Details for gene set V$CDP

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$CDP_02
Enrichment Score (ES)	0.47921258
Normalized Enrichment Score (NES)	1.4298149
Nominal p-value	0.016427105
FDR q-value	0.38702688
FWER p-Value	0.98

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	WDR12	1417270_at 1448646_at 1459762_x_at	31	4.677	0.1102	Yes
2	MBNL1	1416904_at 1439686_at 1440315_at 1445106_at 1457924_at	43	4.392	0.2145	Yes
3	CDCA7	1428069_at 1445681_at	66	3.948	0.3077	Yes
4	CNIH	1423727_at	244	2.701	0.3641	Yes
5	DOCK4	1431114_at 1436405_at 1441462_at 1441469_at 1446283_at 1457146_at 1459279_at	626	1.741	0.3882	Yes
6	JARID2	1422698_s_at 1446082_at 1450710_at 1456661_at	656	1.698	0.4274	Yes
7	DACH1	1420694_a_at 1420695_at 1433743_at 1447174_at 1459381_at	818	1.490	0.4556	Yes
8	CS	1422577_at 1422578_at 1450667_a_at	987	1.312	0.4792	Yes
9	OGG1	1430078_a_at 1448815_at	1505	0.964	0.4786	No
10	SLC6A9	1417636_at 1431812_a_at	2244	0.670	0.4608	No
11	HNRPA2B1	1420365_a_at 1433829_a_at 1433830_at 1434047_x_at	2438	0.614	0.4666	No
12	IGSF4	1417376_a_at 1417377_at 1417378_at 1431611_a_at	3151	0.461	0.4450	No
13	KIF1B	1423994_at 1423995_at 1425270_at 1451200_at 1451642_at 1451762_a_at 1455182_at 1458426_at	3369	0.429	0.4453	No
14	NDST4	1421318_at 1431452_at 1450195_at	3648	0.392	0.4419	No
15	FOXD3	1422210_at	3652	0.391	0.4511	No
16	POU3F4	1422164_at 1422165_at	3665	0.390	0.4599	No
17	SLC5A10	1440834_at	3812	0.374	0.4621	No
18	GNAO1	1421152_a_at 1448031_at 1460383_at	4115	0.343	0.4565	No
19	MAB21L2	1418934_at	4272	0.332	0.4573	No
20	TOB1	1423176_at 1440844_at	4958	0.284	0.4327	No
21	SREBF2	1426744_at 1452174_at	5393	0.263	0.4192	No
22	SEMA5B	1422146_at 1435963_at	5782	0.245	0.4073	No
23	PTMA	1423455_at	5941	0.238	0.4057	No
24	HOXA11	1420414_at	6530	0.215	0.3839	No
25	PDZRN4	1456512_at	6634	0.210	0.3842	No
26	HOXA7	1449499_at	6814	0.203	0.3809	No
27	ANKRD2	1419621_at	7595	0.176	0.3494	No
28	A2BP1	1418314_a_at 1438217_at 1447735_x_at 1455358_at 1456921_at	7915	0.167	0.3388	No
29	PHACTR3	1429651_at	8204	0.159	0.3294	No
30	CACNA2D3	1419225_at	8417	0.152	0.3233	No
31	GRIA3	1420563_at 1434728_at	8463	0.151	0.3249	No
32	SOX9	1424950_at 1433889_at 1451538_at	8531	0.148	0.3253	No
33	SEMA6A	1421414_a_at 1425903_at 1436458_at	8553	0.148	0.3279	No
34	ERG	1425370_a_at 1440244_at	8564	0.148	0.3310	No
35	MEF2C	1421027_a_at 1421028_a_at 1424852_at 1439946_at 1445420_at 1446484_at 1451506_at 1451507_at 1458551_at	8699	0.144	0.3283	No
36	LRCH2	1436877_at 1441273_at	9159	0.131	0.3104	No
37	ETV4	1423232_at 1443381_at	9279	0.128	0.3080	No
38	SIX1	1427277_at	9821	0.113	0.2859	No
39	LSAMP	1443754_x_at 1455636_at 1460092_at	9926	0.110	0.2838	No
40	TCF4	1416723_at 1416724_x_at 1416725_at 1424089_a_at 1434148_at 1434149_at 1439336_at 1440106_at 1446386_at 1458201_at	10057	0.107	0.2804	No
41	PTF1A	1419424_at	10081	0.106	0.2819	No
42	PPM1L	1435699_at 1435787_at 1438012_at	10095	0.106	0.2838	No
43	SYT1	1421990_at 1431191_a_at 1433884_at 1438282_at 1442557_at 1457497_at	10193	0.103	0.2818	No
44	SALL1	1450489_at	10593	0.093	0.2658	No
45	HCN1	1450193_at	11048	0.082	0.2470	No
46	EPHA3	1425574_at 1425575_at 1426057_a_at 1443273_at	11462	0.071	0.2298	No
47	GC	1426547_at	11509	0.070	0.2294	No
48	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	11807	0.063	0.2173	No
49	GPX1	1460671_at	12158	0.054	0.2025	No
50	PTGS2	1417262_at 1417263_at	12170	0.054	0.2033	No
51	CDH9	1427618_at	12442	0.047	0.1921	No
52	HOXA2	1419602_at	12919	0.035	0.1711	No
53	SLITRK2	1441483_at	12960	0.033	0.1701	No
54	SRPK2	1417134_at 1417135_at 1417136_s_at 1431372_at 1435746_at 1440080_at 1442241_at 1442980_at 1447755_at 1448603_at	13199	0.027	0.1598	No
55	LPHN2	1434111_at 1434112_at 1444906_at	13407	0.021	0.1509	No
56	NRXN3	1419825_at 1431153_at 1432931_at 1433788_at 1438193_at 1439629_at 1442423_at 1444700_at 1456137_at 1460101_at	13873	0.007	0.1298	No
57	MYH10	1441057_at 1452740_at	13934	0.005	0.1272	No
58	LIF	1421206_at 1421207_at 1450160_at	14044	0.002	0.1222	No
59	BHLHB5	1418271_at	14248	-0.005	0.1130	No
60	DCX	1418139_at 1418140_at 1418141_at 1448974_at	14473	-0.013	0.1031	No
61	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	14520	-0.015	0.1013	No
62	TBX3	1437479_x_at 1439567_at 1444594_at 1445757_at 1448029_at	14626	-0.019	0.0970	No
63	HOXB8	1452493_s_at	14744	-0.023	0.0922	No
64	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	14774	-0.024	0.0914	No
65	DGKB	1440901_at 1442860_at 1443631_at 1455361_at	15009	-0.033	0.0815	No
66	LCP1	1415983_at 1448160_at	15107	-0.038	0.0780	No
67	GBX2	1420337_at	15242	-0.043	0.0729	No
68	GPM6A	1426442_at 1456741_s_at 1459303_at	15313	-0.045	0.0708	No
69	OTX1	1437601_at	15619	-0.060	0.0582	No
70	SP8	1440519_at	16230	-0.094	0.0326	No
71	PKD2L2	1419422_at 1449469_at	16282	-0.098	0.0326	No
72	HNF4G	1422182_at 1450518_at 1460127_at	17300	-0.185	-0.0095	No
73	STAG2	1421849_at 1450396_at	17433	-0.202	-0.0108	No
74	MARCKS	1415971_at 1415972_at 1430311_at 1437034_x_at 1456028_x_at	17459	-0.205	-0.0070	No
75	GNAQ	1428938_at 1428939_s_at 1428940_at 1429559_at 1446688_at 1447593_x_at 1450115_at 1455729_at 1458159_at	18345	-0.332	-0.0396	No
76	RPA3	1448938_at	18476	-0.353	-0.0371	No
77	GTF2IRD1	1451899_a_at 1460364_at	19195	-0.510	-0.0578	No
78	CPEB4	1420617_at 1420618_at 1449931_at	19289	-0.532	-0.0493	No
79	DUSP10	1417163_at 1417164_at	19355	-0.548	-0.0392	No
80	SLC1A3	1426340_at 1426341_at 1439072_at 1440491_at 1443749_x_at 1452031_at	19737	-0.667	-0.0408	No
81	MEIS1	1440431_at 1443260_at 1445773_at 1450992_a_at 1459423_at 1459512_at	20652	-1.096	-0.0564	No
82	PRKAG1	1417690_at 1433533_x_at 1457803_at	20924	-1.313	-0.0375	No
83	CCND2	1416122_at 1416123_at 1416124_at 1430127_a_at 1434745_at 1448229_s_at 1455956_x_at	21827	-3.509	0.0050	No