Details for gene set REACTOME_DIABETES

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	REACTOME_DIABETES_PATHWAYS
Enrichment Score (ES)	0.54419357
Normalized Enrichment Score (NES)	1.7722553
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.022582725
FWER p-Value	0.308

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	COX7C	1448112_at 1459884_at 1459885_s_at	0	8.097	0.0599	Yes
2	COX8A	1416112_at 1436409_at 1448222_x_at	2	6.931	0.1111	Yes
3	COX5B	1416902_a_at 1435613_x_at 1436149_at 1448514_at 1454716_x_at 1456588_x_at	3	6.855	0.1618	Yes
4	RPL14	1422128_at 1426793_a_at 1433688_x_at 1436688_x_at 1438507_x_at 1438626_x_at	6	6.466	0.2096	Yes
5	ATP5C1	1416058_s_at 1438809_at	15	5.347	0.2488	Yes
6	NDUFB8	1448198_a_at 1458404_at	46	4.285	0.2791	Yes
7	CYCS	1422484_at 1445484_at	51	4.211	0.3101	Yes
8	EIF2S1	1440272_at 1452662_a_at	78	3.772	0.3368	Yes
9	IDH3A	1422500_at 1422501_s_at 1432016_a_at 1447701_x_at	149	3.166	0.3570	Yes
10	PDHA1	1418560_at 1446954_at 1449137_at	150	3.164	0.3804	Yes
11	ATP5G1	1416020_a_at 1444874_at	224	2.845	0.3981	Yes
12	F2	1418897_at	362	2.335	0.4091	Yes
13	NDUFS8	1423907_a_at 1423908_at 1434212_at 1434213_x_at 1434579_x_at 1455283_x_at	419	2.164	0.4225	Yes
14	MBTPS1	1431385_a_at 1431386_s_at 1448240_at	459	2.054	0.4359	Yes
15	TPI1	1415918_a_at 1435659_a_at 1452927_x_at	606	1.765	0.4422	Yes
16	RPS3	1435151_a_at 1447563_at 1455600_at	654	1.701	0.4527	Yes
17	ATP5F1	1426742_at 1433562_s_at	759	1.576	0.4596	Yes
18	EXOC5	1436817_at 1438126_at	956	1.347	0.4605	Yes
19	CS	1422577_at 1422578_at 1450667_a_at	987	1.312	0.4688	Yes
20	DLD	1423159_at	1314	1.077	0.4618	Yes
21	PKM2	1417308_at	1548	0.945	0.4581	Yes
22	NDUFV1	1415966_a_at 1415967_at 1456015_x_at	1579	0.931	0.4637	Yes
23	NDUFC1	1416285_at 1448284_a_at	1678	0.889	0.4657	Yes
24	SSR2	1449930_a_at	1799	0.830	0.4664	Yes
25	SDHD	1428235_at 1437489_x_at	1820	0.822	0.4715	Yes
26	ATP5L	1448203_at	1892	0.789	0.4741	Yes
27	UQCRFS1	1450968_at	1931	0.774	0.4781	Yes
28	NDUFV2	1428179_at 1438159_x_at 1452692_a_at	2007	0.743	0.4801	Yes
29	UQCR	1448292_at	2018	0.740	0.4851	Yes
30	PLA2G7	1430700_a_at	2047	0.729	0.4893	Yes
31	ATP5J	1416143_at	2147	0.699	0.4899	Yes
32	SDHB	1418005_at	2180	0.690	0.4935	Yes
33	NDUFS7	1424313_a_at 1451312_at	2206	0.681	0.4974	Yes
34	RPL4	1425183_a_at	2216	0.678	0.5020	Yes
35	NDUFB10	1428322_a_at	2233	0.673	0.5062	Yes
36	RPS3A	1422475_a_at	2312	0.646	0.5074	Yes
37	SUCLG1	1415891_at	2329	0.642	0.5115	Yes
38	RPL18	1437005_a_at 1450372_a_at	2347	0.636	0.5154	Yes
39	ETFB	1428181_at	2348	0.636	0.5201	Yes
40	NDUFA8	1423692_at	2386	0.627	0.5230	Yes
41	GLP1R	1422330_at	2399	0.623	0.5271	Yes
42	NDUFA7	1422976_x_at 1428360_x_at 1436567_a_at 1450818_a_at 1455749_x_at	2532	0.589	0.5254	Yes
43	IGFBP6	1417933_at	2573	0.578	0.5278	Yes
44	ATP5E	1416567_s_at	2817	0.525	0.5205	Yes
45	NDUFB6	1434056_a_at 1434057_at	2820	0.523	0.5243	Yes
46	NDUFB5	1417102_a_at 1448589_at	2896	0.508	0.5246	Yes
47	UQCRC1	1428782_a_at	2915	0.503	0.5275	Yes
48	IDH3G	1416788_a_at 1416789_at	2923	0.501	0.5309	Yes
49	NDUFA6	1448427_at	2965	0.493	0.5327	Yes
50	RPS24	1436064_x_at 1436500_at 1453362_x_at 1455195_at 1456628_x_at	2968	0.493	0.5362	Yes
51	ATP5O	1416278_a_at	3021	0.484	0.5374	Yes
52	SEC61B	1417083_at	3100	0.469	0.5373	Yes
53	NDUFS6	1433603_at	3153	0.461	0.5383	Yes
54	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	3166	0.459	0.5412	Yes
55	COX6C	1415970_at 1434491_a_at	3175	0.457	0.5442	Yes
56	NDUFS3	1423737_at	3333	0.434	0.5402	No
57	NDUFA9	1416663_at	3425	0.420	0.5391	No
58	SPCS3	1451175_at	3525	0.407	0.5376	No
59	SEC61G	1423090_x_at	3549	0.404	0.5395	No
60	UQCRC2	1428631_a_at 1435757_a_at	3584	0.400	0.5409	No
61	RPL37	1453729_a_at	3613	0.397	0.5426	No
62	KLF4	1417394_at 1417395_at	3829	0.373	0.5355	No
63	ADRA2A	1423022_at 1433600_at 1433601_at	3869	0.368	0.5364	No
64	RPL8	1417762_a_at	3923	0.362	0.5366	No
65	RPS4X	1416276_a_at	3998	0.354	0.5359	No
66	ATP5A1	1420037_at 1423111_at 1449710_s_at	4020	0.352	0.5375	No
67	RPS25	1430978_at 1451068_s_at	4160	0.340	0.5336	No
68	IGF1	1419519_at 1436497_at 1437401_at 1452014_a_at	4190	0.338	0.5348	No
69	RPL27A	1437729_at	4191	0.338	0.5373	No
70	SRP72	1428876_at 1428877_at	4378	0.322	0.5311	No
71	RPL6	1416546_a_at	4516	0.311	0.5271	No
72	MDH2	1416478_a_at 1433984_a_at	4518	0.311	0.5294	No
73	ATP5B	1416829_at	4523	0.310	0.5315	No
74	RPL11	1417615_a_at	4659	0.302	0.5275	No
75	COX6B1	1416565_at 1436757_a_at	4913	0.287	0.5180	No
76	SYT5	1422531_at	5042	0.281	0.5142	No
77	CHRM3	1422258_at	5163	0.275	0.5108	No
78	RPSA	1416196_at 1448245_at	5181	0.274	0.5120	No
79	ATP5J2	1416269_at 1435395_s_at	5346	0.266	0.5064	No
80	ATP5I	1422525_at 1434053_x_at 1450640_x_at	5377	0.264	0.5070	No
81	RPS23	1460175_at	5386	0.264	0.5086	No
82	PRKAR2B	1430640_a_at 1438664_at 1456475_s_at	5402	0.263	0.5099	No
83	RPS2	1431766_x_at	5610	0.254	0.5022	No
84	ABCC8	1455765_a_at 1457066_at	6152	0.229	0.4791	No
85	GNAS	1421740_at 1427789_s_at 1443007_at 1443375_at 1444767_at 1450186_s_at 1453413_at	6342	0.222	0.4721	No
86	RPL41	1422623_x_at 1455578_x_at	6374	0.220	0.4723	No
87	RPS5	1416054_at	6589	0.212	0.4640	No
88	NDUFS2	1451096_at	6654	0.210	0.4626	No
89	MMP2	1416136_at 1439364_a_at	8034	0.163	0.4005	No
90	RPL28	1416074_a_at	8599	0.146	0.3757	No
91	UQCRQ	1427880_at 1430326_s_at 1437134_at 1452613_at	8694	0.144	0.3724	No
92	NFYA	1422082_a_at 1427808_at 1452560_a_at	8728	0.143	0.3720	No
93	IQGAP1	1417379_at 1417380_at 1431395_a_at 1431396_at 1434998_at 1445724_at 1458124_at	8776	0.141	0.3709	No
94	ATP5D	1423716_s_at 1456580_s_at	8787	0.141	0.3715	No
95	NDUFB3	1416547_at	8967	0.136	0.3642	No
96	SRP19	1450891_at	9103	0.132	0.3590	No
97	RPS15A	1453467_s_at 1457726_at	9243	0.129	0.3536	No
98	NDUFS5	1416494_at 1416495_s_at	9379	0.125	0.3483	No
99	GCG	1425952_a_at	9380	0.125	0.3492	No
100	IGFALS	1422826_at	9406	0.124	0.3490	No
101	NDUFA11	1429708_at 1444154_at	9455	0.123	0.3477	No
102	NDUFB7	1416417_a_at 1448331_at	9696	0.117	0.3376	No
103	KCNJ11	1450515_at 1455417_at	9834	0.112	0.3321	No
104	NDUFC2	1431670_at	10578	0.094	0.2987	No
105	SLC30A7	1450697_at	10645	0.092	0.2963	No
106	COX6A1	1417417_a_at	10769	0.090	0.2913	No
107	PFKFB1	1427213_at	10817	0.088	0.2898	No
108	RPS28	1451101_a_at	10849	0.087	0.2891	No
109	ERN1	1421240_at 1431886_at 1437119_at 1438583_at 1438997_at 1450176_at	10868	0.087	0.2889	No
110	RPL37A	1416217_a_at 1460543_x_at	10882	0.087	0.2889	No
111	LEP	1422582_at	10942	0.085	0.2868	No
112	NDUFA10	1418068_at 1448934_at	11014	0.083	0.2842	No
113	RPL18A	1428152_a_at	11015	0.083	0.2848	No
114	NDUFB4	1428075_at 1428076_s_at 1432427_at	11038	0.082	0.2844	No
115	COX4I1	1448322_a_at	11216	0.078	0.2769	No
116	KIF5B	1418427_at 1418428_at 1418429_at 1418430_at 1418431_at	11559	0.069	0.2617	No
117	NDUFA4	1424085_at	11719	0.065	0.2548	No
118	PCSK2	1428305_at 1444147_at 1447991_at 1447992_s_at 1448312_at	11732	0.065	0.2548	No
119	RPL39	1423032_at 1450840_a_at	12112	0.055	0.2378	No
120	RPS20	1456373_x_at 1456436_x_at	12290	0.051	0.2300	No
121	SDHA	1426688_at 1426689_s_at 1445317_at	12388	0.049	0.2259	No
122	RPL19	1416219_at	12561	0.044	0.2184	No
123	PFKFB2	1422090_a_at 1422091_at 1422092_at 1429486_at 1431901_a_at	12946	0.034	0.2010	No
124	CPE	1415949_at	13169	0.028	0.1910	No
125	DDOST	1416493_at 1420179_at	13183	0.027	0.1906	No
126	RPLP2	1415879_a_at	13270	0.026	0.1868	No
127	RPS14	1436586_x_at	13283	0.025	0.1865	No
128	RAP1A	1424139_at	13497	0.019	0.1768	No
129	IGFBP1	1418918_at	14760	-0.023	0.1191	No
130	HSPA5	1416064_a_at 1427464_s_at 1447824_x_at	15088	-0.037	0.1043	No
131	NKX2-2	1421112_at	15147	-0.039	0.1019	No
132	RPLP1	1416277_a_at	15172	-0.040	0.1011	No
133	NDUFA2	1417368_s_at	15514	-0.055	0.0859	No
134	PRKCA	1427562_a_at 1443069_at 1445028_at 1445395_at 1446598_at 1450945_at	15821	-0.071	0.0724	No
135	FAU	1417452_a_at	15884	-0.074	0.0701	No
136	NDUFS4	1418117_at 1438166_x_at 1444464_at 1448959_at 1459760_at	15987	-0.080	0.0660	No
137	SLC2A2	1449067_at	16061	-0.085	0.0632	No
138	SSR4	1427096_s_at 1435709_at 1448524_s_at	16073	-0.085	0.0634	No
139	IGFBP5	1422313_a_at 1452114_s_at	16280	-0.098	0.0546	No
140	ATF4	1438992_x_at 1439258_at 1448135_at	16381	-0.105	0.0508	No
141	SPCS2	1423215_at 1450907_at	16858	-0.141	0.0300	No
142	RPS21	1430288_x_at 1433549_x_at 1433721_x_at 1434358_x_at	17047	-0.157	0.0225	No
143	SRP14	1418567_a_at 1418568_x_at 1454615_x_at 1455939_x_at	17142	-0.167	0.0195	No
144	RPL17	1423855_x_at 1435791_x_at 1453752_at	17511	-0.214	0.0041	No
145	PFKFB4	1456888_at	17655	-0.232	-0.0007	No
146	ETFDH	1451084_at 1458152_at	17810	-0.253	-0.0059	No
147	ATF6	1435444_at 1453288_at 1456021_at	17885	-0.263	-0.0073	No
148	NDUFAB1	1428159_s_at 1428160_at 1435934_at 1447919_x_at 1453565_at 1458678_at	18725	-0.400	-0.0429	No
149	IGFBP4	1421991_a_at 1421992_a_at 1423756_s_at 1423757_x_at 1437405_a_at 1437406_x_at	19851	-0.707	-0.0893	No
150	EXOC8	1436048_at	20259	-0.873	-0.1016	No
151	SRP54	1430476_at 1441233_at 1441480_at	20261	-0.875	-0.0951	No
152	KLK3	1450718_at 1453389_a_at	20491	-0.989	-0.0983	No
153	VAMP2	1420833_at 1420834_at	20961	-1.367	-0.1098	No
154	UQCRB	1416337_at 1455997_a_at	21131	-1.594	-0.1057	No
155	RPL5	1423665_a_at 1447460_at	21222	-1.737	-0.0970	No
156	OGDH	1445632_at 1451274_at	21795	-3.369	-0.0983	No
157	RPS17	1437510_x_at 1438501_at 1438986_x_at 1455662_x_at 1457940_at 1459986_a_at	21916	-5.231	-0.0652	No
158	RPS16	1416404_s_at 1437196_x_at 1455835_at	21936	-8.926	-0.0000	No