Details for gene set V$IK1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$IK1_01
Enrichment Score (ES)	-0.45143583
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.4856849
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.16136171
FWER p-Value	0.885

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	CLCN1	1427591_at 1448082_at	373	2.299	0.0043	No
2	SP4	1421504_at 1437508_at	451	2.080	0.0202	No
3	SMYD2	1424760_a_at	502	1.975	0.0363	No
4	SOCS2	1418507_s_at 1438470_at 1441476_at 1442586_at 1446085_at 1449109_at	539	1.886	0.0523	No
5	POLE3	1421015_s_at	561	1.848	0.0685	No
6	FGF17	1421523_at 1456239_at	732	1.602	0.0757	No
7	ELK4	1422233_at 1427162_a_at 1447571_at 1450549_s_at	798	1.522	0.0869	No
8	PHLDB1	1424467_at 1424468_s_at	799	1.521	0.1011	No
9	MRPS18B	1451164_a_at	905	1.403	0.1093	No
10	STOML2	1448774_at	1089	1.225	0.1124	No
11	MRPS36	1423242_at	1511	0.963	0.1020	No
12	PPARBP	1421906_at 1421907_at 1439408_a_at 1446250_at 1447450_at 1448708_at 1450402_at 1453972_x_at	1586	0.927	0.1072	No
13	SP6	1427786_at 1427787_at 1437788_at 1442342_at	1679	0.888	0.1113	No
14	ITPR1	1417279_at 1443492_at 1457189_at 1460203_at	1772	0.844	0.1149	No
15	POLR2B	1433552_a_at	2070	0.722	0.1080	No
16	CRTAC1	1426606_at 1452936_at 1457474_at 1459858_x_at	2382	0.628	0.0996	No
17	DLX1	1449470_at	2391	0.625	0.1050	No
18	MSI1	1421409_at 1444306_at	2475	0.601	0.1068	No
19	FBXO3	1423490_at 1423491_at 1431078_at 1441019_at 1455047_at	2526	0.589	0.1100	No
20	LRP1	1442849_at 1448655_at	2605	0.572	0.1118	No
21	BRCA1	1424629_at 1424630_a_at 1427698_at 1443763_at 1451417_at	2612	0.570	0.1168	No
22	PURG	1424970_at 1452029_a_at	2709	0.547	0.1175	No
23	ZFPM2	1419012_at 1444803_at 1447020_at 1449314_at	2713	0.546	0.1225	No
24	TBX19	1422085_at 1422086_at	2935	0.499	0.1169	No
25	MMP16	1422626_at 1437568_at 1440161_at 1443412_s_at	3103	0.468	0.1136	No
26	TRPC1	1421095_a_at 1421096_at	3190	0.454	0.1139	No
27	SFRS7	1424033_at 1424883_s_at 1436871_at	3351	0.431	0.1106	No
28	DHRS4	1419382_a_at 1451559_a_at	3375	0.428	0.1135	No
29	ADAMTS20	1456901_at	3504	0.410	0.1114	No
30	KCNQ4	1435721_at 1442909_at	3583	0.400	0.1116	No
31	FOXD3	1422210_at	3652	0.391	0.1121	No
32	TGM3	1421355_at 1440150_at	3726	0.384	0.1123	No
33	NSD1	1420881_at 1435088_at 1440972_at 1456916_at	3990	0.355	0.1036	No
34	TBX20	1422219_a_at 1425158_at 1453351_at	4211	0.336	0.0966	No
35	DEPDC2	1432047_at	4240	0.334	0.0984	No
36	PPAP2B	1429514_at 1446850_at 1448908_at	4484	0.313	0.0902	No
37	TNNC2	1417464_at	4563	0.308	0.0894	No
38	RNF128	1418318_at 1449036_at	4565	0.307	0.0923	No
39	PROP1	1450361_at	4605	0.305	0.0933	No
40	PI16	1422026_at 1440744_at 1453839_a_at	4606	0.305	0.0962	No
41	ASCL3	1420780_at	4754	0.296	0.0922	No
42	SHC3	1450326_at	4959	0.284	0.0854	No
43	RHBDF1	1424138_at	5006	0.282	0.0859	No
44	ELF5	1419555_at 1419556_at	5569	0.256	0.0625	No
45	NR2F6	1449846_at 1460647_a_at 1460648_at	5706	0.249	0.0586	No
46	COBL	1434917_at 1442076_at	5743	0.246	0.0592	No
47	KIF12	1424910_at 1453193_s_at	5890	0.241	0.0547	No
48	AAMP	1454754_a_at	5982	0.236	0.0527	No
49	CHAD	1420569_at	6012	0.235	0.0536	No
50	IL13RA1	1425625_at 1427164_at 1427165_at 1451775_s_at 1454783_at	6284	0.224	0.0432	No
51	HOXC4	1422870_at	6294	0.224	0.0449	No
52	GADD45B	1420197_at 1449773_s_at 1450971_at	6373	0.220	0.0434	No
53	CYP26A1	1419430_at	6380	0.220	0.0452	No
54	RFX4	1432053_at 1436931_at 1443312_at	6469	0.217	0.0431	No
55	BCKDK	1443813_x_at 1460644_at	6504	0.216	0.0436	No
56	DOC2A	1436862_at	6554	0.214	0.0433	No
57	ATP1A3	1424856_at 1427481_a_at	6662	0.209	0.0404	No
58	POU3F3	1422331_at 1435197_at	6690	0.208	0.0411	No
59	HOXB4	1451761_at 1460379_at	6763	0.205	0.0397	No
60	WRN	1425074_at 1425982_a_at 1450163_a_at	6771	0.205	0.0413	No
61	KCNAB1	1448468_a_at 1454043_a_at	6803	0.204	0.0417	No
62	RBMS1	1418703_at 1434005_at 1441437_at 1458578_at 1459968_at	6830	0.202	0.0424	No
63	TWIST1	1418733_at	7102	0.193	0.0318	No
64	ABCA2	1449302_at	7167	0.191	0.0306	No
65	EHF	1419474_a_at 1419475_a_at 1447760_x_at 1451375_at	7174	0.191	0.0321	No
66	CD86	1420404_at 1449858_at	7259	0.187	0.0300	No
67	CHX10	1419628_at	7272	0.187	0.0312	No
68	ZIC4	1421539_at 1456417_at	7355	0.184	0.0291	No
69	NR4A3	1421079_at 1421080_at	7465	0.180	0.0258	No
70	FILIP1	1436650_at 1444075_at	7466	0.180	0.0275	No
71	MOBKL2C	1440919_at 1459919_a_at	7548	0.177	0.0254	No
72	NAPB	1423172_at 1423173_at 1427470_s_at 1450888_at 1452444_at	7664	0.174	0.0217	No
73	TITF1	1422346_at	7819	0.169	0.0162	No
74	HOXC5	1439885_at 1450832_at 1456301_at	7867	0.168	0.0156	No
75	BMP4	1422912_at	7916	0.167	0.0150	No
76	NEK4	1427639_a_at 1449861_at	7981	0.165	0.0136	No
77	PRDM1	1420425_at 1444997_at	8379	0.153	-0.0032	No
78	MYOCD	1425808_a_at 1425978_at	8453	0.151	-0.0052	No
79	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	8511	0.149	-0.0064	No
80	SEMA6A	1421414_a_at 1425903_at 1436458_at	8553	0.148	-0.0069	No
81	ABCC5	1418042_a_at 1418043_at 1427565_a_at 1435683_a_at 1435684_at 1435685_x_at 1438056_x_at 1447384_at 1459782_x_at	8582	0.147	-0.0069	No
82	GP2	1449452_a_at	8795	0.141	-0.0153	No
83	BAI3	1446358_at 1454782_at	8904	0.138	-0.0190	No
84	HOXC6	1427361_at 1427362_x_at 1427454_at	8966	0.136	-0.0205	No
85	RORA	1420583_a_at 1424034_at 1424035_at 1436325_at 1436326_at 1441085_at 1443511_at 1443647_at 1446360_at 1455165_at 1457177_at 1458129_at	9253	0.129	-0.0325	No
86	SGCD	1444822_at 1450805_at	9426	0.123	-0.0392	No
87	APBA1	1437940_at 1455369_at 1459605_at	9457	0.123	-0.0395	No
88	TEF	1424175_at 1438033_at 1450184_s_at	9729	0.116	-0.0508	No
89	LAMA1	1418153_at	9794	0.114	-0.0527	No
90	ACVR2B	1419140_at 1439856_at	9801	0.114	-0.0519	No
91	ATP2B4	1445701_at	9889	0.111	-0.0549	No
92	SLITRK1	1428089_at	10120	0.105	-0.0645	No
93	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	10277	0.101	-0.0707	No
94	HOXB13	1419576_at	10404	0.098	-0.0756	No
95	PSD	1435780_at	10577	0.094	-0.0826	No
96	SALL1	1450489_at	10593	0.093	-0.0825	No
97	VSNL1	1420955_at 1450055_at	10702	0.091	-0.0866	No
98	ARHGAP5	1423194_at 1450896_at 1450897_at 1457410_at	10717	0.091	-0.0864	No
99	STARD13	1452604_at	10787	0.089	-0.0887	No
100	MEOX2	1424233_at 1424234_s_at	11131	0.080	-0.1038	No
101	LHX6	1422262_a_at 1425094_a_at	11208	0.078	-0.1065	No
102	CILP	1457296_at	11325	0.075	-0.1112	No
103	NEK6	1451043_at	11457	0.071	-0.1165	No
104	NAPG	1424069_at 1424070_at 1443366_at	11492	0.071	-0.1174	No
105	WWP2	1438482_at 1442162_at 1448145_at 1448146_at 1456714_at 1457499_at	11621	0.067	-0.1227	No
106	TINAG	1419314_at	11881	0.060	-0.1340	No
107	MLLT7	1422149_at	12075	0.056	-0.1424	No
108	VAT1	1423726_at 1438165_x_at 1441930_x_at	12224	0.053	-0.1487	No
109	GRIN2B	1422223_at 1431700_at	12231	0.053	-0.1485	No
110	USP15	1436891_at 1446186_at 1454036_a_at 1455842_x_at	12257	0.052	-0.1491	No
111	PLA2R1	1450144_at 1454145_at	12547	0.045	-0.1620	No
112	RND1	1455197_at	12719	0.040	-0.1695	No
113	IFRG15	1418115_s_at 1418116_at 1448958_at 1458364_s_at	12779	0.039	-0.1719	No
114	T	1419304_at	12858	0.036	-0.1751	No
115	ABR	1433477_at	12976	0.033	-0.1802	No
116	GUCY1B3	1420871_at 1420872_at	12982	0.033	-0.1801	No
117	PNLIPRP1	1415777_at	13058	0.031	-0.1833	No
118	MID2	1422216_at 1450537_at	13078	0.031	-0.1838	No
119	VGF	1436094_at	13205	0.027	-0.1894	No
120	COL12A1	1427391_a_at 1445751_at	13215	0.027	-0.1896	No
121	JUN	1417409_at 1448694_at	13314	0.024	-0.1938	No
122	LRP2	1427133_s_at 1427621_at 1445901_at 1452320_at	13351	0.023	-0.1953	No
123	CITED2	1417129_a_at 1421267_a_at 1439915_at 1440091_at 1443561_at 1443926_at 1445638_at 1446176_at 1447861_x_at 1457632_s_at 1459301_at	13539	0.018	-0.2037	No
124	POLR3B	1443466_s_at 1443494_at 1452949_at 1457345_at	13766	0.010	-0.2140	No
125	MSX1	1417127_at 1448601_s_at	13793	0.010	-0.2151	No
126	NLK	1419112_at 1435970_at 1443279_at 1445427_at 1456467_s_at	13868	0.007	-0.2185	No
127	NNAT	1423506_a_at	13925	0.006	-0.2210	No
128	IL6	1450297_at	13928	0.006	-0.2210	No
129	PCDH17	1436920_at 1446821_at 1453070_at	14113	0.000	-0.2295	No
130	CCL20	1422029_at	14320	-0.007	-0.2389	No
131	RARB	1454906_at	14461	-0.012	-0.2452	No
132	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	14520	-0.015	-0.2477	No
133	PPP2R5E	1428461_at 1428462_at 1428463_a_at 1439401_x_at 1443533_at 1443949_at 1446356_at 1452788_at	14523	-0.015	-0.2477	No
134	DLL4	1421826_at 1421827_at	14636	-0.019	-0.2527	No
135	LTBP1	1419786_at 1440678_at 1446232_at 1447547_at 1448870_at 1457852_at 1458739_at	14759	-0.023	-0.2581	No
136	KCNJ2	1450503_at	14972	-0.032	-0.2675	No
137	FOSL2	1422931_at	14975	-0.032	-0.2673	No
138	LIFR	1425107_a_at 1450207_at	15076	-0.036	-0.2716	No
139	HMGA2	1422851_at 1443394_at 1446196_at 1450780_s_at 1450781_at 1458241_at	15224	-0.042	-0.2779	No
140	GPM6A	1426442_at 1456741_s_at 1459303_at	15313	-0.045	-0.2816	No
141	SLC26A6	1416275_at	15400	-0.050	-0.2850	No
142	OTX1	1437601_at	15619	-0.060	-0.2945	No
143	NCOA2	1435233_at 1435234_at 1446827_at 1450458_at	15715	-0.065	-0.2983	No
144	LUZP1	1416469_at 1448352_at	15759	-0.067	-0.2996	No
145	VAMP3	1421102_a_at 1433693_x_at 1433916_at 1437708_x_at 1456245_x_at 1457391_at	15814	-0.070	-0.3015	No
146	MKNK2	1418300_a_at 1449029_at	15960	-0.079	-0.3074	No
147	IFNB1	1422305_at	16331	-0.101	-0.3235	No
148	EPHB2	1425015_at 1425016_at 1442471_at 1445417_at 1454022_at	16499	-0.112	-0.3301	No
149	PRKACA	1447720_x_at 1450519_a_at	16584	-0.119	-0.3328	No
150	SFRS16	1428961_a_at	16872	-0.142	-0.3447	No
151	TCF8	1418926_at 1420243_at 1443005_at 1443203_at 1446127_at 1456686_at	16873	-0.142	-0.3434	No
152	ARID1A	1447104_at	16914	-0.146	-0.3439	No
153	CDK6	1435338_at 1440040_at 1455287_at 1460291_at	17266	-0.181	-0.3583	No
154	GNB2	1450623_at	17269	-0.182	-0.3567	No
155	HCN3	1451023_at	17304	-0.186	-0.3565	No
156	SAV1	1416075_at 1448204_at	17551	-0.218	-0.3658	No
157	DDX5	1419653_a_at 1423645_a_at 1433809_at 1433810_x_at 1438371_x_at 1454793_x_at	17605	-0.227	-0.3661	No
158	ELMO3	1434489_at	17613	-0.228	-0.3643	No
159	TRPC4	1423579_a_at 1446366_at 1451033_a_at	17629	-0.230	-0.3629	No
160	NFKB2	1425902_a_at 1429128_x_at	17945	-0.270	-0.3748	No
161	KPNA3	1421828_at 1445527_at 1446538_at 1450385_at 1450386_at	18030	-0.282	-0.3761	No
162	ICAM1	1424067_at	18113	-0.296	-0.3771	No
163	ITM2B	1417999_at 1418000_a_at 1418001_at 1456372_at	18284	-0.323	-0.3819	No
164	LNX2	1460249_at	18666	-0.389	-0.3958	No
165	ACTN1	1427385_s_at 1428585_at 1452415_at	18819	-0.422	-0.3988	No
166	GNA11	1434254_at 1449144_at	18855	-0.431	-0.3964	No
167	TOP1	1423474_at 1438495_at 1457573_at 1459672_at	19006	-0.466	-0.3990	No
168	TNFRSF21	1422740_at 1450731_s_at	19224	-0.516	-0.4041	No
169	BCL3	1418133_at	19548	-0.605	-0.4134	No
170	RAB10	1422664_at 1429296_at 1442463_at 1453095_at	19618	-0.624	-0.4107	No
171	RDH10	1426968_a_at 1460632_at	20290	-0.889	-0.4333	No
172	MKL1	1434900_at	20686	-1.116	-0.4410	Yes
173	ZPBP2	1429512_at 1460503_at	20733	-1.158	-0.4323	Yes
174	RELB	1417856_at	20776	-1.198	-0.4231	Yes
175	PPP1R10	1426726_at 1426727_s_at 1430560_at	20811	-1.226	-0.4132	Yes
176	FOXP1	1421140_a_at 1421141_a_at 1421142_s_at 1435222_at 1438802_at 1443258_at 1446280_at 1447209_at 1455242_at 1456851_at	20881	-1.284	-0.4044	Yes
177	TNIP1	1427689_a_at	20959	-1.367	-0.3952	Yes
178	HIVEP1	1422742_at	21000	-1.418	-0.3838	Yes
179	ATP1B1	1418453_a_at 1423890_x_at 1439036_a_at 1451152_a_at 1455949_at	21286	-1.823	-0.3799	Yes
180	EIF4ENIF1	1431075_a_at 1439169_at	21377	-1.957	-0.3658	Yes
181	SMOC1	1448321_at	21462	-2.111	-0.3499	Yes
182	CD69	1428735_at	21470	-2.122	-0.3304	Yes
183	P2RX1	1429794_a_at 1457590_at 1460719_a_at	21471	-2.127	-0.3106	Yes
184	RBM4	1416920_at 1437322_at 1455517_at	21472	-2.127	-0.2907	Yes
185	CXCL14	1418456_a_at 1418457_at	21540	-2.270	-0.2726	Yes
186	ARPC2	1437148_at 1442295_at	21593	-2.427	-0.2524	Yes
187	BAZ2B	1435240_at 1440984_at 1441556_at 1442704_at 1442971_at 1445048_at 1448007_at 1458077_at	21625	-2.560	-0.2299	Yes
188	UBE2H	1418631_at 1418632_at 1428791_at 1438971_x_at 1447374_at 1459930_at	21704	-2.850	-0.2069	Yes
189	PIAS1	1422581_at 1446448_at 1455486_at 1455611_at	21720	-2.886	-0.1807	Yes
190	FGF13	1418497_at 1418498_at	21760	-3.067	-0.1538	Yes
191	TES	1424246_a_at 1440649_at 1460378_a_at	21762	-3.079	-0.1251	Yes
192	ZNRF1	1420949_at 1420950_at 1424384_a_at	21779	-3.246	-0.0956	Yes
193	PDE10A	1419389_at 1419390_at 1432490_a_at 1439618_at 1458499_at	21804	-3.396	-0.0650	Yes
194	CDKN2C	1416868_at 1439164_at	21808	-3.419	-0.0332	Yes
195	RRM1	1415878_at 1440073_at 1448127_at	21883	-4.186	0.0024	Yes