Details for gene set UVC_TTD_ALL

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_03_absentNotch_versus_truncNotch.phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls #absentNotch_versus_truncNotch.phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls #absentNotch_versus_truncNotch_repos
Phenotype	phenotype_absentNotch_versus_truncNotch.cls#absentNotch_versus_truncNotch_repos
Upregulated in class	absentNotch
GeneSet	UVC_TTD_ALL_DN
Enrichment Score (ES)	0.5996546
Normalized Enrichment Score (NES)	1.8680738
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.00493578
FWER p-Value	0.019

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PTK2	1780148	1	6.937	0.0349	Yes
2	PRKACB	4210170	9	6.062	0.0651	Yes
3	MAPK6	6760520	38	4.847	0.0880	Yes
4	DHX15	870632	44	4.807	0.1120	Yes
5	SPOP	450035	60	4.589	0.1343	Yes
6	FUBP1	5390373	71	4.465	0.1563	Yes
7	SRPK2	6380341	87	4.282	0.1771	Yes
8	ABI1	2850152	162	3.784	0.1922	Yes
9	MAP2K4	5130133	175	3.735	0.2103	Yes
10	TLK1	7100605	183	3.696	0.2286	Yes
11	EIF4G3	670707	185	3.687	0.2471	Yes
12	KLF7	50390	189	3.660	0.2654	Yes
13	MNAT1	730292 2350364	243	3.445	0.2799	Yes
14	FCHSD2	5720092	293	3.256	0.2937	Yes
15	SLC4A7	2370056	447	2.822	0.2996	Yes
16	PARG	50139	458	2.797	0.3131	Yes
17	CUTL1	1570113 1770091 1850273 2100286 5340605	469	2.771	0.3266	Yes
18	GSK3B	5360348	510	2.696	0.3380	Yes
19	CREBBP	5690035 7040050	535	2.625	0.3499	Yes
20	HNRPDL	1050102 1090181 5360471	603	2.480	0.3588	Yes
21	UBL3	6450458	624	2.441	0.3700	Yes
22	NCOA1	3610438	637	2.418	0.3815	Yes
23	KIF23	5570112	668	2.363	0.3918	Yes
24	RBM39	4230458 6450280	675	2.355	0.4034	Yes
25	SIPA1L1	50292	709	2.305	0.4132	Yes
26	TBL1X	6400524	726	2.280	0.4238	Yes
27	ZNF292	840736 1500390	734	2.263	0.4348	Yes
28	ORC5L	1940133 1940711	754	2.234	0.4451	Yes
29	UGCG	3420053	755	2.234	0.4563	Yes
30	PPP2R5E	70671 2120056	776	2.202	0.4664	Yes
31	TLK2	1170161	908	2.029	0.4695	Yes
32	UPF2	4810471	985	1.906	0.4749	Yes
33	RUNX1	3840711	1043	1.837	0.4811	Yes
34	ENC1	4810348	1054	1.828	0.4898	Yes
35	TLE1	540390 1580309 3710019	1108	1.770	0.4958	Yes
36	MPP6	6020148	1145	1.734	0.5026	Yes
37	ARIH1	6900025	1168	1.698	0.5099	Yes
38	CHD1	4590048	1176	1.692	0.5181	Yes
39	CENTG2	4210053	1236	1.626	0.5231	Yes
40	TCF12	3610324 7000156	1276	1.578	0.5289	Yes
41	WDHD1	3450390	1289	1.563	0.5361	Yes
42	ZNF638	6510112	1474	1.369	0.5330	Yes
43	OGT	2360131 4610333	1542	1.298	0.5359	Yes
44	MBNL1	2640762 7100048	1576	1.263	0.5405	Yes
45	ITSN2	780484	1720	1.139	0.5384	Yes
46	PRIM2A	7000692	1791	1.081	0.5401	Yes
47	EVI5	6380040	1809	1.070	0.5446	Yes
48	REV3L	1090717	1823	1.065	0.5492	Yes
49	SEC24B	460717 3060040	1885	1.021	0.5510	Yes
50	ATBF1	1240131 7040465	1899	1.013	0.5554	Yes
51	SLC25A13	4920072 5690722	2050	0.939	0.5520	Yes
52	SOCS6	1170347 7100280	2052	0.938	0.5567	Yes
53	CASP8	4850154	2097	0.907	0.5589	Yes
54	BHLHB2	7040603	2152	0.878	0.5604	Yes
55	CLASP1	6860279	2182	0.859	0.5631	Yes
56	NCOA3	4540195	2284	0.802	0.5616	Yes
57	WDR7	670279 1090121	2349	0.765	0.5620	Yes
58	DYRK1A	3190181	2353	0.763	0.5657	Yes
59	LRIG1	1050136	2385	0.750	0.5678	Yes
60	RNGTT	780152 780746 1090471	2390	0.749	0.5714	Yes
61	PPP1R12A	4070066 4590162	2393	0.748	0.5750	Yes
62	CNOT4	2320242 6760706	2440	0.713	0.5761	Yes
63	TDRD3	540292	2444	0.710	0.5795	Yes
64	SLC25A24	5360017 5860484	2499	0.676	0.5800	Yes
65	LRP6	5130064	2504	0.674	0.5832	Yes
66	TRIM33	580619 2230280 3990433 6200747	2532	0.659	0.5850	Yes
67	SMURF2	1940161	2624	0.622	0.5832	Yes
68	MSH3	6770575	2648	0.612	0.5850	Yes
69	MAP4K5	3190286 4760300 5270070 5550494	2686	0.591	0.5860	Yes
70	ANKRD17	2120402 3850035 6400044	2741	0.565	0.5859	Yes
71	MPHOSPH1	4610427	2817	0.532	0.5845	Yes
72	THRAP2	4920600	2843	0.524	0.5858	Yes
73	IFRD1	4590215	2856	0.519	0.5878	Yes
74	FLNB	2510575	2861	0.516	0.5901	Yes
75	MAST2	6200348	2905	0.496	0.5903	Yes
76	AQR	3800139	2920	0.492	0.5920	Yes
77	AMPH	2260338 3140576	2947	0.480	0.5930	Yes
78	FUT8	1340068 2340056	2982	0.470	0.5935	Yes
79	ZNF148	6420403	3012	0.459	0.5943	Yes
80	STRN3	1450093 6200685	3021	0.454	0.5961	Yes
81	ARFGEF1	6760494	3031	0.452	0.5979	Yes
82	CTBP2	430309 3710079	3047	0.445	0.5993	Yes
83	MELK	130022 5220537	3082	0.430	0.5997	Yes
84	MARCH7	3800020 6620168	3224	0.383	0.5939	No
85	ATF2	2260348 2480441	3226	0.383	0.5958	No
86	MAD1L1	5700035	3238	0.379	0.5971	No
87	NRIP1	3190039	3269	0.369	0.5973	No
88	E2F3	50162 460180	3320	0.350	0.5964	No
89	MYC	380541 4670170	3372	0.337	0.5953	No
90	STK3	7100427	3462	0.306	0.5920	No
91	ZRF1	6020181 6510484	3489	0.297	0.5921	No
92	ROCK2	1780035 5720025	3498	0.295	0.5931	No
93	LASS6	5890576 6520138	3507	0.294	0.5942	No
94	CASK	2340215 3290576 6770215	3581	0.271	0.5916	No
95	EIF4E	1580403 70133 6380215	3604	0.264	0.5917	No
96	BARD1	3170348	3612	0.261	0.5926	No
97	DOK5	770113 3450156	3613	0.261	0.5939	No
98	FNDC3A	2690097 3290044	3635	0.255	0.5941	No
99	ZFYVE9	6980288 7100017	3637	0.254	0.5953	No
100	TCF7L2	2190348 5220113	3667	0.248	0.5950	No
101	RGS20	4540541 4730086	3690	0.242	0.5950	No
102	ORC2L	1990470 6510019	3731	0.231	0.5940	No
103	STK39	50692	3853	0.207	0.5884	No
104	SPAG9	580497 2510180 4210685	4123	0.157	0.5746	No
105	MYO10	3830576 5570092	4154	0.153	0.5737	No
106	DUSP1	6860121	4217	0.144	0.5711	No
107	PIP5K3	5360112	4307	0.134	0.5669	No
108	THRAP1	2470121	4332	0.131	0.5662	No
109	STARD13	540722	4364	0.128	0.5652	No
110	UST	2100053	4442	0.119	0.5616	No
111	ACVR1	6840671	4475	0.115	0.5604	No
112	PTPRK	1450433 2640142	4579	0.106	0.5554	No
113	TOPBP1	6020333	4595	0.105	0.5551	No
114	JMJD2C	3290341	4660	0.099	0.5521	No
115	DAPK1	5570010	4744	0.093	0.5480	No
116	SERPINB2	70487	4749	0.093	0.5483	No
117	FYN	2100468 4760520 4850687	4785	0.091	0.5468	No
118	PTPN12	2030309 6020725 6130746 6290609	4851	0.085	0.5437	No
119	BLM	520619 5570170	5035	0.075	0.5341	No
120	IRAK1BP1	610037	5211	0.066	0.5249	No
121	SEMA3C	7000020	5225	0.066	0.5246	No
122	GNAI1	4560390	5227	0.065	0.5248	No
123	LARS2	7000706	5253	0.065	0.5238	No
124	MYST4	1400563 2570687 3360458 6840402	5336	0.061	0.5196	No
125	F3	2940180	5476	0.056	0.5123	No
126	COL5A2	780040	5516	0.054	0.5105	No
127	BICD1	110128 2940324	5568	0.053	0.5080	No
128	CDC42BPA	840671	5661	0.050	0.5032	No
129	ZCCHC11	3390731 5360039	5726	0.048	0.5000	No
130	PARD3	3390324 5390541	5744	0.047	0.4993	No
131	GOLGA4	460300	5816	0.045	0.4956	No
132	TSPAN5	6770019	5950	0.041	0.4886	No
133	FGF5	5270204	5954	0.041	0.4886	No
134	EDG2	6290215	6059	0.038	0.4832	No
135	ARHGAP12	1050181	6060	0.038	0.4834	No
136	TGFB2	4920292	6193	0.034	0.4763	No
137	DPYD	6110095	6313	0.031	0.4700	No
138	SLC16A7	2320672	6469	0.028	0.4617	No
139	MITF	380056	6523	0.026	0.4589	No
140	SCHIP1	4560152	6555	0.026	0.4574	No
141	EHBP1	430348	6630	0.024	0.4535	No
142	VEGFC	5910494	6922	0.018	0.4377	No
143	CLASP2	2510139	6949	0.018	0.4364	No
144	AUH	5570152	7200	0.013	0.4228	No
145	TLE4	1450064 1500519	7323	0.010	0.4162	No
146	ARHGEF7	1690441	7397	0.009	0.4123	No
147	CRY1	6770039	7568	0.006	0.4031	No
148	PLEKHC1	2650066	7620	0.005	0.4003	No
149	PUM2	4200441 5910446	7693	0.004	0.3964	No
150	PCTK2	5700673	7791	0.002	0.3912	No
151	KLF10	4850056	7935	0.000	0.3834	No
152	STAG1	1190300 1400722 4590100	7962	-0.000	0.3819	No
153	HOMER1	360131 1690092 1990300 4590068	7976	-0.000	0.3812	No
154	SHB	4920494	7988	-0.001	0.3806	No
155	NEK7	4540026	8012	-0.001	0.3794	No
156	ARNT2	1740594	8081	-0.002	0.3757	No
157	NUP153	7000452	8186	-0.004	0.3701	No
158	SAMD4A	1170717	8358	-0.007	0.3608	No
159	ERC1	1580170 2630717 6110762 6840280	8683	-0.012	0.3432	No
160	SATB2	2470181	8760	-0.014	0.3391	No
161	LYN	6040600	8816	-0.015	0.3362	No
162	FBXW11	6450632	8838	-0.015	0.3351	No
163	GBE1	2190368	9010	-0.018	0.3259	No
164	CTGF	4540577	9137	-0.020	0.3191	No
165	ITSN1	2640577	9240	-0.022	0.3137	No
166	RGS7	3390044	9297	-0.023	0.3108	No
167	SMAD7	430377	9316	-0.023	0.3099	No
168	SRGAP2	1050092 1230403 3830066 6130215	9714	-0.031	0.2884	No
169	TRIM24	7050670	9851	-0.034	0.2812	No
170	WDFY3	3610041 4560333 4570273	9869	-0.034	0.2804	No
171	SKAP2	6760500	10023	-0.037	0.2723	No
172	PTPN2	130315	10057	-0.038	0.2707	No
173	RABGAP1L	3190014 6860088	10060	-0.038	0.2708	No
174	NRG1	1050332	10091	-0.039	0.2693	No
175	ROR1	6220026	10155	-0.040	0.2661	No
176	MYO1B	770372	10173	-0.041	0.2654	No
177	RNF13	2370021	10237	-0.042	0.2621	No
178	ACVR2A	6110647	10239	-0.042	0.2623	No
179	SYNJ2	3170524	10385	-0.045	0.2546	No
180	CRADD	6770520	10549	-0.049	0.2460	No
181	CENPE	2850022	10578	-0.049	0.2447	No
182	FBXL7	6620711	10661	-0.051	0.2405	No
183	CNOT2	520546 2060397 4610543 5550113	11210	-0.064	0.2110	No
184	GNAQ	430670 4210131 5900736	11427	-0.072	0.1996	No
185	ANAPC10	870086 1170037 2260129	11439	-0.072	0.1993	No
186	PTPRM	6370136	11523	-0.075	0.1952	No
187	PHLPP	3440563	11629	-0.078	0.1899	No
188	RGL1	1500097 6900450	11658	-0.079	0.1887	No
189	DDX10	520746	11849	-0.086	0.1788	No
190	MID1	4070114 4760458	11900	-0.089	0.1765	No
191	GALK2	2360632	11903	-0.089	0.1769	No
192	NFIB	460450	11926	-0.089	0.1761	No
193	FARS2	5340575	11952	-0.091	0.1752	No
194	SOS1	7050338	12089	-0.096	0.1683	No
195	TRAM2	3940112	12119	-0.098	0.1672	No
196	BCAR3	1660717	12228	-0.102	0.1618	No
197	ATXN1	5550156	12348	-0.109	0.1559	No
198	CAP2	7100315	12362	-0.110	0.1558	No
199	EPHA4	460750	12418	-0.113	0.1533	No
200	PKP4	3710400 5890097	12495	-0.117	0.1498	No
201	ATRX	2340039 3610132 4210373	12507	-0.118	0.1498	No
202	KIF2A	3990286 6130575	12527	-0.119	0.1493	No
203	FTO	1690477	12529	-0.119	0.1499	No
204	CXCL12	580546 4150750 4570068	12660	-0.127	0.1434	No
205	DNMBP	2810368 6900403	12757	-0.134	0.1389	No
206	TUBGCP3	4920563	12924	-0.145	0.1306	No
207	ARID5B	110403	12985	-0.150	0.1281	No
208	GULP1	2230725 2350039 5570446	13076	-0.156	0.1240	No
209	IL1RAP	50546 450711 1580397 3940301 5890181 6370373	13116	-0.159	0.1226	No
210	CD2AP	1940369	13118	-0.159	0.1234	No
211	BMP2K	60541 5570504	13165	-0.163	0.1217	No
212	ZZZ3	780133 2320239 2640452 5080706 6550341	13217	-0.167	0.1198	No
213	CREB5	2320368	13496	-0.191	0.1056	No
214	PAFAH1B1	4230333 6420121 6450066	13670	-0.213	0.0972	No
215	CENPA	5080154	13738	-0.221	0.0947	No
216	GPR176	130017	13770	-0.226	0.0941	No
217	SLIT1	50110	13847	-0.233	0.0912	No
218	PBX3	1300424 3710577 6180575	13878	-0.236	0.0907	No
219	MDN1	60671 770091	14022	-0.254	0.0842	No
220	RRAS2	6290170	14142	-0.272	0.0791	No
221	SERPINE1	4210403	14220	-0.285	0.0764	No
222	XRCC4	1690685 6660427	14349	-0.306	0.0709	No
223	EXT1	4540603	14352	-0.307	0.0724	No
224	FGF2	3450433	14449	-0.323	0.0688	No
225	PPAP2B	3190397 4730280	14538	-0.339	0.0657	No
226	SOCS5	3830398 7100093	14544	-0.339	0.0671	No
227	EGFR	4920138 6480521	14611	-0.351	0.0653	No
228	INPP5F	60010 5360164	14737	-0.377	0.0604	No
229	GTF2F2	2690546	14740	-0.378	0.0622	No
230	IL7R	2060088 6380500	14762	-0.383	0.0630	No
231	MGLL	2030446 4210520	14784	-0.389	0.0638	No
232	CBLB	3520465 4670348	14787	-0.390	0.0657	No
233	CDYL	4200142 4730397 6060400	14892	-0.411	0.0621	No
234	ANKS1A	50148	14906	-0.415	0.0634	No
235	CCND1	460524 770309 3120576 6980398	14927	-0.419	0.0645	No
236	SSBP2	2260725 2900400 4730711	14986	-0.435	0.0635	No
237	MTF2	50333	15006	-0.438	0.0647	No
238	DAAM1	1500273	15017	-0.442	0.0664	No
239	SWAP70	2810577 2850739 5130594	15100	-0.466	0.0642	No
240	MGAT5	1770592 6940441	15238	-0.513	0.0594	No
241	RBM6	840279 3840563 4780129 6020446	15243	-0.514	0.0617	No
242	DLC1	1090632 6450594	15250	-0.516	0.0640	No
243	CDK8	1050113 1190601 1780358 6110102	15335	-0.544	0.0622	No
244	ZHX2	2900452	15396	-0.567	0.0618	No
245	ZHX3	460615	15422	-0.576	0.0633	No
246	PKN2	940746 2350168	15423	-0.577	0.0662	No
247	HIRA	4480609 5270167	15491	-0.601	0.0656	No
248	SEPT9	1940040	15602	-0.643	0.0629	No
249	HAS2	5360181	15725	-0.694	0.0597	No
250	PPP2R2A	2900014 5700575	15890	-0.786	0.0547	No
251	PRKCA	6400551	15989	-0.839	0.0536	No
252	CTAGE5	70053 2100435 6020692	16313	-1.019	0.0412	No
253	NUP98	2850465	16455	-1.097	0.0390	No
254	RBM16	6290286 6400181	16548	-1.162	0.0399	No
255	ZMYND11	630181 2570019 4850138 5360040	16891	-1.433	0.0285	No
256	ATXN2	3940017 4810242	16954	-1.473	0.0325	No
257	MTMR3	1050014 4920180	16991	-1.493	0.0381	No
258	MYST3	5270500	17220	-1.648	0.0340	No
259	SMAD3	6450671	17349	-1.764	0.0359	No
260	LHFPL2	450020	17492	-1.894	0.0377	No
261	PEX14	520603	17592	-1.999	0.0424	No
262	IGF2BP3	2810161 4230338	18072	-2.645	0.0296	No