Details for gene set V$AP2REP

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_BT_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#BT_ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	BT_ATM_minus
GeneSet	V$AP2REP_01
Enrichment Score (ES)	0.29365832
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2493489
Nominal p-value	0.07880435
FDR q-value	0.5256228
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	PDE10A	1419389_at 1419390_at 1432490_a_at 1439618_at 1458499_at	90	2.370	0.0317	Yes
2	PANK1	1418715_at 1429813_at 1429814_at 1431028_a_at 1457110_at	297	1.676	0.0476	Yes
3	LTBP3	1418049_at 1437833_at 1438312_s_at 1456189_x_at	323	1.649	0.0714	Yes
4	PHYHIPL	1427023_at 1437062_s_at	374	1.606	0.0933	Yes
5	ARL6IP2	1416793_at 1416794_at 1431197_at 1435594_at	519	1.424	0.1083	Yes
6	CALM3	1426710_at 1438825_at 1438826_x_at 1450864_at	608	1.338	0.1244	Yes
7	YWHAG	1420816_at 1420817_at 1450012_x_at 1459693_x_at	675	1.285	0.1408	Yes
8	COBL	1434917_at 1442076_at	767	1.230	0.1552	Yes
9	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	874	1.157	0.1679	Yes
10	BRD4	1424922_a_at 1440078_at 1450711_at 1451870_a_at 1458708_at	1143	1.046	0.1714	Yes
11	PHC2	1416048_at 1437239_x_at 1439639_at	1345	1.000	0.1773	Yes
12	CBLL1	1421122_at 1437203_at 1458261_at	1383	0.994	0.1906	Yes
13	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	1460	0.978	0.2019	Yes
14	SERPINF1	1416168_at 1453724_a_at	1500	0.969	0.2148	Yes
15	SERPINB2	1419082_at	1558	0.957	0.2266	Yes
16	SMARCA5	1440048_at	2000	0.855	0.2193	Yes
17	DDIT4L	1439332_at 1444139_at 1451751_at	2044	0.846	0.2301	Yes
18	NUDT11	1426887_at	2161	0.818	0.2372	Yes
19	BCL2L11	1426334_a_at 1435448_at 1435449_at 1456005_a_at 1456006_at 1459794_at	2208	0.806	0.2472	Yes
20	PPOX	1416618_at 1441862_at 1448065_at	2210	0.806	0.2594	Yes
21	CALD1	1424768_at 1424769_s_at 1424770_at 1433146_at 1433147_at 1458057_at	2233	0.801	0.2705	Yes
22	IRX4	1419539_at	2327	0.781	0.2780	Yes
23	RORA	1420583_a_at 1424034_at 1424035_at 1436325_at 1436326_at 1441085_at 1443511_at 1443647_at 1446360_at 1455165_at 1457177_at 1458129_at	2462	0.751	0.2832	Yes
24	RHOJ	1418892_at 1444982_at	2586	0.723	0.2885	Yes
25	UBE2E2	1424358_at 1447025_at	2898	0.665	0.2843	Yes
26	CYR61	1416039_x_at 1417848_at 1417849_at 1438133_a_at 1442340_x_at 1457823_at 1459462_at	3095	0.628	0.2848	Yes
27	NFKBIE	1431843_a_at 1458299_s_at	3109	0.625	0.2937	Yes
28	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	3583	0.552	0.2803	No
29	CYB561D1	1431021_at 1434226_at 1459837_at	3730	0.531	0.2816	No
30	GRIN2A	1421616_at	3884	0.512	0.2824	No
31	RAP2C	1428119_a_at 1437016_x_at 1460430_at	4011	0.498	0.2841	No
32	BHLHB5	1418271_at	4092	0.486	0.2878	No
33	CYP8B1	1449309_at	4539	0.436	0.2739	No
34	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	4617	0.428	0.2769	No
35	YBX2	1420762_a_at	4670	0.424	0.2809	No
36	IL3	1450566_at	4802	0.410	0.2811	No
37	PUM1	1423117_at 1456054_a_at 1460325_at	4896	0.401	0.2829	No
38	TNPO1	1433585_at 1447034_at 1455043_at	5093	0.381	0.2796	No
39	SCAMP5	1450247_a_at 1451224_at	5128	0.378	0.2838	No
40	ITSN2	1423184_at 1431772_a_at 1435023_at 1445375_at 1446595_at 1446735_at 1446911_at	5344	0.358	0.2794	No
41	DYRK1B	1422254_a_at	5352	0.358	0.2844	No
42	NR3C2	1435991_at 1440306_at 1442533_at	5479	0.346	0.2839	No
43	PAK6	1445475_at 1455200_at	5533	0.342	0.2866	No
44	PIK3R3	1445097_at 1447068_at 1456482_at	5592	0.337	0.2891	No
45	JPH1	1421520_at 1438428_at	5765	0.321	0.2860	No
46	FXYD6	1417343_at	5856	0.311	0.2866	No
47	ARHGAP6	1417704_a_at 1451867_x_at 1456333_a_at	6094	0.293	0.2802	No
48	GNB2	1450623_at	6377	0.271	0.2713	No
49	MYO1C	1419648_at 1419649_s_at 1449550_at 1449551_at	6378	0.271	0.2754	No
50	MYOZ1	1448636_at 1460202_at	6770	0.240	0.2611	No
51	DAAM1	1431035_at 1455244_at 1458662_at	7004	0.222	0.2538	No
52	EBF2	1418494_at 1446128_at 1449101_at 1449102_at	7190	0.209	0.2485	No
53	PDYN	1416266_at	7214	0.207	0.2506	No
54	PARD6A	1449100_at	7708	0.173	0.2306	No
55	CHRM1	1439611_at 1450833_at	7765	0.170	0.2306	No
56	WDTC1	1434560_at	7775	0.170	0.2327	No
57	SLC6A5	1425992_at	7951	0.158	0.2271	No
58	HOXC6	1427361_at 1427362_x_at 1427454_at	8275	0.134	0.2143	No
59	EFNA5	1421796_a_at 1436866_at 1440052_at 1446383_at 1451930_at	8307	0.133	0.2149	No
60	NOSTRIN	1441075_at	8373	0.128	0.2139	No
61	NKX3-1	1449998_at	8437	0.124	0.2129	No
62	IRAK1	1448668_a_at 1460649_at	8492	0.121	0.2122	No
63	BMP1	1426238_at 1427457_a_at 1427458_at 1446007_at	8513	0.120	0.2131	No
64	ADNP	1423069_at	8747	0.104	0.2040	No
65	EPHA1	1422917_at 1432399_a_at 1432400_at	8802	0.101	0.2030	No
66	MRVI1	1422245_a_at 1459665_s_at	8868	0.098	0.2015	No
67	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	9451	0.061	0.1758	No
68	ZDHHC15	1442274_at	9562	0.054	0.1716	No
69	NUDT10	1435061_at	9611	0.051	0.1701	No
70	EYA4	1432461_at 1442542_at 1445809_at 1456647_a_at 1456665_at	9960	0.029	0.1546	No
71	PTMA	1423455_at	10172	0.014	0.1452	No
72	ARID1A	1447104_at	10559	-0.009	0.1276	No
73	PDZRN4	1456512_at	10560	-0.009	0.1277	No
74	GRIN3A	1436575_at 1438866_at 1458378_at	10563	-0.009	0.1278	No
75	ATP2B2	1420402_at 1420403_at 1433888_at	10629	-0.014	0.1250	No
76	TRPM3	1439026_at 1441966_at 1443723_at 1445555_at 1456633_at 1456923_at 1457927_at	11065	-0.042	0.1057	No
77	EED	1448653_at	11091	-0.044	0.1052	No
78	CD3D	1422828_at	11144	-0.046	0.1035	No
79	PCSK6	1426981_at	11254	-0.054	0.0993	No
80	GNG3	1417428_at	12143	-0.107	0.0602	No
81	CD3G	1419178_at	12305	-0.117	0.0546	No
82	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	12379	-0.123	0.0531	No
83	ATP5H	1423676_at 1435112_a_at	12685	-0.141	0.0413	No
84	WNT4	1450782_at	12722	-0.144	0.0418	No
85	NLGN3	1456384_at	12897	-0.155	0.0362	No
86	COL16A1	1427986_a_at	12972	-0.159	0.0352	No
87	NRG1	1456524_at	13601	-0.201	0.0094	No
88	IGFALS	1422826_at	14024	-0.229	-0.0064	No
89	MAPT	1417885_at 1424718_at 1424719_a_at 1445634_at 1455028_at	14182	-0.240	-0.0100	No
90	BTBD9	1431230_a_at 1434769_at 1435706_at 1440548_at 1444827_at 1445220_at 1458043_at	14470	-0.261	-0.0192	No
91	TACSTD2	1423323_at	14522	-0.265	-0.0176	No
92	FHIT	1425893_a_at	14705	-0.279	-0.0217	No
93	CLPTM1	1416883_at	14748	-0.282	-0.0194	No
94	SMURF2	1429045_at 1429046_at 1454894_at	15458	-0.334	-0.0468	No
95	POLR2A	1422311_a_at 1426242_at 1458710_at	15897	-0.369	-0.0613	No
96	ECH1	1448491_at	15904	-0.370	-0.0560	No
97	NHLH2	1436888_at	16115	-0.386	-0.0598	No
98	TNPO2	1425592_at 1425593_at 1437283_at	16119	-0.386	-0.0541	No
99	JMJD1C	1426900_at 1439998_at 1441592_at 1448049_at 1458521_at	16149	-0.389	-0.0496	No
100	MPO	1415960_at	16160	-0.390	-0.0441	No
101	PHF12	1434922_at 1453579_at	16518	-0.422	-0.0541	No
102	UBE2H	1418631_at 1418632_at 1428791_at 1438971_x_at 1447374_at 1459930_at	16727	-0.440	-0.0570	No
103	ADAMTS4	1452595_at	16792	-0.447	-0.0532	No
104	LCAT	1417043_at	16960	-0.464	-0.0538	No
105	GMPPB	1439030_at	17005	-0.469	-0.0488	No
106	JPH2	1421453_at 1455404_at	17244	-0.494	-0.0522	No
107	NEFL	1426255_at	17545	-0.526	-0.0580	No
108	BSCL2	1420632_a_at 1437345_a_at	17578	-0.529	-0.0515	No
109	PTGDS	1423859_a_at 1423860_at	17602	-0.532	-0.0445	No
110	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	17742	-0.549	-0.0426	No
111	MSN	1421814_at 1450379_at	17833	-0.561	-0.0382	No
112	PBX1	1430183_at 1440037_at 1440954_at 1442846_at 1449542_at 1458853_at	18265	-0.619	-0.0486	No
113	CPNE1	1433439_at	18590	-0.666	-0.0534	No
114	SCAMP3	1416294_at	18647	-0.675	-0.0458	No
115	RHOG	1422572_at	19100	-0.748	-0.0552	No
116	TNKS1BP1	1427051_at	19294	-0.783	-0.0522	No
117	ACVR1	1416786_at 1416787_at 1448460_at 1457551_at	20023	-0.938	-0.0714	No
118	AMFR	1450102_a_at	20862	-1.184	-0.0920	No
119	PCBP4	1433658_x_at 1449054_a_at 1449055_x_at	20933	-1.222	-0.0767	No
120	CACNB3	1448656_at	20963	-1.239	-0.0593	No
121	ZBTB4	1429722_at 1460488_at	21344	-1.502	-0.0540	No
122	GATA1	1449232_at	21364	-1.516	-0.0320	No
123	VIM	1438118_x_at 1450641_at 1456292_a_at	21441	-1.597	-0.0114	No
124	ZHX2	1455210_at	21747	-2.244	0.0086	No