Details for gene set STEMCELL_COMMON

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_SCID.phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls #ATM_minus_versus_SCID
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_SCID.cls#ATM_minus_versus_SCID
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	STEMCELL_COMMON_UP
Enrichment Score (ES)	0.5207527
Normalized Enrichment Score (NES)	2.0398347
Nominal p-value	0.0
FDR q-value	0.018972687
FWER p-Value	0.032

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	WDR43	1428389_s_at 1428390_at	33	8.025	0.0331	Yes
2	RAB18	1420899_at 1420900_a_at	34	7.938	0.0673	Yes
3	SEC23IP	1433627_at 1439882_at	37	7.785	0.1008	Yes
4	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	47	7.254	0.1317	Yes
5	RSL1D1	1456383_at	61	6.230	0.1580	Yes
6	XRCC5	1451968_at	66	6.024	0.1838	Yes
7	PSMD12	1448492_a_at	76	5.745	0.2081	Yes
8	GNL2	1426579_at	134	4.575	0.2252	Yes
9	RABGGTB	1419553_a_at	137	4.567	0.2449	Yes
10	DDX1	1415915_at 1440816_x_at	179	4.024	0.2603	Yes
11	EIF4G2	1415863_at 1452758_s_at	260	3.482	0.2717	Yes
12	ACADM	1415984_at	297	3.281	0.2842	Yes
13	KLHL7	1428091_at 1452660_s_at	347	3.128	0.2954	Yes
14	PEX7	1418988_at	357	3.104	0.3084	Yes
15	LSG1	1437630_at	387	3.045	0.3202	Yes
16	XPO1	1418442_at 1418443_at 1448070_at	421	2.975	0.3315	Yes
17	FKBP9	1423677_at 1437687_x_at	424	2.973	0.3442	Yes
18	GSTA4	1416368_at	518	2.769	0.3519	Yes
19	MKI67IP	1424001_at	573	2.660	0.3609	Yes
20	WBP5	1451230_a_at	680	2.422	0.3665	Yes
21	CIRH1A	1423884_at	682	2.420	0.3769	Yes
22	COPS4	1416163_at	709	2.374	0.3859	Yes
23	TXNDC9	1424512_a_at 1436108_at 1436951_x_at	786	2.265	0.3922	Yes
24	CRTAP	1448592_at	905	2.089	0.3958	Yes
25	SFRS6	1416720_at 1416721_s_at 1447898_s_at 1448454_at	990	1.984	0.4005	Yes
26	MRPS2	1420845_at 1420846_at	991	1.984	0.4090	Yes
27	BLZF1	1418973_at 1418974_at 1442164_at	1032	1.948	0.4156	Yes
28	ZMAT3	1449353_at	1104	1.875	0.4204	Yes
29	RCL1	1416730_at 1457992_at	1106	1.874	0.4285	Yes
30	PDCD2	1423534_at	1125	1.857	0.4357	Yes
31	RFFL	1431748_a_at 1434432_at	1225	1.781	0.4388	Yes
32	UMPS	1431652_at 1434859_at 1451445_at 1455832_a_at	1273	1.750	0.4442	Yes
33	NDUFAB1	1428159_s_at 1428160_at 1435934_at 1447919_x_at 1453565_at 1458678_at	1328	1.723	0.4491	Yes
34	MSH2	1416988_at 1447888_x_at	1351	1.709	0.4555	Yes
35	SMARCAD1	1435651_a_at 1440066_at 1452276_at	1400	1.683	0.4605	Yes
36	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	1429	1.672	0.4665	Yes
37	MPDU1	1416104_at	1534	1.610	0.4686	Yes
38	RNF4	1423654_a_at 1445749_at 1451072_a_at	1638	1.539	0.4706	Yes
39	IARS2	1426735_at 1441665_at	1647	1.535	0.4768	Yes
40	WTAP	1438471_at 1452401_at 1454805_at	1746	1.481	0.4787	Yes
41	SLC38A2	1426722_at 1429593_at 1429594_at	1844	1.437	0.4804	Yes
42	FBXO8	1418510_s_at	1899	1.407	0.4840	Yes
43	PPIC	1416498_at	1945	1.384	0.4879	Yes
44	GARS	1423784_at	2014	1.347	0.4906	Yes
45	DICER1	1427941_at 1460571_at	2042	1.337	0.4951	Yes
46	JAGN1	1417064_at	2056	1.331	0.5003	Yes
47	ADAM9	1416094_at	2075	1.321	0.5052	Yes
48	PPA1	1416939_at	2101	1.310	0.5097	Yes
49	FBXO38	1452255_at	2211	1.263	0.5101	Yes
50	SEC23A	1423347_at	2229	1.254	0.5147	Yes
51	UPP1	1448562_at	2284	1.230	0.5175	Yes
52	SMAD1	1416081_at 1448208_at 1459843_s_at	2410	1.187	0.5169	Yes
53	CDKN1A	1421679_a_at 1424638_at	2438	1.175	0.5208	Yes
54	XPOT	1428772_at 1428949_at 1441681_at 1441682_s_at	2582	1.131	0.5191	No
55	SMAD2	1420634_a_at 1458304_at	2837	1.064	0.5120	No
56	GNB1	1417432_a_at 1425908_at 1454696_at 1459442_at	2892	1.048	0.5140	No
57	PTPN2	1417140_a_at 1425197_at 1425198_at 1438562_a_at	3121	1.000	0.5079	No
58	FHL1	1417872_at 1459003_at	3426	0.937	0.4979	No
59	YWHAB	1420878_a_at 1420879_a_at 1420880_a_at 1436783_x_at 1438708_x_at 1455815_a_at	3470	0.928	0.5000	No
60	ZCCHC10	1418820_s_at	3498	0.922	0.5027	No
61	LAPTM4A	1423368_at	3539	0.913	0.5048	No
62	PRPSAP1	1428182_at	3666	0.884	0.5028	No
63	DNAJB6	1429776_a_at 1429777_at 1434035_at 1435701_at 1442217_at 1448234_at	3668	0.884	0.5066	No
64	CAD	1440857_at 1452829_at 1452830_s_at	3728	0.871	0.5077	No
65	MARCH7	1420609_at 1436893_a_at 1440966_at 1443329_at 1458690_at	3976	0.824	0.4999	No
66	RPP14	1419460_at 1419461_at 1443358_at	4031	0.813	0.5009	No
67	ARCN1	1423743_at 1436062_at 1444372_at 1451089_a_at	4203	0.783	0.4964	No
68	ZFX	1419565_a_at 1425972_a_at 1428046_a_at 1449512_a_at	4625	0.702	0.4801	No
69	ITGB1	1426918_at 1426919_at 1426920_x_at 1427771_x_at 1438119_at 1452545_a_at	4764	0.681	0.4767	No
70	MRPS10	1428153_at 1458999_at	4875	0.662	0.4745	No
71	RAD23B	1424222_s_at 1450903_at 1455420_at 1456822_at	4889	0.659	0.4768	No
72	NDUFAF1	1423711_at	4904	0.657	0.4789	No
73	USP9X	1420922_at 1420923_at 1428193_at 1428194_at 1450037_at 1450038_s_at 1450039_at	5170	0.612	0.4694	No
74	IMPAD1	1437288_at 1437289_at 1437290_at	5375	0.584	0.4626	No
75	RARSL	1424209_at	5644	0.547	0.4526	No
76	TPP2	1421893_a_at 1421894_a_at 1430575_a_at 1430576_at 1438264_a_at	5661	0.545	0.4542	No
77	ZZZ3	1434332_at 1438487_s_at 1441748_at	5753	0.533	0.4523	No
78	KIF2A	1432072_at 1450052_at 1450053_at 1452499_a_at 1454107_a_at	5754	0.533	0.4546	No
79	TXNL1	1423299_at 1435235_at 1436947_a_at 1437905_at 1437906_x_at 1455866_x_at	5902	0.513	0.4501	No
80	EIF4EBP1	1417562_at 1417563_at 1434976_x_at	7217	0.361	0.3913	No
81	MRPL17	1450866_a_at 1450867_at 1458027_at	7264	0.357	0.3907	No
82	TGIF2	1431115_at 1434400_at	7578	0.324	0.3777	No
83	MDFI	1420713_a_at 1425924_at	7643	0.319	0.3762	No
84	SH3D19	1418460_at 1418461_at 1427574_s_at 1445781_at 1449084_s_at	8103	0.276	0.3563	No
85	YES1	1418470_at 1449090_a_at 1456843_at 1458878_at	8233	0.263	0.3515	No
86	RNF138	1419368_a_at 1419369_at 1454064_a_at	8663	0.220	0.3327	No
87	PHTF2	1437067_at 1437637_at 1444559_at	8673	0.219	0.3333	No
88	STAM	1416861_at 1416862_at 1457828_at 1459427_at	8738	0.213	0.3313	No
89	RCN1	1417090_at 1447890_at	8816	0.207	0.3286	No
90	YAP1	1416487_a_at 1448363_at	9274	0.165	0.3083	No
91	SOCS2	1418507_s_at 1438470_at 1441476_at 1442586_at 1446085_at 1449109_at	9800	0.118	0.2847	No
92	TBRG4	1417658_at 1442793_s_at 1448795_a_at 1448796_s_at	9999	0.101	0.2761	No
93	RRN3	1415725_at	10095	0.094	0.2721	No
94	DTYMK	1438096_a_at 1449116_a_at 1452681_at	10314	0.077	0.2624	No
95	MRPS31	1417737_at 1443165_at	11004	0.016	0.2308	No
96	PPP1R2	1417341_a_at 1417342_at 1448684_at 1456830_at	11027	0.014	0.2299	No
97	PCF11	1427159_at 1427160_at 1428724_at 1456489_at	11052	0.012	0.2288	No
98	RPS6KB1	1428849_at 1446376_at 1454956_at 1457562_at 1459951_at 1460705_at	11316	-0.012	0.2168	No
99	ERCC5	1450935_at 1457713_at	11778	-0.053	0.1959	No
100	GAB1	1417693_a_at 1417694_at 1448814_at	11817	-0.057	0.1944	No
101	CBR3	1427912_at	11818	-0.057	0.1946	No
102	CTBP2	1422887_a_at 1439823_at	11979	-0.070	0.1876	No
103	BACH1	1440831_at 1449311_at	12073	-0.078	0.1836	No
104	CTTN	1421313_s_at 1421314_at 1421315_s_at 1423917_a_at 1433908_a_at	12126	-0.083	0.1816	No
105	RASA1	1426476_at 1426477_at 1426478_at 1438998_at	12131	-0.084	0.1818	No
106	SNX12	1421797_a_at 1454807_a_at 1455465_at 1459041_at	12291	-0.098	0.1749	No
107	PSMD11	1429370_a_at 1432726_at 1456059_at 1456104_at	12296	-0.098	0.1751	No
108	SFRS3	1416150_a_at 1416151_at 1416152_a_at 1454993_a_at	12329	-0.101	0.1741	No
109	LAS1L	1446743_at 1452266_at	12408	-0.109	0.1710	No
110	MTERFD1	1454116_a_at 1459262_at	12470	-0.114	0.1687	No
111	LIMA1	1422499_at 1425654_a_at 1435726_at 1435727_s_at 1450629_at	12670	-0.132	0.1601	No
112	KCNAB3	1421790_a_at 1423950_at	13175	-0.180	0.1377	No
113	TJP1	1417749_a_at	13264	-0.188	0.1345	No
114	ALDH7A1	1415902_at 1448137_at 1460167_at	13354	-0.196	0.1313	No
115	GRWD1	1436887_x_at 1452171_at 1455841_s_at	13371	-0.197	0.1314	No
116	MRPL45	1423492_at	13649	-0.221	0.1196	No
117	TOM1L1	1439337_at 1451117_a_at	13710	-0.226	0.1178	No
118	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	13768	-0.231	0.1162	No
119	TXNRD1	1421529_a_at 1424486_a_at 1424487_x_at	13857	-0.241	0.1132	No
120	LAPTM4B	1416148_at 1436915_x_at 1438365_x_at 1459215_at	13881	-0.244	0.1132	No
121	MDFIC	1427040_at	14249	-0.282	0.0976	No
122	TEAD2	1448519_at	14309	-0.288	0.0961	No
123	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	14599	-0.318	0.0842	No
124	CPXM1	1448901_at	14652	-0.324	0.0832	No
125	MAP4K3	1444406_at	15141	-0.379	0.0624	No
126	ELOVL6	1417403_at 1417404_at 1445062_at 1445578_at 1445641_at	15325	-0.397	0.0557	No
127	PIGX	1425134_a_at 1455284_x_at	15708	-0.443	0.0401	No
128	YWHAH	1416004_at	16143	-0.498	0.0223	No
129	WDR55	1426496_at	16379	-0.528	0.0138	No
130	ROCK2	1423592_at 1451041_at	17294	-0.669	-0.0253	No
131	USP10	1448230_at	17358	-0.680	-0.0253	No
132	PAFAH2	1448489_at	17366	-0.681	-0.0226	No
133	RYK	1426388_s_at 1447400_at 1451789_a_at 1458960_at 1459188_at	18122	-0.828	-0.0538	No
134	GAS2	1429147_at 1435834_at 1438564_at 1450112_a_at	18240	-0.860	-0.0554	No
135	MRPL3	1422463_a_at 1422464_at 1431006_at 1440636_at	18263	-0.865	-0.0527	No
136	PRPF6	1424036_at 1426026_at 1454789_x_at	18836	-0.989	-0.0747	No
137	PANX3	1432860_at 1454387_at 1456073_s_at	18862	-0.995	-0.0716	No
138	ZMYM4	1429253_at 1438460_at	18968	-1.010	-0.0720	No
139	PKD2	1417753_at 1441870_s_at	18989	-1.014	-0.0686	No
140	EPRS	1430370_at	19123	-1.036	-0.0702	No
141	UBE2D2	1416475_at 1416476_a_at 1416477_at 1439655_at 1445885_at 1448356_at	19318	-1.083	-0.0745	No
142	PLS3	1423725_at	19329	-1.088	-0.0702	No
143	STATIP1	1415774_at 1438179_s_at	19526	-1.143	-0.0743	No
144	UTP20	1452252_at 1459028_at	19541	-1.146	-0.0700	No
145	GCAT	1417823_at 1417824_at	19591	-1.161	-0.0672	No
146	DPH5	1439049_at 1452839_at 1459549_at	19621	-1.170	-0.0635	No
147	IARS	1426705_s_at 1452154_at	19703	-1.198	-0.0621	No
148	SLC4A7	1455876_at 1457528_at	19711	-1.200	-0.0572	No
149	ANKRD17	1415726_at 1421220_at 1436775_a_at 1444608_at 1445826_at 1454763_at 1459952_at	20138	-1.383	-0.0708	No
150	COPS7A	1423245_at 1429078_a_at	20275	-1.449	-0.0708	No
151	TRIP6	1449041_a_at	20383	-1.503	-0.0692	No
152	TARSL1	1431125_a_at 1436856_x_at	20675	-1.674	-0.0754	No
153	ITGA6	1422444_at 1422445_at	20747	-1.720	-0.0712	No
154	MPHOSPH10	1429080_at 1431388_at	20844	-1.788	-0.0679	No
155	MRPL34	1416349_at 1438014_at	20865	-1.811	-0.0610	No
156	CRSP3	1452064_at	20943	-1.871	-0.0565	No
157	RPUSD4	1452710_at	20964	-1.891	-0.0493	No
158	STRN3	1423535_at 1423536_at 1441050_at 1441266_at 1457343_at	21125	-2.013	-0.0479	No
159	UBE2T	1422462_at 1442398_at	21225	-2.086	-0.0435	No
160	ARIH1	1427188_at 1427189_at 1436498_at 1441022_at 1459397_at 1460090_at	21233	-2.091	-0.0348	No
161	GCLM	1418627_at	21327	-2.216	-0.0295	No
162	TBC1D15	1416060_at 1416061_at 1416062_at	21705	-2.967	-0.0340	No
163	PLA2G6	1422147_a_at 1431278_s_at	21745	-3.183	-0.0221	No
164	CHD1	1420990_at 1444787_at 1444788_x_at 1450077_at 1457473_at	21777	-3.396	-0.0089	No
165	NUP35	1426447_at	21823	-3.734	0.0052	No