Details for gene set V$SRF

Table: GSEA Results Summary

Dataset	set03_truncNotch_versus_wtNotch
Phenotype	NoPhenotypeAvailable
Upregulated in class	na_pos
GeneSet	V$SRF_Q6
Enrichment Score (ES)	0.24257924
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2513599
Nominal p-value	0.06966292
FDR q-value	1.0
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	MAPKAPK2	45	4.126	0.0149	Yes
2	FLNA	73	3.845	0.0296	Yes
3	ABL1	205	3.245	0.0361	Yes
4	CSNK1E	239	3.173	0.0476	Yes
5	PPARG	433	2.809	0.0489	Yes
6	GRK6	578	2.636	0.0522	Yes
7	TADA3L	589	2.624	0.0626	Yes
8	TGFB1I1	633	2.580	0.0711	Yes
9	ARPC4	723	2.491	0.0768	Yes
10	ASPH	764	2.461	0.0849	Yes
11	MYL6	780	2.450	0.0944	Yes
12	SLC4A3	905	2.345	0.0975	Yes
13	PDLIM7	909	2.343	0.1072	Yes
14	NPPA	968	2.303	0.1137	Yes
15	BLOC1S1	1267	2.128	0.1065	Yes
16	CTDSP1	1277	2.121	0.1149	Yes
17	TITF1	1278	2.121	0.1238	Yes
18	ACAA2	1310	2.106	0.1309	Yes
19	MUS81	1397	2.071	0.1350	Yes
20	DUSP10	1415	2.060	0.1427	Yes
21	POU3F4	1447	2.043	0.1496	Yes
22	SRD5A2	1473	2.034	0.1568	Yes
23	CNN2	1513	2.020	0.1631	Yes
24	GPR158	1796	1.907	0.1558	Yes
25	ACTB	1873	1.871	0.1596	Yes
26	LRP5	1972	1.834	0.1620	Yes
27	NPM3	1976	1.831	0.1695	Yes
28	HIST1H4I	1981	1.830	0.1769	Yes
29	CX3CL1	2026	1.816	0.1822	Yes
30	MRGPRF	2067	1.800	0.1876	Yes
31	EGR1	2211	1.746	0.1871	Yes
32	LRRFIP1	2389	1.690	0.1846	Yes
33	NR2F1	2420	1.681	0.1901	Yes
34	CALD1	2423	1.681	0.1970	Yes
35	EGR3	2449	1.673	0.2027	Yes
36	CSMD3	2517	1.658	0.2060	Yes
37	ITGB1BP2	2591	1.638	0.2089	Yes
38	NAV1	2653	1.619	0.2124	Yes
39	PRELP	2706	1.602	0.2163	Yes
40	TLE3	2721	1.599	0.2223	Yes
41	LRRTM4	2875	1.554	0.2205	Yes
42	ANXA6	3105	1.496	0.2143	Yes
43	NR2F2	3482	1.401	0.1998	Yes
44	PCDH7	3497	1.399	0.2049	Yes
45	MAP1A	3556	1.386	0.2076	Yes
46	NR4A1	3620	1.372	0.2099	Yes
47	COL1A1	3776	1.333	0.2071	Yes
48	HOXC5	3861	1.315	0.2081	Yes
49	DMD	3883	1.309	0.2124	Yes
50	RIMS1	3987	1.291	0.2123	Yes
51	TAZ	4089	1.272	0.2121	Yes
52	ATP1A2	4168	1.252	0.2131	Yes
53	CKM	4214	1.244	0.2159	Yes
54	FOXE3	4238	1.238	0.2199	Yes
55	PODN	4249	1.236	0.2245	Yes
56	DVL3	4286	1.228	0.2277	Yes
57	PFN1	4384	1.203	0.2275	Yes
58	CDKN1B	4465	1.185	0.2281	Yes
59	MYLK	4541	1.166	0.2290	Yes
60	TPM2	4563	1.164	0.2327	Yes
61	SCN3B	4614	1.153	0.2348	Yes
62	EPHB1	4636	1.148	0.2385	Yes
63	PDLIM4	4710	1.134	0.2393	Yes
64	ITGA7	4738	1.127	0.2426	Yes
65	HOXB5	4898	1.098	0.2386	No
66	STAT5B	4945	1.090	0.2406	No
67	FGF8	5109	1.059	0.2362	No
68	MYO18B	5375	1.007	0.2261	No
69	HOXD13	5536	0.976	0.2215	No
70	NOL4	5650	0.957	0.2194	No
71	COL1A2	5779	0.932	0.2163	No
72	SIX2	5780	0.932	0.2203	No
73	RHOJ	5881	0.914	0.2187	No
74	SEPX1	5927	0.904	0.2200	No
75	RARB	6070	0.879	0.2160	No
76	SIPA1	6109	0.872	0.2176	No
77	TES	6129	0.867	0.2202	No
78	H2AFX	6170	0.860	0.2217	No
79	CITED2	6359	0.828	0.2149	No
80	FGFRL1	6430	0.813	0.2145	No
81	RUNDC1	6563	0.791	0.2107	No
82	SRF	6658	0.772	0.2088	No
83	PLN	6747	0.755	0.2072	No
84	EMILIN2	6894	0.728	0.2024	No
85	PRDM1	6917	0.726	0.2042	No
86	LPP	6929	0.723	0.2067	No
87	MYADM	6990	0.716	0.2064	No
88	SLC7A1	7114	0.696	0.2027	No
89	ACTG2	7160	0.687	0.2031	No
90	WNT5A	7213	0.677	0.2031	No
91	NKX2-2	7314	0.661	0.2005	No
92	RAI2	7478	0.629	0.1943	No
93	CNN1	7538	0.619	0.1937	No
94	RAP1A	7716	0.583	0.1865	No
95	JPH2	7725	0.582	0.1885	No
96	GNG8	8067	0.518	0.1722	No
97	FOS	8087	0.514	0.1733	No
98	ELAVL4	8121	0.507	0.1736	No
99	HOXA1	8231	0.487	0.1698	No
100	JUNB	8312	0.471	0.1674	No
101	MYO1E	8342	0.466	0.1678	No
102	FOSL1	8432	0.449	0.1648	No
103	TNNC1	8808	0.381	0.1461	No
104	AQP2	8856	0.372	0.1451	No
105	ACTA1	9000	0.343	0.1388	No
106	NKX6-1	9021	0.339	0.1391	No
107	NFATC4	9023	0.339	0.1405	No
108	TRDN	9065	0.329	0.1396	No
109	TAGLN	9251	0.289	0.1308	No
110	PLCB3	9357	0.267	0.1262	No
111	DIXDC1	9365	0.266	0.1270	No
112	PDLIM3	9369	0.265	0.1279	No
113	RSU1	9483	0.237	0.1228	No
114	NPAS2	9550	0.222	0.1201	No
115	HOXD10	9760	0.177	0.1095	No
116	HOXA5	9852	0.157	0.1053	No
117	MSX1	9947	0.138	0.1007	No
118	KCNMB1	10055	0.118	0.0954	No
119	RASD2	10280	0.070	0.0836	No
120	LDHA	10361	0.050	0.0794	No
121	LSP1	10362	0.050	0.0796	No
122	KCNA1	10385	0.045	0.0786	No
123	MYH11	10478	0.024	0.0737	No
124	GADD45G	11047	-0.104	0.0433	No
125	FST	11104	-0.114	0.0408	No
126	IL17B	11163	-0.132	0.0382	No
127	KCNK3	11349	-0.171	0.0289	No
128	SP7	11367	-0.176	0.0287	No
129	MYL9	11394	-0.183	0.0280	No
130	MAP2K6	11466	-0.203	0.0250	No
131	EGR2	11526	-0.214	0.0227	No
132	TRIM46	11715	-0.254	0.0136	No
133	NPR3	11744	-0.262	0.0132	No
134	CORO1C	11788	-0.273	0.0120	No
135	INSM1	11988	-0.322	0.0026	No
136	MYL1	12236	-0.379	-0.0093	No
137	TNMD	12274	-0.388	-0.0096	No
138	DUSP2	12418	-0.425	-0.0156	No
139	CABP1	12480	-0.442	-0.0171	No
140	FOXP1	12643	-0.483	-0.0238	No
141	EFHD1	12748	-0.508	-0.0273	No
142	VCL	13115	-0.607	-0.0447	No
143	KIF1B	13122	-0.610	-0.0424	No
144	ADAMTS12	13218	-0.632	-0.0449	No
145	FOSB	13389	-0.687	-0.0513	No
146	THBS1	13426	-0.697	-0.0503	No
147	RAB27A	13698	-0.780	-0.0617	No
148	STARD13	13801	-0.811	-0.0639	No
149	PRKAB2	13834	-0.818	-0.0622	No
150	IGF1	13921	-0.840	-0.0633	No
151	BDNF	14026	-0.876	-0.0653	No
152	DGKG	14124	-0.910	-0.0667	No
153	ACTR3	14404	-0.999	-0.0777	No
154	FOXP2	14497	-1.024	-0.0784	No
155	CFL1	14556	-1.041	-0.0771	No
156	RASSF2	14558	-1.042	-0.0728	No
157	SLC25A4	14588	-1.055	-0.0700	No
158	HOXA3	14738	-1.112	-0.0734	No
159	KRTCAP2	14929	-1.178	-0.0787	No
160	FOXP3	14998	-1.207	-0.0774	No
161	PPAP2B	15021	-1.214	-0.0735	No
162	PHF12	15154	-1.268	-0.0753	No
163	EML4	15341	-1.339	-0.0798	No
164	GPR20	15377	-1.352	-0.0760	No
165	DHH	15505	-1.407	-0.0770	No
166	SDPR	15543	-1.419	-0.0730	No
167	HIVEP3	15590	-1.443	-0.0695	No
168	PICALM	15769	-1.519	-0.0728	No
169	ATF4	15863	-1.564	-0.0712	No
170	NNAT	16088	-1.666	-0.0764	No
171	RERE	16099	-1.672	-0.0699	No
172	ABR	16424	-1.822	-0.0799	No
173	H3F3A	16494	-1.854	-0.0758	No
174	RRM1	16502	-1.857	-0.0684	No
175	MYL7	16619	-1.921	-0.0666	No
176	CACNA1B	16685	-1.951	-0.0620	No
177	MATR3	16687	-1.952	-0.0538	No
178	CFL2	16783	-2.009	-0.0506	No
179	PPP1R12A	17014	-2.128	-0.0541	No
180	UBE2D3	17090	-2.167	-0.0491	No
181	SYNCRIP	17454	-2.383	-0.0588	No
182	PADI2	17545	-2.437	-0.0534	No
183	SCOC	17786	-2.594	-0.0556	No
184	MBNL1	17818	-2.617	-0.0463	No
185	RBBP7	17920	-2.697	-0.0404	No
186	SVIL	18029	-2.790	-0.0346	No
187	SIN3A	18050	-2.813	-0.0238	No
188	TPM3	18287	-3.115	-0.0236	No
189	CNTF	18293	-3.120	-0.0108	No
190	ROCK2	18399	-3.300	-0.0026	No
191	HOXB4	18436	-3.412	0.0098	No