Details for gene set TGACCTTG_V$SF1

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_SCID.phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls #ATM_minus_versus_SCID
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls#ATM_minus_versus_SCID
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	TGACCTTG_V$SF1_Q6
Enrichment Score (ES)	0.3410655
Normalized Enrichment Score (NES)	1.3520656
Nominal p-value	0.02852615
FDR q-value	0.76813793
FWER p-Value	1.0

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	AMPD3	1422573_at	82	5.554	0.0306	Yes
2	HSPD1	1426351_at	118	4.752	0.0584	Yes
3	TNNI1	1450813_a_at	147	4.413	0.0844	Yes
4	NDFIP1	1424820_a_at 1424821_at 1451493_at	160	4.284	0.1104	Yes
5	NTNG2	1432033_at 1450820_a_at	230	3.645	0.1298	Yes
6	GABPA	1450664_at 1450665_at	436	2.951	0.1386	Yes
7	CACNB2	1441521_at 1444693_at 1446632_at 1452476_at 1456401_at	457	2.901	0.1556	Yes
8	UBL3	1423461_a_at	766	2.290	0.1556	Yes
9	PNOC	1425892_a_at	936	2.045	0.1605	Yes
10	SYNGR1	1419289_a_at 1434661_at 1453772_at	940	2.041	0.1730	Yes
11	IDH3A	1422500_at 1422501_s_at 1432016_a_at 1447701_x_at	1176	1.822	0.1735	Yes
12	ZDHHC21	1429488_at	1280	1.746	0.1796	Yes
13	MTCH2	1430474_a_at 1430969_at 1437806_x_at 1438842_at 1438843_x_at 1448654_at	1526	1.618	0.1783	Yes
14	CS	1422577_at 1422578_at 1450667_a_at	1547	1.601	0.1873	Yes
15	PHF5A	1424170_at	1625	1.545	0.1933	Yes
16	VDAC2	1415990_at	1631	1.542	0.2026	Yes
17	RNF4	1423654_a_at 1445749_at 1451072_a_at	1638	1.539	0.2119	Yes
18	ALDOA	1416921_x_at 1433604_x_at 1434799_x_at	1671	1.526	0.2199	Yes
19	PPP3CC	1420743_a_at 1430025_at	1727	1.491	0.2266	Yes
20	ATP6AP2	1423662_at 1437688_x_at 1439456_x_at	1747	1.481	0.2349	Yes
21	ATP5J	1416143_at	1919	1.397	0.2356	Yes
22	STK32A	1456818_at	1924	1.396	0.2441	Yes
23	ATP6V0C	1416392_a_at 1435732_x_at 1438925_x_at	1991	1.357	0.2495	Yes
24	TIMM9	1428010_at 1449886_a_at	2026	1.343	0.2562	Yes
25	KIN	1427317_at	2140	1.293	0.2590	Yes
26	SDK1	1445326_at 1459711_at	2171	1.283	0.2656	Yes
27	ATP1B1	1418453_a_at 1423890_x_at 1439036_a_at 1451152_a_at 1455949_at	2183	1.278	0.2730	Yes
28	AK2	1448450_at 1448451_at	2189	1.273	0.2806	Yes
29	EEF1A2	1418062_at	2206	1.264	0.2877	Yes
30	UCHL1	1448260_at	2282	1.231	0.2919	Yes
31	HMGB3	1416155_at	2373	1.200	0.2952	Yes
32	TIMM8B	1431665_a_at	2393	1.194	0.3017	Yes
33	PPP1R16B	1425414_at 1455080_at	2404	1.188	0.3086	Yes
34	COMTD1	1428635_at	2430	1.177	0.3147	Yes
35	SEMA7A	1422040_at 1459903_at	2456	1.168	0.3208	Yes
36	LAMB2	1416513_at	2460	1.168	0.3279	Yes
37	ARF3	1421789_s_at 1423973_a_at 1434787_at 1437331_a_at 1456007_at	2902	1.046	0.3141	Yes
38	DNER	1423671_at 1456379_x_at	2906	1.045	0.3204	Yes
39	RANBP1	1422547_at	2915	1.042	0.3265	Yes
40	ZRANB1	1415712_at 1427200_at 1436228_at	3020	1.019	0.3280	Yes
41	PCDH7	1427592_at 1437442_at 1449249_at 1456214_at	3165	0.994	0.3276	Yes
42	FZD9	1427529_at	3278	0.968	0.3284	Yes
43	TCF2	1421224_a_at 1441484_at 1451687_a_at	3393	0.945	0.3290	Yes
44	ATP5G1	1416020_a_at 1444874_at	3587	0.902	0.3257	Yes
45	PHACTR3	1429651_at	3609	0.898	0.3303	Yes
46	SLC30A3	1460654_at	3649	0.888	0.3340	Yes
47	PRPSAP1	1428182_at	3666	0.884	0.3388	Yes
48	SH3GL2	1418791_at 1418792_at 1449228_at	3734	0.870	0.3411	Yes
49	MTX2	1430500_s_at	3918	0.835	0.3378	No
50	PDHX	1456090_at 1459434_at	4219	0.781	0.3289	No
51	FSTL3	1422803_at	4601	0.706	0.3157	No
52	VAMP2	1420833_at 1420834_at	4806	0.673	0.3105	No
53	RHOT1	1423533_a_at 1440853_at	4809	0.673	0.3146	No
54	ATP5G3	1454661_at	5155	0.614	0.3025	No
55	RPH3A	1434635_at 1449961_at	5363	0.585	0.2966	No
56	RILP	1457696_at	5548	0.558	0.2916	No
57	CCNE1	1416492_at 1441910_x_at	5660	0.545	0.2899	No
58	EPN3	1424960_at	5689	0.541	0.2920	No
59	CX3CL1	1415803_at 1415804_at 1421610_at 1441884_x_at	5790	0.528	0.2906	No
60	MYL3	1427768_s_at 1427769_x_at 1428266_at	5846	0.519	0.2913	No
61	NPTX2	1420720_at 1449960_at	5855	0.518	0.2942	No
62	SNPH	1435210_s_at	5959	0.506	0.2926	No
63	MRPL47	1429054_at 1443915_at 1453927_at	6008	0.501	0.2935	No
64	SLC37A2	1452492_a_at	6191	0.479	0.2881	No
65	HTF9C	1434244_x_at 1441920_x_at 1448114_a_at 1448115_at 1453995_a_at 1457620_at	6734	0.416	0.2657	No
66	ATP5C1	1416058_s_at 1438809_at	6876	0.400	0.2617	No
67	CDH16	1448906_at	7026	0.383	0.2572	No
68	APP	1420621_a_at 1427442_a_at 1438373_at 1438374_x_at 1444705_at 1447347_at 1458525_at	7070	0.379	0.2576	No
69	CNTN2	1435165_at 1435166_at 1450523_at 1456962_at	7227	0.360	0.2527	No
70	LRFN5	1441502_at 1454687_at	7288	0.355	0.2521	No
71	MGST3	1448300_at 1450563_at	7655	0.318	0.2373	No
72	CA2	1448752_at	8095	0.277	0.2188	No
73	INSR	1421380_at 1450225_at	8247	0.262	0.2135	No
74	WDFY3	1427456_at 1428517_at 1445718_at 1446109_at 1447433_at 1458952_at 1459287_at 1459414_at	8352	0.250	0.2102	No
75	AUH	1420776_a_at 1430487_at 1431124_at 1444433_at 1445496_at 1445800_at 1447952_at 1458436_at	8424	0.242	0.2085	No
76	ASTN2	1442857_at 1443401_at 1450309_at	8548	0.230	0.2043	No
77	PHF15	1430081_at 1455345_at	8828	0.205	0.1927	No
78	ELAVL3	1452524_a_at	9091	0.182	0.1818	No
79	VSNL1	1420955_at 1450055_at	9222	0.170	0.1769	No
80	RIN2	1426368_at 1441209_at 1442829_at	9227	0.170	0.1777	No
81	ATP6V1B1	1419373_at	9268	0.166	0.1769	No
82	KIRREL3	1431402_at 1441357_at 1452728_at	9349	0.158	0.1742	No
83	MEF2D	1421388_at 1434487_at 1436642_x_at 1437300_at 1458901_at	9351	0.157	0.1751	No
84	CHGA	1418149_at	9356	0.157	0.1759	No
85	ZNF289	1439460_a_at 1448672_a_at	9521	0.143	0.1693	No
86	CAMK2G	1423941_at 1423942_a_at	9873	0.112	0.1538	No
87	HOXC10	1439798_at	9977	0.103	0.1498	No
88	DIRAS1	1425748_at 1451820_at 1455526_at	10257	0.081	0.1374	No
89	RHCG	1417362_at	10331	0.074	0.1345	No
90	CHAT	1440070_at	10372	0.070	0.1331	No
91	SCN5A	1422194_at 1458813_at	10444	0.064	0.1303	No
92	AFG3L2	1427206_at 1427207_s_at 1454003_at	10553	0.056	0.1257	No
93	KCNK1	1448690_at 1455896_a_at	10598	0.052	0.1240	No
94	TFRC	1422966_a_at 1422967_a_at 1452661_at AFFX-TransRecMur/X57349_3_at AFFX-TransRecMur/X57349_5_at AFFX-TransRecMur/X57349_M_at	10759	0.040	0.1169	No
95	CASQ2	1422529_s_at	10839	0.032	0.1134	No
96	GABRA3	1421263_at	10908	0.027	0.1105	No
97	FGF9	1420795_at 1438718_at 1445258_at	10930	0.025	0.1097	No
98	EPS8L2	1417843_s_at	11023	0.014	0.1055	No
99	RAB3A	1422589_at 1459980_x_at	11036	0.013	0.1050	No
100	SLC38A3	1418706_at 1446013_at	11067	0.011	0.1037	No
101	NXPH4	1429753_at	11269	-0.007	0.0945	No
102	SV2A	1423406_at	12078	-0.079	0.0579	No
103	SEMA3F	1420508_at 1425840_a_at 1438947_x_at	12272	-0.096	0.0496	No
104	FNDC5	1435115_at 1453135_at	12275	-0.096	0.0501	No
105	CRSP7	1452282_at 1458377_at	12338	-0.102	0.0479	No
106	NRXN2	1435907_at 1435908_at 1455499_at	12676	-0.132	0.0332	No
107	NCDN	1416852_a_at 1416853_at	12697	-0.134	0.0331	No
108	HCN1	1450193_at	12754	-0.140	0.0314	No
109	KIF5A	1434670_at	13246	-0.186	0.0100	No
110	COX5B	1416902_a_at 1435613_x_at 1436149_at 1448514_at 1454716_x_at 1456588_x_at	13475	-0.205	0.0008	No
111	DSCR1L1	1421425_a_at 1450243_a_at	13500	-0.208	0.0010	No
112	CYC1	1416604_at	13567	-0.214	-0.0007	No
113	MNT	1418192_at	13597	-0.216	-0.0007	No
114	MAEA	1438903_at	13601	-0.217	0.0005	No
115	NDUFB5	1417102_a_at 1448589_at	13689	-0.224	-0.0021	No
116	RNF139	1429425_at 1429426_at	13766	-0.231	-0.0042	No
117	POLR3D	1424565_at 1424566_s_at	13932	-0.249	-0.0102	No
118	DNAJC11	1433880_at 1433881_at 1439763_at 1446686_at 1447055_at	13967	-0.253	-0.0102	No
119	ATP5B	1416829_at	14028	-0.259	-0.0114	No
120	SLITRK1	1428089_at	14100	-0.267	-0.0130	No
121	CATSPER2	1425309_at 1445264_at	14132	-0.270	-0.0127	No
122	CEL	1417257_at	14199	-0.277	-0.0141	No
123	KCNG4	1428536_at	14512	-0.307	-0.0265	No
124	STAC2	1424581_at	14840	-0.345	-0.0394	No
125	FANCD2	1430916_at 1438339_at 1439091_at 1442092_at	15206	-0.385	-0.0538	No
126	TUBB4	1423221_at	15248	-0.390	-0.0533	No
127	MAL	1417275_at 1432558_a_at	15378	-0.403	-0.0567	No
128	NNAT	1423506_a_at	15539	-0.423	-0.0614	No
129	UQCRC1	1428782_a_at	15710	-0.444	-0.0665	No
130	SLC6A8	1417116_at 1448596_at	15826	-0.457	-0.0689	No
131	YWHAH	1416004_at	16143	-0.498	-0.0804	No
132	TBX6	1449868_at	16207	-0.505	-0.0802	No
133	TMEM28	1435138_at 1443271_at 1445869_at 1446912_at 1459483_at	16333	-0.523	-0.0827	No
134	MASP1	1419677_at 1425985_s_at 1438602_s_at 1438603_x_at 1455346_at	16375	-0.527	-0.0813	No
135	BLCAP	1420631_a_at	16382	-0.528	-0.0783	No
136	ADCY1	1445112_at 1445359_at 1456487_at 1457251_x_at 1457329_at	16429	-0.534	-0.0771	No
137	HOXC13	1425874_at	16679	-0.574	-0.0850	No
138	IBRDC3	1432478_a_at 1435226_at	16845	-0.597	-0.0889	No
139	SNTG1	1432287_a_at 1440598_at	16890	-0.602	-0.0872	No
140	KCNMB2	1426322_a_at 1431844_at	16909	-0.605	-0.0843	No
141	ABHD3	1417946_at	16915	-0.606	-0.0807	No
142	GBAS	1419484_a_at 1444503_at 1446137_at	17007	-0.621	-0.0811	No
143	RGS7	1450659_at	17089	-0.634	-0.0809	No
144	CKB	1455106_a_at	17140	-0.645	-0.0792	No
145	NTF3	1434802_s_at 1450803_at	17431	-0.691	-0.0882	No
146	SLC2A4	1415958_at 1415959_at	17460	-0.695	-0.0852	No
147	COX4I1	1448322_a_at	17661	-0.733	-0.0899	No
148	VASP	1451097_at	17964	-0.792	-0.0989	No
149	MSI2	1421230_a_at 1421231_at 1435520_at 1435521_at 1436818_a_at 1441185_at 1441373_at 1443008_at 1443530_at 1446022_at 1458136_at 1458542_at	18273	-0.866	-0.1077	No
150	PANK1	1418715_at 1429813_at 1429814_at 1431028_a_at 1457110_at	18528	-0.927	-0.1136	No
151	SDHD	1428235_at 1437489_x_at	18565	-0.936	-0.1095	No
152	PCTK1	1415956_a_at 1438314_at 1443296_at 1460169_a_at	18793	-0.982	-0.1138	No
153	MEF2C	1421027_a_at 1421028_a_at 1424852_at 1439946_at 1445420_at 1446484_at 1451506_at 1451507_at 1458551_at	18835	-0.989	-0.1096	No
154	RREB1	1428657_at 1434741_at 1438216_at 1442047_at 1452862_at	18943	-1.008	-0.1083	No
155	WWP1	1427097_at 1427098_at 1446364_at 1446853_at 1452299_at	19302	-1.078	-0.1180	No
156	CTSD	1448118_a_at	19337	-1.091	-0.1128	No
157	TRAP1	1416170_at 1437379_x_at	19356	-1.097	-0.1069	No
158	IMMT	1429533_at 1429534_a_at 1433470_a_at 1437126_at	19395	-1.104	-0.1018	No
159	AMY2A	1457367_at	19794	-1.231	-0.1125	No
160	ABTB2	1433453_a_at 1433454_at 1443497_at 1444771_at	19830	-1.244	-0.1064	No
161	ANKRD28	1434630_at 1454801_at	20035	-1.334	-0.1075	No
162	RBMS1	1418703_at 1434005_at 1441437_at 1458578_at 1459968_at	20132	-1.382	-0.1034	No
163	FBXO18	1452153_at	20152	-1.388	-0.0957	No
164	RBMX	1416177_at 1416354_at 1416355_at 1426863_at 1437847_x_at	20699	-1.696	-0.1103	No
165	RAPGEF5	1445255_at 1455137_at 1455840_at	20761	-1.732	-0.1023	No
166	RANBP10	1424584_a_at 1424585_at 1446446_at	20847	-1.794	-0.0952	No
167	UBE1	1442767_s_at 1448116_at	20931	-1.864	-0.0874	No
168	DEXI	1460174_at	20999	-1.919	-0.0786	No
169	CHD2	1444246_at 1445843_at	21056	-1.957	-0.0691	No
170	ESRRA	1442864_at 1460652_at	21130	-2.017	-0.0600	No
171	GABARAPL1	1416418_at 1416419_s_at 1442572_at	21332	-2.220	-0.0555	No
172	HSPE1	1450668_s_at	21520	-2.483	-0.0487	No
173	TOMM40	1426118_a_at 1459680_at	21532	-2.494	-0.0338	No
174	ACO2	1436934_s_at 1442102_at 1451002_at	21552	-2.526	-0.0190	No
175	MADD	1425735_at 1455502_at	21698	-2.944	-0.0075	No
176	TBC1D15	1416060_at 1416061_at 1416062_at	21705	-2.967	0.0106	No