Details for gene set V$E2F

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	BT_ATM_minus
GeneSet	V$E2F_03
Enrichment Score (ES)	0.27196237
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2201753
Nominal p-value	0.06309148
FDR q-value	0.54424906
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	NUTF2	1434367_s_at 1447440_at 1449017_at	65	2.441	0.0211	Yes
2	SUV39H1	1427382_a_at 1432227_at 1432236_a_at	87	2.387	0.0436	Yes
3	H2AFZ	1441370_at	92	2.365	0.0667	Yes
4	CBX5	1421932_at 1421933_at 1421934_at 1450416_at 1454636_at 1459845_at	167	2.007	0.0831	Yes
5	FBXL20	1442464_at 1445575_at 1452826_s_at 1456378_s_at	293	1.686	0.0940	Yes
6	HNRPD	1425142_a_at 1446083_at	340	1.629	0.1079	Yes
7	ANP32E	1420592_a_at 1447680_at	345	1.629	0.1238	Yes
8	SF4	1424381_at 1444699_at	436	1.546	0.1349	Yes
9	HRBL	1425362_at 1437642_at 1441347_at	441	1.539	0.1499	Yes
10	PRKDC	1451576_at	457	1.506	0.1640	Yes
11	ORC1L	1422663_at 1443172_at	540	1.403	0.1741	Yes
12	RFC1	1418342_at 1449050_at 1451920_a_at	562	1.372	0.1867	Yes
13	NUP153	1441689_at 1441733_s_at 1452176_at	616	1.331	0.1973	Yes
14	WHSC1L1	1442085_at 1447931_at 1455668_at 1457630_at 1457793_a_at 1457794_at 1459907_a_at	762	1.232	0.2028	Yes
15	KNTC1	1435575_at	876	1.156	0.2090	Yes
16	DLST	1423710_at 1430161_at 1431011_at 1437775_at	1040	1.077	0.2122	Yes
17	TOP1	1423474_at 1438495_at 1457573_at 1459672_at	1077	1.067	0.2210	Yes
18	DPYSL2	1433770_at 1450502_at 1458188_at 1458632_at	1301	1.010	0.2207	Yes
19	STAG1	1421939_a_at 1421940_at 1431921_a_at 1434189_at 1435731_x_at 1445145_at 1445652_at 1450420_at	1439	0.982	0.2241	Yes
20	ARHGEF17	1419938_s_at 1419939_at 1433682_at 1442357_at 1447441_at	1488	0.972	0.2315	Yes
21	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	1534	0.961	0.2389	Yes
22	GRIA4	1421351_at 1435722_at 1436772_at 1440891_at 1443285_at 1458230_at 1460097_at	1625	0.943	0.2440	Yes
23	MCM7	1416030_a_at 1416031_s_at 1438320_s_at	1699	0.925	0.2498	Yes
24	FBXO5	1429499_at	1701	0.925	0.2589	Yes
25	PLK4	1419838_s_at 1426580_at 1452115_a_at	1911	0.876	0.2579	Yes
26	STAG2	1421849_at 1450396_at	1991	0.857	0.2627	Yes
27	TOPBP1	1452241_at 1458480_at	2016	0.851	0.2700	Yes
28	TCP1	1442317_at 1448122_at	2167	0.816	0.2711	Yes
29	CENPB	1426051_a_at 1435944_s_at	2318	0.782	0.2720	Yes
30	DLL4	1421826_at 1421827_at	2707	0.699	0.2610	No
31	EIF4G2	1415863_at 1452758_s_at	3002	0.646	0.2539	No
32	KCND2	1422834_at 1422835_at 1446065_at 1447764_at 1450773_at 1459288_at	3123	0.624	0.2545	No
33	PRIM1	1418369_at 1444544_at 1449061_a_at	3361	0.584	0.2494	No
34	OSBPL7	1428893_at 1459966_at	3667	0.540	0.2407	No
35	MXD3	1422970_at 1438847_at 1448878_at	3898	0.510	0.2351	No
36	MCM3	1420029_at 1426653_at	4122	0.482	0.2296	No
37	PIM1	1423006_at 1435458_at	4153	0.479	0.2330	No
38	RPA2	1416433_at 1454011_a_at	4222	0.470	0.2345	No
39	APRIN	1435242_at 1436161_at 1441553_at	4253	0.467	0.2377	No
40	SLC16A2	1418446_at	4272	0.465	0.2415	No
41	AXUD1	1434350_at	4278	0.465	0.2458	No
42	DMC1	1420335_at 1449819_at	4317	0.460	0.2486	No
43	MCM4	1416214_at 1436708_x_at	4455	0.445	0.2467	No
44	A2BP1	1418314_a_at 1438217_at 1447735_x_at 1455358_at 1456921_at	4613	0.429	0.2437	No
45	POLD1	1448187_at 1456055_x_at	4981	0.393	0.2307	No
46	CCNT2	1427088_at 1427089_at 1435445_at 1452297_at 1453399_at 1457439_at	5035	0.387	0.2321	No
47	MCM6	1416251_at 1438852_x_at 1447756_x_at	5054	0.386	0.2351	No
48	ZIC3	1423424_at 1438737_at	5387	0.354	0.2233	No
49	NRIP3	1418104_at 1431597_a_at 1448954_at	5454	0.348	0.2237	No
50	PODN	1435180_at	5457	0.347	0.2270	No
51	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	5479	0.346	0.2295	No
52	MCM2	1434079_s_at 1448777_at	5509	0.344	0.2315	No
53	PDGFRA	1421916_at 1421917_at 1438946_at	5571	0.338	0.2321	No
54	LGALS1	1419573_a_at 1455439_a_at	5692	0.327	0.2298	No
55	JPH1	1421520_at 1438428_at	5765	0.321	0.2296	No
56	EIF2S1	1440272_at 1452662_a_at	5825	0.314	0.2300	No
57	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	6094	0.293	0.2206	No
58	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	6251	0.280	0.2162	No
59	BMP7	1418910_at 1432410_a_at	6369	0.271	0.2135	No
60	AP4M1	1418846_at	6403	0.269	0.2146	No
61	DCK	1428838_a_at 1439012_a_at 1449176_a_at	6446	0.266	0.2153	No
62	PCSK1	1421396_at	6801	0.238	0.2014	No
63	BRMS1L	1452850_s_at 1460443_at	6940	0.227	0.1973	No
64	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	6969	0.225	0.1982	No
65	NASP	1416042_s_at 1416043_at 1440328_at 1442728_at	7057	0.218	0.1964	No
66	UNG	1425753_a_at	7161	0.212	0.1937	No
67	SLBP	1430058_at 1460168_at	7163	0.212	0.1958	No
68	RCOR2	1417302_at	7191	0.209	0.1966	No
69	RHD	1417049_at	7884	0.162	0.1664	No
70	ADAMTS2	1435990_at 1455720_at 1457058_at	8226	0.138	0.1521	No
71	E2F1	1417878_at 1431875_a_at 1447840_x_at	8294	0.134	0.1503	No
72	CTCF	1418330_at 1449042_at	8463	0.123	0.1438	No
73	SFRS2	1415807_s_at 1427504_s_at 1427816_at 1452439_s_at	8564	0.116	0.1404	No
74	KCTD15	1435339_at	8679	0.108	0.1362	No
75	CTDSP1	1452055_at	9250	0.073	0.1107	No
76	RPL28	1416074_a_at	9253	0.073	0.1113	No
77	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	9451	0.061	0.1029	No
78	SEZ6	1420885_a_at 1427674_a_at 1459972_x_at	9613	0.051	0.0960	No
79	TREX2	1449367_at	9806	0.039	0.0876	No
80	REPS2	1435389_at 1446652_at	10020	0.024	0.0780	No
81	NR4A2	1447863_s_at 1450749_a_at 1450750_a_at 1455034_at	10027	0.024	0.0780	No
82	PKMYT1	1418481_at 1438601_at	10036	0.023	0.0778	No
83	PTMA	1423455_at	10172	0.014	0.0718	No
84	STMN1	1415849_s_at	10216	0.012	0.0699	No
85	LUC7L2	1423251_at 1427087_at 1436165_at 1436766_at 1436767_at 1437761_at 1458423_at	10305	0.007	0.0659	No
86	PPM1D	1434142_at 1449092_at 1459069_at	10572	-0.010	0.0538	No
87	MELK	1416558_at	10812	-0.026	0.0431	No
88	CASP8AP2	1449217_at	10983	-0.037	0.0356	No
89	SLITRK3	1439250_at	11068	-0.042	0.0322	No
90	IPO7	1442511_at 1454955_at 1458165_at	11255	-0.054	0.0242	No
91	ASXL2	1439063_at 1444754_at 1453295_at 1458366_at 1460597_at	11412	-0.063	0.0176	No
92	ANP32A	1421918_at 1434555_at 1450407_a_at	11421	-0.063	0.0179	No
93	SLC25A11	1426586_at	11545	-0.071	0.0129	No
94	SEMA5A	1422167_at 1434776_at 1437422_at 1446772_at 1446865_at 1446910_at 1459109_at	11569	-0.072	0.0126	No
95	PCSK4	1425824_a_at	11616	-0.075	0.0112	No
96	MAZ	1427099_at	11658	-0.078	0.0101	No
97	SFRS1	1428099_a_at 1428100_at 1430982_at 1434972_x_at 1452430_s_at 1453722_s_at 1457136_at	11671	-0.079	0.0103	No
98	DNAJC9	1426473_at	11719	-0.082	0.0090	No
99	SALL1	1450489_at	12122	-0.105	-0.0085	No
100	UXT	1418986_a_at	12263	-0.114	-0.0138	No
101	CACNA1G	1423365_at	12295	-0.116	-0.0141	No
102	ATE1	1420036_at 1420651_at 1420652_at 1435173_at 1446611_at 1449709_s_at	12442	-0.127	-0.0195	No
103	FANCG	1420960_at	12481	-0.129	-0.0200	No
104	TBX3	1437479_x_at 1439567_at 1444594_at 1445757_at 1448029_at	12664	-0.139	-0.0270	No
105	ATAD2	1436174_at 1443146_at 1443229_at	12958	-0.158	-0.0389	No
106	CDC45L	1416575_at 1457838_at	12997	-0.161	-0.0390	No
107	HMGN2	1433507_a_at	13048	-0.164	-0.0397	No
108	GLRA3	1450239_at	13168	-0.172	-0.0435	No
109	EPHB1	1455188_at	13254	-0.178	-0.0456	No
110	RAD51	1418281_at	13482	-0.193	-0.0542	No
111	EGLN2	1416533_at	13665	-0.206	-0.0605	No
112	NR6A1	1421515_at 1421516_at 1428825_at 1428826_at 1445872_at	13746	-0.211	-0.0621	No
113	NHLRC2	1429145_at 1433929_at 1444863_at 1453048_at 1457312_at	14165	-0.239	-0.0790	No
114	DNAJC11	1433880_at 1433881_at 1439763_at 1446686_at 1447055_at	14512	-0.263	-0.0923	No
115	RPS6KA5	1431050_at 1437625_at 1439004_at 1440343_at	14533	-0.265	-0.0906	No
116	MRPL18	1448373_at	14765	-0.283	-0.0984	No
117	RPS20	1456373_x_at 1456436_x_at	14831	-0.288	-0.0985	No
118	RBBP4	1434892_x_at 1442443_at 1454791_a_at 1454875_a_at 1456260_at	14931	-0.295	-0.1002	No
119	DAXX	1419026_at	15027	-0.302	-0.1016	No
120	HNRPA0	1428407_at	15077	-0.305	-0.1008	No
121	PEG3	1417355_at 1417356_at 1433924_at 1447731_at 1447732_x_at	15118	-0.308	-0.0996	No
122	ARID4A	1436191_at 1438464_at 1456420_at	15431	-0.331	-0.1107	No
123	RAB11B	1423448_at	15466	-0.334	-0.1090	No
124	PRKCSH	1416339_a_at	15610	-0.344	-0.1121	No
125	EVI1	1423011_at 1438325_at	15952	-0.374	-0.1241	No
126	PAQR4	1423101_at	16039	-0.380	-0.1243	No
127	LIG1	1416641_at	16208	-0.394	-0.1282	No
128	PLAGL1	1426208_x_at 1438588_at 1450533_a_at	16495	-0.421	-0.1372	No
129	AUTS2	1427293_a_at 1438680_at 1441869_x_at 1442360_at 1443062_at 1443070_at 1443770_x_at 1444069_at 1445307_at 1445469_at 1445538_at 1446849_at 1452379_at 1457139_at 1458592_at 1459338_at	16538	-0.424	-0.1349	No
130	ANKHD1	1419867_a_at 1436597_at 1440754_at 1441597_at 1442641_at 1448008_at 1453023_at 1455759_a_at	17074	-0.477	-0.1548	No
131	UFD1L	1418087_at 1432367_a_at	17092	-0.478	-0.1509	No
132	DCLRE1A	1417904_at 1432097_a_at 1442329_at	17349	-0.505	-0.1577	No
133	CDC6	1417019_a_at	17494	-0.521	-0.1591	No
134	CDCA7	1428069_at 1445681_at	17510	-0.522	-0.1547	No
135	KCNA6	1421568_at 1441049_at 1456954_at	17711	-0.546	-0.1585	No
136	KLF5	1430255_at 1451021_a_at 1451739_at	17802	-0.557	-0.1571	No
137	KLHDC3	1415991_a_at 1448164_at 1454747_a_at 1455910_at	17902	-0.570	-0.1561	No
138	RANBP1	1422547_at	17987	-0.581	-0.1542	No
139	ZIM2	1432297_at	18045	-0.590	-0.1510	No
140	GMNN	1417506_at	18237	-0.615	-0.1537	No
141	ING3	1422805_a_at 1422806_x_at 1450760_a_at 1460082_at	18304	-0.624	-0.1506	No
142	DNMT1	1422946_a_at 1435122_x_at 1445637_at 1447877_x_at	18626	-0.671	-0.1587	No
143	RET	1421359_at	18768	-0.694	-0.1584	No
144	ZCCHC8	1423755_at 1441639_at	18832	-0.702	-0.1544	No
145	E2F7	1437187_at	19250	-0.776	-0.1659	No
146	ATP6V1D	1416951_a_at 1416952_at 1438993_a_at	19316	-0.787	-0.1611	No
147	HNRPA1	1423531_a_at 1430020_x_at 1436549_a_at 1442758_at 1446038_at 1455305_x_at 1455740_at	19340	-0.791	-0.1544	No
148	PRPS1	1416052_at	19364	-0.795	-0.1476	No
149	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	19502	-0.822	-0.1458	No
150	FMO4	1425799_at 1444852_at	19544	-0.830	-0.1395	No
151	FKBP5	1416125_at 1447736_at 1448231_at 1458089_at	19553	-0.831	-0.1317	No
152	PVRL1	1438111_at 1438421_at 1440131_at 1446488_at 1450819_at	20040	-0.942	-0.1447	No
153	DDB2	1425706_a_at 1436680_s_at	20045	-0.944	-0.1356	No
154	ARF3	1421789_s_at 1423973_a_at 1434787_at 1437331_a_at 1456007_at	20058	-0.947	-0.1268	No
155	TIAM1	1418057_at 1444373_at 1453887_a_at	20197	-0.980	-0.1235	No
156	POLA2	1425794_at 1448369_at 1456713_at	20212	-0.985	-0.1144	No
157	VAMP3	1421102_a_at 1433693_x_at 1433916_at 1437708_x_at 1456245_x_at 1457391_at	20278	-1.001	-0.1075	No
158	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	20490	-1.047	-0.1069	No
159	TLE3	1419654_at 1419655_at 1449554_at 1458512_at	20515	-1.053	-0.0976	No
160	PHF15	1430081_at 1455345_at	20520	-1.054	-0.0874	No
161	RBL1	1424156_at 1425166_at 1432604_at 1454293_at	20581	-1.070	-0.0796	No
162	AK2	1448450_at 1448451_at	20632	-1.088	-0.0712	No
163	RNF121	1426503_a_at 1426504_a_at	20642	-1.089	-0.0609	No
164	EZH2	1416544_at 1444263_at	20722	-1.122	-0.0535	No
165	PPRC1	1426381_at	20878	-1.192	-0.0488	No
166	USP52	1426700_a_at	20929	-1.221	-0.0391	No
167	E2F3	1427462_at 1434564_at	21038	-1.272	-0.0315	No
168	MYC	1424942_a_at	21058	-1.289	-0.0197	No
169	HTF9C	1434244_x_at 1441920_x_at 1448114_a_at 1448115_at 1453995_a_at 1457620_at	21203	-1.375	-0.0128	No
170	ID3	1416630_at	21267	-1.433	-0.0015	No
171	FUS	1451285_at 1451286_s_at 1455831_at 1458801_at	21375	-1.525	0.0086	No
172	CDC25A	1417131_at 1417132_at 1445995_at	21559	-1.732	0.0172	No