Details for gene set UVC_XPCS_ALL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_03_absentNotch_versus_truncNotch.phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls #absentNotch_versus_truncNotch.phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls #absentNotch_versus_truncNotch_repos
Phenotype	phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls#absentNotch_versus_truncNotch_repos
Upregulated in class	absentNotch
GeneSet	UVC_XPCS_ALL_DN
Enrichment Score (ES)	0.58674973
Normalized Enrichment Score (NES)	1.8719485
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.0082263
FWER p-Value	0.019

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PTK2	1780148	1	6.937	0.0274	Yes
2	PRKACB	4210170	9	6.062	0.0509	Yes
3	APPBP2	5130215	13	5.776	0.0736	Yes
4	PRMT3	1660609	15	5.671	0.0959	Yes
5	DHX15	870632	44	4.807	0.1134	Yes
6	UBE2G1	2230546 5420528 7040463	80	4.350	0.1286	Yes
7	SRPK2	6380341	87	4.282	0.1452	Yes
8	MAP2K4	5130133	175	3.735	0.1552	Yes
9	TLK1	7100605	183	3.696	0.1694	Yes
10	EIF4G3	670707	185	3.687	0.1840	Yes
11	KLF7	50390	189	3.660	0.1982	Yes
12	MTAP	2120136	277	3.321	0.2066	Yes
13	FCHSD2	5720092	293	3.256	0.2186	Yes
14	PIK3C3	6590717	386	2.975	0.2254	Yes
15	RB1	5900338	411	2.912	0.2356	Yes
16	SLC4A7	2370056	447	2.822	0.2448	Yes
17	PARG	50139	458	2.797	0.2553	Yes
18	CUTL1	1570113 1770091 1850273 2100286 5340605	469	2.771	0.2657	Yes
19	GSK3B	5360348	510	2.696	0.2741	Yes
20	CREBBP	5690035 7040050	535	2.625	0.2832	Yes
21	PAIP1	3870576	563	2.557	0.2918	Yes
22	HNRPDL	1050102 1090181 5360471	603	2.480	0.2995	Yes
23	UBL3	6450458	624	2.441	0.3080	Yes
24	NCOA1	3610438	637	2.418	0.3169	Yes
25	RBM39	4230458 6450280	675	2.355	0.3242	Yes
26	RAB6IP1	4150044	701	2.320	0.3320	Yes
27	TBL1X	6400524	726	2.280	0.3397	Yes
28	ZNF292	840736 1500390	734	2.263	0.3483	Yes
29	SFRS3	770315 4230593	747	2.240	0.3565	Yes
30	ORC5L	1940133 1940711	754	2.234	0.3650	Yes
31	UGCG	3420053	755	2.234	0.3738	Yes
32	UBE2D2	4590671 6510446	761	2.229	0.3823	Yes
33	PPP2R5E	70671 2120056	776	2.202	0.3902	Yes
34	RASA1	1240315	794	2.176	0.3979	Yes
35	EIF2C2	770451	880	2.077	0.4015	Yes
36	RAD51C	3780592	902	2.044	0.4084	Yes
37	TLK2	1170161	908	2.029	0.4161	Yes
38	MAN2A1	6650176	942	1.980	0.4221	Yes
39	UPF2	4810471	985	1.906	0.4274	Yes
40	RUNX1	3840711	1043	1.837	0.4315	Yes
41	TLE1	540390 1580309 3710019	1108	1.770	0.4350	Yes
42	IBTK	780242	1119	1.759	0.4414	Yes
43	TRIP12	130154 5080288 5720446	1150	1.728	0.4466	Yes
44	APRIN	2810050	1162	1.712	0.4528	Yes
45	TOP2A	360717	1165	1.703	0.4594	Yes
46	ARIH1	6900025	1168	1.698	0.4660	Yes
47	CHD1	4590048	1176	1.692	0.4723	Yes
48	CENTG2	4210053	1236	1.626	0.4755	Yes
49	CUL1	1990632	1241	1.620	0.4816	Yes
50	TCF12	3610324 7000156	1276	1.578	0.4860	Yes
51	SMC5	3440164	1292	1.561	0.4914	Yes
52	TIAM1	5420288	1420	1.424	0.4900	Yes
53	ATR	6860273	1459	1.381	0.4934	Yes
54	ZNF638	6510112	1474	1.369	0.4981	Yes
55	DNAJC13	4730091	1520	1.317	0.5008	Yes
56	OGT	2360131 4610333	1542	1.298	0.5048	Yes
57	PJA2	430537	1544	1.296	0.5098	Yes
58	MBNL1	2640762 7100048	1576	1.263	0.5131	Yes
59	RYK	1500338 1770072	1640	1.208	0.5145	Yes
60	NT5C2	4280735 4670528	1707	1.148	0.5154	Yes
61	MARK3	2370450	1711	1.145	0.5197	Yes
62	THBS2	2850136	1717	1.140	0.5240	Yes
63	ITSN2	780484	1720	1.139	0.5284	Yes
64	STAU2	2810411	1746	1.117	0.5314	Yes
65	PCNT	4760053	1760	1.102	0.5351	Yes
66	PRIM2A	7000692	1791	1.081	0.5377	Yes
67	MECP2	1940450	1803	1.075	0.5413	Yes
68	REV3L	1090717	1823	1.065	0.5445	Yes
69	NVL	2690687 6900735	1835	1.057	0.5481	Yes
70	SEC24B	460717 3060040	1885	1.021	0.5494	Yes
71	ANKMY2	780600 2230440	1917	1.001	0.5517	Yes
72	SLC25A13	4920072 5690722	2050	0.939	0.5482	Yes
73	OPA1	2030433 3520390 4730537	2055	0.937	0.5516	Yes
74	RPS6KA3	1980707	2130	0.889	0.5511	Yes
75	BHLHB2	7040603	2152	0.878	0.5534	Yes
76	CLASP1	6860279	2182	0.859	0.5552	Yes
77	PTEN	3390064	2217	0.838	0.5567	Yes
78	KPNA3	7040088	2227	0.834	0.5595	Yes
79	NCOA3	4540195	2284	0.802	0.5596	Yes
80	PCCA	3390400	2332	0.773	0.5601	Yes
81	PEX3	2760100	2342	0.769	0.5626	Yes
82	WDR7	670279 1090121	2349	0.765	0.5653	Yes
83	DYRK1A	3190181	2353	0.763	0.5682	Yes
84	RNGTT	780152 780746 1090471	2390	0.749	0.5691	Yes
85	PPP1R12A	4070066 4590162	2393	0.748	0.5720	Yes
86	CNOT4	2320242 6760706	2440	0.713	0.5723	Yes
87	MAP2K1	840739	2487	0.683	0.5725	Yes
88	GMPS	460670	2523	0.663	0.5732	Yes
89	TRIM33	580619 2230280 3990433 6200747	2532	0.659	0.5753	Yes
90	ADCY9	5690168	2539	0.656	0.5776	Yes
91	SOS2	2060722	2589	0.639	0.5775	Yes
92	SMURF2	1940161	2624	0.622	0.5780	Yes
93	ADARB1	780451	2632	0.617	0.5801	Yes
94	PPM1B	380180 450154 3610215	2652	0.611	0.5815	Yes
95	ANKRD17	2120402 3850035 6400044	2741	0.565	0.5789	Yes
96	MPHOSPH1	4610427	2817	0.532	0.5769	Yes
97	THRAP2	4920600	2843	0.524	0.5776	Yes
98	IFRD1	4590215	2856	0.519	0.5790	Yes
99	MYO9B	1230435 3060358	2874	0.510	0.5801	Yes
100	MSH2	6180273	2927	0.488	0.5792	Yes
101	FUT8	1340068 2340056	2982	0.470	0.5780	Yes
102	ZNF148	6420403	3012	0.459	0.5783	Yes
103	STRN3	1450093 6200685	3021	0.454	0.5796	Yes
104	ATP11B	4230100	3022	0.454	0.5814	Yes
105	ARFGEF1	6760494	3031	0.452	0.5828	Yes
106	CTBP2	430309 3710079	3047	0.445	0.5837	Yes
107	NEDD4	460736 1190280	3060	0.438	0.5848	Yes
108	MELK	130022 5220537	3082	0.430	0.5853	Yes
109	PDE8A	5080446	3088	0.429	0.5867	Yes
110	MARCH7	3800020 6620168	3224	0.383	0.5809	No
111	ATF2	2260348 2480441	3226	0.383	0.5823	No
112	PAWR	5130546 6330706	3260	0.372	0.5820	No
113	NRIP1	3190039	3269	0.369	0.5830	No
114	MYC	380541 4670170	3372	0.337	0.5788	No
115	BMPR1A	2190193 4060603	3376	0.335	0.5799	No
116	CREB1	1500717 2230358 3610600 6550601	3414	0.323	0.5792	No
117	MALT1	4670292	3450	0.311	0.5785	No
118	PICALM	1940280	3454	0.310	0.5796	No
119	USP12	6130735 6620280	3458	0.309	0.5806	No
120	STK3	7100427	3462	0.306	0.5817	No
121	KIF5C	6370717	3473	0.304	0.5823	No
122	R3HDM1	940685 3290161	3485	0.299	0.5829	No
123	ROCK2	1780035 5720025	3498	0.295	0.5834	No
124	LASS6	5890576 6520138	3507	0.294	0.5841	No
125	CASK	2340215 3290576 6770215	3581	0.271	0.5812	No
126	EIF4E	1580403 70133 6380215	3604	0.264	0.5810	No
127	BARD1	3170348	3612	0.261	0.5817	No
128	FNDC3A	2690097 3290044	3635	0.255	0.5815	No
129	ZFYVE9	6980288 7100017	3637	0.254	0.5824	No
130	TCF7L2	2190348 5220113	3667	0.248	0.5818	No
131	RANBP2	4280338	3686	0.242	0.5818	No
132	RGS20	4540541 4730086	3690	0.242	0.5826	No
133	ORC2L	1990470 6510019	3731	0.231	0.5813	No
134	STK39	50692	3853	0.207	0.5755	No
135	NUMB	2450735 3800253 6350040	3951	0.187	0.5709	No
136	ATRN	870735 3360390	4148	0.154	0.5608	No
137	MYO10	3830576 5570092	4154	0.153	0.5612	No
138	SLC7A1	2450193 2710241	4280	0.137	0.5549	No
139	PIP5K3	5360112	4307	0.134	0.5540	No
140	THRAP1	2470121	4332	0.131	0.5532	No
141	STARD13	540722	4364	0.128	0.5520	No
142	NUP133	2360168 4760017	4365	0.127	0.5525	No
143	ACVR1	6840671	4475	0.115	0.5470	No
144	PTPRK	1450433 2640142	4579	0.106	0.5418	No
145	TOPBP1	6020333	4595	0.105	0.5413	No
146	STAM	3850008 4760441	4604	0.104	0.5413	No
147	DAPK1	5570010	4744	0.093	0.5341	No
148	KLF6	110541 5360026	4763	0.092	0.5335	No
149	FYN	2100468 4760520 4850687	4785	0.091	0.5327	No
150	PTPN12	2030309 6020725 6130746 6290609	4851	0.085	0.5294	No
151	RCOR1	5360717	4910	0.082	0.5266	No
152	IL6	380133	4953	0.080	0.5246	No
153	STK24	6760484	4959	0.079	0.5247	No
154	BLM	520619 5570170	5035	0.075	0.5208	No
155	ACSL3	3140195	5101	0.072	0.5176	No
156	IRAK1BP1	610037	5211	0.066	0.5119	No
157	SEMA3C	7000020	5225	0.066	0.5114	No
158	GNAI1	4560390	5227	0.065	0.5116	No
159	PIK3C2A	6040593	5231	0.065	0.5117	No
160	SEC14L1	2120551 3610537	5232	0.065	0.5120	No
161	RAD23B	2190671	5234	0.065	0.5122	No
162	LARS2	7000706	5253	0.065	0.5114	No
163	MYST4	1400563 2570687 3360458 6840402	5336	0.061	0.5072	No
164	F3	2940180	5476	0.056	0.4998	No
165	BICD1	110128 2940324	5568	0.053	0.4950	No
166	CDC42BPA	840671	5661	0.050	0.4902	No
167	AKAP9	510184 2060195 2470136 4280048	5709	0.048	0.4878	No
168	IGF1R	3360494	5719	0.048	0.4875	No
169	ZCCHC11	3390731 5360039	5726	0.048	0.4874	No
170	PARD3	3390324 5390541	5744	0.047	0.4866	No
171	OSBPL8	50603	5750	0.047	0.4865	No
172	GOLGA4	460300	5816	0.045	0.4832	No
173	PKD2	4670390	5907	0.042	0.4784	No
174	TGFBR3	5290577	5923	0.042	0.4777	No
175	TSPAN5	6770019	5950	0.041	0.4765	No
176	FGF5	5270204	5954	0.041	0.4765	No
177	ARHGAP12	1050181	6060	0.038	0.4709	No
178	TGFB2	4920292	6193	0.034	0.4638	No
179	DPYD	6110095	6313	0.031	0.4574	No
180	TRIM37	5270091	6519	0.026	0.4463	No
181	SCHIP1	4560152	6555	0.026	0.4445	No
182	TIPARP	50397	6561	0.026	0.4443	No
183	CENPF	5050088	6564	0.026	0.4443	No
184	PLCE1	4780685	6603	0.025	0.4423	No
185	EHBP1	430348	6630	0.024	0.4410	No
186	RAB6A	3840463 4780731	6666	0.023	0.4392	No
187	USP13	1450670	6819	0.020	0.4309	No
188	VEGFC	5910494	6922	0.018	0.4254	No
189	CLASP2	2510139	6949	0.018	0.4241	No
190	GLRB	2510433 4280736	6999	0.017	0.4215	No
191	E2F5	5860575	7163	0.014	0.4126	No
192	AUH	5570152	7200	0.013	0.4107	No
193	USP15	610592 3520504	7236	0.012	0.4088	No
194	TLE4	1450064 1500519	7323	0.010	0.4041	No
195	ADAM10	3780156	7346	0.010	0.4030	No
196	PLCB4	50576	7369	0.010	0.4018	No
197	ARHGEF7	1690441	7397	0.009	0.4004	No
198	XPO1	540707	7492	0.008	0.3953	No
199	PVRL3	1400324 4200593 6650128	7610	0.005	0.3889	No
200	PLEKHC1	2650066	7620	0.005	0.3884	No
201	PUM2	4200441 5910446	7693	0.004	0.3845	No
202	EPS15	4200215	7770	0.003	0.3803	No
203	PCTK2	5700673	7791	0.002	0.3792	No
204	KLF10	4850056	7935	0.000	0.3714	No
205	KIF11	5390139	7948	-0.000	0.3708	No
206	STAG1	1190300 1400722 4590100	7962	-0.000	0.3701	No
207	HOMER1	360131 1690092 1990300 4590068	7976	-0.000	0.3693	No
208	SLIT2	1940037	7987	-0.001	0.3688	No
209	SHB	4920494	7988	-0.001	0.3688	No
210	NR2F2	3170609 3310577	8001	-0.001	0.3681	No
211	NEK7	4540026	8012	-0.001	0.3676	No
212	NUP153	7000452	8186	-0.004	0.3582	No
213	SAMD4A	1170717	8358	-0.007	0.3488	No
214	RPGR	5910711	8406	-0.008	0.3463	No
215	SATB2	2470181	8760	-0.014	0.3270	No
216	EPS8	7050204	8779	-0.014	0.3261	No
217	PTX3	870309 3520102	8794	-0.014	0.3254	No
218	LYN	6040600	8816	-0.015	0.3243	No
219	FBXW11	6450632	8838	-0.015	0.3232	No
220	GBE1	2190368	9010	-0.018	0.3139	No
221	CTGF	4540577	9137	-0.020	0.3071	No
222	NFYC	1400746	9183	-0.021	0.3047	No
223	ITSN1	2640577	9240	-0.022	0.3017	No
224	RGS7	3390044	9297	-0.023	0.2988	No
225	NMT2	6900148	9473	-0.026	0.2893	No
226	SRGAP2	1050092 1230403 3830066 6130215	9714	-0.031	0.2763	No
227	TAF4	1450170	9716	-0.031	0.2763	No
228	WDR37	2630519 6840347	9760	-0.032	0.2741	No
229	PTPN2	130315	10057	-0.038	0.2581	No
230	NRG1	1050332	10091	-0.039	0.2564	No
231	TRIM2	430546 1170286	10102	-0.039	0.2560	No
232	MYO1B	770372	10173	-0.041	0.2524	No
233	RNF13	2370021	10237	-0.042	0.2491	No
234	CRADD	6770520	10549	-0.049	0.2322	No
235	CENPE	2850022	10578	-0.049	0.2309	No
236	FBXL7	6620711	10661	-0.051	0.2266	No
237	TDRD7	6550520	10721	-0.053	0.2236	No
238	TERF1	2340113	10806	-0.055	0.2192	No
239	CENPC1	610273	11074	-0.061	0.2049	No
240	MTX2	6660288	11093	-0.061	0.2041	No
241	LRPPRC	2370072 2470408	11152	-0.063	0.2012	No
242	CNOT2	520546 2060397 4610543 5550113	11210	-0.064	0.1983	No
243	NPEPPS	2630731	11303	-0.068	0.1936	No
244	GNAQ	430670 4210131 5900736	11427	-0.072	0.1871	No
245	PRKCI	5420139	11438	-0.072	0.1868	No
246	KIAA0427	1690435	11542	-0.075	0.1815	No
247	PHLPP	3440563	11629	-0.078	0.1771	No
248	CENTD1	2570592	11719	-0.081	0.1726	No
249	RAGE	730102 2120706 7050315	11770	-0.083	0.1701	No
250	DDX10	520746	11849	-0.086	0.1662	No
251	MID1	4070114 4760458	11900	-0.089	0.1638	No
252	NFIB	460450	11926	-0.089	0.1628	No
253	FARS2	5340575	11952	-0.091	0.1618	No
254	WASF3	5130017	11967	-0.091	0.1614	No
255	CREB3L2	3390484	12017	-0.093	0.1591	No
256	NBN	730538 2470619 4780594	12073	-0.095	0.1565	No
257	SOS1	7050338	12089	-0.096	0.1560	No
258	TRAM2	3940112	12119	-0.098	0.1548	No
259	PHF21A	610014	12153	-0.099	0.1534	No
260	NCK1	6200575 6510050	12187	-0.100	0.1520	No
261	BCAR3	1660717	12228	-0.102	0.1502	No
262	PARN	3840129	12284	-0.106	0.1476	No
263	EPHA4	460750	12418	-0.113	0.1408	No
264	PKP4	3710400 5890097	12495	-0.117	0.1371	No
265	ATRX	2340039 3610132 4210373	12507	-0.118	0.1370	No
266	KIF2A	3990286 6130575	12527	-0.119	0.1364	No
267	CXCL12	580546 4150750 4570068	12660	-0.127	0.1297	No
268	USP9X	130435 2370735 3120338	12681	-0.128	0.1291	No
269	DNMBP	2810368 6900403	12757	-0.134	0.1255	No
270	CYR61	1240408 5290026 4120452 6550008	12825	-0.138	0.1224	No
271	TUBGCP3	4920563	12924	-0.145	0.1176	No
272	IL1RAP	50546 450711 1580397 3940301 5890181 6370373	13116	-0.159	0.1078	No
273	CD2AP	1940369	13118	-0.159	0.1083	No
274	PMM2	670673 2570044 2690093 4540068 6450056	13174	-0.164	0.1060	No
275	ZZZ3	780133 2320239 2640452 5080706 6550341	13217	-0.167	0.1043	No
276	WNT5A	840685 3120152	13276	-0.171	0.1018	No
277	ABCE1	4280050	13628	-0.209	0.0835	No
278	PAFAH1B1	4230333 6420121 6450066	13670	-0.213	0.0821	No
279	CENPA	5080154	13738	-0.221	0.0793	No
280	DOCK4	5910102	13805	-0.229	0.0765	No
281	PBX3	1300424 3710577 6180575	13878	-0.236	0.0735	No
282	PPP2R5C	3310121 6650672	13892	-0.238	0.0738	No
283	SPEN	2060041	13919	-0.241	0.0733	No
284	HIVEP1	3850632	13957	-0.246	0.0723	No
285	MDN1	60671 770091	14022	-0.254	0.0698	No
286	GRK5	1940348 4670053	14083	-0.262	0.0675	No
287	RRAS2	6290170	14142	-0.272	0.0654	No
288	CUL2	4200278	14153	-0.274	0.0659	No
289	SERPINE1	4210403	14220	-0.285	0.0635	No
290	CDH2	520435 2450451 2760025 6650477	14221	-0.285	0.0646	No
291	RB1CC1	510494 7100072	14304	-0.298	0.0613	No
292	XRCC4	1690685 6660427	14349	-0.306	0.0601	No
293	EXT1	4540603	14352	-0.307	0.0612	No
294	HOXB2	6450592	14396	-0.314	0.0601	No
295	FGF2	3450433	14449	-0.323	0.0585	No
296	ATP2C1	2630446 6520253	14495	-0.331	0.0573	No
297	MICAL3	6040333	14510	-0.333	0.0579	No
298	MKLN1	70504 1850129	14535	-0.338	0.0579	No
299	SOCS5	3830398 7100093	14544	-0.339	0.0588	No
300	EGFR	4920138 6480521	14611	-0.351	0.0566	No
301	INPP5F	60010 5360164	14737	-0.377	0.0512	No
302	GTF2F2	2690546	14740	-0.378	0.0526	No
303	IL7R	2060088 6380500	14762	-0.383	0.0530	No
304	MGLL	2030446 4210520	14784	-0.389	0.0534	No
305	CBLB	3520465 4670348	14787	-0.390	0.0548	No
306	CDYL	4200142 4730397 6060400	14892	-0.411	0.0507	No
307	ANKS1A	50148	14906	-0.415	0.0517	No
308	SSBP2	2260725 2900400 4730711	14986	-0.435	0.0491	No
309	MTF2	50333	15006	-0.438	0.0497	No
310	SWAP70	2810577 2850739 5130594	15100	-0.466	0.0465	No
311	TJP2	3870397 5570324	15139	-0.477	0.0463	No
312	DLC1	1090632 6450594	15250	-0.516	0.0423	No
313	DOCK9	5080037	15282	-0.527	0.0427	No
314	CDK8	1050113 1190601 1780358 6110102	15335	-0.544	0.0420	No
315	CDS2	1570520	15349	-0.549	0.0435	No
316	NFKB1	5420358	15387	-0.564	0.0437	No
317	ZHX2	2900452	15396	-0.567	0.0455	No
318	ZHX3	460615	15422	-0.576	0.0464	No
319	PKN2	940746 2350168	15423	-0.577	0.0487	No
320	CLOCK	1410070 2940292 3390075	15435	-0.581	0.0504	No
321	HIRA	4480609 5270167	15491	-0.601	0.0497	No
322	DLG1	2630091 6020286	15497	-0.602	0.0518	No
323	AKAP10	2630504 5910577	15499	-0.603	0.0541	No
324	SEPT9	1940040	15602	-0.643	0.0511	No
325	CRIM1	130491	15709	-0.690	0.0480	No
326	PRKCA	6400551	15989	-0.839	0.0361	No
327	BTRC	3170131	16231	-0.978	0.0268	No
328	PCMT1	4590338 4590541	16310	-1.019	0.0265	No
329	NUP98	2850465	16455	-1.097	0.0230	No
330	RBM16	6290286 6400181	16548	-1.162	0.0225	No
331	USP24	870672 4560100	16568	-1.172	0.0261	No
332	SON	3120148 5860239 7040403	16751	-1.303	0.0213	No
333	XPO6	3940019	16789	-1.328	0.0245	No
334	ZMYND11	630181 2570019 4850138 5360040	16891	-1.433	0.0246	No
335	ATXN2	3940017 4810242	16954	-1.473	0.0271	No
336	MTMR3	1050014 4920180	16991	-1.493	0.0310	No
337	MYST3	5270500	17220	-1.648	0.0250	No
338	SMAD3	6450671	17349	-1.764	0.0250	No
339	LHFPL2	450020	17492	-1.894	0.0247	No
340	SLC25A12	7400731	17566	-1.964	0.0285	No
341	ARHGEF10	3120593 6900673	17604	-2.008	0.0344	No
342	PRR3	3440112	18069	-2.642	0.0194	No
343	IGF2BP3	2810161 4230338	18072	-2.645	0.0298	No