Details for gene set V$E4F1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_SCID.phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls #ATM_minus_versus_SCID
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls#ATM_minus_versus_SCID
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$E4F1_Q6
Enrichment Score (ES)	0.33520523
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3540043
Nominal p-value	0.013782542
FDR q-value	0.8122518
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	NINJ1	1438928_x_at 1441281_s_at 1447549_x_at 1448417_at	11	9.085	0.0478	Yes
2	PSMD12	1448492_a_at	76	5.745	0.0754	Yes
3	PRG1	1417426_at	112	4.867	0.0997	Yes
4	SMARCE1	1422675_at 1422676_at 1430822_at	234	3.630	0.1134	Yes
5	UBQLN2	1420844_at 1450021_at 1456627_at	313	3.232	0.1270	Yes
6	DDX3X	1416467_at 1423042_at 1423043_s_at	323	3.196	0.1436	Yes
7	NR4A3	1421079_at 1421080_at	455	2.908	0.1530	Yes
8	GOLGA5	1418447_at	511	2.784	0.1653	Yes
9	OSR1	1449350_at	598	2.598	0.1751	Yes
10	PTP4A1	1419024_at 1455002_at	613	2.554	0.1880	Yes
11	SEC63	1419819_s_at 1424924_at 1424925_at 1424926_at 1457988_at	650	2.485	0.1996	Yes
12	PLK4	1419838_s_at 1426580_at 1452115_a_at	674	2.436	0.2115	Yes
13	WBP5	1451230_a_at	680	2.422	0.2241	Yes
14	PDE7A	1423313_at 1423314_s_at 1450933_at 1451839_a_at 1458218_s_at	794	2.251	0.2309	Yes
15	NR4A1	1416505_at	889	2.108	0.2378	Yes
16	ATF1	1417296_at	956	2.021	0.2455	Yes
17	YWHAG	1420816_at 1420817_at 1450012_x_at 1459693_x_at	958	2.020	0.2562	Yes
18	SLC31A1	1433750_at 1455285_at	1022	1.952	0.2637	Yes
19	RAB6A	1447776_x_at 1448304_a_at 1448305_at	1063	1.913	0.2720	Yes
20	HNRPA2B1	1420365_a_at 1433829_a_at 1433830_at 1434047_x_at	1108	1.872	0.2799	Yes
21	EHD4	1449852_a_at	1199	1.801	0.2854	Yes
22	IKBKB	1426207_at 1426333_a_at 1432275_at 1445141_at 1454184_a_at	1409	1.680	0.2847	Yes
23	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	1553	1.598	0.2866	Yes
24	PPP2R2A	1429715_at 1437730_at 1453260_a_at	1590	1.566	0.2933	Yes
25	ADNP	1423069_at	1676	1.524	0.2975	Yes
26	KDELR3	1418538_at	1704	1.507	0.3042	Yes
27	NEDD9	1422818_at 1437132_x_at 1447885_x_at 1450767_at	1926	1.393	0.3015	Yes
28	PSME3	1418078_at 1418079_at 1438509_at	1947	1.382	0.3079	Yes
29	PRR3	1424145_at	1962	1.371	0.3145	Yes
30	ATP6V0C	1416392_a_at 1435732_x_at 1438925_x_at	1991	1.357	0.3205	Yes
31	GTF2A1	1421357_at	2158	1.287	0.3197	Yes
32	EGR2	1427682_a_at 1427683_at	2191	1.273	0.3250	Yes
33	BRAF	1425693_at 1435434_at 1435480_at 1442749_at 1445786_at 1447940_a_at 1447941_x_at 1456505_at 1458641_at	2227	1.255	0.3300	Yes
34	MAF	1435828_at 1437473_at 1444073_at 1447849_s_at 1447945_at 1456060_at	2353	1.207	0.3307	Yes
35	TAF10	1448784_at	2626	1.121	0.3241	Yes
36	SLC18A2	1437079_at	2792	1.074	0.3223	Yes
37	EGR4	1449977_at	2875	1.053	0.3241	Yes
38	SH2D2A	1449105_at	3015	1.020	0.3231	Yes
39	NR4A2	1447863_s_at 1450749_a_at 1450750_a_at 1455034_at	3110	1.002	0.3241	Yes
40	FSTL5	1436800_at 1439904_at	3190	0.989	0.3257	Yes
41	HIST1H4H	1428014_at 1431333_at	3243	0.976	0.3285	Yes
42	PTMA	1423455_at	3433	0.935	0.3248	Yes
43	RUSC1	1431137_at 1434743_x_at 1436014_a_at 1437991_x_at 1438017_at	3442	0.933	0.3294	Yes
44	PRKAG1	1417690_at 1433533_x_at 1457803_at	3574	0.906	0.3282	Yes
45	RAB1A	1416082_at 1448210_at 1457537_at	3628	0.892	0.3305	Yes
46	CLDN7	1448393_at	3650	0.888	0.3343	Yes
47	NR3C1	1421866_at 1421867_at 1453860_s_at 1457635_s_at 1460303_at	3731	0.871	0.3352	Yes
48	EDG5	1428176_at 1447880_x_at	3937	0.831	0.3302	No
49	SATB2	1425904_at 1427017_at	4120	0.796	0.3260	No
50	GNAS	1421740_at 1427789_s_at 1443007_at 1443375_at 1444767_at 1450186_s_at 1453413_at	4326	0.761	0.3207	No
51	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	4370	0.752	0.3227	No
52	ZMYND15	1438498_at	4442	0.740	0.3234	No
53	CCBL1	1428151_x_at 1438348_x_at 1446302_at 1452678_a_at	4671	0.694	0.3166	No
54	ZFHX1B	1422748_at 1434298_at 1442393_at 1445518_at 1454200_at 1456389_at	4852	0.666	0.3118	No
55	CLDN3	1426332_a_at 1434651_a_at 1451701_x_at 1453258_at 1460569_x_at	5153	0.614	0.3013	No
56	SLC20A2	1434235_at 1451768_a_at 1457302_at	5279	0.596	0.2987	No
57	FBXL11	1435329_at 1443336_at 1444358_at 1455942_at 1458449_at	5337	0.589	0.2992	No
58	UFC1	1416327_at	5367	0.584	0.3010	No
59	HMGB1	1416176_at 1425048_a_at 1435324_x_at	5447	0.572	0.3004	No
60	FOXA1	1418496_at	5542	0.559	0.2990	No
61	FOSB	1422134_at	5675	0.544	0.2959	No
62	CX36	1423019_at 1435297_at	5698	0.540	0.2977	No
63	GRK6	1437436_s_at 1450480_a_at 1451672_at	5780	0.530	0.2968	No
64	CD2AP	1420906_at 1420907_at 1420908_at 1460140_at	5849	0.519	0.2964	No
65	ANK2	1434264_at 1434265_s_at 1440042_at 1440043_at 1443548_at 1444023_at 1445346_at 1446108_at 1459317_at	5987	0.503	0.2928	No
66	IRX6	1427383_at	6061	0.494	0.2921	No
67	STAG1	1421939_a_at 1421940_at 1431921_a_at 1434189_at 1435731_x_at 1445145_at 1445652_at 1450420_at	6309	0.462	0.2832	No
68	SLC36A3	1440102_at	6416	0.450	0.2807	No
69	SCG2	1450708_at	6420	0.450	0.2829	No
70	ARF4	1423052_at 1423053_at 1434074_x_at 1439367_x_at 1442905_at 1457348_at	6520	0.439	0.2807	No
71	SYNGR3	1416098_at 1448216_at	6714	0.418	0.2741	No
72	ZNF24	1422810_at 1426895_at 1426896_at 1430650_at 1430651_s_at 1450762_s_at	6767	0.411	0.2739	No
73	SHC3	1450326_at	7066	0.380	0.2622	No
74	RHOBTB1	1429206_at 1429656_at	7110	0.374	0.2622	No
75	CXCL16	1418718_at 1449195_s_at	7139	0.371	0.2629	No
76	NUMBL	1416491_at	7200	0.363	0.2620	No
77	TNFAIP8	1416950_at 1442239_at 1442753_at 1444224_at 1457996_at	7272	0.356	0.2607	No
78	ERF	1422114_at 1435561_at	7282	0.355	0.2621	No
79	SCAMP5	1450247_a_at 1451224_at	7370	0.347	0.2600	No
80	GRIN2B	1422223_at 1431700_at	7473	0.336	0.2571	No
81	DDX51	1428728_at	7499	0.332	0.2577	No
82	HS6ST2	1420938_at 1420939_at 1446257_at 1450047_at	7619	0.320	0.2539	No
83	DNM3	1425403_at 1436624_at 1436875_at 1438801_at 1445540_at 1446265_at 1446431_at 1446694_at 1457405_at	7689	0.315	0.2524	No
84	TRPC1	1421095_a_at 1421096_at	7800	0.304	0.2490	No
85	PTOV1	1416945_at 1438058_s_at 1458357_x_at	7966	0.290	0.2429	No
86	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	8329	0.252	0.2276	No
87	FLRT3	1429310_at 1453102_at	8428	0.242	0.2244	No
88	PPP2R2B	1426621_a_at	8567	0.229	0.2193	No
89	CHGB	1415885_at	8680	0.218	0.2153	No
90	AGPAT1	1421024_at 1421025_at	8784	0.210	0.2116	No
91	FOXD3	1422210_at	8854	0.203	0.2096	No
92	PPP6C	1424346_at 1424347_at	9089	0.182	0.1998	No
93	SLC30A5	1422497_at	9144	0.177	0.1982	No
94	FKBP7	1416803_at 1446078_at	9211	0.172	0.1961	No
95	KIRREL3	1431402_at 1441357_at 1452728_at	9349	0.158	0.1906	No
96	NEK1	1434267_at 1438592_at 1453612_at 1458211_at	9368	0.156	0.1906	No
97	GEM	1426063_a_at	9776	0.120	0.1726	No
98	FZD7	1450043_at 1450044_at	9825	0.117	0.1710	No
99	HOXC10	1439798_at	9977	0.103	0.1646	No
100	TBRG4	1417658_at 1442793_s_at 1448795_a_at 1448796_s_at	9999	0.101	0.1641	No
101	NEUROD6	1418047_at	10086	0.095	0.1607	No
102	NAP1L2	1418046_at	10203	0.086	0.1558	No
103	LTBP1	1419786_at 1440678_at 1446232_at 1447547_at 1448870_at 1457852_at 1458739_at	10264	0.081	0.1535	No
104	MRC2	1421044_at 1421045_at 1446466_at	10490	0.061	0.1435	No
105	CBX3	1432628_at 1454305_at	10533	0.058	0.1418	No
106	RPL41	1422623_x_at 1455578_x_at	10927	0.025	0.1239	No
107	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	10930	0.025	0.1239	No
108	UBAP1	1423185_a_at 1444624_at 1450893_a_at	10967	0.020	0.1224	No
109	CSTF3	1424723_s_at 1443909_at	11465	-0.025	0.0996	No
110	EIF4A1	1427058_at 1430980_a_at 1434985_a_at	11595	-0.036	0.0939	No
111	PNMA3	1456829_at	11637	-0.041	0.0922	No
112	GOLGA2	1448625_at	11838	-0.058	0.0833	No
113	EGR3	1421486_at 1436329_at	11907	-0.064	0.0806	No
114	FAU	1417452_a_at	12094	-0.081	0.0724	No
115	TRIB1	1424880_at 1424881_at	12104	-0.082	0.0725	No
116	USP48	1419277_at 1419278_at 1424056_at	12155	-0.085	0.0706	No
117	ZNF462	1439106_at 1456789_at	12172	-0.087	0.0703	No
118	NR6A1	1421515_at 1421516_at 1428825_at 1428826_at 1445872_at	12285	-0.097	0.0657	No
119	DACT1	1417937_at	12588	-0.124	0.0525	No
120	HOXB3	1427605_at 1456229_at	12658	-0.131	0.0500	No
121	ABCF3	1426747_at 1426748_s_at 1452177_at	12837	-0.147	0.0426	No
122	CD160	1420066_s_at 1420067_at 1420396_at 1456847_at	12862	-0.151	0.0423	No
123	PITX2	1424797_a_at 1450482_a_at	12889	-0.154	0.0419	No
124	ZBTB4	1429722_at 1460488_at	13196	-0.182	0.0288	No
125	SOX9	1424950_at 1433889_at 1451538_at	13369	-0.197	0.0219	No
126	CALM2	1422414_a_at 1423807_a_at	13402	-0.200	0.0215	No
127	SMARCA1	1460292_a_at	13457	-0.204	0.0201	No
128	CALD1	1424768_at 1424769_s_at 1424770_at 1433146_at 1433147_at 1458057_at	13541	-0.212	0.0174	No
129	TBX20	1422219_a_at 1425158_at 1453351_at	13761	-0.231	0.0086	No
130	GRM3	1430136_at	13876	-0.243	0.0046	No
131	KCNA2	1422197_at	14020	-0.258	-0.0006	No
132	NKX2-2	1421112_at	14062	-0.262	-0.0011	No
133	ADAMTS3	1441693_at 1458143_at	14449	-0.301	-0.0172	No
134	SACM1L	1416500_at 1438900_at	14600	-0.318	-0.0224	No
135	DUSP1	1448830_at	14677	-0.327	-0.0242	No
136	SNF1LK	1419766_at 1459601_at	14763	-0.337	-0.0263	No
137	PPARGC1A	1434099_at 1434100_x_at 1437751_at 1456395_at 1460336_at	14869	-0.348	-0.0293	No
138	MCAM	1416357_a_at	14912	-0.353	-0.0293	No
139	TSPYL5	1455807_at	14997	-0.362	-0.0313	No
140	NOL4	1430189_at 1441447_at 1456387_at	15006	-0.363	-0.0297	No
141	C1QTNF7	1429030_at 1460163_at	15321	-0.396	-0.0421	No
142	GNG4	1417943_at 1417944_at 1447669_s_at	15431	-0.409	-0.0449	No
143	CREB1	1421582_a_at 1421583_at 1423402_at 1428755_at 1452529_a_at 1452901_at	15462	-0.414	-0.0441	No
144	MAP1A	1460566_at	15521	-0.421	-0.0445	No
145	RNF5	1422888_at	15619	-0.432	-0.0467	No
146	KCNA6	1421568_at 1441049_at 1456954_at	15664	-0.438	-0.0464	No
147	GPR3	1460275_at	15766	-0.450	-0.0486	No
148	ZADH2	1451277_at	15887	-0.464	-0.0517	No
149	MAFF	1418936_at	15889	-0.464	-0.0493	No
150	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	15891	-0.465	-0.0468	No
151	ID1	1425895_a_at	15970	-0.474	-0.0479	No
152	PCQAP	1441617_at 1444680_at 1444688_at 1448435_at	16040	-0.484	-0.0485	No
153	SLC25A25	1424735_at 1447856_x_at 1454284_at	16247	-0.512	-0.0553	No
154	MASTL	1423524_at 1423525_at 1444725_at 1447136_at	16316	-0.520	-0.0556	No
155	RFX5	1423103_at	16384	-0.529	-0.0559	No
156	PDLIM3	1443299_at 1449178_at	16524	-0.549	-0.0594	No
157	LENG9	1440190_at 1440191_s_at 1455497_at	16920	-0.607	-0.0743	No
158	CKB	1455106_a_at	17140	-0.645	-0.0810	No
159	MYST1	1432080_s_at	17378	-0.682	-0.0882	No
160	SLC39A13	1423926_at	17390	-0.684	-0.0851	No
161	OSBP	1460350_at	17596	-0.721	-0.0907	No
162	RANBP2	1422621_at 1440104_at 1445883_at 1450690_at	17697	-0.737	-0.0914	No
163	PAFAH1B1	1417086_at 1427703_at 1439656_at 1441404_at 1444125_at 1448578_at 1456947_at 1460199_a_at	17761	-0.754	-0.0903	No
164	ALDOC	1424714_at 1451461_a_at	17878	-0.777	-0.0915	No
165	SSTR2	1422256_at	17931	-0.787	-0.0897	No
166	RBBP8	1427061_at 1427062_at 1446097_at	18093	-0.820	-0.0927	No
167	RFX1	1422109_at 1436059_at	18342	-0.883	-0.0994	No
168	SRPR	1423670_a_at 1427570_at	18549	-0.933	-0.1040	No
169	PPM2C	1434228_at 1438201_at	18616	-0.948	-0.1019	No
170	ARG2	1418847_at 1438841_s_at	18645	-0.954	-0.0982	No
171	CALCRL	1418489_a_at 1425814_a_at 1440685_at 1459536_at	18780	-0.980	-0.0991	No
172	WNT10A	1460657_at	18963	-1.010	-0.1021	No
173	ATP10D	1436544_at	19293	-1.077	-0.1115	No
174	PKP4	1438677_at 1452209_at	19328	-1.088	-0.1073	No
175	CYR61	1416039_x_at 1417848_at 1417849_at 1438133_a_at 1442340_x_at 1457823_at 1459462_at	19416	-1.109	-0.1054	No
176	NDUFB2	1416834_x_at 1442658_at 1448483_a_at 1453806_at	19576	-1.156	-0.1066	No
177	RBMS2	1423540_at 1433979_at	19873	-1.261	-0.1135	No
178	TLE3	1419654_at 1419655_at 1449554_at 1458512_at	19899	-1.270	-0.1079	No
179	BCL2L13	1424406_at 1429539_at	19901	-1.271	-0.1012	No
180	GAK	1426703_at 1426704_at	19930	-1.281	-0.0957	No
181	HIC2	1427581_at 1437571_at 1454944_at	20070	-1.354	-0.0949	No
182	CBX8	1419198_at 1419199_at	20115	-1.374	-0.0896	No
183	MAP3K13	1430137_at 1440749_at 1447699_at	20161	-1.392	-0.0843	No
184	CRY2	1426383_at	20340	-1.481	-0.0846	No
185	POLR2A	1422311_a_at 1426242_at 1458710_at	20505	-1.561	-0.0838	No
186	MAP1LC3A	1447883_x_at 1451290_at	20578	-1.612	-0.0786	No
187	EPC1	1418850_at 1429914_at 1440198_at 1440742_at 1442279_at 1443675_at 1458315_at	20604	-1.632	-0.0710	No
188	ETF1	1420023_at 1420024_s_at 1424013_at 1440629_at 1451208_at	20713	-1.702	-0.0669	No
189	PURB	1419640_at 1419641_at 1419642_at 1428254_at 1436940_at	21014	-1.932	-0.0705	No
190	ATP2A2	1416551_at 1427250_at 1427251_at 1437797_at 1443551_at 1452363_a_at 1458927_at	21047	-1.952	-0.0616	No
191	RPS6KA3	1427299_at 1441360_at 1452383_at	21172	-2.042	-0.0564	No
192	CCNI	1416427_at 1448334_a_at 1448335_s_at 1458536_at 1459602_at	21198	-2.055	-0.0466	No
193	SFRS1	1428099_a_at 1428100_at 1430982_at 1434972_x_at 1452430_s_at 1453722_s_at 1457136_at	21222	-2.084	-0.0366	No
194	DHX36	1424397_at 1424398_at 1437550_at	21264	-2.128	-0.0272	No
195	MRPL49	1423218_a_at 1423219_a_at	21456	-2.393	-0.0233	No
196	ALS2CR13	1434010_at 1444629_at 1446891_at	21595	-2.636	-0.0156	No
197	ELOVL5	1415840_at 1437211_x_at 1459242_at	21896	-5.874	0.0018	No