Details for gene set V$USF

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$USF_C
Enrichment Score (ES)	0.28060415
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2499906
Nominal p-value	0.043290045
FDR q-value	0.21505246
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	SDC1	1415943_at 1415944_at 1437279_x_at 1448158_at	3	9.253	0.0256	Yes
2	SH3KBP1	1431592_a_at 1432269_a_at 1446562_at 1456261_at 1460337_at	13	9.021	0.0503	Yes
3	SET	1426853_at 1426854_a_at	30	8.162	0.0723	Yes
4	LYAR	1417511_at	49	7.195	0.0915	Yes
5	LAP3	1450860_at	105	6.082	0.1059	Yes
6	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	109	6.040	0.1226	Yes
7	IVNS1ABP	1420961_a_at 1425718_a_at 1450084_s_at	174	5.428	0.1348	Yes
8	TIMM10	1417499_at	398	4.354	0.1366	Yes
9	G6PC3	1428245_at	511	3.984	0.1426	Yes
10	ABCB6	1422524_at	559	3.836	0.1511	Yes
11	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	627	3.693	0.1583	Yes
12	B4GALT2	1418080_at 1448941_at	652	3.660	0.1674	Yes
13	NUDC	1419471_a_at	662	3.630	0.1770	Yes
14	EXOSC5	1417167_at	713	3.537	0.1846	Yes
15	HMOX1	1448239_at	755	3.456	0.1923	Yes
16	XRN2	1422842_at 1450777_at	775	3.426	0.2010	Yes
17	PAICS	1423564_a_at 1423565_at 1436298_x_at	921	3.157	0.2031	Yes
18	MXD4	1422574_at 1434378_a_at 1434379_at	1014	3.036	0.2073	Yes
19	HSPE1	1450668_s_at	1159	2.872	0.2087	Yes
20	FBL	1416684_at 1416685_s_at	1190	2.827	0.2152	Yes
21	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	1204	2.812	0.2224	Yes
22	ENO3	1417951_at 1449631_at	1208	2.809	0.2301	Yes
23	PPAT	1428543_at 1441770_at 1452831_s_at	1250	2.767	0.2359	Yes
24	SRP72	1428876_at 1428877_at	1267	2.749	0.2428	Yes
25	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	1376	2.652	0.2452	Yes
26	AMPD2	1426757_at 1438941_x_at	1516	2.506	0.2458	Yes
27	CACNA1D	1427974_s_at 1428051_a_at	1666	2.383	0.2456	Yes
28	MAX	1423501_at	1745	2.319	0.2485	Yes
29	POLR2L	1428296_at	1746	2.319	0.2549	Yes
30	IPO4	1436420_a_at 1450814_a_at	1804	2.275	0.2586	Yes
31	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	1907	2.216	0.2601	Yes
32	EIF4B	1426378_at 1426379_at 1426380_at	2082	2.112	0.2580	Yes
33	SEZ6L	1424764_at 1440128_s_at	2216	2.042	0.2575	Yes
34	MYCL1	1422087_at 1422088_at 1434777_at	2245	2.026	0.2619	Yes
35	FGF6	1427582_at	2348	1.971	0.2627	Yes
36	LTBR	1416435_at	2401	1.951	0.2657	Yes
37	PTMA	1423455_at	2509	1.898	0.2661	Yes
38	COL2A1	1450567_a_at	2787	1.791	0.2583	Yes
39	OPRS1	1416750_at 1435579_at 1440792_x_at 1451956_a_at 1457324_at	2859	1.767	0.2600	Yes
40	PA2G4	1420142_s_at 1423060_at 1435372_a_at 1450854_at 1460265_at	2871	1.764	0.2644	Yes
41	FARP1	1445200_at 1452280_at 1459799_at	2916	1.746	0.2672	Yes
42	RHEBL1	1447818_x_at 1451516_at	2926	1.743	0.2717	Yes
43	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	2962	1.729	0.2749	Yes
44	RUNX2	1424704_at 1425389_a_at 1426034_a_at	3008	1.716	0.2776	Yes
45	DIABLO	1417683_at 1425768_at	3046	1.700	0.2806	Yes
46	LRP8	1421459_a_at 1440882_at 1442347_at	3321	1.615	0.2725	No
47	GRIN2A	1421616_at	3362	1.601	0.2751	No
48	BMP2K	1421103_at 1437419_at 1458370_at	3374	1.596	0.2790	No
49	HPCA	1425833_a_at 1450930_at	3589	1.531	0.2735	No
50	PSMB3	1417052_at	3667	1.509	0.2741	No
51	MCM8	1429557_at	3854	1.456	0.2696	No
52	TIMM9	1428010_at 1449886_a_at	3896	1.447	0.2717	No
53	TDRD1	1421513_at	4038	1.409	0.2692	No
54	USP2	1417168_a_at 1417169_at	4185	1.375	0.2663	No
55	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	4206	1.370	0.2692	No
56	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	4425	1.319	0.2628	No
57	SNX5	1417646_a_at 1417647_at 1417648_s_at 1437074_at 1448791_at	4575	1.284	0.2595	No
58	DAZL	1419542_at 1449502_at	4717	1.254	0.2565	No
59	ARHGAP20	1427522_at 1429918_at	4768	1.244	0.2577	No
60	GTF2H1	1453169_a_at	5198	1.164	0.2412	No
61	HSPA4	1416146_at 1416147_at 1440575_at	5476	1.112	0.2315	No
62	PSEN2	1425869_a_at 1431542_at	5571	1.094	0.2303	No
63	TNFRSF21	1422740_at 1450731_s_at	5865	1.046	0.2197	No
64	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	5935	1.036	0.2194	No
65	POLR2H	1424473_at	5948	1.035	0.2217	No
66	HPCAL4	1433987_at	6160	1.002	0.2148	No
67	EIF2C2	1426366_at 1438043_at	6172	1.000	0.2171	No
68	KIAA0427	1427743_at 1436047_at	6370	0.971	0.2107	No
69	LIN28	1437752_at	6538	0.947	0.2057	No
70	BTBD5	1428721_at 1453987_at	6547	0.946	0.2079	No
71	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	6616	0.936	0.2074	No
72	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	7000	0.875	0.1922	No
73	ENPP6	1436090_at 1438785_at	7022	0.871	0.1937	No
74	HOXA4	1420226_x_at 1427354_at	7158	0.850	0.1898	No
75	NPM1	1415839_a_at 1420267_at 1420268_x_at 1420269_at 1432416_a_at	7230	0.837	0.1889	No
76	SCRT2	1440930_a_at 1440931_at 1446986_at 1457310_x_at	7390	0.811	0.1838	No
77	SOCS5	1423349_at 1423350_at 1441640_at 1442890_at	7514	0.794	0.1804	No
78	GTF2A1	1421357_at	7527	0.792	0.1820	No
79	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	7668	0.771	0.1778	No
80	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	7970	0.731	0.1659	No
81	MICAL2	1438726_at 1455685_at	8034	0.721	0.1650	No
82	H3F3A	1423263_at 1442087_at	8042	0.720	0.1667	No
83	AKAP12	1419706_a_at 1458235_at	8394	0.664	0.1524	No
84	WEE1	1416773_at 1416774_at	8415	0.661	0.1533	No
85	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	8590	0.635	0.1471	No
86	VGF	1436094_at	8619	0.630	0.1476	No
87	DRD1	1455629_at 1456051_at	8622	0.630	0.1492	No
88	FLT3	1419538_at	8693	0.619	0.1477	No
89	SATB2	1425904_at 1427017_at	8709	0.617	0.1488	No
90	TLL1	1420753_at	8763	0.610	0.1480	No
91	MPP3	1419077_at 1459611_at	8900	0.591	0.1434	No
92	SYT3	1417708_at	8960	0.582	0.1423	No
93	STMN1	1415849_s_at	9253	0.538	0.1304	No
94	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	9315	0.529	0.1290	No
95	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	9440	0.513	0.1248	No
96	ELOVL4	1424306_at 1451308_at	9487	0.505	0.1240	No
97	ADCY3	1421959_s_at 1421960_at 1436928_s_at 1436929_x_at 1440405_at 1444641_at	9538	0.499	0.1231	No
98	BCKDHA	1416647_at	9580	0.493	0.1226	No
99	ARRDC3	1454617_at	9601	0.490	0.1231	No
100	PB1	1426877_a_at 1426878_at 1427266_at 1442603_at	9658	0.482	0.1218	No
101	PLA2G4A	1448558_a_at	10168	0.415	0.0996	No
102	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	10311	0.396	0.0941	No
103	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	10322	0.394	0.0948	No
104	SLC12A5	1425337_at 1445933_at 1451674_at	10496	0.368	0.0878	No
105	GPRC5C	1424450_at 1452947_at	10601	0.351	0.0840	No
106	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	10855	0.319	0.0733	No
107	HS3ST3A1	1435622_at	11097	0.286	0.0630	No
108	DAZAP1	1419275_at	11111	0.284	0.0632	No
109	NTN2L	1422056_at	11330	0.250	0.0538	No
110	ACVR2B	1419140_at 1439856_at	11350	0.247	0.0536	No
111	RAPGEF6	1427412_s_at 1434509_at 1438828_at 1443877_a_at 1443878_at	11372	0.244	0.0533	No
112	NLN	1424981_at 1451555_at	11462	0.231	0.0499	No
113	BHLHB2	1418025_at	11517	0.223	0.0480	No
114	ARX	1420926_at 1441175_at 1450042_at	11867	0.171	0.0324	No
115	BMP4	1422912_at	12130	0.131	0.0207	No
116	ALDH3B1	1452301_at	12160	0.126	0.0198	No
117	GPD1	1416204_at 1439396_x_at 1448249_at 1456732_at	12289	0.107	0.0142	No
118	SGTB	1437977_at 1451529_at	12315	0.103	0.0133	No
119	AK3	1423717_at 1423718_at 1432436_a_at 1458812_at	12508	0.076	0.0047	No
120	GIT1	1454759_at	12553	0.069	0.0029	No
121	CTSF	1449794_x_at 1451019_at	12577	0.066	0.0020	No
122	NPTX1	1422130_at 1434877_at	12911	0.014	-0.0133	No
123	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	12936	0.010	-0.0144	No
124	CENTB5	1439021_at	13209	-0.038	-0.0268	No
125	CHRM1	1439611_at 1450833_at	13287	-0.052	-0.0302	No
126	RPL19	1416219_at	13386	-0.068	-0.0345	No
127	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	13749	-0.134	-0.0508	No
128	RPL13A	1417608_a_at 1433928_a_at 1455001_x_at 1455485_x_at	13993	-0.177	-0.0615	No
129	ETV4	1423232_at 1443381_at	14087	-0.193	-0.0652	No
130	HYAL2	1448679_at	14149	-0.204	-0.0675	No
131	CGN	1430329_at 1435155_at	14392	-0.250	-0.0779	No
132	AVP	1450794_at	14566	-0.280	-0.0851	No
133	HMGN2	1433507_a_at	14597	-0.286	-0.0857	No
134	SCFD2	1433608_at 1447367_at	14958	-0.360	-0.1013	No
135	SLC6A15	1426712_at	14979	-0.364	-0.1012	No
136	FHOD1	1435557_at	15035	-0.374	-0.1026	No
137	GPX1	1460671_at	15117	-0.390	-0.1053	No
138	GNA13	1422555_s_at 1422556_at 1430295_at 1433749_at 1446722_at 1450656_at 1453470_a_at 1460317_s_at	15145	-0.394	-0.1054	No
139	NKX2-3	1425827_at 1427741_x_at 1452528_a_at	15414	-0.459	-0.1165	No
140	MYOHD1	1451183_at 1459265_at	15595	-0.507	-0.1234	No
141	LHX9	1419324_at 1431598_a_at 1441313_x_at	15831	-0.562	-0.1326	No
142	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	15911	-0.579	-0.1346	No
143	SIRT1	1418640_at 1458538_at	16079	-0.623	-0.1406	No
144	PPARGC1B	1438775_at 1449945_at 1457578_at	16235	-0.668	-0.1459	No
145	ABCA1	1421839_at 1421840_at 1450392_at	16331	-0.695	-0.1483	No
146	ZFP91	1426326_at 1429615_at 1429616_at 1459444_at	16406	-0.716	-0.1497	No
147	HHIP	1421426_at 1437933_at 1438083_at 1455277_at	16462	-0.736	-0.1502	No
148	UBXD3	1426007_a_at 1451906_at 1456385_x_at 1457581_at	16519	-0.750	-0.1507	No
149	FGF11	1421793_at 1439959_at	16636	-0.790	-0.1538	No
150	SLC26A2	1421145_at 1443882_at	16672	-0.804	-0.1532	No
151	PFDN2	1421950_at	16768	-0.829	-0.1553	No
152	RXRB	1416990_at	16924	-0.878	-0.1599	No
153	IPO13	1433464_at	16981	-0.894	-0.1600	No
154	EXOSC2	1426630_at 1446994_at	16990	-0.896	-0.1579	No
155	HOXC13	1425874_at	17019	-0.908	-0.1567	No
156	POGK	1447864_s_at 1459896_at	17168	-0.955	-0.1608	No
157	MYST3	1436315_at 1437487_at 1446143_at 1446405_at	17281	-0.994	-0.1632	No
158	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	17321	-1.005	-0.1622	No
159	NR1D1	1421802_at 1426464_at	17482	-1.055	-0.1666	No
160	CHST11	1428902_at 1450509_at	17503	-1.065	-0.1646	No
161	GRK6	1437436_s_at 1450480_a_at 1451672_at	17587	-1.100	-0.1653	No
162	PRKCE	1437860_at 1437861_s_at 1442609_at 1444649_at 1449956_at 1452878_at	17869	-1.223	-0.1749	No
163	RUSC1	1431137_at 1434743_x_at 1436014_a_at 1437991_x_at 1438017_at	17870	-1.223	-0.1715	No
164	CLCN2	1449248_at	17999	-1.274	-0.1738	No
165	CNOT4	1420999_at 1421000_at 1436645_a_at 1437586_at 1443169_at 1450083_at 1459449_at	18095	-1.312	-0.1745	No
166	BCAS3	1423528_at 1428454_at 1457817_at 1458557_at	18157	-1.344	-0.1736	No
167	HSPBAP1	1428566_at 1428567_at 1441900_x_at 1442842_at	18226	-1.377	-0.1729	No
168	HERPUD1	1435626_a_at 1448185_at	18341	-1.435	-0.1741	No
169	SLC31A2	1416654_at 1453721_a_at 1459399_at	18410	-1.470	-0.1732	No
170	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	18438	-1.481	-0.1703	No
171	ZNRF2	1431154_at 1434016_at 1434017_at 1444735_at 1455290_at 1455291_s_at	18484	-1.507	-0.1682	No
172	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	18562	-1.539	-0.1674	No
173	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	18579	-1.547	-0.1639	No
174	TMEM15	1424366_at	18665	-1.580	-0.1634	No
175	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	18706	-1.601	-0.1608	No
176	CDC14A	1436913_at 1443184_at 1446493_at 1459517_at	18822	-1.681	-0.1614	No
177	FADS3	1418773_at 1435910_at 1449219_at	18877	-1.706	-0.1591	No
178	CAMK4	1421941_at 1426167_a_at 1439843_at 1442822_at 1452572_at	18892	-1.712	-0.1550	No
179	SLC39A7	1416949_s_at	18911	-1.728	-0.1510	No
180	ADNP	1423069_at	18967	-1.769	-0.1486	No
181	SLC20A1	1438824_at 1446441_at 1448568_a_at	19371	-2.055	-0.1614	No
182	PABPC1	1418883_a_at 1419500_at 1453840_at	19451	-2.099	-0.1592	No
183	MTHFD1	1415916_a_at 1415917_at 1436704_x_at	19624	-2.217	-0.1610	No
184	PFN1	1449018_at	19696	-2.277	-0.1579	No
185	MNT	1418192_at	19727	-2.306	-0.1529	No
186	ELK1	1421896_at 1421897_at 1446390_at	19848	-2.424	-0.1516	No
187	SC5DL	1424709_at 1434520_at 1451457_at	19861	-2.435	-0.1454	No
188	DNAJB9	1417191_at	20131	-2.729	-0.1502	No
189	EEF1E1	1444757_at 1449044_at	20135	-2.731	-0.1427	No
190	FCHSD2	1434260_at 1456949_at	20157	-2.756	-0.1360	No
191	PER1	1449851_at	20193	-2.792	-0.1299	No
192	JMJD1A	1426810_at	20442	-3.078	-0.1327	No
193	CRMP1	1448289_at	20452	-3.090	-0.1245	No
194	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	20469	-3.111	-0.1166	No
195	TBX4	1426321_at 1456033_at	20560	-3.261	-0.1117	No
196	PDK2	1448825_at	20876	-3.723	-0.1158	No
197	TEF	1424175_at 1438033_at 1450184_s_at	20878	-3.725	-0.1055	No
198	CCDC6	1428311_at 1459159_a_at	20950	-3.824	-0.0981	No
199	GABARAP	1416937_at	20951	-3.828	-0.0874	No
200	SEMA7A	1422040_at 1459903_at	21019	-3.949	-0.0795	No
201	UBE1	1442767_s_at 1448116_at	21074	-4.080	-0.0706	No
202	CNNM1	1420354_at 1441312_at 1445979_at	21106	-4.144	-0.0605	No
203	RORC	1425792_a_at 1425793_a_at	21592	-5.874	-0.0665	No
204	WBP2	1448121_at	21620	-6.056	-0.0509	No
205	ANXA6	1415818_at 1429246_a_at 1429247_at 1442288_at	21906	-11.714	-0.0314	No
206	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	21907	-11.718	0.0012	No