Details for gene set V$USF

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_SCID.phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls #ATM_minus_versus_SCID
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls#ATM_minus_versus_SCID
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$USF_C
Enrichment Score (ES)	0.328041
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3252541
Nominal p-value	0.028257458
FDR q-value	0.76792246
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	XRN2	1422842_at 1450777_at	39	7.638	0.0370	Yes
2	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	47	7.254	0.0736	Yes
3	IVNS1ABP	1420961_a_at 1425718_a_at 1450084_s_at	111	4.887	0.0955	Yes
4	LYAR	1417511_at	148	4.405	0.1163	Yes
5	PPAT	1428543_at 1441770_at 1452831_s_at	205	3.804	0.1330	Yes
6	SET	1426853_at 1426854_a_at	221	3.678	0.1510	Yes
7	HMOX1	1448239_at	263	3.455	0.1667	Yes
8	SH3KBP1	1431592_a_at 1432269_a_at 1446562_at 1456261_at 1460337_at	326	3.189	0.1801	Yes
9	SRP72	1428876_at 1428877_at	350	3.115	0.1948	Yes
10	SNX5	1417646_a_at 1417647_at 1417648_s_at 1437074_at 1448791_at	481	2.846	0.2033	Yes
11	ABCB6	1422524_at	886	2.110	0.1955	Yes
12	BMP2K	1421103_at 1437419_at 1458370_at	1026	1.951	0.1990	Yes
13	EXOSC5	1417167_at	1167	1.825	0.2018	Yes
14	AK3	1423717_at 1423718_at 1432436_a_at 1458812_at	1175	1.822	0.2108	Yes
15	SDC1	1415943_at 1415944_at 1437279_x_at 1448158_at	1252	1.766	0.2162	Yes
16	ENO3	1417951_at 1449631_at	1324	1.725	0.2217	Yes
17	OPRS1	1416750_at 1435579_at 1440792_x_at 1451956_a_at 1457324_at	1336	1.718	0.2300	Yes
18	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	1429	1.672	0.2342	Yes
19	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	1531	1.611	0.2378	Yes
20	ZFP91	1426326_at 1429615_at 1429616_at 1459444_at	1543	1.604	0.2454	Yes
21	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	1553	1.598	0.2531	Yes
22	ADNP	1423069_at	1676	1.524	0.2553	Yes
23	SLC12A5	1425337_at 1445933_at 1451674_at	1961	1.371	0.2492	Yes
24	CLCN2	1449248_at	1968	1.369	0.2559	Yes
25	TIMM9	1428010_at 1449886_a_at	2026	1.343	0.2601	Yes
26	G6PC3	1428245_at	2121	1.301	0.2624	Yes
27	GTF2A1	1421357_at	2158	1.287	0.2672	Yes
28	IPO4	1436420_a_at 1450814_a_at	2325	1.216	0.2658	Yes
29	SLC26A2	1421145_at 1443882_at	2412	1.186	0.2679	Yes
30	SEMA7A	1422040_at 1459903_at	2456	1.168	0.2718	Yes
31	ENPP6	1436090_at 1438785_at	2459	1.168	0.2777	Yes
32	PB1	1426877_a_at 1426878_at 1427266_at 1442603_at	2622	1.122	0.2759	Yes
33	SC5DL	1424709_at 1434520_at 1451457_at	2701	1.097	0.2779	Yes
34	JMJD1A	1426810_at	2717	1.094	0.2828	Yes
35	DRD1	1455629_at 1456051_at	2745	1.085	0.2870	Yes
36	GRIN2A	1421616_at	2982	1.028	0.2814	Yes
37	PDK2	1448825_at	2983	1.028	0.2866	Yes
38	MPP3	1419077_at 1459611_at	2990	1.026	0.2916	Yes
39	BCKDHA	1416647_at	3072	1.009	0.2930	Yes
40	ARX	1420926_at 1441175_at 1450042_at	3143	0.997	0.2948	Yes
41	GPD1	1416204_at 1439396_x_at 1448249_at 1456732_at	3202	0.987	0.2972	Yes
42	MTHFD1	1415916_a_at 1415917_at 1436704_x_at	3284	0.967	0.2984	Yes
43	FGF6	1427582_at	3314	0.962	0.3019	Yes
44	DIABLO	1417683_at 1425768_at	3432	0.935	0.3013	Yes
45	PTMA	1423455_at	3433	0.935	0.3060	Yes
46	ANXA6	1415818_at 1429246_a_at 1429247_at 1442288_at	3436	0.934	0.3107	Yes
47	RUSC1	1431137_at 1434743_x_at 1436014_a_at 1437991_x_at 1438017_at	3442	0.933	0.3152	Yes
48	LRP8	1421459_a_at 1440882_at 1442347_at	3494	0.923	0.3176	Yes
49	HHIP	1421426_at 1437933_at 1438083_at 1455277_at	3608	0.898	0.3169	Yes
50	USP2	1417168_a_at 1417169_at	3610	0.898	0.3214	Yes
51	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	3675	0.883	0.3230	Yes
52	BCAS3	1423528_at 1428454_at 1457817_at 1458557_at	3697	0.878	0.3265	Yes
53	CACNA1D	1427974_s_at 1428051_a_at	3835	0.851	0.3245	Yes
54	SATB2	1425904_at 1427017_at	4120	0.796	0.3155	Yes
55	FARP1	1445200_at 1452280_at 1459799_at	4244	0.776	0.3138	Yes
56	KIAA0427	1427743_at 1436047_at	4268	0.770	0.3166	Yes
57	AKAP12	1419706_a_at 1458235_at	4288	0.766	0.3196	Yes
58	CDC14A	1436913_at 1443184_at 1446493_at 1459517_at	4351	0.756	0.3206	Yes
59	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	4370	0.752	0.3236	Yes
60	NR1D1	1421802_at 1426464_at	4466	0.735	0.3230	Yes
61	POGK	1447864_s_at 1459896_at	4512	0.723	0.3246	Yes
62	NUDC	1419471_a_at	4637	0.700	0.3224	Yes
63	EEF1E1	1444757_at 1449044_at	4702	0.689	0.3230	Yes
64	ZNRF2	1431154_at 1434016_at 1434017_at 1444735_at 1455290_at 1455291_s_at	4713	0.687	0.3260	Yes
65	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	4746	0.684	0.3280	Yes
66	RUNX2	1424704_at 1425389_a_at 1426034_a_at	4888	0.659	0.3249	No
67	ALDH3B1	1452301_at	4994	0.641	0.3233	No
68	FADS3	1418773_at 1435910_at 1449219_at	5182	0.610	0.3178	No
69	MCM8	1429557_at	5217	0.605	0.3193	No
70	CNOT4	1420999_at 1421000_at 1436645_a_at 1437586_at 1443169_at 1450083_at 1459449_at	5266	0.598	0.3202	No
71	DAZL	1419542_at 1449502_at	5304	0.593	0.3215	No
72	AMPD2	1426757_at 1438941_x_at	5309	0.593	0.3243	No
73	B4GALT2	1418080_at 1448941_at	5341	0.588	0.3259	No
74	NKX2-3	1425827_at 1427741_x_at 1452528_a_at	5449	0.572	0.3239	No
75	GRK6	1437436_s_at 1450480_a_at 1451672_at	5780	0.530	0.3114	No
76	WEE1	1416773_at 1416774_at	6022	0.499	0.3028	No
77	ELOVL4	1424306_at 1451308_at	6071	0.494	0.3031	No
78	ELK1	1421896_at 1421897_at 1446390_at	6157	0.482	0.3017	No
79	ACVR2B	1419140_at 1439856_at	6270	0.468	0.2989	No
80	TDRD1	1421513_at	6477	0.443	0.2916	No
81	LIN28	1437752_at	6705	0.418	0.2833	No
82	RHEBL1	1447818_x_at 1451516_at	6800	0.408	0.2811	No
83	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	6898	0.397	0.2786	No
84	LHX9	1419324_at 1431598_a_at 1441313_x_at	7011	0.385	0.2754	No
85	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	7100	0.375	0.2733	No
86	PER1	1449851_at	7233	0.359	0.2690	No
87	POLR2H	1424473_at	7291	0.354	0.2682	No
88	RXRB	1416990_at	7341	0.349	0.2677	No
89	SEZ6L	1424764_at 1440128_s_at	7417	0.342	0.2660	No
90	EXOSC2	1426630_at 1446994_at	7606	0.321	0.2590	No
91	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	8329	0.252	0.2271	No
92	HS3ST3A1	1435622_at	8708	0.215	0.2108	No
93	RAPGEF6	1427412_s_at 1434509_at 1438828_at 1443877_a_at 1443878_at	8791	0.209	0.2081	No
94	DNAJB9	1417191_at	8855	0.203	0.2062	No
95	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	8872	0.202	0.2065	No
96	SYT3	1417708_at	8971	0.192	0.2030	No
97	LAP3	1450860_at	8980	0.192	0.2036	No
98	SCRT2	1440930_a_at 1440931_at 1446986_at 1457310_x_at	9067	0.184	0.2005	No
99	GTF2H1	1453169_a_at	9163	0.176	0.1971	No
100	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	9338	0.159	0.1899	No
101	MYCL1	1422087_at 1422088_at 1434777_at	9402	0.153	0.1877	No
102	FGF11	1421793_at 1439959_at	9983	0.102	0.1616	No
103	PSMB3	1417052_at	10412	0.067	0.1422	No
104	HPCAL4	1433987_at	10480	0.062	0.1395	No
105	HMGN2	1433507_a_at	10504	0.060	0.1387	No
106	CHST11	1428902_at 1450509_at	10636	0.048	0.1329	No
107	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	10727	0.042	0.1290	No
108	ARHGAP20	1427522_at 1429918_at	10730	0.042	0.1291	No
109	NLN	1424981_at 1451555_at	10962	0.021	0.1186	No
110	ETV4	1423232_at 1443381_at	11003	0.016	0.1168	No
111	AVP	1450794_at	11301	-0.010	0.1032	No
112	STMN1	1415849_s_at	11332	-0.013	0.1019	No
113	PSEN2	1425869_a_at 1431542_at	11382	-0.017	0.0997	No
114	FLT3	1419538_at	11414	-0.020	0.0984	No
115	SLC39A7	1416949_s_at	11456	-0.024	0.0966	No
116	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	11765	-0.052	0.0827	No
117	BMP4	1422912_at	11782	-0.054	0.0823	No
118	PLA2G4A	1448558_a_at	11947	-0.068	0.0751	No
119	SCFD2	1433608_at 1447367_at	12311	-0.099	0.0589	No
120	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	12464	-0.113	0.0524	No
121	CRMP1	1448289_at	12637	-0.129	0.0452	No
122	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	12686	-0.133	0.0437	No
123	SOCS5	1423349_at 1423350_at 1441640_at 1442890_at	12706	-0.135	0.0435	No
124	MAX	1423501_at	12735	-0.138	0.0429	No
125	H3F3A	1423263_at 1442087_at	12766	-0.141	0.0422	No
126	FCHSD2	1434260_at 1456949_at	12982	-0.163	0.0331	No
127	PFN1	1449018_at	13056	-0.169	0.0307	No
128	COL2A1	1450567_a_at	13064	-0.170	0.0312	No
129	CGN	1430329_at 1435155_at	13080	-0.171	0.0314	No
130	TLL1	1420753_at	13414	-0.201	0.0171	No
131	MNT	1418192_at	13597	-0.216	0.0098	No
132	SGTB	1437977_at 1451529_at	13622	-0.219	0.0098	No
133	SLC6A15	1426712_at	13737	-0.228	0.0057	No
134	TBX4	1426321_at 1456033_at	13748	-0.230	0.0064	No
135	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	13768	-0.231	0.0067	No
136	ARRDC3	1454617_at	13830	-0.238	0.0051	No
137	PPARGC1B	1438775_at 1449945_at 1457578_at	13907	-0.246	0.0029	No
138	HPCA	1425833_a_at 1450930_at	14074	-0.263	-0.0034	No
139	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	14356	-0.293	-0.0149	No
140	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	14485	-0.305	-0.0192	No
141	CHRM1	1439611_at 1450833_at	14520	-0.308	-0.0192	No
142	ADCY3	1421959_s_at 1421960_at 1436928_s_at 1436929_x_at 1440405_at 1444641_at	14538	-0.311	-0.0184	No
143	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	14594	-0.317	-0.0193	No
144	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	14599	-0.318	-0.0179	No
145	PRKCE	1437860_at 1437861_s_at 1442609_at 1444649_at 1449956_at 1452878_at	14627	-0.321	-0.0175	No
146	CTSF	1449794_x_at 1451019_at	14822	-0.343	-0.0247	No
147	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	15041	-0.367	-0.0328	No
148	TMEM15	1424366_at	15080	-0.370	-0.0327	No
149	CENTB5	1439021_at	15164	-0.381	-0.0346	No
150	CNNM1	1420354_at 1441312_at 1445979_at	15188	-0.383	-0.0337	No
151	BTBD5	1428721_at 1453987_at	15343	-0.399	-0.0388	No
152	CAMK4	1421941_at 1426167_a_at 1439843_at 1442822_at 1452572_at	15551	-0.424	-0.0461	No
153	HSPA4	1416146_at 1416147_at 1440575_at	15600	-0.430	-0.0461	No
154	RPL19	1416219_at	15709	-0.444	-0.0489	No
155	PFDN2	1421950_at	15711	-0.444	-0.0467	No
156	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	15891	-0.465	-0.0525	No
157	IPO13	1433464_at	16071	-0.490	-0.0583	No
158	ABCA1	1421839_at 1421840_at 1450392_at	16091	-0.492	-0.0567	No
159	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	16425	-0.534	-0.0693	No
160	GNA13	1422555_s_at 1422556_at 1430295_at 1433749_at 1446722_at 1450656_at 1453470_a_at 1460317_s_at	16436	-0.535	-0.0670	No
161	HYAL2	1448679_at	16536	-0.551	-0.0688	No
162	HOXC13	1425874_at	16679	-0.574	-0.0724	No
163	FHOD1	1435557_at	16785	-0.588	-0.0742	No
164	UBXD3	1426007_a_at 1451906_at 1456385_x_at 1457581_at	16798	-0.589	-0.0718	No
165	MYST3	1436315_at 1437487_at 1446143_at 1446405_at	16810	-0.592	-0.0693	No
166	VGF	1436094_at	16969	-0.615	-0.0734	No
167	MYOHD1	1451183_at 1459265_at	17204	-0.653	-0.0809	No
168	HSPBAP1	1428566_at 1428567_at 1441900_x_at 1442842_at	17363	-0.680	-0.0847	No
169	SIRT1	1418640_at 1458538_at	17491	-0.701	-0.0870	No
170	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	17595	-0.721	-0.0880	No
171	BHLHB2	1418025_at	17608	-0.723	-0.0849	No
172	NTN2L	1422056_at	17672	-0.734	-0.0841	No
173	POLR2L	1428296_at	17711	-0.740	-0.0821	No
174	TEF	1424175_at 1438033_at 1450184_s_at	17819	-0.764	-0.0831	No
175	GPRC5C	1424450_at 1452947_at	17842	-0.770	-0.0802	No
176	MXD4	1422574_at 1434378_a_at 1434379_at	17922	-0.785	-0.0798	No
177	DAZAP1	1419275_at	17938	-0.788	-0.0765	No
178	NPTX1	1422130_at 1434877_at	18035	-0.806	-0.0768	No
179	FBL	1416684_at 1416685_s_at	18145	-0.833	-0.0776	No
180	GPX1	1460671_at	18364	-0.888	-0.0831	No
181	NPM1	1415839_a_at 1420267_at 1420268_x_at 1420269_at 1432416_a_at	18475	-0.913	-0.0836	No
182	MICAL2	1438726_at 1455685_at	18813	-0.986	-0.0941	No
183	GIT1	1454759_at	18817	-0.986	-0.0892	No
184	PA2G4	1420142_s_at 1423060_at 1435372_a_at 1450854_at 1460265_at	18863	-0.995	-0.0862	No
185	SLC20A1	1438824_at 1446441_at 1448568_a_at	19001	-1.016	-0.0873	No
186	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	19273	-1.071	-0.0944	No
187	TIMM10	1417499_at	19307	-1.080	-0.0904	No
188	EIF4B	1426378_at 1426379_at 1426380_at	19602	-1.165	-0.0980	No
189	SLC31A2	1416654_at 1453721_a_at 1459399_at	19876	-1.262	-0.1041	No
190	LTBR	1416435_at	20067	-1.353	-0.1060	No
191	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	20101	-1.368	-0.1006	No
192	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	20266	-1.444	-0.1008	No
193	HOXA4	1420226_x_at 1427354_at	20281	-1.452	-0.0940	No
194	RORC	1425792_a_at 1425793_a_at	20283	-1.454	-0.0867	No
195	HERPUD1	1435626_a_at 1448185_at	20447	-1.536	-0.0864	No
196	RPL13A	1417608_a_at 1433928_a_at 1455001_x_at 1455485_x_at	20496	-1.555	-0.0807	No
197	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	20664	-1.665	-0.0799	No
198	WBP2	1448121_at	20686	-1.684	-0.0723	No
199	UBE1	1442767_s_at 1448116_at	20931	-1.864	-0.0741	No
200	CCDC6	1428311_at 1459159_a_at	20932	-1.864	-0.0646	No
201	TNFRSF21	1422740_at 1450731_s_at	21213	-2.072	-0.0669	No
202	PAICS	1423564_a_at 1423565_at 1436298_x_at	21389	-2.304	-0.0633	No
203	HSPE1	1450668_s_at	21520	-2.483	-0.0566	No
204	GABARAP	1416937_at	21559	-2.536	-0.0455	No
205	EIF2C2	1426366_at 1438043_at	21825	-3.768	-0.0385	No
206	PABPC1	1418883_a_at 1419500_at 1453840_at	21936	-8.578	-0.0000	No