Details for gene set V$NRF2

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_02_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$NRF2_Q4
Enrichment Score (ES)	0.2823749
Normalized Enrichment Score (NES)	1.2609674
Nominal p-value	0.020618556
FDR q-value	0.23073006
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	SKP1A	1423148_at 1423149_at	23	8.417	0.0290	Yes
2	PSMD1	1419799_at 1429291_at	41	7.327	0.0544	Yes
3	FTSJ3	1451026_at	72	6.629	0.0767	Yes
4	PSMD12	1448492_a_at	82	6.430	0.0993	Yes
5	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	159	5.571	0.1157	Yes
6	BAG2	1423948_at	259	4.970	0.1289	Yes
7	RBBP7	1415775_at 1456227_x_at	397	4.357	0.1381	Yes
8	UBE2L3	1417907_at 1417908_s_at 1448879_at 1448880_at	538	3.891	0.1456	Yes
9	ABCB6	1422524_at	559	3.836	0.1584	Yes
10	PSMA2	1448206_at	573	3.811	0.1714	Yes
11	SLC11A1	1420361_at	588	3.777	0.1842	Yes
12	MRPL32	1424372_at	617	3.723	0.1963	Yes
13	BLVRB	1451386_at	689	3.582	0.2058	Yes
14	ARHGAP8	1451463_at	720	3.525	0.2170	Yes
15	PSMA3	1448442_a_at	798	3.372	0.2255	Yes
16	BLMH	1438961_s_at 1439325_at 1452101_at	839	3.299	0.2355	Yes
17	CANX	1415692_s_at 1422845_at 1428935_at	1180	2.840	0.2300	Yes
18	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	1204	2.812	0.2390	Yes
19	BNIP3	1422470_at	1546	2.478	0.2321	Yes
20	ALDOA	1416921_x_at 1433604_x_at 1434799_x_at	1582	2.449	0.2393	Yes
21	ETV5	1420998_at 1428142_at 1450082_s_at	1588	2.445	0.2478	Yes
22	EEF1A2	1418062_at	1647	2.393	0.2536	Yes
23	PRX	1423292_a_at	1670	2.380	0.2611	Yes
24	WBP4	1419374_at 1419375_at	1673	2.378	0.2695	Yes
25	YWHAG	1420816_at 1420817_at 1450012_x_at 1459693_x_at	2016	2.146	0.2615	Yes
26	LOXL4	1421153_at 1450134_at	2144	2.074	0.2631	Yes
27	PSMC5	1415740_at	2226	2.037	0.2666	Yes
28	SYTL1	1450240_a_at	2234	2.032	0.2735	Yes
29	ELA1	1423693_at	2366	1.963	0.2745	Yes
30	TGIF	1422286_a_at	2596	1.863	0.2707	Yes
31	IDS	1421216_a_at 1427812_at 1427813_at 1434751_at 1450166_at 1455481_at	2665	1.837	0.2741	Yes
32	SOST	1421245_at 1436240_at 1450179_at	2726	1.815	0.2778	Yes
33	LRRFIP2	1436378_at 1436510_a_at	2856	1.768	0.2782	Yes
34	CPNE8	1430520_at 1430521_s_at 1431146_a_at	3195	1.654	0.2686	Yes
35	OGG1	1430078_a_at 1448815_at	3262	1.635	0.2714	Yes
36	NUDT11	1426887_at	3337	1.611	0.2737	Yes
37	APBA2BP	1431946_a_at 1447907_x_at	3488	1.565	0.2724	Yes
38	NOG	1422300_at	3513	1.558	0.2769	Yes
39	ADAM15	1416080_at 1425170_a_at 1438760_x_at 1454206_a_at	3594	1.530	0.2787	Yes
40	TTC1	1416994_at 1448537_at	3741	1.491	0.2773	Yes
41	CRYGS	1420453_at	3843	1.460	0.2779	Yes
42	FLNC	1424063_at 1447812_x_at 1449073_at	3937	1.437	0.2787	Yes
43	ZIC4	1421539_at 1456417_at	4017	1.416	0.2801	Yes
44	SEC24D	1426972_at 1458821_at	4078	1.399	0.2824	Yes
45	SLC16A6	1417884_at	4424	1.319	0.2712	No
46	EPHB2	1425015_at 1425016_at 1442471_at 1445417_at 1454022_at	4569	1.285	0.2692	No
47	ATP6V0A1	1417632_at 1425227_a_at 1459924_at 1460650_at	4814	1.235	0.2624	No
48	TREX1	1450672_a_at 1459618_at	4924	1.215	0.2617	No
49	ABHD4	1416315_at 1439259_x_at	5098	1.183	0.2580	No
50	TBXAS1	1416827_at	5102	1.182	0.2621	No
51	SYT2	1420418_at 1440323_at 1449866_at	5297	1.143	0.2572	No
52	ENO1	1419023_x_at	5302	1.142	0.2611	No
53	ROM1	1448996_at	5488	1.110	0.2566	No
54	LGI3	1433667_at 1436238_at 1460546_at	5596	1.091	0.2556	No
55	SLC38A2	1426722_at 1429593_at 1429594_at	5696	1.074	0.2548	No
56	MIA2	1451964_at	5701	1.073	0.2585	No
57	TOMM70A	1417192_at 1426675_at 1426676_s_at 1447239_at 1457353_at	5799	1.056	0.2578	No
58	RAN	1443131_at 1446819_at 1447478_at 1460551_at	6151	1.002	0.2453	No
59	MGST1	1415897_a_at 1415898_at	6245	0.991	0.2445	No
60	PKN3	1434525_at	6362	0.973	0.2427	No
61	CD44	1423760_at 1434376_at 1443265_at 1452483_a_at	6384	0.968	0.2451	No
62	MCF2	1419021_at	6437	0.962	0.2462	No
63	DRP2	1440452_at 1441224_at 1441542_at	6794	0.907	0.2331	No
64	TFPI2	1418547_at	6880	0.895	0.2324	No
65	INHA	1422728_at	6908	0.890	0.2343	No
66	LRP1B	1450211_at 1457235_at	6931	0.887	0.2365	No
67	FGF12	1440270_at 1451693_a_at 1460137_at	6979	0.879	0.2374	No
68	NDRG2	1448154_at	7101	0.859	0.2349	No
69	PPP2R2B	1426621_a_at	7513	0.794	0.2189	No
70	GTF2A1	1421357_at	7527	0.792	0.2211	No
71	TNXB	1450798_at	7648	0.774	0.2184	No
72	BTK	1422755_at	8127	0.705	0.1989	No
73	GPX2	1449279_at	8161	0.700	0.1999	No
74	H3F3B	1420376_a_at 1430357_at 1455725_a_at	8198	0.693	0.2007	No
75	PDZRN4	1456512_at	8321	0.675	0.1975	No
76	CLDN15	1418920_at	8494	0.650	0.1919	No
77	CSMD3	1438272_at 1438572_at 1454245_at	8501	0.648	0.1940	No
78	TLL1	1420753_at	8763	0.610	0.1841	No
79	SH3BGRL2	1434109_at 1434211_at	8976	0.580	0.1765	No
80	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	9193	0.548	0.1685	No
81	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	9315	0.529	0.1648	No
82	FGF1	1423136_at 1441042_at 1450869_at	9331	0.527	0.1660	No
83	DCTN2	1424461_at	9343	0.527	0.1674	No
84	RTN3	1418101_a_at 1425539_a_at 1442365_at 1443220_at	9409	0.518	0.1662	No
85	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	9440	0.513	0.1667	No
86	SYNPO	1427045_at 1434089_at	9653	0.482	0.1587	No
87	DUSP13	1450198_at	9822	0.459	0.1526	No
88	PPP2R2C	1438054_x_at 1438671_at 1443804_at	9901	0.448	0.1506	No
89	LIMK1	1417627_a_at 1425836_a_at 1456234_at 1458989_at	9967	0.439	0.1492	No
90	GADD45G	1453851_a_at	10051	0.428	0.1469	No
91	ADCYAP1	1423427_at 1441778_at	10057	0.428	0.1482	No
92	CDH23	1432346_a_at 1452028_a_at	10232	0.405	0.1416	No
93	UCHL1	1448260_at	10304	0.397	0.1398	No
94	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	10311	0.396	0.1409	No
95	CRYBA2	1419011_at	10386	0.385	0.1389	No
96	MAST2	1417324_at 1440321_at 1441847_at 1444813_at 1456927_at 1459558_at	10941	0.308	0.1145	No
97	SLC26A1	1451239_a_at 1458327_x_at	11043	0.295	0.1109	No
98	USP13	1452442_at 1455473_at	11054	0.293	0.1115	No
99	LAMA3	1444860_at	11059	0.293	0.1124	No
100	PITPNC1	1428025_s_at 1428878_a_at 1428879_at 1431074_a_at 1435066_at 1441574_at 1452939_a_at 1452940_x_at 1453750_x_at 1455204_at	11422	0.237	0.0966	No
101	ALS2	1417783_at 1417784_at 1431608_at 1446183_at	11496	0.227	0.0940	No
102	PHLDA2	1417837_at	11569	0.217	0.0915	No
103	SMPX	1418095_at	11595	0.213	0.0911	No
104	IL6	1450297_at	11609	0.212	0.0913	No
105	NUDT10	1435061_at	11689	0.198	0.0884	No
106	CNTN6	1422649_at	11879	0.169	0.0803	No
107	TFEC	1419537_at	11885	0.168	0.0806	No
108	DTX2	1421720_a_at 1439429_x_at	11926	0.162	0.0794	No
109	F2RL2	1421407_at 1445680_x_at	12107	0.134	0.0716	No
110	KCND1	1421538_at 1446556_at 1455514_at	12177	0.124	0.0689	No
111	SNCG	1417788_at	12317	0.103	0.0628	No
112	KIF5A	1434670_at	12412	0.090	0.0588	No
113	CAPN6	1421952_at 1450429_at	12457	0.084	0.0571	No
114	MAPRE3	1427079_at	12485	0.079	0.0561	No
115	PRDM1	1420425_at 1444997_at	12655	0.055	0.0486	No
116	NOTCH4	1436901_at 1449146_at 1456263_at	13241	-0.044	0.0218	No
117	ZIC1	1423477_at 1439627_at	13379	-0.067	0.0158	No
118	ITM2B	1417999_at 1418000_a_at 1418001_at 1456372_at	13441	-0.077	0.0132	No
119	GAS2L1	1430595_at 1434928_at 1441422_at	13748	-0.134	-0.0003	No
120	TXNRD1	1421529_a_at 1424486_a_at 1424487_x_at	13806	-0.145	-0.0025	No
121	ABCA2	1449302_at	13838	-0.150	-0.0033	No
122	HSPG2	1418669_at 1418670_s_at	13907	-0.161	-0.0059	No
123	MMRN2	1437123_at	14139	-0.202	-0.0158	No
124	PDE4D	1443289_at 1458212_at 1459289_at 1459311_at	14377	-0.247	-0.0258	No
125	TUBA4	1417373_a_at 1417374_at 1417375_at	14779	-0.324	-0.0431	No
126	LRP1	1442849_at 1448655_at	14933	-0.354	-0.0489	No
127	FOXN1	1450508_at 1456815_at	15033	-0.374	-0.0521	No
128	MDFI	1420713_a_at 1425924_at	15121	-0.390	-0.0547	No
129	KCNA2	1422197_at	15436	-0.466	-0.0675	No
130	RDH5	1418808_at 1421702_at	15646	-0.520	-0.0752	No
131	PSMD2	1415831_at	15833	-0.563	-0.0817	No
132	WNT2	1449425_at	16013	-0.605	-0.0878	No
133	RABEP1	1421305_x_at 1426023_a_at 1427448_at 1443856_at 1444930_at 1459494_at	16014	-0.605	-0.0857	No
134	PLEC1	1419835_s_at 1434610_at 1437554_at	16290	-0.685	-0.0958	No
135	MAP2K1	1416351_at	16403	-0.715	-0.0984	No
136	UBXD2	1426484_at 1426485_at 1426486_at	16541	-0.756	-0.1020	No
137	FGF11	1421793_at 1439959_at	16636	-0.790	-0.1035	No
138	TUBB	1416256_a_at 1455719_at	16712	-0.813	-0.1041	No
139	SFXN5	1436618_at 1440428_at	16745	-0.822	-0.1026	No
140	PSMD4	1418874_a_at 1425859_a_at 1451725_a_at	16777	-0.834	-0.1011	No
141	APBA1	1437940_at 1455369_at 1459605_at	16821	-0.847	-0.1000	No
142	ADCK4	1448490_at	16867	-0.859	-0.0990	No
143	RARG	1419415_a_at 1419416_a_at	16952	-0.885	-0.0997	No
144	IPO13	1433464_at	16981	-0.894	-0.0978	No
145	PIAS1	1422581_at 1446448_at 1455486_at 1455611_at	17082	-0.930	-0.0991	No
146	USP14	1416208_at 1437714_x_at 1439201_at 1455829_at	17102	-0.937	-0.0966	No
147	SPTBN4	1425116_a_at	17180	-0.960	-0.0967	No
148	PER2	1417602_at 1417603_at 1445892_at 1457350_at	17267	-0.988	-0.0972	No
149	NR1D1	1421802_at 1426464_at	17482	-1.055	-0.1032	No
150	RAB6A	1447776_x_at 1448304_a_at 1448305_at	17545	-1.083	-0.1022	No
151	CACNB2	1441521_at 1444693_at 1446632_at 1452476_at 1456401_at	17649	-1.123	-0.1029	No
152	LMO4	1420981_a_at 1439651_at	17681	-1.145	-0.1003	No
153	TBL1X	1434643_at 1434644_at 1441435_at 1446736_at 1455042_at	17715	-1.162	-0.0976	No
154	PSME4	1426823_s_at 1426824_at 1440511_at 1445147_at 1446464_at 1452211_at	18040	-1.293	-0.1079	No
155	DMD	1417307_at 1430320_at 1446156_at 1448665_at 1457022_at	18076	-1.306	-0.1049	No
156	ATP1B1	1418453_a_at 1423890_x_at 1439036_a_at 1451152_a_at 1455949_at	18105	-1.314	-0.1014	No
157	NR5A1	1418315_at 1421730_at	18188	-1.358	-0.1004	No
158	CAPN12	1449970_at	18325	-1.428	-0.1015	No
159	MASP1	1419677_at 1425985_s_at 1438602_s_at 1438603_x_at 1455346_at	18420	-1.473	-0.1006	No
160	SQSTM1	1440076_at 1442237_at 1444021_at 1450957_a_at	18467	-1.501	-0.0973	No
161	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	18706	-1.601	-0.1026	No
162	ITPKC	1440024_at 1454755_at	18771	-1.654	-0.0996	No
163	FBXO30	1429441_at 1436550_at 1453136_at 1453137_at	18825	-1.682	-0.0960	No
164	FCHSD1	1427155_at	18917	-1.733	-0.0940	No
165	NRXN2	1435907_at 1435908_at 1455499_at	19013	-1.805	-0.0919	No
166	RB1CC1	1418968_at 1431605_at 1449292_at	19023	-1.815	-0.0859	No
167	AKT3	1422078_at 1435260_at 1435879_at 1443222_at 1460307_at	19096	-1.860	-0.0825	No
168	MMP19	1421976_at 1421977_at	19099	-1.861	-0.0760	No
169	BAZ2A	1427209_at 1427210_at 1438192_s_at	19156	-1.907	-0.0717	No
170	RGS2	1419247_at 1419248_at 1447830_s_at	19219	-1.958	-0.0676	No
171	ESRRG	1421747_at 1455267_at 1457896_at	19221	-1.959	-0.0606	No
172	BEX2	1417388_at	19486	-2.120	-0.0652	No
173	CSNK1G2	1423370_a_at	19521	-2.147	-0.0591	No
174	MNT	1418192_at	19727	-2.306	-0.0603	No
175	LAMC1	1423885_at 1423886_at	19956	-2.539	-0.0617	No
176	BACH1	1440831_at 1449311_at	19968	-2.549	-0.0531	No
177	PFN2	1418209_a_at 1418210_at 1436993_x_at	20013	-2.592	-0.0459	No
178	BRD2	1423502_at 1437210_a_at	20113	-2.714	-0.0407	No
179	PAFAH1B1	1417086_at 1427703_at 1439656_at 1441404_at 1444125_at 1448578_at 1456947_at 1460199_a_at	20122	-2.721	-0.0314	No
180	RHOH	1429319_at 1441385_at 1443015_at	20337	-2.963	-0.0306	No
181	ABCD1	1418838_at	20607	-3.313	-0.0312	No
182	KCNH3	1421619_at 1431690_at 1445805_x_at 1459107_at	20836	-3.660	-0.0286	No
183	PSMD7	1432820_at 1451056_at 1454368_at	20912	-3.761	-0.0186	No
184	EDG1	1423571_at	21529	-5.520	-0.0272	No
185	DDX17	1437773_x_at 1439037_at 1452155_a_at	21573	-5.789	-0.0085	No
186	TUBA1	1418884_x_at	21729	-7.008	0.0094	No