Details for gene set V$FOXO1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_plus
GeneSet	V$FOXO1_01
Enrichment Score (ES)	-0.46448973
Normalized Enrichment Score (NES)	-1.5267638
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.13672146
FWER p-Value	0.737

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	BCL11B	1440137_at 1441762_at 1450339_a_at	140	3.228	0.0210	No
2	KLHDC2	1435086_s_at 1442596_at 1460678_at	257	2.677	0.0384	No
3	H3F3B	1420376_a_at 1430357_at 1455725_a_at	390	2.252	0.0514	No
4	LMO4	1420981_a_at 1439651_at	439	2.111	0.0671	No
5	MED8	1431423_a_at 1442417_at	447	2.084	0.0845	No
6	ETV5	1420998_at 1428142_at 1450082_s_at	588	1.801	0.0934	No
7	CCND1	1417419_at 1417420_at 1448698_at	613	1.756	0.1072	No
8	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	664	1.690	0.1192	No
9	ELAVL2	1421881_a_at 1421882_a_at 1421883_at 1433052_at	741	1.591	0.1293	No
10	PALM	1422034_a_at 1423967_at 1439927_at 1457217_at	1053	1.251	0.1256	No
11	NFIB	1416293_at 1427680_a_at 1434101_at 1434102_at 1438072_at 1438244_at 1442214_at 1444800_at 1448288_at 1454834_at	1179	1.158	0.1297	No
12	NDRG1	1423413_at 1450976_at 1456174_x_at	1251	1.112	0.1358	No
13	SLC38A2	1426722_at 1429593_at 1429594_at	1286	1.090	0.1435	No
14	IMPDH2	1415851_a_at 1415852_at	1409	1.012	0.1465	No
15	THRA	1426997_at 1443952_at 1454675_at	1652	0.900	0.1430	No
16	CDKN1C	1417649_at	1715	0.870	0.1476	No
17	GFRA1	1421973_at 1439015_at 1450440_at	2038	0.735	0.1390	No
18	OSR1	1449350_at	2363	0.634	0.1295	No
19	DLX1	1449470_at	2391	0.625	0.1336	No
20	HSPB2	1429888_a_at	2503	0.595	0.1335	No
21	CRB1	1421451_at 1441330_at	2694	0.550	0.1295	No
22	MCM7	1416030_a_at 1416031_s_at 1438320_s_at	2708	0.547	0.1335	No
23	HESX1	1420604_at	2992	0.490	0.1247	No
24	ORC1L	1422663_at 1443172_at	3218	0.449	0.1181	No
25	FGF12	1440270_at 1451693_a_at 1460137_at	3285	0.439	0.1188	No
26	TDRD5	1446208_at 1456391_at	3400	0.423	0.1172	No
27	KCNN1	1419617_at 1449536_at	3492	0.411	0.1165	No
28	POU3F4	1422164_at 1422165_at	3665	0.390	0.1119	No
29	SH3BP5	1421922_at 1421923_at 1444346_at	3816	0.374	0.1082	No
30	GPR63	1422338_at 1440725_at	3881	0.367	0.1083	No
31	INHBA	1422053_at 1458291_at	3952	0.360	0.1082	No
32	ABLIM3	1434013_at 1446069_at	4180	0.339	0.1006	No
33	AP4M1	1418846_at	4232	0.335	0.1011	No
34	DEPDC2	1432047_at	4240	0.334	0.1036	No
35	SEMA4G	1449202_at	4251	0.333	0.1060	No
36	AKT1S1	1428158_at 1437736_at 1452684_at	4328	0.328	0.1053	No
37	PLXDC2	1418912_at 1449270_at	4480	0.314	0.1010	No
38	BMI1	1417493_at 1448733_at	4755	0.296	0.0909	No
39	HHEX	1423319_at	4965	0.284	0.0837	No
40	SH3GL3	1432103_a_at	5074	0.279	0.0811	No
41	ELOVL6	1417403_at 1417404_at 1445062_at 1445578_at 1445641_at	5644	0.252	0.0571	No
42	SFRS12	1427134_at 1427135_at 1427136_s_at 1458056_at	5692	0.249	0.0571	No
43	CLDN2	1417231_at 1417232_at	5818	0.244	0.0534	No
44	KBTBD5	1431043_at	5854	0.242	0.0538	No
45	LASP1	1438633_x_at 1438634_x_at 1439264_x_at 1444947_at 1448207_at 1455470_x_at 1456309_x_at 1456469_x_at 1456578_x_at 1460173_at	6034	0.234	0.0476	No
46	HOXC4	1422870_at	6294	0.224	0.0376	No
47	SALL3	1441186_at 1452386_at	6481	0.217	0.0309	No
48	HOXA11	1420414_at	6530	0.215	0.0305	No
49	HOXB4	1451761_at 1460379_at	6763	0.205	0.0216	No
50	EPHB1	1455188_at	6800	0.204	0.0217	No
51	KCNJ15	1435354_at 1443054_at 1450185_a_at	6967	0.197	0.0157	No
52	APOA2	1417950_a_at	7035	0.195	0.0143	No
53	CHES1	1434002_at 1436925_at 1438255_at 1440607_at 1444555_at 1447325_at 1453094_at	7049	0.195	0.0153	No
54	SLITRK6	1437231_at	7099	0.193	0.0147	No
55	EML1	1458317_at	7290	0.186	0.0076	No
56	POU3F2	1450831_at 1453478_at 1457734_at	7631	0.175	-0.0066	No
57	A2BP1	1418314_a_at 1438217_at 1447735_x_at 1455358_at 1456921_at	7915	0.167	-0.0182	No
58	PHACTR3	1429651_at	8204	0.159	-0.0301	No
59	SEMA6D	1446536_at 1448060_at 1453055_at 1459318_at	8219	0.158	-0.0294	No
60	RUNX1	1422864_at 1422865_at 1427650_a_at 1427847_at 1440878_at 1444527_at 1446930_at 1452530_a_at 1452531_at 1452578_at 1459470_at	8298	0.156	-0.0316	No
61	TSC1	1422043_at 1439989_at 1455252_at	8344	0.154	-0.0324	No
62	PRDM1	1420425_at 1444997_at	8379	0.153	-0.0326	No
63	EPHB3	1451550_at	8433	0.151	-0.0338	No
64	FSTL1	1416221_at 1448259_at	8535	0.148	-0.0372	No
65	TBX4	1426321_at 1456033_at	8727	0.143	-0.0447	No
66	NFYA	1422082_a_at 1427808_at 1452560_a_at	8728	0.143	-0.0435	No
67	SLITRK5	1429718_at	8838	0.140	-0.0474	No
68	FST	1421365_at 1434458_at	8983	0.135	-0.0528	No
69	IGSF1	1433652_at 1438589_at 1447702_x_at	9186	0.130	-0.0610	No
70	EZH1	1418290_a_at 1429629_at 1429630_at 1444604_at 1449023_a_at	9257	0.128	-0.0631	No
71	CSAD	1427981_a_at	9260	0.128	-0.0621	No
72	LHX5	1420348_at	9565	0.120	-0.0751	No
73	ESRRG	1421747_at 1455267_at 1457896_at	9650	0.118	-0.0780	No
74	SCRN3	1426916_at 1426917_s_at 1436573_at	10237	0.102	-0.1040	No
75	CADPS	1444488_at 1445586_at 1448955_s_at 1458298_at	10260	0.101	-0.1042	No
76	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	10277	0.101	-0.1041	No
77	GRIK3	1427709_at	10430	0.098	-0.1102	No
78	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	10549	0.095	-0.1148	No
79	MGLL	1426785_s_at 1431331_at 1450391_a_at 1453836_a_at	10620	0.093	-0.1173	No
80	EFEMP1	1427183_at	10888	0.087	-0.1288	No
81	GPRC5C	1424450_at 1452947_at	10902	0.086	-0.1287	No
82	IRS4	1441429_at	10998	0.083	-0.1323	No
83	SDK2	1430425_at 1457333_at	11031	0.082	-0.1331	No
84	C1QTNF3	1422606_at	11319	0.075	-0.1457	No
85	NRG1	1456524_at	11471	0.071	-0.1520	No
86	TRIM8	1418577_at 1427593_at 1438679_at 1460237_at	11495	0.071	-0.1525	No
87	PROX1	1421336_at 1437894_at 1457432_at	11779	0.063	-0.1649	No
88	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	11807	0.063	-0.1656	No
89	SLC25A28	1424776_a_at	12062	0.056	-0.1768	No
90	NFIX	1423493_a_at 1436363_a_at 1436364_x_at 1451443_at 1459909_at	12329	0.050	-0.1886	No
91	GRB7	1448227_at	12604	0.043	-0.2009	No
92	NTRK3	1422329_a_at 1425070_at 1425071_s_at 1426003_at 1433825_at 1443970_at 1455917_at	12608	0.043	-0.2006	No
93	CRH	1457984_at	12788	0.038	-0.2085	No
94	SLC26A7	1425841_at	12913	0.035	-0.2139	No
95	ITPR3	1417297_at	13086	0.030	-0.2216	No
96	ZFHX1B	1422748_at 1434298_at 1442393_at 1445518_at 1454200_at 1456389_at	13220	0.027	-0.2275	No
97	NMNAT2	1436155_at	13249	0.026	-0.2285	No
98	PAPPA	1427633_a_at 1432591_at 1432592_at 1459375_at	13332	0.023	-0.2321	No
99	LPHN2	1434111_at 1434112_at 1444906_at	13407	0.021	-0.2353	No
100	NF1	1438067_at 1441523_at 1443097_at 1452525_a_at	13461	0.020	-0.2376	No
101	SOX2	1416967_at	13567	0.017	-0.2423	No
102	CXXC5	1431469_a_at 1448960_at	13593	0.016	-0.2433	No
103	DTNA	1419223_a_at 1425292_at 1426066_a_at 1427588_a_at 1429768_at 1447280_at 1456069_at 1458908_at	13636	0.015	-0.2451	No
104	GPR110	1421443_at	13693	0.013	-0.2476	No
105	CYR61	1416039_x_at 1417848_at 1417849_at 1438133_a_at 1442340_x_at 1457823_at 1459462_at	13817	0.009	-0.2531	No
106	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	13998	0.004	-0.2614	No
107	PTPRD	1424886_at 1429052_at 1435537_at 1439175_at 1440624_at 1441498_at 1441932_at 1442837_at 1443053_at 1443056_at 1443075_at 1443860_at 1444492_at 1444622_at 1445767_at 1459173_at	14103	0.000	-0.2662	No
108	LHX1	1421951_at 1450428_at	14300	-0.007	-0.2751	No
109	BDNF	1422168_a_at 1422169_a_at	14354	-0.009	-0.2775	No
110	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	14520	-0.015	-0.2849	No
111	CSNK1G3	1429383_at 1429384_at 1458994_at	14684	-0.021	-0.2923	No
112	HOXB8	1452493_s_at	14744	-0.023	-0.2948	No
113	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	14774	-0.024	-0.2959	No
114	KLF12	1439846_at 1439847_s_at 1441040_at 1455521_at	14936	-0.031	-0.3030	No
115	DDIT4	1428306_at	14981	-0.032	-0.3048	No
116	GATA6	1425463_at 1425464_at 1443081_at	15056	-0.035	-0.3079	No
117	NKX2-2	1421112_at	15147	-0.039	-0.3117	No
118	YTHDF3	1426840_at 1426841_at 1426842_at 1445235_at	15175	-0.040	-0.3126	No
119	GPR109A	1419721_at	15206	-0.041	-0.3136	No
120	BUB3	1416815_s_at 1448058_s_at 1448473_at 1459104_at 1459918_at	15208	-0.041	-0.3133	No
121	LMO3	1455754_at	15274	-0.044	-0.3159	No
122	ZADH2	1451277_at	15473	-0.053	-0.3246	No
123	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	15702	-0.064	-0.3345	No
124	FOXP2	1422014_at 1438231_at 1438232_at 1440108_at 1441365_at 1458191_at	15777	-0.069	-0.3374	No
125	EIF4EBP2	1417084_at 1436158_at 1437733_at 1455575_at 1456613_at	15864	-0.073	-0.3407	No
126	UTX	1427235_at 1427672_a_at 1440524_at 1441201_at 1445198_at 1446234_at 1446278_at	15907	-0.076	-0.3420	No
127	RASGEF1B	1454742_at	15937	-0.077	-0.3426	No
128	BIN1	1423618_at 1425532_a_at 1444120_at	15997	-0.081	-0.3447	No
129	ANKRD28	1434630_at 1454801_at	16239	-0.095	-0.3549	No
130	OLIG3	1421728_at	16740	-0.131	-0.3768	No
131	WHSC1L1	1442085_at 1447931_at 1455668_at 1457630_at 1457793_a_at 1457794_at 1459907_a_at	16926	-0.146	-0.3841	No
132	PMCH	1429361_at	16975	-0.151	-0.3850	No
133	OPA3	1455131_at	17001	-0.153	-0.3848	No
134	MITF	1422025_at 1455214_at	17279	-0.183	-0.3960	No
135	WBP4	1419374_at 1419375_at	17349	-0.190	-0.3976	No
136	UBL3	1423461_a_at	17538	-0.217	-0.4044	No
137	SLC26A2	1421145_at 1443882_at	17621	-0.229	-0.4062	No
138	LRRC1	1452411_at	17747	-0.246	-0.4099	No
139	H2AFX	1416746_at	18043	-0.284	-0.4210	No
140	DEDD	1432000_a_at 1434994_at 1434995_s_at	18203	-0.309	-0.4257	No
141	TBCC	1424644_at 1451423_at	18394	-0.339	-0.4316	No
142	PLCB2	1452481_at	18486	-0.354	-0.4327	No
143	GTF2B	1438066_at 1451135_at	18509	-0.358	-0.4307	No
144	LAG3	1449911_at	18526	-0.360	-0.4284	No
145	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	18852	-0.430	-0.4397	No
146	TBC1D17	1423659_a_at	18902	-0.441	-0.4382	No
147	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	19116	-0.492	-0.4438	No
148	PPP1CB	1426205_at 1431328_at 1433540_x_at 1456462_x_at	19158	-0.501	-0.4414	No
149	PDCD4	1444171_at	19209	-0.513	-0.4394	No
150	PLAG1	1421745_at 1443943_at	19233	-0.518	-0.4360	No
151	USP3	1425022_at 1425023_at 1435531_at 1441056_at 1446886_at	19320	-0.540	-0.4354	No
152	CHD1	1420990_at 1444787_at 1444788_x_at 1450077_at 1457473_at	19954	-0.743	-0.4582	Yes
153	TAZ	1416207_at 1453785_at	19966	-0.747	-0.4523	Yes
154	PURA	1420628_at 1438219_at 1449934_at 1453783_at 1456898_at	20096	-0.802	-0.4515	Yes
155	CHCHD7	1440158_x_at 1444318_at 1446844_at 1454640_at	20238	-0.863	-0.4506	Yes
156	EXT1	1417730_at 1439877_at 1440011_at 1440092_at 1456655_at 1458054_at 1458296_at	20488	-0.986	-0.4537	Yes
157	EMP1	1416529_at 1459171_at	20578	-1.044	-0.4489	Yes
158	ASB7	1435010_at 1438744_at 1446319_at 1450363_at	20612	-1.062	-0.4414	Yes
159	JMJD1A	1426810_at	20644	-1.089	-0.4336	Yes
160	ZFYVE1	1435071_at 1435072_at	20779	-1.198	-0.4296	Yes
161	SSBP3	1425940_a_at 1427917_s_at 1439136_at 1443554_at 1457560_at 1458749_at	20822	-1.232	-0.4210	Yes
162	GPR18	1439141_at	20930	-1.320	-0.4148	Yes
163	CREM	1418322_at 1430598_at 1430847_a_at 1449037_at	21125	-1.586	-0.4102	Yes
164	BMF	1422995_at 1454880_s_at 1458325_x_at	21130	-1.593	-0.3969	Yes
165	DUSP1	1448830_at	21133	-1.596	-0.3834	Yes
166	SMAD1	1416081_at 1448208_at 1459843_s_at	21165	-1.650	-0.3708	Yes
167	LCP2	1418641_at 1418642_at	21182	-1.674	-0.3573	Yes
168	CCNG2	1416488_at 1448364_at	21241	-1.768	-0.3450	Yes
169	NR4A2	1447863_s_at 1450749_a_at 1450750_a_at 1455034_at	21244	-1.774	-0.3300	Yes
170	ASXL1	1434561_at 1435077_at 1458380_at	21266	-1.798	-0.3157	Yes
171	AXIN2	1421341_at 1436845_at	21387	-1.982	-0.3044	Yes
172	CNNM3	1420480_at 1420481_at 1420482_at 1420483_at 1441544_at 1458330_x_at	21393	-1.994	-0.2877	Yes
173	ARID4A	1436191_at 1438464_at 1456420_at	21414	-2.023	-0.2714	Yes
174	SPAG9	1430556_at 1433648_at 1437676_at	21485	-2.152	-0.2564	Yes
175	NR2C2	1425014_at 1439696_at 1445613_at 1446955_at 1451569_at 1454167_at 1454851_at	21561	-2.320	-0.2401	Yes
176	HIPK1	1421298_a_at 1424540_at 1457515_at	21570	-2.344	-0.2206	Yes
177	SESN3	1449303_at 1453313_at	21626	-2.567	-0.2013	Yes
178	ATF7IP	1446323_at 1449192_at 1454973_at 1459096_at	21698	-2.826	-0.1806	Yes
179	UBE2H	1418631_at 1418632_at 1428791_at 1438971_x_at 1447374_at 1459930_at	21704	-2.850	-0.1566	Yes
180	HBP1	1432143_a_at 1438430_at 1446269_at 1460367_at	21745	-2.989	-0.1331	Yes
181	FOXO1A	1416981_at 1416982_at 1416983_s_at 1459170_at	21766	-3.101	-0.1077	Yes
182	NNT	1416105_at 1432608_at 1456573_x_at	21800	-3.378	-0.0805	Yes
183	MLL5	1427236_a_at 1432601_at 1434704_at 1439107_a_at 1439108_at	21813	-3.448	-0.0518	Yes
184	H2AFV	1428029_a_at 1436596_at	21932	-6.758	0.0002	Yes