_at 1460265_at	21700	-2.834	-0.0823	No
204	RORC	1425792_a_at 1425793_a_at	21714	-2.867	-0.0619	No
205	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	21730	-2.913	-0.0412	No
206	PABPC1	1418883_a_at 1419500_at 1453840_at	21933	-6.913	0.0001	No