Details for gene set V$USF

Table: GSEA Results Summary

Dataset	Set_01_ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus.phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls #ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Phenotype	phenotype_ATM_minus_versus_ATM_plus.cls#ATM_minus_versus_ATM_plus_repos
Upregulated in class	ATM_minus
GeneSet	V$USF_C
Enrichment Score (ES)	0.36645085
Normalized Enrichment Score (NES)	1.4837025
Nominal p-value	0.0020703934
FDR q-value	0.07690182
FWER p-Value	0.916

Table: GSEA details [plain text format]
	PROBE	DESCRIPTION (from dataset)	RANK IN GENE LIST	RANK METRIC SCORE	RUNNING ES	CORE ENRICHMENT
1	MTHFD1	1415916_a_at 1415917_at 1436704_x_at	30	9.067	0.0248	Yes
2	LYAR	1417511_at	114	7.118	0.0414	Yes
3	SDC1	1415943_at 1415944_at 1437279_x_at 1448158_at	152	6.595	0.0588	Yes
4	LAP3	1450860_at	168	6.388	0.0765	Yes
5	RAB2	1418621_at 1418622_at 1418623_at 1419945_s_at 1419946_s_at 1436477_x_at 1449676_at	262	5.426	0.0878	Yes
6	IPO4	1436420_a_at 1450814_a_at	272	5.362	0.1029	Yes
7	TIMM10	1417499_at	292	5.234	0.1171	Yes
8	FBL	1416684_at 1416685_s_at	296	5.197	0.1319	Yes
9	EIF3S1	1426394_at 1426395_s_at 1452052_s_at	357	4.956	0.1435	Yes
10	EXOSC5	1417167_at	387	4.794	0.1559	Yes
11	NUDC	1419471_a_at	435	4.604	0.1670	Yes
12	PPAT	1428543_at 1441770_at 1452831_s_at	473	4.443	0.1781	Yes
13	MORF4L2	1415778_at 1439413_x_at	480	4.420	0.1906	Yes
14	IVNS1ABP	1420961_a_at 1425718_a_at 1450084_s_at	497	4.357	0.2024	Yes
15	ABCB6	1422524_at	522	4.275	0.2136	Yes
16	HMOX1	1448239_at	577	4.122	0.2230	Yes
17	SLC12A5	1425337_at 1445933_at 1451674_at	582	4.091	0.2346	Yes
18	HSPE1	1450668_s_at	605	4.019	0.2452	Yes
19	SET	1426853_at 1426854_a_at	724	3.721	0.2505	Yes
20	G6PC3	1428245_at	746	3.667	0.2601	Yes
21	PSMB3	1417052_at	747	3.666	0.2707	Yes
22	EXOSC2	1426630_at 1446994_at	772	3.617	0.2800	Yes
23	XRN2	1422842_at 1450777_at	1006	3.163	0.2784	Yes
24	NLN	1424981_at 1451555_at	1027	3.127	0.2865	Yes
25	RUSC1	1431137_at 1434743_x_at 1436014_a_at 1437991_x_at 1438017_at	1077	3.055	0.2930	Yes
26	MAX	1423501_at	1081	3.051	0.3017	Yes
27	POLR2L	1428296_at	1165	2.946	0.3064	Yes
28	WEE1	1416773_at 1416774_at	1261	2.836	0.3102	Yes
29	SNX5	1417646_a_at 1417647_at 1417648_s_at 1437074_at 1448791_at	1279	2.818	0.3175	Yes
30	EIF4B	1426378_at 1426379_at 1426380_at	1392	2.700	0.3201	Yes
31	POLR2H	1424473_at	1420	2.678	0.3266	Yes
32	EEF1E1	1444757_at 1449044_at	1432	2.660	0.3338	Yes
33	SH3KBP1	1431592_a_at 1432269_a_at 1446562_at 1456261_at 1460337_at	1448	2.650	0.3407	Yes
34	AKAP12	1419706_a_at 1458235_at	1716	2.371	0.3353	Yes
35	NKX2-3	1425827_at 1427741_x_at 1452528_a_at	1775	2.325	0.3393	Yes
36	SLC9A5	1420070_a_at 1455760_at	1776	2.324	0.3460	Yes
37	CACNA1D	1427974_s_at 1428051_a_at	1903	2.221	0.3466	Yes
38	TIMM9	1428010_at 1449886_a_at	1961	2.174	0.3502	Yes
39	MCM8	1429557_at	2034	2.124	0.3531	Yes
40	RPS19	1449243_a_at 1460442_at	2085	2.085	0.3568	Yes
41	FGF6	1427582_at	2200	2.007	0.3573	Yes
42	GRK6	1437436_s_at 1450480_a_at 1451672_at	2235	1.990	0.3615	Yes
43	AK3	1423717_at 1423718_at 1432436_a_at 1458812_at	2252	1.982	0.3665	Yes
44	CTSF	1449794_x_at 1451019_at	2713	1.745	0.3503	No
45	EIF4G1	1427036_a_at 1427037_at 1438686_at	2802	1.715	0.3512	No
46	LTBR	1416435_at	2843	1.701	0.3543	No
47	PB1	1426877_a_at 1426878_at 1427266_at 1442603_at	2913	1.677	0.3559	No
48	ENO3	1417951_at 1449631_at	3066	1.617	0.3536	No
49	OPRS1	1416750_at 1435579_at 1440792_x_at 1451956_a_at 1457324_at	3077	1.613	0.3578	No
50	GTF2A1	1421357_at	3257	1.553	0.3540	No
51	FADS3	1418773_at 1435910_at 1449219_at	3267	1.551	0.3581	No
52	SUCLG2	1427441_a_at 1435841_s_at 1444309_at	3322	1.533	0.3600	No
53	ENPP6	1436090_at 1438785_at	3351	1.526	0.3631	No
54	BCAS3	1423528_at 1428454_at 1457817_at 1458557_at	3472	1.482	0.3619	No
55	SEZ6L	1424764_at 1440128_s_at	3666	1.418	0.3571	No
56	SRP72	1428876_at 1428877_at	3700	1.410	0.3596	No
57	LRP8	1421459_a_at 1440882_at 1442347_at	3770	1.389	0.3604	No
58	BCL9L	1419180_at 1438806_at 1443700_at 1444855_at	3813	1.378	0.3625	No
59	SATB2	1425904_at 1427017_at	3891	1.359	0.3629	No
60	RUNX2	1424704_at 1425389_a_at 1426034_a_at	3949	1.347	0.3641	No
61	USP2	1417168_a_at 1417169_at	4736	1.184	0.3314	No
62	RHEBL1	1447818_x_at 1451516_at	4737	1.184	0.3348	No
63	COL2A1	1450567_a_at	4763	1.179	0.3370	No
64	STMN1	1415849_s_at	4840	1.165	0.3369	No
65	PSEN2	1425869_a_at 1431542_at	4952	1.143	0.3351	No
66	ELK1	1421896_at 1421897_at 1446390_at	4953	1.143	0.3384	No
67	SCRT2	1440930_a_at 1440931_at 1446986_at 1457310_x_at	4977	1.136	0.3406	No
68	NPTX1	1422130_at 1434877_at	5098	1.116	0.3383	No
69	HYAL2	1448679_at	5256	1.090	0.3342	No
70	PTMA	1423455_at	5264	1.088	0.3370	No
71	FGF11	1421793_at 1439959_at	5332	1.076	0.3370	No
72	HMGN2	1433507_a_at	5478	1.051	0.3334	No
73	FKBP11	1417267_s_at 1425839_at 1425938_a_at	5527	1.046	0.3342	No
74	SYT6	1420188_at 1426106_a_at 1449766_at 1449767_x_at	5634	1.032	0.3323	No
75	ARX	1420926_at 1441175_at 1450042_at	5723	1.019	0.3312	No
76	GPD1	1416204_at 1439396_x_at 1448249_at 1456732_at	5729	1.019	0.3339	No
77	MYOHD1	1451183_at 1459265_at	5980	0.989	0.3252	No
78	EIF2C2	1426366_at 1438043_at	6004	0.986	0.3270	No
79	EFNB1	1418285_at 1418286_a_at 1451591_a_at	6029	0.983	0.3287	No
80	HHIP	1421426_at 1437933_at 1438083_at 1455277_at	6667	0.890	0.3020	No
81	KIAA0427	1427743_at 1436047_at	7325	0.796	0.2741	No
82	TDRD1	1421513_at	7399	0.788	0.2730	No
83	BMP4	1422912_at	7609	0.761	0.2655	No
84	AVP	1450794_at	7676	0.752	0.2647	No
85	LIN28	1437752_at	7823	0.734	0.2601	No
86	NTN2L	1422056_at	8110	0.694	0.2489	No
87	MPP3	1419077_at 1459611_at	8113	0.693	0.2508	No
88	POLR3E	1429456_a_at 1453147_at	8126	0.691	0.2522	No
89	TBX4	1426321_at 1456033_at	8449	0.652	0.2393	No
90	BCKDHA	1416647_at	8538	0.641	0.2371	No
91	TIAL1	1421148_a_at 1426352_s_at 1446713_at 1452821_at 1455675_a_at 1455676_x_at	8672	0.624	0.2328	No
92	B4GALT2	1418080_at 1448941_at	8717	0.618	0.2325	No
93	DAZL	1419542_at 1449502_at	8776	0.613	0.2316	No
94	ANXA6	1415818_at 1429246_a_at 1429247_at 1442288_at	8783	0.612	0.2331	No
95	PAX6	1419271_at 1425960_s_at 1437816_at 1452526_a_at 1456342_at	8873	0.601	0.2308	No
96	CNNM1	1420354_at 1441312_at 1445979_at	8951	0.592	0.2289	No
97	ETV4	1423232_at 1443381_at	9032	0.583	0.2269	No
98	PFDN2	1421950_at	9196	0.563	0.2210	No
99	SYT3	1417708_at	9239	0.558	0.2207	No
100	LHX9	1419324_at 1431598_a_at 1441313_x_at	9469	0.531	0.2117	No
101	TEF	1424175_at 1438033_at 1450184_s_at	9507	0.526	0.2115	No
102	GRIN2A	1421616_at	9570	0.520	0.2102	No
103	DRD1	1455629_at 1456051_at	9622	0.512	0.2093	No
104	HERPUD1	1435626_a_at 1448185_at	9686	0.506	0.2079	No
105	HPCAL4	1433987_at	9696	0.505	0.2089	No
106	RPL13A	1417608_a_at 1433928_a_at 1455001_x_at 1455485_x_at	9931	0.477	0.1995	No
107	SNCAIP	1423499_at 1430463_a_at 1441037_at	10081	0.459	0.1940	No
108	IPO13	1433464_at	10344	0.435	0.1832	No
109	CENTB5	1439021_at	10369	0.432	0.1833	No
110	ETV1	1422607_at 1445314_at 1450684_at	10374	0.431	0.1844	No
111	BHLHB2	1418025_at	10423	0.425	0.1834	No
112	FCHSD2	1434260_at 1456949_at	10608	0.407	0.1761	No
113	ARRDC3	1454617_at	10628	0.405	0.1764	No
114	GPRC5C	1424450_at 1452947_at	10738	0.391	0.1725	No
115	HS3ST3A1	1435622_at	10809	0.382	0.1704	No
116	ACVR2B	1419140_at 1439856_at	10814	0.381	0.1713	No
117	FHOD1	1435557_at	10856	0.377	0.1705	No
118	DAZAP1	1419275_at	10877	0.375	0.1707	No
119	NXPH1	1436718_at 1438388_at 1459921_at	10881	0.375	0.1716	No
120	RAPGEF6	1427412_s_at 1434509_at 1438828_at 1443877_a_at 1443878_at	10975	0.363	0.1684	No
121	HPCA	1425833_a_at 1450930_at	11172	0.343	0.1603	No
122	TLL1	1420753_at	11186	0.342	0.1607	No
123	HSPA4	1416146_at 1416147_at 1440575_at	11275	0.331	0.1576	No
124	ELOVL4	1424306_at 1451308_at	11329	0.325	0.1561	No
125	SC5DL	1424709_at 1434520_at 1451457_at	11737	0.279	0.1382	No
126	CGN	1430329_at 1435155_at	11933	0.258	0.1300	No
127	ALDH3B1	1452301_at	12031	0.248	0.1262	No
128	GPX1	1460671_at	12051	0.246	0.1260	No
129	SLC6A15	1426712_at	12269	0.225	0.1167	No
130	UBXD3	1426007_a_at 1451906_at 1456385_x_at 1457581_at	12419	0.208	0.1105	No
131	NPM1	1415839_a_at 1420267_at 1420268_x_at 1420269_at 1432416_a_at	12454	0.203	0.1095	No
132	RPL19	1416219_at	12479	0.201	0.1090	No
133	SIRT1	1418640_at 1458538_at	12562	0.193	0.1057	No
134	PPP1R9B	1447247_at 1447486_at	12746	0.170	0.0978	No
135	GTF2H1	1453169_a_at	12811	0.164	0.0953	No
136	FLT3	1419538_at	12825	0.162	0.0952	No
137	VGF	1436094_at	13159	0.123	0.0802	No
138	PPARGC1B	1438775_at 1449945_at 1457578_at	13175	0.121	0.0799	No
139	MAT2A	1423667_at 1433576_at 1438386_x_at 1438630_x_at 1438976_x_at 1439386_x_at 1456702_x_at	13252	0.111	0.0767	No
140	ABCA1	1421839_at 1421840_at 1450392_at	13514	0.080	0.0649	No
141	PLA2G4A	1448558_a_at	13525	0.078	0.0647	No
142	DIABLO	1417683_at 1425768_at	13592	0.070	0.0619	No
143	NR1D1	1421802_at 1426464_at	13741	0.047	0.0552	No
144	SGTB	1437977_at 1451529_at	14160	-0.007	0.0360	No
145	IL1RAPL1	1445821_at 1458964_at	14354	-0.036	0.0272	No
146	GIT1	1454759_at	14646	-0.082	0.0140	No
147	PRKCE	1437860_at 1437861_s_at 1442609_at 1444649_at 1449956_at 1452878_at	15005	-0.138	-0.0020	No
148	CDC14A	1436913_at 1443184_at 1446493_at 1459517_at	15251	-0.177	-0.0128	No
149	CHRM1	1439611_at 1450833_at	15268	-0.181	-0.0130	No
150	SLC39A7	1416949_s_at	15318	-0.189	-0.0147	No
151	HSPBAP1	1428566_at 1428567_at 1441900_x_at 1442842_at	15416	-0.205	-0.0186	No
152	RXRB	1416990_at	15644	-0.248	-0.0283	No
153	SOCS5	1423349_at 1423350_at 1441640_at 1442890_at	15774	-0.276	-0.0335	No
154	SLC31A2	1416654_at 1453721_a_at 1459399_at	15824	-0.286	-0.0349	No
155	FGF14	1435747_at 1447221_x_at 1447480_at 1449958_a_at 1458830_at 1459073_x_at	15849	-0.291	-0.0352	No
156	CNOT4	1420999_at 1421000_at 1436645_a_at 1437586_at 1443169_at 1450083_at 1459449_at	16258	-0.384	-0.0528	No
157	CHST11	1428902_at 1450509_at	16440	-0.429	-0.0599	No
158	HOXA4	1420226_x_at 1427354_at	16602	-0.474	-0.0660	No
159	HOXC13	1425874_at	16726	-0.506	-0.0702	No
160	DNMT3A	1423063_at 1423064_at 1423065_at 1423066_at 1442309_at 1460324_at	16777	-0.524	-0.0710	No
161	TMEM15	1424366_at	16823	-0.536	-0.0715	No
162	POGK	1447864_s_at 1459896_at	16967	-0.584	-0.0764	No
163	ZNRF2	1431154_at 1434016_at 1434017_at 1444735_at 1455290_at 1455291_s_at	17008	-0.596	-0.0765	No
164	SLC26A2	1421145_at 1443882_at	17240	-0.676	-0.0852	No
165	ADCY3	1421959_s_at 1421960_at 1436928_s_at 1436929_x_at 1440405_at 1444641_at	17279	-0.688	-0.0850	No
166	EIF4E	1450909_at 1457489_at 1459371_at	17356	-0.717	-0.0864	No
167	MYCL1	1422087_at 1422088_at 1434777_at	17534	-0.791	-0.0923	No
168	MICAL2	1438726_at 1455685_at	17667	-0.843	-0.0959	No
169	ARHGAP20	1427522_at 1429918_at	17728	-0.870	-0.0962	No
170	MYST3	1436315_at 1437487_at 1446143_at 1446405_at	17997	-0.980	-0.1057	No
171	FARP1	1445200_at 1452280_at 1459799_at	18002	-0.982	-0.1030	No
172	CAMK4	1421941_at 1426167_a_at 1439843_at 1442822_at 1452572_at	18098	-1.010	-0.1045	No
173	GNA13	1422555_s_at 1422556_at 1430295_at 1433749_at 1446722_at 1450656_at 1453470_a_at 1460317_s_at	18114	-1.016	-0.1022	No
174	SEMA7A	1422040_at 1459903_at	18372	-1.108	-0.1109	No
175	PER1	1449851_at	18601	-1.214	-0.1179	No
176	PAICS	1423564_a_at 1423565_at 1436298_x_at	18656	-1.238	-0.1168	No
177	CRMP1	1448289_at	18752	-1.289	-0.1174	No
178	PFN1	1449018_at	18754	-1.291	-0.1138	No
179	H3F3A	1423263_at 1442087_at	18876	-1.361	-0.1154	No
180	CLCN2	1449248_at	18971	-1.419	-0.1157	No
181	AMPD2	1426757_at 1438941_x_at	19038	-1.456	-0.1145	No
182	EIF5A	1437859_x_at 1451470_s_at	19093	-1.496	-0.1127	No
183	MNT	1418192_at	19289	-1.619	-0.1170	No
184	SLC4A11	1434867_at 1457989_at	19298	-1.626	-0.1127	No
185	BTBD5	1428721_at 1453987_at	19319	-1.642	-0.1088	No
186	BMP2K	1421103_at 1437419_at 1458370_at	19397	-1.702	-0.1075	No
187	ZFP91	1426326_at 1429615_at 1429616_at 1459444_at	19486	-1.763	-0.1064	No
188	MXD4	1422574_at 1434378_a_at 1434379_at	19498	-1.772	-0.1018	No
189	HOXA3	1427433_s_at 1441070_at 1452421_at	19602	-1.876	-0.1012	No
190	TNFRSF21	1422740_at 1450731_s_at	19615	-1.887	-0.0963	No
191	PA2G4	1420142_s_at 1423060_at 1435372_a_at 1450854_at 1460265_at	19726	-1.974	-0.0957	No
192	ADNP	1423069_at	19729	-1.976	-0.0901	No
193	ARF6	1418822_a_at 1418823_at 1418824_at	19821	-2.038	-0.0884	No
194	RPL22	1448398_s_at 1453118_s_at	19901	-2.089	-0.0860	No
195	UBE1	1442767_s_at 1448116_at	20050	-2.219	-0.0864	No
196	CCDC6	1428311_at 1459159_a_at	20344	-2.525	-0.0926	No
197	GABARAP	1416937_at	20813	-3.223	-0.1049	No
198	JMJD1A	1426810_at	21153	-3.908	-0.1092	No
199	WBP2	1448121_at	21400	-4.705	-0.1070	No
200	PDK2	1448825_at	21401	-4.705	-0.0934	No
201	DNAJB9	1417191_at	21412	-4.757	-0.0801	No
202	SCFD2	1433608_at 1447367_at	21656	-6.176	-0.0735	No
203	SLC20A1	1438824_at 1446441_at 1448568_a_at	21735	-6.812	-0.0575	No
204	BCL6	1421818_at 1450381_a_at	21780	-7.247	-0.0386	No
205	RORC	1425792_a_at 1425793_a_at	21785	-7.272	-0.0178	No
206	PABPC1	1418883_a_at 1419500_at 1453840_at	21934	-8.586	0.0001	No